Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | KT2440 | 4,750,123 | C→T | 5.7% | Q573* (CAG→TAG) | macB → | Macrolide export ATP‑binding/permease proteinMacB |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | KT2440 | 4,750,123 | 0 | C | T | 5.7% | 225.1 / 2.7 | 70 | Q573* (CAG→TAG) | macB | Macrolide export ATP‑binding/permease proteinMacB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (40/26); new base T (2/2); total (42/28) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GTCGTTGATGCTCGGGGCCATTGCCGCCATCTCGCTGCTGGTCGGCGGTATCGGAGTGATGAACATCATGCTCATGACCGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCTGGTGGTCGGCGCCAGCCTTACCCTGGCCGACATTGCCGTGGCGTTCGCCC > KT2440/4749993‑4750255 | gTCGTTGATGCTCGGGGCCATTGCCGCCATCTCGCTGCTGGTCGGCGGTATCGGAGTGATGAACATCATGCTCATGACCGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAgcgc > 7:446478/1‑136 (MQ=255) gTCGTTGATGCTCGGGGCCATTGCCGCCATCTCGCTGCTGGTCGGCGGAATCGGAGTGATGAACATCATGCTCATGACCGTGCACGACCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAccg > 2:281285/1‑135 (MQ=255) tGATGCTCGGGGCCATTGCCGCCATCTCGCTGCTGGTCGGCGGTATCGGAGTGATGAACATCATGCTCATGACCGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACAt > 7:254159/1‑136 (MQ=255) aTGCTCGGGGCCATTGCCGCCATCTCGCTGCTGGTCGGCGGTATCGGAGTGATGAACATCATGCTCATGACCGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACAt < 4:69050/134‑1 (MQ=255) tCGGGGCCATTGCCGCCATCTCGCTGCTGGTCGGCGGTATCGGAGTGATGAACATCATGCTCATGACCGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACAtcctc < 6:184762/134‑1 (MQ=255) gggCCATTGCCGCCATCTCGCTGCTGGTCGGCGGTATCGGAGTGATGAACATCATGCTCATGACCGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCg > 4:57914/1‑133 (MQ=255) gggCCATTGCCGCCATCTCGCAGCTGGTCGGCGGTTTCGGAGTGATGAACATCATGCTCATGACCGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCg < 2:390299/133‑1 (MQ=255) cATTGCCGCCATCTCGCTGCTGGTCGGCGGTATCGGAGTGATGAACATCATGCTCATGACCGTGCTCGAGCGCTCCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCCGTTc > 7:181412/1‑136 (MQ=255) ccgccATCTCGCTGCTGGTCGGCGGTATCGGAGTGATGAACATCATGCTCATGACCGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGa > 2:435109/1‑135 (MQ=255) ccATCTCGCTGCTGGTCGGCGGTATCGGAGTGATGAACATCATGCTCATGACCGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCg < 5:99234/135‑1 (MQ=255) aTCTCGCTGCTGGTCGGCGGTATCGGAGTGATGAACATCATGCTCATGACCGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAgg > 8:85020/1‑136 (MQ=255) gctgctGGTCGGCGGTATCGGAGTGATGAACATCATGCTCATGACCGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCg < 8:385373/133‑1 (MQ=255) gctgctGGTCGGCGGTATCGGAGTGATGAACATCATGCTCATGACCGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGa > 5:58769/1‑134 (MQ=255) gctgGTCGGCGGTATCGGAGTGATGAACATCATGCTCATGACCGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCAt > 2:3641/1‑135 (MQ=255) ggTATCGGAGTGATGAACATCATGCTCATGACCGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATgg < 8:107972/136‑1 (MQ=255) atgaACATCATGCTCATGACCGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTg > 5:316834/1‑135 (MQ=255) aaCATCATGCTCATGACCGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGAcc > 3:209673/1‑135 (MQ=255) aaCATCATGCTCATGACCGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGAcc > 2:119980/1‑135 (MQ=255) aaCATCATGCTCATGACCGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGAcc > 1:6247/1‑135 (MQ=255) aaCATCATGCTCATGACCGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGAcc > 1:128084/1‑135 (MQ=255) aaCATCATGCTCATGACCGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCg > 8:111523/1‑136 (MQ=255) aaCATCATGCTCATGACCGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCg > 7:177341/1‑136 (MQ=255) aaCATCATGCTCATGACCGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCg < 8:16326/136‑1 (MQ=255) tCATGACCGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGt < 4:402278/105‑1 (MQ=255) tCATGACCGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGt > 3:402278/1‑105 (MQ=255) tCATGACCGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCgccc > 2:165720/1‑135 (MQ=255) tCATGACCGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCgccc > 2:122259/1‑135 (MQ=255) tCATGACCGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGAACGGCATCgccct > 8:94207/1‑136 (MQ=255) cATGACCGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCgccct > 2:3413/1‑135 (MQ=255) aCCGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCg < 4:213537/121‑1 (MQ=255) aCCGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCg > 3:213537/1‑121 (MQ=255) ccGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCgccctggcc < 2:121662/134‑1 (MQ=255) cGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCAGGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCgccctggccctg > 7:172500/1‑136 (MQ=255) gTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCgccctggccctg > 1:59901/1‑135 (MQ=255) gcgcGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCtggt < 4:284260/135‑1 (MQ=255) gcgAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCTAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCtggtgg > 2:274813/1‑135 (MQ=255) gcgAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCTAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCtggtgg > 2:267872/1‑135 (MQ=255) gcgAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGCCCGGCATCGCCCTGGCCCtggtgg > 5:320483/1‑135 (MQ=255) gcgAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCtggtgg > 3:219359/1‑135 (MQ=255) gcgAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCtggtgg > 3:440876/1‑135 (MQ=255) gcgAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCtggtgg > 4:374067/1‑135 (MQ=255) gcgAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCtggtgg > 3:175499/1‑135 (MQ=255) gcgAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCTggtggt > 7:100653/1‑136 (MQ=255) gcgAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCTggtggt > 8:184457/1‑136 (MQ=255) cgAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCTggtggt > 4:299012/1‑135 (MQ=255) gAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGCCCACCGGCGCCCCCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGAGATCATGCTGTAGATGGTTCGCGTCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCAGGTGGTc > 2:34806/1‑135 (MQ=255) aGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCTGGTGGTCgg < 8:254159/136‑1 (MQ=255) aGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCTGGTGGTCgg < 7:251604/136‑1 (MQ=255) aGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCTGGTGGTCgg < 7:184457/136‑1 (MQ=255) gcgcCCCCGTGAACTGGGGATCCGCCTGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACAGCCACCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCGTGGTGGTCgg < 5:289711/135‑1 (MQ=255) gcgcACGCGTGAACTCGGTATGCGGATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGGTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCTGGTGGTCgg < 1:281285/135‑1 (MQ=255) gcgcACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGTCATCGCCCTGGCCCTGGTGGTCgg < 4:127934/135‑1 (MQ=255) gcgcACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCTGGTGGTCgg < 5:145974/135‑1 (MQ=255) gcgcACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCTGGTGGTCgg < 1:34806/135‑1 (MQ=255) gcgcACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCTGGTGGTCgg < 6:184934/135‑1 (MQ=255) gcgcACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCTGGTGGTCgg < 3:178469/135‑1 (MQ=255) cGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCTGGTGGTCGGCGCCAGCCTTACCCt < 4:317683/135‑1 (MQ=255) cGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGGCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCTGGTGGTCGGCGCCAGCCTTACCCt < 6:54867/135‑1 (MQ=255) tATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCTGGTGGTCGGCGCCAGCCTTACCCTGGc < 5:202021/135‑1 (MQ=255) aTCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCTGGTGGTCGGCGCCAGCCTTACCCTGGc > 6:79059/1‑134 (MQ=255) aTCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCTGGTGGTCGGCGCCAGCCTTACCCTGGCCg > 8:97640/1‑136 (MQ=255) ccGCATGGCCACCGGCGCCCGCTAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCTGGTGGTCGGCGCCAGCCTTACCCTGGCCg < 1:274813/134‑1 (MQ=255) ccGCATGGCCACCGGCGCCCGCTAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCTGGTGGTCGGCGCCAGCCTTACCCTGGCCg < 1:267872/134‑1 (MQ=255) ccGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCTGGTGGTCGGCGCCAGCCTTACCCTGGCCg > 3:174967/1‑134 (MQ=255) ccGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCTGGTGGTCGGCGCCAGCCTTACCCTGGCCg > 6:94598/1‑134 (MQ=255) gCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGCCCGGCATCGCCCTGGGCCTGGTGGTCGGCGCCCGCCTTACCCTGGCCGACa > 2:222306/1‑135 (MQ=255) ggCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCTGGTGGTCGGCGCCAGCCTTACCCTGGCCGACATTGc > 6:17278/1‑135 (MQ=255) ggCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCTGGTGGTCGGCGCCAGCCTTACCCTGGCCGACATTGc < 4:174967/135‑1 (MQ=255) ccACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATAGCCCTGGCCCTGGTTGTCGGCGCCAGCCTTACCCTGGCCGACATTGCCg > 6:384674/1‑135 (MQ=255) aCCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCTGGTGGTCGGCGCCAGCCTTACCCTGGCCGACATTGCCGTg < 1:435109/135‑1 (MQ=255) cgcccgccAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGCGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCTGGTGGTCGGCGCCCGCCTTACCCTGGCCGCCATTGCCGTGGCggt > 6:413988/1‑133 (MQ=255) gcccgccAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCTGGTGGTCGGCGCCAGCCTTACCCTGGCCGACATTGCCGTGGCGTTc < 3:232727/135‑1 (MQ=255) gcccgccAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCTGGTGGTCGGCGCCAGCCTTACCCTGGCCGACATTGCCGTGGCGTTc < 3:232595/135‑1 (MQ=255) cccgccAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCTGGTGGTCGGCGCCAGCCTTACCCTGGCCGACATTGCCGTGGCGTTCGc < 7:85020/136‑1 (MQ=255) gccAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCTGGTGGTCGGCGCCAGCCTTACCCTGGCCGACATTGCCGTGGCGTTCGccc < 1:122259/135‑1 (MQ=255) | GTCGTTGATGCTCGGGGCCATTGCCGCCATCTCGCTGCTGGTCGGCGGTATCGGAGTGATGAACATCATGCTCATGACCGTGCGCGAGCGCACCCGTGAAATCGGTATCCGCATGGCCACCGGCGCCCGCCAGCGCGACATCCTCCGGCAGTTCCTGAGCGAGGCGATCATGCTGTCGATGGTTGGCGGCCTGACCGGCATCGCCCTGGCCCTGGTGGTCGGCGCCAGCCTTACCCTGGCCGACATTGCCGTGGCGTTCGCCC > KT2440/4749993‑4750255 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |