Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC | NZ_CP009273 | 914,673 | (ATATG)1→2 | intergenic (‑133/‑18) | ybjX ← / → macA | VirK/YbjX family protein/macrolide transporter subunit MacA |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NZ_CP009273 | = 914668 | 0 (0.000) | 204 (1.160) +ATATG |
155/476 | 0.0 | 100% | intergenic (‑128/‑23) | ybjX/macA | VirK/YbjX family protein/macrolide transporter subunit MacA |
? | NZ_CP009273 | 914669 = | 0 (0.000) | intergenic (‑129/‑22) | ybjX/macA | VirK/YbjX family protein/macrolide transporter subunit MacA |
Only 100 of 209 total aligned reads displayed.
TACGGCGATGCCAGAATTTACCCGGCCGACACTGTCCACGTGCCAGACTAAGAAAAAGTGACAGGCTGCTGAGAGATTCAGATGGCGTAAAGGTCCGTTCAGTTAGCTGCGACATATTCATGAAATCAATGGTTATACATGGCGTCGATTTCACCATTGCGTATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATATTTCGTTGAAGTTAATGACCCGGATTGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NZ_CP009273/914420‑914668 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATATGGAGTATTCAGAAAATTTATGAAAAAGCGGAAAACCGTGAAGAAGCGTTACGTTATTGCGCTGGTGATAGTCATCGCCGGACTGATTACGTTATGGAGAATTCTTAACGCACCCGTGCCGACTTATCAGACGCTGATTGTGCGCCCCGGTGATTTACAGCAAAGCGTGCTGGCGACCGGAAAGCTGGACGCGCTGCGTAAGGTTGATGTGGGCGCGCAGGTCAGCGGTCAGTTGAAAACTCTGT > NZ_CP009273/914669‑914916 ||||| TACGGCGATGCCAGAATTTACCCGGCCGACACTGTCCACGTGCCAGACTAAGAAAAAGTGACAGGCTGCTGAGAGATTCAGATGGCGTAAAGGTCCGTTCAGTTAGCTGCGACATATTCATGAAATCAATGGTTATACATGGCGTCGATTTCACCATTGCGTATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATATTTCGTTGAAGTTAATGACCCGGATTGGCA > 2:523889/1‑250 CGGCGATGCCAGAATTTACCCGGCCGACACTGTCCACGTGCCAGACTAAGAAAAAGTGACAGGCTGCTGGGAGATTCAGATGGCGTAAAGGTCCGTTCAGTTAGCTGCGACATATTCATGAAATCAATGGTTATACATGGCGTCGATTTCACCATTGCGTATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATATTTCGTTGAAGTTAATGACCCGGATTGGCATA > 1:1356406/1‑250 CGGCGATGCCAGAATTTACCCGGCCGACACTGTCCACGTGCCAGACTAAGAAAAAGTGACAGGCTGCTGAGAGATTCAGATGGCGTAAAGGTCCGTTCAGTTAGCTGCGACATATTCATGAAATCAATGGTTATACATGGCGTCGATTTCCCCATTGCGTATCTTAACTAAACATCAATAGTGTTTTTACTACCGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATATTTCATTGAAGTTAATGACCCGGTTTGGTATA > 2:1565052/1‑250 GCGATGCCAGAATTTACCCGGCCGACACTGTCCACGTGCCAGACTAAGAAAAAGTGACAGGCTGCTGAGAGATTCAGATGGCGTAAAGGTCCGTTCAGTTAGCTGCGACATATTCATGAAATCAATGGTTATACATGGCGTCGATTTCACCATTGCGTATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATATTTCGTTGAAGTTAATGACCCGGATTGGCATATG < 1:1656190/250‑1 AGAATTTACCCGGCCGACACTGTCCACGTGCCAGACTAAGAAAAAGTGACAGGCTGCTGAGAGATTCAGATGGCGTAAAGGTCCGTTCAGTTAGCTGCGACATATTCATGAAATCAATGGTTATACATGGCGTCGATTTCACCATTGCGTATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATATTTCGTTGAAGTTAATGACCCGGATTGGCATATGATATGGAG > 2:236685/1‑250 AGAATTTACCCGGCCGACACTGTCCACGTGCCAGACTAAGAAAAAGTGACAGGCTGCTGAGAGATTCAGATGGCGTAAAGGTCCGTTCAGTTAGCTGCGACATATTCATGAAATCAATGGTTATACATGGCGTCGATTTCACCATTGCGTATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATATTTCGTTGAAGTTAATGACCCGGATTGGCATATGATATGGAG < 1:983558/250‑1 ACCCGGCCGACACTGTCCACGTGCCAGACTAAGAAAAAGTGACAGGCTGCTGAGAGATTCAGATGGCGTAAAGGTCCGTTCAGTTCGCTGCGACATATTCATGAAATCAATGGTTATACATGGCGTCGATTTCACCATTGCGTATCTTAACCAAACATCCATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATATTTCGTTGAAGTTAATGACCCGGATTGGCATATGATATGGAGTATT > 1:70967/1‑247 CGGCCGACACTGTCCACGTGCCAGACTAAGAAAAAGTGACAGGCTGCTGAGAGATTCAGATGGCGTAAAGGTCCGTTCAGTTAGCTGCGACATATTCATGAAATCAATGGTTATACATGGCGTCGATTTCACCATTGCGTATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATATTTCGTTGAAGTTAATGACCCGGATTGGCATATGATATGGAGTATTCAGAAA < 1:1000928/250‑1 GGCCGACACTGTCCACGTGCCAGACTAAGAAAAAGTGACAGGCTGCTGAGAGATTCAGATGGCGTAAAGGTCCGTTCAGTTAGCTGCGACATATTCATGAAATCAATGGTTATACATGGCGTCGATTTCACCATTGCGTATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATATTTCGTTGAAGTTAATGACCCGGATTGGCATATGATATGGAGTATTCAGAAAA < 1:1402926/250‑1 GGCCGACACTGTCCACGTGCCAGACTAAGAAAAAGTGACAGGCTGCTGAGAGATTCAGATGGCGTAAAGGTCCGTTCAGTTAGCTGCGACATATTCATGAAATCAATGGTTATACATGGCGTCGATTTCACCATTGCGTATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATATTTCGTTGAAGTTAATGACCCGGATTGGCATATGATATGGAGTATTCAGAAAA > 1:506908/1‑250 GACACTGTCCACGTGCCAGACTAAGAAAAAGTGACAGGCTGCTGAGAGATTCAGATGGCGTAAAGGTCCGTTCAGTTAGCTGCGACATATTCATGAAATCAATGGTTATACATGGCGTCGATTTCACCATTGCGTATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATATTTCGTTGAAGTTAATGACCCGGATTGGCATATGATATGGAGTATTCAGAAAATTTA < 1:1579238/250‑1 ACACTGTCCACGTGCCAGACTAAGAAAAAGTGACAGGCTGCTGAGAGATTCAGATGGCGTAAAGGTCCGTTCAGTTAGCTGCGACATATTCATGAAATCAATGGTTATACATGGCGTCGATTTCACCATTGCGTATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATATTTCGTTGAAGTTAATGACCCGGATTGGCATATGATATGGAGTATTCAGAAAATTTAT > 2:61345/1‑250 TCCACGTGCCAGACTAAGAAAAAGTGACAGGCTGCTGAGAGATTCAGATGGCGTAAAGGTCCGTTCAGTTAGCTGCGACATATTCATGAAATCAATGGTTATACATGGCGTCGATTTCACCATTGCGTATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATATTTCGTTGAAGTTAATGACCCGGATTGGCATATGATATGGAGTATTCAGAAAATTTATGAAA > 2:555851/1‑248 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GCCAGACTAAGAAAAAGTGACAGGCTGCTGAGAGATTCAGATGGCGTAAAGGTCCGTTCAGTTAGCTGCGACATATTCATGAAATCAATGGTTATACATGGCGTCGATTTCACCATTGCGTATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATATTTCGTTGAAGTTAATGACCCGGATTGGCATATGATATGGAGTATTCAGAAAATTTATGAAAAAGCGGAA > 2:1480494/1‑249 CCAGACTAAGAAAAAGTGACAGGCTGCTGAGAGATTCAGATGGCGTAAAGGTCCGTTCAGTTAGCTGCGACATATTCATGAAATCAATGGTTATACATGGCGTCGATTTCACCATTGCGTATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATATTTCGTTGAAGTTAATGACCCGGATTGGCATATGATATGGAGTATTCAGAAAATTTATGAAAAAGCGGAAAA > 2:1226741/1‑250 AGAAAAAGTGACAGGCTGCTGAGAGATTCAGATGGCGTAAAGGTCCGTTCAGTTAGCTGCGACATATTCATGAAATCAATGGTTATACATGGCGTCGATTTCACCATTGCGTATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATATTTCGTTGAAGTTAATGACCCGGATTGGCATATGATATGGAGTATTCAGAAAATTTATGAAAAAGCGGAAAACCGTGAA < 1:582510/249‑1 AGAAAAAGTGACAGGCTGCTGAGAGATTCAGATGGCGTAAAGGTCCGTTCAGTTAGCTGCGACATATTCATGAAATCAATGGTTATACATGGCGTCGATTTCACCATTGCGTATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATATTTCGTTGAAGTTAATGACCCGGATTGGCATATGATATGGAGTATTCAGAAAATTTATGAAAAAGCGGAAAACCGTGAA < 2:1347418/249‑1 AGAAAAAGTGACAGGCTGCTGAGAGATTCAGATGGCGTAAAGGTCCGTTCAGTTAGCTGCGACATATTCATGAAATCAATGGTTATACATGGCGTCGATTTCACCATTGCGTATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATATTTCGTTGAAGTTAATGACCCGGATTGGCATATGATATGGAGTATTCAGAAAATTTATGAAAAAGCGGAAAACCGTG > 2:1370624/1‑247 AAAGTGACAGGCTGCTGAGAGATTCAGATGGCGTAAAGGTCCGTTCAGTTAGCTGCGACATATTCATGAAATCAATGGTTATACATGGCGTCGATTTCACCATTGCGTATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATATTTCGTTGAAGTTAATGACCCGGATTGGCATATGATATGGAGTATTCAGAAAATTTATGAAAAAGCGGAAAACCGTGAAGAAGC > 2:1091263/1‑250 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CTGAGAGATTCAGATGGCGTAAAGGTCCGTTCAGTTAGCTGCGACATATTCATGAAATCAATGGTTATACATGGCGTCGATTTCACCATTGCGTATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATATTTCGTTGAAGTTAATGACCCGGATTGGCATATGATATGGAGTATTCAGAAAATTTATGAAAAAGCGGAAAACCGTGAAGAAGCGTTACGTTATTGCG < 2:189118/250‑1 CTGAGAGATTCAGATGGCGTAAAGGTCCGTTCAGTTAGCTGCGACATATTCATGAAATCAATGGTTATACATGGCGTCGATTTCACCATTGCGTATCTTAACCAAACATCAATAGGGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTGGATATTTCGTTGAAGTTAATGACCCGGATTGGCATATGATATGGAGTATGCAGAAAATTTATGAAAAAGCGGAAAACCGTGAAGAAGCGTTACGTTATTGC < 1:1152779/249‑1 TGAGAGATTCAGATGGCGTAAAGGTCCGTTCAGTTAGCTGCGACATATTCATGAAATCAATGGTTATACATGGCGTCGATTTCACCATTGCGTATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATATTTCGTTGAAGTTAATGACCCGGATTGGCATATGATATGGAGTATTCAGAAAATTTATGAAAAAGCGGAAAACCGTGAAGAAGCGTTACGTTATTGCGC > 1:224893/1‑250 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TGTTGATATTTCGTTGAAGTTAATGACCCGGATTGGCATATGATATGGAGTATTCAGAAAATTTATGAAAAAGCGGAAAACCGTGAAGAAGCGTTACGTTATTGCGCTGGTGATAGTCATCGCCGGACTGATTACGTTATGGAGAATTCTTAACGCACCCGTGCCGACTTATCAGACGCTGATTGTGCGCCCCGGTGATTTACAGCAAAGCGTGCTGGCGACCGGAAAGCTGGACGCGCTGCGTAAGGTT > 1:179557/1‑250 TGTTGATATTTCGATGAAGTTAATGACCCGGATTGGCATATGATATGGAGTATTCAGAAAATTTATGAAAAAGCGGAAAACCGTGAAGAAGCGTTACGTTATTGCGCTGGTGATAGTCATCGCCGGACTGATTACGTTATGGAGAATTCTTAACGCACCCGTGCCGACTTATCAGACGCTGATTGTGCGCCCCGGTGATTTACAGCAAAGCGTGCTGGCGACCGGAAAGCTGGACGCGCTGCGTAAGGgt > 2:1674821/1‑248 TGATATTTCGTTGAAGTTAATGACCCGGATTGGCATATGATATGGAGTATTCAGAAAATTTATGAAAAAGCGGAAAACCGTGAAGAAGCGTTACGTTATTGCGCTGGTGATAGTCATCGCCGGACTGATTACGTTATGGAGAATTCTTAACGCACCCGTGCCGACTTATCAGACGCTGATTGTGCGCCCCGGTGATTTACAGCAAAGCGTGCTGGCGACCGGAAAGCTGGACGCGCTGCGTAAGGTTGAT > 1:498157/1‑250 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TTAATGACCCGGATTGGCATATGATATGGAGTATTCAGAAAATTTATGAAAAAGCGGAAAACCGTGAAGAAGCGTTACGTTATTGCGCTGGTGATAGTCATCGCCGGACTGATTACGTTATGGAGAATTCTTAACGCACCCGTGCCGACTTATCAGACGCTGATTGTGCGCCCCGGTGATTTACAGCAAAGCGTGCTGGCGACCGGAAAGCTGGACGCGCTGCGTAAGGTTGATGTGGGCGCGCAGGTCA < 2:666146/250‑1 TAATGACCCGGATTGGCATATGATATGGAGTATTCAGAAAATTTATGAAAAAGCGGAAAACCGTGAAGAAGCGTTACGTTATTGCGCTGGTGATAGTCATCGCCGGACTGATTACGTTATGGAGAATTCTTAACGCACCCGTGCCGCCTTATCAGACGCTGATTGTGCGCCCCGGTGATTTACAGCACAGCGCGCTGGCGACCGGACAGCTGGACGCGCTGCGTAAGGTTGATGTGGCCGCGCAGGTCAG > 2:1241992/1‑250 ATGACCCGGATTGGCATATGATATGGAGTATTCAGAAAATTTATGAAAAAGCGGAAAACCGTGAAGAAGCGTTACGTTATTGCGCTGGTGATAGTCATCGCCGGACTGATTACGTTATGGAGAATTCTTAACGCACCCGTGCCGACTTATCAGACGCTGATTGTGCGCCCCGGTGATTTACAGCAAAGCGTGCTGGCGACCGGAAAGCTGGACGCGCTGCGTAAGGTTGATGTGGGCGCGCAGGTCAGCG < 1:614148/250‑1 ATGACCCGGATTGGCATATGATATGGAGTATTCAGAAAATTTATGAAAAAGCGGAAAACCGTGAAGAAGCGTTACGTTATTGCGCTGGTGATAGTCATCGCCGGACTGATTACGTTATGGAGAATTCTTAACGCACCCGTGCCGACTTATCAGACGCTGATTGTGCGCCCCGGTGATTTACAGCAAAGCGTGCTGGCGACCGGAAAGCTGGACGCGCTGCGTAAGGTTGATGTGGGCGCGCAGGTCAGC < 1:313876/249‑1 CCGGATTGGCATATGATATGGAGTATTCAGAAAATTTATGAAAAAGCGGAAAACCGTGAAGAAGCGTTACGTTATTGCGCTGGTGATAGTCATCGCCGGACTGATTACGTTATGGAGAATTCTTAACGCACCCGTGCCGACTTATCAGACGCTGATTGTGCGCCCCGGTGATTTACAGCAAAGCGTGCTGGCGACCGGAAAGCTGGACGCGCTGCGTAAGGTTGATGTGGGCGCGCAGGTCAGCGGTCAG < 1:1198894/250‑1 GGATTGGCATATGATATGGAGTATTCAGAAAATTTATGAAAAAGCGGAAAACCGTGAAGAAGCGTTACGTTATTGCGCTGGTGATAGTCATCGCCGGACTGATTACGTTATGGAGAATTCTTAACGCACCCGTGCCGACTTATCAGACGCTGATTGTGCGCCCCGGTGATTTACAGCAAAGCGTGCTGGCGACCGGAAAGCTGGACGCGCTGCGTAAGGTTGATGTGGGCGCGCAGGTCAGCGGTCAGTT < 2:1003760/250‑1 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |