Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NZ_CP009273 | 3,632,231 | Δ75 bp | coding (1230‑1304/1500 nt) | pitA → | inorganic phosphate transporter PitA |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NZ_CP009273 | 3632231 | 3632305 | 75 | 89 [0] | [0] 89 | pitA | inorganic phosphate transporter PitA |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NZ_CP009273 | = 3632230 | 0 (0.000) | 88 (0.910) | 85/482 | 0.2 | 100% | coding (1229/1500 nt) | pitA | inorganic phosphate transporter PitA |
? | NZ_CP009273 | 3632306 = | 0 (0.000) | coding (1305/1500 nt) | pitA | inorganic phosphate transporter PitA |
AGTGGTGAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGG‑CCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGA > NZ_CP009273/3632060‑3632549 | ctacgacaagctgtcgcttgatcaacgtagccagatgcgccgcattatgctgtgcgtttctgacactatcgacaaagtggtgaagatgcctggcgtgagtgctgacgatcagcgcctgttgaagaaactgaagtccgacatgcttagcaccatcgagtatgcaccggtgtggatcatcatggcggtcgcgctggcgttaggtatcggtacgatgattggctggcgccgtgtggcaacgactatcggCCTg < 2:950069‑M2/4‑1 (MQ=255) gacaagctgtcgcttgatcaacgtagccagatgcgccgcattatgctgtgcgtttctgacactatcgacaaagtggtgaagatgcctggcgtgagtgctgacgatcagcgcctgttgaagaaactgaagtccgacatgcttagcaccatcgagtatgcaccggtgtggatcatcatggcggtcgcgctggcgttaggtatcggtacgatgattggctggcgccgtgtggcaacgactatcggCCTGGCGa < 1:102150‑M2/8‑1 (MQ=255) acaagctgtcgcttgatcaacgtagccagatgcgccgcattatgctgtgcgtttctgacactatcgacaaagtggtgaagatgcctggcgtgagtgctgacgatcagcgcctgttgaagaaactgaagtccgacatgcttagcaccatcgagtatgcaccggtgtggatcatcatggcggtcgcgctggcggtagggatcggtacggggattggctggcgccctgtggcaaagactatcggcccgggggg > 2:237395‑M2/242‑246 (MQ=255) aagctgtcgcttgatcaacgtagccagatgcgccgcattatgctgtgcgtttctgacactatcgacaaagtggtgaagatgcctggcgtgagtgctgacgatcagcgcctgttgaagaaactgaagtccgacatgcttagcaccatcgagtatgcaccggtgtggatcatcatggcggtcgcgctggcgctatgtatcggtacgatgcttggctggagccgtgagacaacgccaataggCCTCGCGAGtt > 2:588‑M2/240‑250 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |