Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | KT2440 | 3,323,335 | G→T | 5.0% | F183L (TTC→TTA) | CJ019_03122 ← | Carboxynorspermidine synthase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | KT2440 | 3,323,335 | 0 | G | T | 5.0% | 255.0 / 2.7 | 80 | F183L (TTC→TTA) | CJ019_03122 | Carboxynorspermidine synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (43/33); new base T (2/2); total (45/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.73e-01 |
TGGCCGGTCAGGTACAGGTTTTGCGAGCCTACCACTGGCAGGTCGTCGGTACGCTTGACCTCGAACATGGTGTTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGTCGAAATACTGCTGCTGCGCCAGCTTGGCGTAGCTGTTCA > KT2440/3323210‑3323462 | tGGCCGGTCAGGTACAGGTTTTGCGAGCCTACCACTGGCAGGTCGTCGGTACGCTTGACCTCGAACATGGTGTTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGAt < 2:182413/134‑1 (MQ=255) ccGGTCAGGTACAGGTTTTGCGAGCCTACCACTGGCAGGTCGTCGGTACGCTTGACCTCGAACATGGTGTTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTcc > 2:446149/1‑135 (MQ=255) ccGGTCAGGTACAGGTTTTGCGAGCCTACCACTGGCAGGTCGTCGGTACGCTTGACCTCGAACATGGTGTTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTcc > 5:384062/1‑135 (MQ=255) ggTCAGGTACAGGTTTTGCGAGCCTACCACTGGCAGGTCGTCGGTACGCTTGACCTCGAACATGGTGTTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCggg > 8:164306/1‑136 (MQ=255) ggTCAGGTACAGGTTTTGCGAGCCTACCACTGGCAGGTCGTCGGTACGCTTGACCTCGAACATGGTGTTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCgg > 6:215381/1‑135 (MQ=255) gTTTTGCGAGCCTACCACTGGCAGGTCGTCGGTACGCTTGACCTCGAACATGGTGTTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTtggtg < 7:239113/136‑1 (MQ=255) ttttGCGAGCCTACCACTGGCAGGTCGTCGGTACGCTTGACCTCGAACATGGTGTTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTtggtg < 6:316705/135‑1 (MQ=255) tttGCGAGCCTACCACTGGCAGGTCGTCGGTACGCTTGACCTCGAACATGGTGTTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTtggtgg < 6:338011/135‑1 (MQ=255) cGAGCCTACCACTGGCAGGTCGTCGGTACGCTTGACCTCGAACATGGTGTTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGTAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCaaa > 5:380757/1‑135 (MQ=255) cGAGCCTACCACTGGCAGGTCGTCGGTACGCTTGACCTCGAACATGGTGTTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGTAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCaaa > 5:374027/1‑135 (MQ=255) gAGCCTACCACTGGCAGGTCGTCGGTACGCTTGACCTCGAACATGGTGTTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGATGTTGGTGGCaaa > 6:219346/1‑134 (MQ=255) gAGCCTACCACTGGCAGGTCGTCGGTACGCTTGACCTCGAACATGGTGTTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCaaa > 1:16233/1‑134 (MQ=255) gAGCCTACCACTGGCAGGTCGTCGGTACGCTTGACCTCGAACATGGTGTTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCaaa > 2:97926/1‑134 (MQ=255) gAGCCTACCACTGGCAGGTCGTCGGTACGCTTGACCTCGAACATGGTGTTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAg > 7:283402/1‑135 (MQ=255) gCAGGTCGTCGGTACGCTTGACCTCGAACATGGTGTTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCg < 7:164306/135‑1 (MQ=255) cAGGTCGTCGGTACGCTTGACCTCGAACATGGTGTTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCg < 6:384062/134‑1 (MQ=255) ggTCGTCGGTACGCTTGACCTCGAACATGGTGTTGCTGGTCCCCTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTGGATTTCCGGGTCGCAGTTGGGGGCGAAGTACTTGCCATGCGAAc > 5:283023/1‑135 (MQ=255) ggTCGTCGGTACGCTTGACCTCGAACATGGTGTTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAAc > 3:186220/1‑135 (MQ=255) gtcgGTACGCTTGACCTCGAACATGGTGTTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCa > 8:124668/1‑136 (MQ=255) tcgGTACGCTTGACCTCGAACATGGTGTTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCAt > 8:274032/1‑136 (MQ=255) ggTACGCTTGACCTCGAACATGGTGTTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGTAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCAtt < 6:374027/135‑1 (MQ=255) ggTACGCTTGACCTCGAACATGGTGTTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTg < 8:28980/136‑1 (MQ=255) gTACGCTTGACCTCGAACATGGTGTTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGTAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCAtt < 6:380757/134‑1 (MQ=255) cGCTTGACCTCGAACAGGGTGTTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGt < 8:227953/136‑1 (MQ=255) gCTTGACCTCGAACATGGTGTTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACg < 4:17461/134‑1 (MQ=255) tGACCTCGAACATGGTGTTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGt > 3:417152/1‑132 (MQ=255) cTCGAACATGGTGTTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTTTACGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCAGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGAGAACCGGCATTGACGTCGAGAat > 2:6524/1‑135 (MQ=255) cTCGAACATGGTGTTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGACAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCTGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAat > 5:226650/1‑135 (MQ=255) gAACATGGTGTTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAatat > 4:4136/1‑134 (MQ=255) aaCATGGTGTTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGTAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATatc < 6:426047/134‑1 (MQ=255) aaCATGGTGTTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATatc < 1:97926/134‑1 (MQ=255) gtTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGTCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATc > 7:130021/1‑135 (MQ=255) gtTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAAt > 6:408630/1‑134 (MQ=255) ttGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCaa < 8:166287/136‑1 (MQ=255) tGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCaa < 4:164374/135‑1 (MQ=255) tGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCaa < 6:223357/135‑1 (MQ=255) tGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCaa < 1:446149/135‑1 (MQ=255) tGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCaa < 1:101272/135‑1 (MQ=255) cTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGTCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGc < 8:130021/136‑1 (MQ=255) tGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGc < 5:215381/135‑1 (MQ=255) ggTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGATGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATggg > 3:311329/1‑133 (MQ=255) gTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGCGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTg < 3:276763/135‑1 (MQ=255) tCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGt < 5:341079/135‑1 (MQ=255) cTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATatc < 1:372374/114‑1 (MQ=255) cTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATatc < 1:377983/114‑1 (MQ=255) cTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATatc > 2:372374/1‑114 (MQ=255) cTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATatc > 2:377983/1‑114 (MQ=255) cTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATaaa > 4:193021/1‑125 (MQ=255) cTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCaa < 3:193021/125‑1 (MQ=255) cTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGTCGaa > 4:431213/1‑135 (MQ=255) cTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGTCGaa > 4:287549/1‑135 (MQ=255) cTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGTCGaa > 1:85268/1‑135 (MQ=255) tGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGTCGAAATAct > 1:446873/1‑135 (MQ=255) cTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGTCGAAATActgctg > 1:152153/1‑135 (MQ=255) tGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGTCGAAATActgctgc > 1:233421/1‑135 (MQ=255) cTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGTCGAAATACTGCTGCTGCGCCa < 8:148927/136‑1 (MQ=255) tCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGTCGAAATACTGCTGCTGCGCCa < 6:390268/135‑1 (MQ=255) tCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGTCGAAATACTGCTGCTGCGCCa < 1:173513/135‑1 (MQ=255) ccACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGTCGAAATACTGCTGCTGCGCCAGc > 7:292463/1‑136 (MQ=255) acacTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGTCGAAATACTGCTGCTGCGCCAGCtt > 8:168144/1‑136 (MQ=255) acacTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGTCGAAATACTGCTGCTGCGCCAGCt < 6:396733/135‑1 (MQ=255) acTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATAGAATCAATGCTGTCGATATACTGCTGCTGCGCCCGCGTg > 3:250073/1‑135 (MQ=255) cTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGTCGAAATACTGCTGCTGCGCCAGCTTgg > 5:17751/1‑135 (MQ=255) cTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGTCGAAATACTGCTGCTGCGCCAGCTTgg < 3:250086/135‑1 (MQ=255) tGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGTCGAAATACTGCTGCTGCGCCAGCTTGGCg > 3:319257/1‑135 (MQ=255) ccGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGTCGAAATACTGCTGCTGCGCCAGCTTGGCGTa < 2:233421/134‑1 (MQ=255) cGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTTGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGTCGAAATActgctgct < 7:156383/117‑1 (MQ=255) cGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGTCGAAATTCTGCTGCTGCGCCAGCTTGGCGTAGCt < 7:274032/136‑1 (MQ=255) cGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGTCGAAATActgctgct > 8:156383/1‑117 (MQ=255) cGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGTCGAAATACTGCTGCTGCTCCAGCTTGGCGTAGc > 1:47681/1‑135 (MQ=255) cGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGTCGAAATACTGCTGCTGCGCCAGCTTGGCGTAGc > 5:284776/1‑135 (MQ=255) cGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGTCGAAATACTGCTGCTGCGCCAGCTTGGCGTAGc > 5:123665/1‑135 (MQ=255) cGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGTCGAAATACTGCTGCTGCGCCAGCTTGGCGTAGc > 6:328820/1‑135 (MQ=255) cGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGTCGAAATACTGCTGCTGCGCCAGCTTGGCGTAGCt > 7:111651/1‑136 (MQ=255) cGGTGAACTAGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGTCGAAATACTGCTGCTGCGCCAGCTTGGCGTAGCt > 7:7336/1‑136 (MQ=255) ggTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGTCGAAATACTGCTGCTGCGCCAGCTTGGCGTAGCt > 4:378860/1‑135 (MQ=255) ggTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGTCGAAATACTGCTGCTGCGCCAGCTTGGCGTAGCt < 1:250005/135‑1 (MQ=255) aCTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGTCGAAATACTGCTGCTGCGCCAGCTTGGCGTAGCTGTTca > 3:144950/1‑135 (MQ=255) tCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGTCGAAATACTGCTGCTGCGCCAGCTTGGCGTAGCTGtt < 4:258420/131‑1 (MQ=255) tCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGTCGAAATACTGCTGCTGCGCCAGCTTGGCGTAGCTGtt > 3:258420/1‑131 (MQ=255) | TGGCCGGTCAGGTACAGGTTTTGCGAGCCTACCACTGGCAGGTCGTCGGTACGCTTGACCTCGAACATGGTGTTGCTGGTCCACTGGCTGTTCTGCCAGCTCCACACTTGTCCGGTGAACTCGCGGAAGTTGATTTCCGGGTCGAAGTTGGTGGCAAAGTACTTGCCATGCGAACCGGCATTGACGTCGAGAATATCGATCGAATCAATGCTGTCGAAATACTGCTGCTGCGCCAGCTTGGCGTAGCTGTTCA > KT2440/3323210‑3323462 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |