| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | KT2440 | 3,957,351 | G→A | H100Y (CAC→TAC) | dmlR_13 ← | HTH‑type transcriptional regulator DmlR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | KT2440 | 3,957,351 | 0 | G | A | 98.6% | 245.5 / NA | 73 | H100Y (CAC→TAC) | dmlR_13 | HTH‑type transcriptional regulator DmlR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); major base A (41/30); minor base C (1/0); total (43/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CACGGTGATCACCACGTCATGCCCTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGG > KT2440/3957217‑3957484 | cACGGTGATCACCACGTCATGCCCTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACg < 2:108200/137‑1 (MQ=255) aCGGTGATCACCACGTCATGCCCTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGTCCACCAGCGTCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCgg > 5:41750/1‑137 (MQ=255) aCGGTGATCACCACGTCATGCCCTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCACCAGCCCCATGCCGTACgg > 6:224650/1‑137 (MQ=255) aCGGTGATCACCACGTCATGCCCTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCCTGCCGTCCgg > 3:242068/1‑137 (MQ=255) aCGGTGATCACCACGTCATGCCCTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACgg > 8:188534/1‑137 (MQ=255) gTGATCACCACGTCATGCCCTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCa > 7:26164/1‑137 (MQ=255) gATCACCACGTCATGCCCTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGt > 8:377201/1‑137 (MQ=255) gATCACCACGTCATGCCCTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGt > 6:37405/1‑137 (MQ=255) aTCACCACGTCATGCCCTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTg < 7:282674/137‑1 (MQ=255) ccacGTCATGCCCTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCaaa > 5:179691/1‑137 (MQ=255) ccacGTCATGCCCTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCaaa > 7:133826/1‑137 (MQ=255) aTGCCCTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGAt > 3:13041/1‑137 (MQ=255) gCCCTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATgg > 1:145787/1‑137 (MQ=255) cccTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGc < 7:340664/137‑1 (MQ=255) cccTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGc < 5:35025/137‑1 (MQ=255) cccTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGc < 1:299879/137‑1 (MQ=255) cccTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGc < 4:78200/137‑1 (MQ=255) cccTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAACGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGc < 2:1093/137‑1 (MQ=255) ccTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGcc < 2:134010/137‑1 (MQ=255) cTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCcg > 7:96819/1‑137 (MQ=255) ggCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGc > 6:127260/1‑131 (MQ=255) ggCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGc < 5:127260/131‑1 (MQ=255) gCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAgg < 3:154246/137‑1 (MQ=255) gCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAgg > 8:26538/1‑137 (MQ=255) gCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAgg > 1:84290/1‑137 (MQ=255) gggTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAg < 5:160941/137‑1 (MQ=255) ggTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGc < 8:262718/123‑1 (MQ=255) ggTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGc > 7:262718/1‑123 (MQ=255) ggggTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAAAAGCCCCATGCAGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCTCGAGGAGTAAGGTgcg > 2:30844/1‑137 (MQ=255) gTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGccc > 5:78074/1‑137 (MQ=255) cgcTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTcg > 4:215253/1‑137 (MQ=255) tGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCgcgc > 8:138755/1‑137 (MQ=255) tGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCgcgc > 5:292475/1‑137 (MQ=255) cAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTAGCGCCTCGc > 3:130271/1‑137 (MQ=255) gTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGTGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCAc < 5:338883/137‑1 (MQ=255) cAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGt > 2:76942/1‑113 (MQ=255) cAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGt < 1:76942/113‑1 (MQ=255) cGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGcttct < 8:60762/137‑1 (MQ=255) aTCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCttcttc < 4:13041/137‑1 (MQ=255) accacTTCCGGTTAAAGCAAGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCACCAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCATACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCAACGGCTACTTCgct > 2:266505/1‑135 (MQ=255) accacTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGc < 3:280797/88‑1 (MQ=255) accacTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGc > 4:280797/1‑88 (MQ=255) accacTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGt < 5:37405/137‑1 (MQ=255) accacTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGt < 2:145787/137‑1 (MQ=255) ccacTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCCCGGCTTCTTCGGTc > 2:179587/1‑137 (MQ=255) ccGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCagcagc > 4:210779/1‑137 (MQ=255) ggTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATCCCGTACGGGCAGTGCAACCGCAGATGGCCGCACGGCGTAAGGTGCGCCCCACGCGCCTCGCCCACGCCTTCTTCGGTCAGCAGCATg > 3:228872/1‑137 (MQ=255) gTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGa > 2:239010/1‑137 (MQ=255) cATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGcc > 1:193448/1‑137 (MQ=255) aTGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGccc > 1:83473/1‑136 (MQ=255) aTGTTGTAGCAGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCcg > 7:224486/1‑137 (MQ=255) tgttgtAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCcgc < 6:228301/137‑1 (MQ=255) tgttgtAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCcgc < 6:292475/137‑1 (MQ=255) gttgtAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCcgcg < 1:144837/137‑1 (MQ=255) gttgtAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCcgcg < 3:283624/137‑1 (MQ=255) gttgtAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTAGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCcgcg < 4:130271/137‑1 (MQ=255) gttgtAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGAGATGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCcgcg < 3:215253/137‑1 (MQ=255) ttgtAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCgcgc < 6:380523/137‑1 (MQ=255) ttgtAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCACGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCgcgc < 1:38766/137‑1 (MQ=255) cGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTcc < 5:224650/137‑1 (MQ=255) ggCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCa > 5:50291/1‑137 (MQ=255) ggCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCa > 2:286031/1‑137 (MQ=255) ccaGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAAc > 1:204855/1‑137 (MQ=255) tCAGCAACAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAATGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCACACGGCTTCTTCGGTCAGAAGCATGATATGCCGCGCACGCTCAAGAAACAGCTAAccc > 8:33554/1‑137 (MQ=255) cAGCCCCATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGc < 6:78074/137‑1 (MQ=255) ccccATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCa > 2:135030/1‑137 (MQ=255) ccATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATg < 6:399668/137‑1 (MQ=255) cATGCCGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCCCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATCATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATgc > 1:36906/1‑137 (MQ=255) cGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCCCGGCTTCGTCGGTCAGCTGCATGATCTGCCGCGCACGCGACAGAAACCGCTCACCCCCCTCGCTCATGCGCAgt > 7:222724/1‑136 (MQ=255) cGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAgg > 5:158543/1‑137 (MQ=255) cGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAgg > 8:237958/1‑137 (MQ=255) cGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAgg > 6:353092/1‑137 (MQ=255) cGTACGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCAAGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGAAAACCCCCCTCGCTCATGCGCAgg > 1:368192/1‑137 (MQ=255) | CACGGTGATCACCACGTCATGCCCTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGTGCAAACGCAGATGGCCGCGAGGCGTAAGGTGCGCCCCTCGCGCCTCGCCCACGGCTTCTTCGGTCAGCAGCATGATCTGCCGCGCACGCTCCAGAAACCGCTCACCCGCCTCGCTCATGCGCAGG > KT2440/3957217‑3957484 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |