Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | KT2440 | 6,107,366 | A→G | 11.3% | N219D (AAC→GAC) | clsA → | Major cardiolipin synthase ClsA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | KT2440 | 6,107,366 | 0 | A | G | 11.3% | 318.5 / 28.4 | 116 | N219D (AAC→GAC) | clsA | Major cardiolipin synthase ClsA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (54/48); new base G (4/9); total (58/58) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.52e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.27e-01 |
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
GTGTTCGTGCTGTACGACCGTGTCGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGCTACAGCCAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCTTTCCCCTTGGCGTGACACCCACGTACAGATCAGCG > KT2440/6107237‑6107501 | gtgtTCGTGCTGTACGACCGTGTCGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGCTACAGCCAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTcc > 7:299414/1‑136 (MQ=255) ttCGTGCTGTACGACCTTGTCGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGCTACAGCCAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGGACTTCCGc < 8:440083/135‑1 (MQ=255) gTGCTGTACGACCGTGTCGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGCTACAGCCAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCaa > 3:292468/1‑134 (MQ=255) gTGCTGTACGACCGTGTCGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGCTACAGCCAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAAcc > 7:99953/1‑136 (MQ=255) gCTGTACGACCGTGTCGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGCTACAGCCAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCAt > 8:199046/1‑136 (MQ=255) gCTGTACGACCGTGTCGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGCTACAGCCAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCAt > 7:343135/1‑136 (MQ=255) cTGTACGACCGTGTCGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGCTACAGCCAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCAt < 8:162283/135‑1 (MQ=255) gTACGACCGTGTCGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGCTACCGCCAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATc > 3:436681/1‑134 (MQ=255) cGACCGTGTCGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGCTACAGCCAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCg > 2:243134/1‑132 (MQ=255) cGTGTCGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGCTACAGCCAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGGACTTCCGCAACCATCGCAAGAtt < 1:99564/135‑1 (MQ=255) cGTGTCGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGCTACAGCCAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATtg < 7:27751/136‑1 (MQ=255) cGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGCTACAGCCAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTgtggtg > 8:102054/1‑136 (MQ=255) cGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGCTACAGCCAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTgtggtg > 8:25162/1‑136 (MQ=255) cGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGCTACAGCCAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTgtggtg > 7:129826/1‑136 (MQ=255) cGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGCTACAGCCAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTgtggtg > 8:61311/1‑136 (MQ=255) cGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGCTACAGCCAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTgtggt > 2:123540/1‑135 (MQ=255) cGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGCTACAGCCAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTgtggt > 4:17469/1‑135 (MQ=255) cGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGCTACAGCCAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTgtggt > 4:6992/1‑135 (MQ=255) cGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGCTACAGCCAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTgtggt > 3:323833/1‑135 (MQ=255) cGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGCTACAGCCAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTgtggt > 6:435935/1‑135 (MQ=255) cGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGCTACAGCCAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACAATCGCAAGAGTgtggt > 6:439383/1‑135 (MQ=255) ggTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGCTACAGCCAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTgtggtgg < 7:262289/136‑1 (MQ=255) cATGCCTTGCCGTCCAGCTACAGCCAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGGCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGAt < 6:265090/135‑1 (MQ=255) cTTGCCGTCCAGCTACAGCCAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCa > 4:174956/1‑108 (MQ=255) cTTGCCGTCCAGCTACAGCCAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCa < 3:174956/108‑1 (MQ=255) ttGCCGTCCAGCTACAGCCAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCACCCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTTTGGTGGTGGATGGCTTg > 4:298189/1‑135 (MQ=255) gCTACAGCCAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCAt < 7:78036/136‑1 (MQ=255) aGCCAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGGTTGCTCGGCTTCATcggc < 5:446134/135‑1 (MQ=255) gCCAGGTGCTGCGTGAGGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACAGGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTGGGCTTCATcggcgg < 8:157780/136‑1 (MQ=255) ccAGGTGCTTCGTGACGGCGGTGTGCAGATACATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCTAGTTTGTGGTGGTGGATGTCTTGCTCGGCTTCATcggcgg < 8:340369/135‑1 (MQ=255) ccAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATcggcgg < 2:278774/135‑1 (MQ=255) ccAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCAGTCGCCTCACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATcggcgg < 6:438398/135‑1 (MQ=255) aGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCca > 7:423480/1‑136 (MQ=255) ggTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCca < 1:290932/135‑1 (MQ=255) ggTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCca < 4:413814/135‑1 (MQ=255) ggTGCTGCGGGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCca < 2:119119/135‑1 (MQ=255) tgcGTGCCGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAAtg < 1:167666/135‑1 (MQ=255) cGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAAtgt < 8:306853/134‑1 (MQ=255) gTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGGACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTgg > 5:332509/1‑135 (MQ=255) tGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTTGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGga < 8:128259/136‑1 (MQ=255) gACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCCCACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTGCCAGGTGAACTTCCGCAACCATGGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGga < 5:335980/135‑1 (MQ=255) gACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGGACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATc > 4:248297/1‑117 (MQ=255) gACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGGACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATc < 3:248297/117‑1 (MQ=255) tcggcggTGTGCAGAACCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACGATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGga < 3:172026/133‑1 (MQ=255) cggTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGa > 6:15208/1‑135 (MQ=255) ggTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAg < 6:145718/135‑1 (MQ=255) tgtgCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTa < 4:292468/135‑1 (MQ=255) tgCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCt > 7:430016/1‑136 (MQ=255) aGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGGACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTgg < 6:203264/135‑1 (MQ=255) aGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACAAGTACCTgg < 5:124148/135‑1 (MQ=255) cATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGaa > 1:171864/1‑135 (MQ=255) agtCGCCACACGGCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATcc < 5:50904/133‑1 (MQ=255) aTTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCcaca > 3:340717/1‑104 (MQ=255) aTTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGAc < 4:291070/115‑1 (MQ=255) aTTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGAc > 3:291070/1‑115 (MQ=255) aTTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATcc > 6:241794/1‑135 (MQ=255) aTTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATcc > 1:257674/1‑135 (MQ=255) aTTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCca > 8:218927/1‑136 (MQ=255) aTTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTACGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATAGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATcc > 1:371004/1‑135 (MQ=255) tCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCca > 7:150543/1‑134 (MQ=255) ccACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGCACATCCACAGc > 1:247921/1‑135 (MQ=255) ccACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCt > 7:299079/1‑136 (MQ=255) ccACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCAAAGc > 3:138464/1‑135 (MQ=255) acacGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGCGACGCGTACCTGGGTGCACATCCACCGCtt > 2:220100/1‑135 (MQ=255) acacGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCtt > 4:152640/1‑135 (MQ=255) acacGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCtt > 1:381922/1‑135 (MQ=255) acGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCTTTcc < 8:299079/136‑1 (MQ=255) tCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCTTTCCCCt > 8:58061/1‑136 (MQ=255) cgcgGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGGACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCTTTCCCCt < 4:363988/135‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCTGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCTTTCCCCTTGGCg < 7:188075/136‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCCCAATGTGGGAGCCGAGTACCTGGGGGAACATCCACAGCGTTCCCCTTGGc > 2:437822/1‑135 (MQ=255) cTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCTTTCCCCTTGGCg < 6:442487/135‑1 (MQ=255) cTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCTTTCCCCTTGGCg < 1:123540/135‑1 (MQ=255) cTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTACGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATTGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCTTTCACCTTGGAGt > 8:44862/1‑136 (MQ=255) gTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCTTTCCCCTTGGCGTGa < 2:257674/135‑1 (MQ=255) ttCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCTTTCCCCTTGGCGTg < 1:278761/133‑1 (MQ=255) ttCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCTTTCCCCTTGGCGTGaca < 8:295782/136‑1 (MQ=255) tCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGAAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCTTTCCCCTTGGCGTGaca < 1:291253/135‑1 (MQ=255) tCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGAGGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGGGAACATCCACAGCTTTCCCCTTGGCGTGaca < 6:94810/135‑1 (MQ=255) gcAACCGCTTCCAGGGGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCTTTCCCCTTGGCGTGaca < 2:407314/134‑1 (MQ=255) cAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCTTTCCCCTTGGCGTGGCAcc > 7:441403/1‑136 (MQ=255) cAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCTTTCCCCTTGGCGTGACAcc > 8:76155/1‑136 (MQ=255) cAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGGGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCCCAATGTGGGAGCCGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCTTTCCCCTTGGCGTGACAcc > 8:133088/1‑136 (MQ=255) cGCTTCCTGGTTTAGTTCCGAAACCTTCGCATTTTTGTGGGGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGAGGGCACATTGTGGGAGAGGAGTACCTGGGTGAACATCAACTTATTTCCCGTTGGGGTGccacccac < 6:68088/135‑1 (MQ=255) cGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCTTTCCCCTTGGCGTGACACCCAc < 1:171756/135‑1 (MQ=255) gCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCTTTCCCCTTGGCGTGACACCCAc > 2:191800/1‑134 (MQ=255) cAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCTTTCCCCTTGGCGTGACACCCACGt > 1:116346/1‑131 (MQ=255) aGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGTTGGATGGCTTTCTCGGCTTCATCGGCCGCCACAATGTGGGAGACCAGTACCTGGGTGAACATCCCCAGCTTTCCCCTTGGCGTGAAACCCCCGt > 2:227719/1‑130 (MQ=255) aGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTCCCTGGGTGAACATCCACAGCTTTCCCCTTGGCGTGACCCCCACGTa > 8:240152/1‑131 (MQ=255) aGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCTTTCCCCTTGGCGTGACACCCACGTACAGAt < 8:299414/136‑1 (MQ=255) ggTGGACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCTTTCCCCTTGGCGTGACACCCACGTACAGAt < 6:332509/135‑1 (MQ=255) ggTGGACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCTTTCCCCTTGGCGTGACACCCACGTACAGAt < 3:41986/135‑1 (MQ=255) ggTGAACTTCCGCAAGCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGGGAACATCCACAGCTTTCCCCTTGGCGTGACACCCACGTACAGAt < 5:439383/135‑1 (MQ=255) ggTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCTTTCCCCTTGGCGTGACACCCACGTACAGAt < 4:323833/135‑1 (MQ=255) ggTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCTTTCCCCTTGGCGTGACACCCACGTACAGAt < 1:191800/135‑1 (MQ=255) ggTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCTTTCCCCTTGGCGTGACACCCACGTACAGAt < 4:253541/135‑1 (MQ=255) ggTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCTTTCCCCTTGGCGTGACACCCACGTACAGAt < 4:45433/135‑1 (MQ=255) aaCTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGTCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCTTTCCCCTTGGCGTGACACCCACGTACAGATCAGCg < 7:307032/136‑1 (MQ=255) aaCTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCTTTCCCCTTGGCGTGACACCCACGTACAGATCAGCg > 8:247883/1‑136 (MQ=255) aaCTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCTTTCCCCTTGGCGTGACACCCACGTACAGATCAGCg < 7:199046/136‑1 (MQ=255) | GTGTTCGTGCTGTACGACCGTGTCGGTAGCCATGCCTTGCCGTCCAGCTACAGCCAGGTGCTGCGTGACGGCGGTGTGCAGATCCATGCATTCGCCACACGTCGCGGCTGGTTCAACCGCTTCCAGGTGAACTTCCGCAACCATCGCAAGATTGTGGTGGTGGATGGCTTGCTCGGCTTCATCGGCGGCCACAATGTGGGAGACGAGTACCTGGGTGAACATCCACAGCTTTCCCCTTGGCGTGACACCCACGTACAGATCAGCG > KT2440/6107237‑6107501 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |