Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | KT2440 | 3,138,367 | 0 | T | G | 37.3% | 70.0 / 24.0 | 67 | F240V (TTT→GTT) | rbsC_2 | Ribose import permease protein RbsC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (16/26); new base G (25/0); total (41/26) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.57e-08 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
CACGCCATTCGGCCTGCGTCTGTACGCCATCGGAGAATACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTCGGCGGCCTGGTTCAGCGGCAGCACCACCGGTTCCGGCGAGATGCTGCTGTCCGTGGTGGCCATCGCTTTTCTTGGGGTGATCTTCTCCCAGCGTCTGCAGCCGAGCATCGGCGGCACGCTGCTGGCAAC > KT2440/3138237‑3138503 | cacGCCATTCGGCCTGCGTCTGTACGCCATCGGAGAATACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGtt < 4:131707/137‑1 (MQ=255) cacGCCATTCGGCCTGCGTCTGTACGCCATCGGAGAATACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGtt < 6:178828/137‑1 (MQ=255) cacGCCATTCGGCCTGCGTCTGTACGCCATCGGAGAATACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGtt < 5:398258/137‑1 (MQ=255) cacGCCATTCGGCCTGCGTCTGTACGCCATCGGAGAATACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GGgttgtt > 7:383946/1‑137 (MQ=255) acGCCATTCGGCCTGCGTCTGTACGCCATCGGAGAATACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GGTGTGttt > 4:241220/1‑136 (MQ=255) ccATTCGGCCTGCGTCTGTACGCCATCGGAGAATACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTcggc < 1:125878/137‑1 (MQ=255) aTTCGGCCTGCGTCTGTACGCCATCGGAGAGTACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GGTTTGTTcggcgg > 2:256344/1‑137 (MQ=255) aTTCGGCCTGCGTCTGTACGCCATCGGAGAGTACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GGTTTGTTaggcgg > 4:22483/1‑137 (MQ=255) aTTCGGCCTGCGTCTGTACGCCATCGGAGAATACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GGTTTGTTgggggg > 7:166365/1‑137 (MQ=255) gCCTGCGTCTGTACGCCATCGGAGAATACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTCGGCGGCCTgg < 3:152525/137‑1 (MQ=255) gCCTGCGTCTGTACGCCATCGGAGAATACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTCGGCGGCCTgg > 8:143662/1‑137 (MQ=255) gCCTGCGTCTGTACGCCATCGGAGAATACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GGTTTTTTAGGCGGCCggg > 1:351082/1‑137 (MQ=255) gCCTGCGTCTGTACGCCATCGGAGAATACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GGTTTGTTGGGCGGCCggg > 5:15797/1‑137 (MQ=255) gCCTGCGTCTGTACGCCATCGGAGAATACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GGTTTGTTGGGCGGCCggg > 5:461976/1‑137 (MQ=255) ccTGCGTCTGTACGCCATCGGAGAATACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTCGGCGGCCTGGt < 2:418034/137‑1 (MQ=255) tCTGTACGCCATCGGAGAATACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTCGGCGGCCTGGTTCAGCg < 1:147404/137‑1 (MQ=255) tCTGTACGCCATCGGAGAATACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTCGGCGGCCTGGTTCAGCg > 6:212352/1‑137 (MQ=255) tCTGTACGCCATCGGAGAATACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTAGGCGGCCGGGTTGAGCg > 4:15056/1‑137 (MQ=255) gTACGCCATCGGAGAATACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTCGGCGGCCTGGTTCAGCGgca < 1:192457/137‑1 (MQ=255) aCGCCATCGGAGAATACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTCGGCGGCCTGGTTCAGCGgcagc < 8:66670/137‑1 (MQ=255) gCCATCGGAGAATACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTCGGCGGCCTGGTTCAGCGGCAGcac < 7:143662/137‑1 (MQ=255) gCCATCGGAGAATACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTCGGCGGCCGGGGTCAGCGGCCGcac > 6:369186/1‑137 (MQ=255) cATCGGAGAATACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GGTTTGTTGGGCGGCCTGGTTCAGCGGCAGcaccc > 1:102873/1‑136 (MQ=255) aTCGGAGAATACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTCGGCGGGCTGGTTAAGCGGCAGcaccac > 4:405459/1‑137 (MQ=255) tCGGAGAATACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTCGGCGGCCTGGTTCACCGGCAGCcccacc > 6:79640/1‑137 (MQ=255) tCGGAGAATACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTAGGCGGCCTGGTTCAGCGGCAGCaccacc > 1:19385/1‑137 (MQ=255) cGGAGAATACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTAGGCGGCCTGGTTCAGCGGCCGCaccaccc > 4:194319/1‑136 (MQ=255) cGGAGAATACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GGTTTGTTGGGCGGCCGGGTTACTCGGCAGCccccccc > 6:34049/1‑136 (MQ=255) cGGAGAATACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GGTTTGTTAGGCGGCCGGGTTCAGCGGCaccaccaccc > 2:364450/1‑136 (MQ=255) gagaATACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GGTTTGTTGGGCGGCCTGGTTCCGCGGCCGcccccaccgt > 3:183369/1‑131 (MQ=255) aTACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCTGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTCGGCGGCCTGGTTCAGCGGCAGCACCACCGGTTCCg < 3:377264/137‑1 (MQ=255) gAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTCGGCGGCCTGGTTCAGCGGCAGCACCACCGGTTCCGGCGAGAt < 8:298886/137‑1 (MQ=255) gAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GGTTTGTTAGGCGGCCTGGGTCAGCGGCAGCACCACCGGTTACCGCGAGAt > 1:10630/1‑137 (MQ=255) gcggcTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GGTTTGTTAGGCGGCCGGGTTGAGCGGCCGCCCCCCCCGTTCCGGCGAGAtgct > 6:280111/1‑137 (MQ=255) ggcTAATGCCGCTGGGCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTCGGCGGCCTGGTTCAGCGGCAGCACCACCGGTTCCGGCGAGAtgctgc < 5:229610/137‑1 (MQ=255) cTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GGTTTGTTGGGCGGCCGGGTTCAGCGGCAGCACCCCCGGTTCCGGCGAGATGcttctg > 6:287540/1‑137 (MQ=255) cTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGACAGCCTGGCCGC‑GGTTTGTTCGGGGGCCGGGGTAAGCCGCAGCACCACCCGTTCGGGCGAGATGctggtg > 5:374315/1‑137 (MQ=255) aTGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTTCGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTGGGCGGGCGGGGTACGCCGGCGCACCAGCGGGTGCGGCGAGATGgtggtgggc > 7:436437/1‑134 (MQ=255) cGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTCTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GGTTTGTTCGGGTGCCTGGTTACGCGGCAGCACCACCGGTTCCGGCGAGCTGCTGCTGTCCgtgg > 5:160495/1‑137 (MQ=255) ggCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTCCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTTGGCGGGCGGGTTGAGCGGCAGCACCACAGGTTCCGGCGAGTTTCTGCGGTGCgtggttgg > 6:444864/1‑134 (MQ=255) gCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGTCCGC‑GGTTTGTTGGGCGGGCGGGTTGAGCCGCCGCACACCCGGGGCCGGCGCGATGCTGTGGTTCGtggtgggg > 2:444878/1‑135 (MQ=255) gCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GGTTTGTTGGGGGGCCGGGGTCAGCGGCCGCCCCACCCGGTGCGGGGAGATGCTGCGGTGCGtggggggc > 4:282121/1‑135 (MQ=255) cTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTCGGCGGCCTGGTTCAGCGGCAGCACCACCGGTTCCGGCGAGATGCTGCTGTCCGTGGTGGCCAt < 4:293421/137‑1 (MQ=255) gTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GGTTTGTTCGGCGGCCTGGTTCAGCGGCAGCACCCCCGGTTGCGGCGAGATGCTGCTGTCCGTGGTGGGCATCgggtt > 4:112967/1‑133 (MQ=255) ggggCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTCGGCGGCCTGGTTCAGCGGCAGCACCACCGGTTCCGGCGAGATGCTGCTGTCCGTGGTGGCCATCGCTTTTCtt < 2:273423/135‑1 (MQ=255) gTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTCGGCGGCCTGGTTCAGCGGCAGCACCACCGGTTCCGGCGAGATGCTGCTGTCCGTGGTGGCCATCGCTTTTCtt < 2:120796/137‑1 (MQ=255) tGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTGGGCGGCCGGGGTGAGCGGCAGCACCACCGGTTCCGGCGAGATGCTGCTGTCCGTGGGGGCCCTCGCTTTTCTTg > 4:428413/1‑137 (MQ=255) gggCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTCGGCGGCCTGGTTCAGCGGCAACACCACCGGTTCCGGCGAGATGCTGCTGTCCGTGGTGGCCATTGCTTTTCTTg < 6:36794/136‑1 (MQ=255) ggCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTCGGCGGCCTGGTTCAGCGGCAGCACCACCGGTTCCGGCGAGATGCTGCTGTCCGTGGTGGCCATCGCTTTTCTTgg < 2:71568/137‑1 (MQ=255) aCGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTCGGCGGCCTGGTTCAGCGGCAGCACCACCGGTTCCGGCGAGATGCTGCTGTCCGTGGTGGCCATCGCTTTTCTTGGGGTg > 6:211025/1‑137 (MQ=255) aCGTGTTCGCAAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTGGGCGGCCTGGGTGAGACGCAGCACAAACGGTTCCGGCGAGATGCTTCTGTGAGGTGTGGTCATCGGGTTTATTGGGGTg > 5:39545/1‑137 (MQ=255) gtTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGCGGTTTTGTT‑GGCGGCCTGGGTCAGCGGCCGCACCACCCGGTGCGGCGAGATGCTGCTGTCCGTGGGGGGCATCGCGTTTGTTgggggggtgt > 1:133106/1‑131 (MQ=255) gCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTCGGCGGCCTGGTTCAGCGGCAGCACCACCGGTTCCGGCGAGATGCTGCTGTCCGTGGTGGCCATCGCTTTTCTTGGGGTGATCTtctc < 2:133106/137‑1 (MQ=255) gCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTCGGCGGCCTGGTGCAGCGGCAGCACCACCGGTTCCGGCGAGATGCTGCTGTCCGTGGTGGCCATCGCTTTTCTTGGGGTGATCTtctc < 4:95319/137‑1 (MQ=255) ccAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GGTTTGTTCGGCGGCCTGGTTCAGCGGCAGCACCACCGGTTCCGGCGAGATGCTGCTGTCCGTGGTGGCCATCGCTTTTCTTGGGGTGATCTTCTcc > 5:428771/1‑137 (MQ=255) aCCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTCGGCGGCCTGGTTCAGCGGCAGCACCACCGGTTCCGGCGAGATGCTGCTGTCCGTGGTGGCCATCGCTTTTCTTGGGGTGATCTTCTCCCAGCGt < 4:303799/137‑1 (MQ=255) aCCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTCGGCGGCCTGGTTCAGCGGCAGCACCACCGGTTCCGGCGAGATGCTGCTGTCCGTGGTGGCCATCGCTTTTCTTGGGGTGATCTTCTCCCAGCGt < 5:287540/137‑1 (MQ=255) ccTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GGTTTGTTGGGGGGCCGGGTTCAGCGGCCGCCCCCCCGGGTCCGGCGCGATGCTGCGGTCCGGGGTGGGCCTCGCGTTTGTTGGGGGGGTGTTGTCCCcgcggc > 3:265517/1‑135 (MQ=255) gggcTGTGCGGCCGCCGGGCCGC‑GTTTTGTTCGGCGGCCTGGTTCAGCGGCAGCACCACCGGTTCCGGCGAGATGCTGCTGTCCGTGGTGGCCATCGCTTTTCTTGGGGTGATCTTCTCCCAGCGTCTGCAGCCGAg < 5:34049/134‑1 (MQ=255) ggTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTCGGCGGCCTGGTTCAGCGGCAGCACCACCGGTTCCGGCGAGATGCTGCTGTCCGTGGTGGCCATCGCTTTTCTTGGGGTGATCTTCTCCCAGCGTCTGCAGCCGAg < 1:364450/137‑1 (MQ=255) tCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GGTTTGTTGGGCGGGCGGGTTGAGCGGCCGCACCACCCGGTCCGGCGCGATGCTGCGGTGCGTGGTGGCCCTCGGGTTTATTTGGGGGGTCTTCTCCCAGCGTCTTCAGCCgcgcc > 6:296178/1‑136 (MQ=255) cTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTTTTCCGAGGGCTGGTTAAGCGGCAGCCACACCAGTGTAGGCGAGATGGTTCTGTCCGTGGTGGGCCTCGCTTTTGTGTGGGGGATCTTATACCAGCGTCTTCAGCCgcggcg > 8:421192/1‑132 (MQ=255) tgtgCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTCGGCGGCCTGGTTCAGCGGCAGCACCACCGGTTCCGGCGAGATGCTGCTGTCCGTGGTGGCCATCGCTTTTCTTGGGGTGATCTTCTCCCAGCGTCTGCAGCCGAGCAta > 4:222520/1‑136 (MQ=255) gCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTCGGCGGCCTGGTTCAGCGGCAGCACCACCGGTTCCGGCGAGATGCTGCTGTCCGTGGTGGCCATCGCTTTTCTTGGGGTGATCTTCTCCCAGCGTCTGCAGCCGAGCATCggcggc < 7:127655/137‑1 (MQ=255) aGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTCGGCGGCCTGGTTCAGCGGCAGCACCACCGGTTCCGGCGAGATGCTGCTGTCCGTGGGGGCCATCGCTTTTCTTGGGGTGATCTTCTCCCAGCGTCTGCAGCCGAGCATCGGCGGCAc < 8:166365/137‑1 (MQ=255) cTGGCCGC‑GGTTTGTTCGGCGGCCGGGTTGAGCGGCAGCACCACCGGGTCCGGCGAGATGCTGCTGTCCGTGGTGGGCCTCGCGTTTCTTGGGGTGTTCTTCTCCCAGCGTCTGCAGCCGAGCATCGGCGGCCCgcg > 8:314575/1‑136 (MQ=255) gc‑gGTTTGTTAGGCGGCCGGGTTAAGCCGCCGCACCACCCGGTCCGGCGAGATGCTGCTGGCCGGGGGGGCCATCGGGTTTCTTGGGGTGGTATTATACCACCCTCAGCAGCCCCCCATACGCCGCACgctgggggg > 4:347567/1‑132 (MQ=255) ttttGTTCGGCGGCCTGGTTCAGCGGCAGCACCACCGGTTCCGGCGAGATGCTGCTGTCCGTGGTGGCCATCGCTTTTCTTGGGGTGATCTTCTCCCAGCGTCTGCAGCCGAGCATCGGCGGCACGCTGCTGGCAAc < 8:383946/137‑1 (MQ=255) | CACGCCATTCGGCCTGCGTCTGTACGCCATCGGAGAATACCCGGAGGCGGCTAATGCCGCTGGCCTGTCGGTGCGTGGCTACGTGTTCGCCAGCTACCTGATCAGCGGTCTGTGCGGCAGCCTGGCCGC‑GTTTTGTTCGGCGGCCTGGTTCAGCGGCAGCACCACCGGTTCCGGCGAGATGCTGCTGTCCGTGGTGGCCATCGCTTTTCTTGGGGTGATCTTCTCCCAGCGTCTGCAGCCGAGCATCGGCGGCACGCTGCTGGCAAC > KT2440/3138237‑3138503 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |