| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | KT2440 | 272,715 | C→G | 6.6% | A194A (GCG→GCC) | yecS_1 ← | L‑cystine transport system permease proteinYecS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | KT2440 | 272,715 | 0 | C | G | 6.6% | 170.8 / 5.9 | 61 | A194A (GCG→GCC) | yecS_1 | L‑cystine transport system permease proteinYecS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (39/18); new base G (2/2); total (41/20) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.91e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.84e-01 | |||||||||||
TCTGGCCCTTGAACCGCTTGGTCAGGCCTTTGACTTCAATCATGCTCAATGCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCT‑TTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAG > KT2440/272583‑272849 | tCTGGCCCTTGAACCGCTTGGTCAGGCCTTTGACTTCAATCATGCTCAATGCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATgaccgc > 5:376440/1‑135 (MQ=255) cTGGCCCTTGAACCGCTTGGTCAGGCCTTTGACTTCAATCATGCTCAATGCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATgaccgcg > 7:286660/1‑135 (MQ=255) ccTTGAACCGCTTGGTCAGGCCTTTGACTTCAATCATGCTCAATGCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATgaccgcgaccgc > 3:272988/1‑135 (MQ=255) ccGCTTGGTCAGGCCTTTGACTTCAATCATGCTCAATGCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCTCGACCGCCACGAAc > 8:282085/1‑135 (MQ=255) ccGCTTGGTCAGGCCTTTGACTTCAATCATGCTCAATGCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTAc > 8:1649/1‑135 (MQ=255) ccGCTTGGTCAGGCCTTTGACTTCAATCATGCTCAATGCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTAc > 7:384621/1‑135 (MQ=255) ccGCTTGGTCAGGCCTTTGACTTCAATCATGCTCAATGCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTAc > 7:338670/1‑135 (MQ=255) cTTGGTCTGGCCTTTGACTTCAATCATGCTCAATGCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATg < 4:48064/135‑1 (MQ=255) cTTGGTCAGGCCTTTGACTTCAATCATGCTCAATGCTCCTGGGCATGCTGGTTGCCCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATg < 8:358362/135‑1 (MQ=255) cTTGGTCAGGCCTTTGACTTCAATCATGCGCAATGCTCCTGGACATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCCTGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTACATGACCGCGACCGCCACGTACATg < 6:195018/135‑1 (MQ=255) tGGTCAGGCCTTTGACTTCAATCATGCTCAATGCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGt < 6:384193/135‑1 (MQ=255) ggTCAGGCCTTTGACTTCAATCATGCTCAATGCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGt > 8:63913/1‑134 (MQ=255) ggTCAGGCCTTTGACTTCAATCATGCTCAATGCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGt > 6:202599/1‑134 (MQ=255) ggTCAGGCCTTTGACTTCAATCATGCTCAATGCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTg > 2:334797/1‑135 (MQ=255) gTCAGGCCTTTGACTTCAATCATGCTCAATGCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGt < 7:221630/133‑1 (MQ=255) gTCAGGCCTTTGACTTCAATCATGCTCAATGCTCCTGGGCATGCTGGTGGACCCGCGCTTCCATGCGGTGCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGt < 7:63970/133‑1 (MQ=255) ggCCTTTGACTTCAATCATGCTCAATGCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAacac > 7:273685/1‑135 (MQ=255) tttGACTTCAATCATGCTCAATGCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGTAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTc > 6:300276/1‑134 (MQ=255) tttGACTTCAATCATGCTCAATGCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCCCGTACATGGTGAACACTTc > 2:352295/1‑134 (MQ=255) cTTCAATCATGCTCAATGCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGt > 2:206683/1‑135 (MQ=255) cTTCAATCATGCTCAATGCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCAGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGt > 2:70099/1‑135 (MQ=255) aaTCATGCTCAATGCTCCTGGGCATGCGGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGACGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTgc < 7:246456/133‑1 (MQ=255) tCAATGCGCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGACGGGCGCAAGTAGGCTCCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAAt < 6:29154/135‑1 (MQ=255) gCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACGGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCt < 4:126028/135‑1 (MQ=255) gCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACGGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCt < 4:132111/135‑1 (MQ=255) gCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACGGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCt > 3:126028/1‑135 (MQ=255) gCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACGGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCt > 3:132111/1‑135 (MQ=255) gCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCt > 8:174542/1‑135 (MQ=255) tCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTgg > 1:110979/1‑135 (MQ=255) tCCTGGACATGGGGGGTCACCGGCGATTCCTTGCGGTTCTGTACGTGCGCACGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTgg < 5:102294/135‑1 (MQ=255) tGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCt < 5:202599/135‑1 (MQ=255) gTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTg > 6:320147/1‑135 (MQ=255) gTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTg > 5:29154/1‑135 (MQ=255) tGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCg < 6:197858/134‑1 (MQ=255) gCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGa > 5:287873/1‑135 (MQ=255) tGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGa > 1:262773/1‑133 (MQ=255) tGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGa > 8:247155/1‑133 (MQ=255) ggTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATgaccgcgaccg > 1:126721/1‑75 (MQ=255) ggTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATgaccgcgaccg < 2:126721/75‑1 (MQ=255) ggTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACa > 6:316981/1‑135 (MQ=255) ggTTGACCCGCGCTTCAATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGCTGAACACATCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGATGTGCTTGGCGGAACa > 6:316978/1‑135 (MQ=255) tCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTcgccg < 8:273685/135‑1 (MQ=255) aaGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAgg < 5:135553/135‑1 (MQ=255) cgcAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGgt < 8:107001/135‑1 (MQ=255) cAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCTACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGTTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTCGATGGTCGCAGCCAGCGCGgtgt > 5:281236/1‑135 (MQ=255) cAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGCACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACCGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCTGGGCGgtgt > 8:285738/1‑135 (MQ=255) cAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCTGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGgtgt > 6:262015/1‑135 (MQ=255) cAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGgtgt > 3:297504/1‑135 (MQ=255) cAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGgtgt > 4:159343/1‑135 (MQ=255) cAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGgtgg > 2:188149/1‑134 (MQ=255) gctgcACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCT‑TTAc < 8:338670/135‑1 (MQ=255) tgcACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCT‑TTACCa < 2:110979/135‑1 (MQ=255) cacaGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGACCAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCT‑TTACCAg > 1:58992/1‑134 (MQ=255) cacaGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCT‑TTACCAg > 2:7828/1‑134 (MQ=255) cacaGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCT‑TTACCAg > 8:176480/1‑134 (MQ=255) cacaGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCT‑TTACCAGc > 3:307231/1‑135 (MQ=255) cacaGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGGAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGGGTGCTGTTAccgc > 5:60955/1‑133 (MQ=255) aGCACCCAGGAGACGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCT‑TTACCAGCgag < 7:343606/135‑1 (MQ=255) gCACCCATTAGCTGCCCGCGACCGCCACGTACATGGTTAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCT‑TTACCAGCgaga < 1:334797/135‑1 (MQ=255) ccAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCT‑TTACCAGCGAGATGaa > 5:229302/1‑135 (MQ=255) ccAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCT‑TTACCAGCGAGATGaa > 4:126932/1‑135 (MQ=255) aGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCT‑TTACCAGCGAGATGAAGc > 5:322659/1‑135 (MQ=255) gTAGATGACCTCGACAGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGAGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCT‑TTACCAGCGAGATGAAGCt > 6:176075/1‑135 (MQ=255) gTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCT‑TTACCAGCGAGATGAAGCt > 7:75332/1‑135 (MQ=255) aGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCG‑TTACCAGCGAGCTGACGCTGt > 6:31984/1‑135 (MQ=255) aGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGGCCG‑TTACCCGCGAGATGAAGCTGt > 2:375494/1‑135 (MQ=255) accgcgaccgcCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCg > 5:285457/1‑102 (MQ=255) accgcgaccgcCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCg < 6:285457/102‑1 (MQ=255) accgcgaccgcCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCT‑TTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGc > 8:217073/1‑133 (MQ=255) accgcgaccgcCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCT‑TTAACCGCCTCATGAAGCTGTTGccc > 5:393455/1‑135 (MQ=255) ccgcgaccgcCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCT‑TTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCa > 1:19447/1‑135 (MQ=255) cgcgaccgcCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCT‑TTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAg > 4:42935/1‑135 (MQ=255) cgcgaccgcCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCT‑TTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAg > 4:7136/1‑135 (MQ=255) | TCTGGCCCTTGAACCGCTTGGTCAGGCCTTTGACTTCAATCATGCTCAATGCTCCTGGTCATGCTGGTTGACCCGCGCTTCCATGCGGTTCTGGAAGTGCGCAAGGATGCTGCACAGCACCCAGTAGATGACCGCGACCGCCACGTACATGGTGAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCT‑TTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAG > KT2440/272583‑272849 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |