Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 2,897,051 | 0 | C | A | 37.6% | 189.7 / 48.2 | 101 | intergenic (+318/+1055) | ygcE/queE | FGGY‑family carbohydrate kinase/7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase QueE |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (4/59); new base A (38/0); total (42/59) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.23e-23 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.42e-01 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
CAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT‑AAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCATGGAGAACTATTTTGAACATGAGGTGT > NZ_CP009273/2896816‑2897300 | cAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTGATT‑TAAAAAAAATCA‑TTaaact > 1:995549/1‑245 (MQ=255) aaCTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATT‑TAAAACCAcacccttacctc > 2:900727/1‑238 (MQ=255) cTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATT‑TAAAAAAAATCA‑TTAACCT‑C‑aa > 2:107235/1‑249 (MQ=255) cTTAAAAAATGATAACAAGTCCGATTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAACAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑aaa < 2:446361/250‑1 (MQ=255) aaaaaTGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACaa < 1:867130/250‑1 (MQ=255) aaTGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTT‑TTAAAACAATCC‑TTATCCT‑C‑aaaaaaaaa > 1:474353/1‑248 (MQ=255) gATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTG‑TAAAAACACTCA‑TTTTCCC‑C‑aaaaaaaaaaaa > 1:557951/1‑245 (MQ=255) aTAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACaa < 1:788218/249‑1 (MQ=255) tAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAc < 1:993578/250‑1 (MQ=255) gTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTTAAAAACA‑TCA‑TTTGACC‑C‑aaaaaaaa‑aaaaaaataaca > 2:763153/1‑243 (MQ=255) gTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAg < 2:947132/250‑1 (MQ=255) tCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGa < 1:609686/250‑1 (MQ=255) ccGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATT‑TAAAAACAACCA‑TTAACCT‑C‑CAAAAAAA‑AACAAAA‑ATCCAAAt > 1:63169/1‑250 (MQ=255) ggTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGAttt < 1:53849/250‑1 (MQ=255) gTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTT‑TTAAAACACACATTTATCTT‑C‑aaaaaaaa‑aaaaaaatacaaattta > 1:144659/1‑239 (MQ=255) cccGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACtt < 2:423210/249‑1 (MQ=255) ccGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TTAAAAAACCCA‑TTAACCT‑C‑AAAAAAAA‑AAAAAAA‑ATCCACATTTTTTAtttta > 1:464073/1‑248 (MQ=255) cTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCa < 1:321665/250‑1 (MQ=255) tGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATT‑TAAAAAAACACA‑TTATCCT‑C‑CAAAAAAA‑AAAAAAA‑ATCCAGATTTATTATTTataca > 2:696995/1‑245 (MQ=255) tGATGCAGGGAACAGAATAAAAACTTTAAGTAGATAGGTTTATCAGGGGAATTACAAGGAAGAAAAAATAAACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATAGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAATAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAAACACTCA‑TTAACCT‑C‑CAAAAAAA‑AAAAAAA‑ATCCCGAATTTttaattaataa > 1:157213/1‑246 (MQ=255) tGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATT‑TTAAAACACTCC‑TTATCCT‑C‑AAAACAAA‑AAAAAAC‑ATCCACATTTTTTTCTTTACCaaaa > 1:482249/1‑247 (MQ=255) cAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGaa < 2:45174/249‑1 (MQ=255) cAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGaa < 1:156356/249‑1 (MQ=255) gAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TTAAAACACTCA‑TTATCCT‑C‑AAAACAAA‑AAAAAAA‑CTCCCAATTTATTTTTTTACCaaaaaaaaaa > 1:770793/1‑241 (MQ=255) aaCATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACaa < 1:114205/250‑1 (MQ=255) aCATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTT‑TTAAAACACTCA‑TTATCCT‑C‑AAAAAAAA‑AAAAAACATTCCTAATTT‑TTAATTAAACaaaaaaaaaaca > 2:291692/1‑239 (MQ=255) ataataAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑t < 2:65709/250‑1 (MQ=255) taataaAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGATAAC‑TTAAAAACCTCATTTAGCTC‑C‑AAAACAAA‑‑AAAAAC‑ATCCCGAATTATTTCATAAACAATTAACAaaaacag > 1:84963/1‑246 (MQ=255) taaAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATT‑TAAAAAAACTAA‑TTATACTCC‑AAAAAAAA‑AAAAACC‑TACCACATTT‑TTATTTAACCAAAAAATAACaaaaataa > 2:358005/1‑243 (MQ=255) aaaaCTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATT‑TAAAAAAACACC‑TTTAACT‑C‑AAAAAAAA‑AAAAAAA‑ATCCAAATTTATTTTTTAAACCATAAAAAAAAAAA‑TTaaaa > 1:477149/1‑249 (MQ=255) tttAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATT‑TTAAAACACTCA‑TTTTCCT‑C‑CAAACAAA‑AACAAAC‑ATCCCGATTTTTTTTTTTAACAATAAATAAAAAAA‑TTAAAAAaaat > 1:881055/1‑249 (MQ=255) tttAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATT‑TAAAAAAACTCA‑TTAACCC‑C‑AAAAAAAA‑AAAAAAA‑TTCCAAATTTTTTTATTTACCAAAAAAAAAAAAAA‑TTAAAAAaaat > 1:742760/1‑249 (MQ=255) ttAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATT‑TTAAAACAACCC‑TTAACCT‑C‑CAAACAAA‑AAAAAAA‑ATCCCCATTTTTTATTTTACCAAATAAAAACAAAC‑TTTAAAAAAATAc > 1:813183/1‑250 (MQ=255) tAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAAtata < 2:122536/248‑1 (MQ=255) aaCTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACt < 1:726510/249‑1 (MQ=255) cTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑tt < 2:138716/250‑1 (MQ=255) ggTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTATACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCTCTTTATCAATGTTCACTTAAAGTAAGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCG‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TGCCAGATTTATTACATAGCCAATGAAGAACAAGC‑GTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑Ta < 2:976132/249‑1 (MQ=255) ccTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGaaaaaa < 2:138778/250‑1 (MQ=255) ccTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTAGAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGaaaaa < 1:146212/249‑1 (MQ=255) tGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTT‑TAAAAACAATAC‑TTAACCT‑CAAAAAAAAA‑AAAAAAA‑TTCCACAATTTTTA‑TTAATCAAAAAAAAAAAAAA‑ATAAAAAAAATAATT‑ATATTT‑TTAaaaaaaaaa > 2:849336/1‑248 (MQ=255) gTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAAAAACTCA‑TTATACT‑C‑AAAAAAAA‑AAAAAAA‑ATTCAGATTTATTAATTAACAAATTAATAAAAAAC‑ATAAAAAAAATAAAG‑ATATTT‑TTAaaaaaaaaat > 2:595199/1‑247 (MQ=255) cAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCa < 1:622967/250‑1 (MQ=255) aaGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCAt < 2:489051/250‑1 (MQ=255) gAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTaa < 1:728373/250‑1 (MQ=255) tAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATT‑TAAAAACACTCA‑TTATCCT‑C‑CAAACAAA‑AACAAAA‑TTCCAGATTTTTTTTTTTACCAAAAAATAAAAAAA‑TTAAAAAATATAATG‑TTATTT‑TAAAAAAAAAAATAAAAAGCAATAATTCaa > 1:608568/1‑249 (MQ=255) aaCTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAat < 2:214440/249‑1 (MQ=255) aCTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAatat < 1:630146/250‑1 (MQ=255) acTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑GAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TTAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAGTATTaaaa < 2:966081/250‑1 (MQ=255) cTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACGTTATCAATTTGCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTaaaaa < 2:127929/250‑1 (MQ=255) tCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTT‑TTAAAACACCCC‑TTAACCT‑C‑AAAAAAAA‑AAAAAAC‑TTCCAGATTTTTTTCTTTAACAATTAAAAACAAAC‑TTAAAAAAAATAATT‑TTTTTT‑TTAAAAAAAAAATAACAAGCATTAATTtaaaaataaaaa > 1:627926/1‑249 (MQ=255) gATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTaaaaaaa < 1:989732/249‑1 (MQ=255) tGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAaataa < 1:118072/250‑1 (MQ=255) cTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATT‑TAAAAAAACAAC‑TTATCCT‑C‑CAAACAAA‑AAAAAAA‑TTTCAAATTTATTATTTAATCCAAGAAAAAAAAAC‑ATAAAAAAAATAATA‑TTTTTT‑TAAAAAAAAAAATAAAAAAGATTTAATAAATATTAAAAAAaaaata > 2:327031/1‑249 (MQ=255) gAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT‑aa < 2:23650/250‑1 (MQ=255) tAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATT‑TAAAAAAAAACA‑TTTTACT‑C‑AAAAAAAA‑AAAAAAA‑TTCCAGATTTTTTATTTTACAAAATAAAAAAAAAA‑TTAAAAAAAATAATT‑TTATTT‑TAAAAAAAAAAAATAAAAGCAATAATTAAATATTAAAAAAAAAAAAAATT‑aaaaa > 2:253977/1‑249 (MQ=255) aaaaGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT‑AAAAtt < 2:711832/250‑1 (MQ=255) aaGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT‑AAAATTTc < 1:312126/250‑1 (MQ=255) aGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATA‑TTAAAAAACCCC‑TTAACCT‑C‑AAAAAAAA‑AAAAAAA‑CACTAAATTTTTTATTTTAAAAAAAAAAAAAAAAA‑TTAAAAAATATACTA‑TTATTT‑TTAAAAAAAAAATAACAAGCAATTATTAAAAATTTAAAAAATAATAAAAT‑AAAAatttt > 2:646267/1‑248 (MQ=255) cAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTT‑TAAAAAAACTCA‑TTATCCC‑C‑AAAAAAAA‑AAAAAAA‑ATTCACATTTATTTATTTAACAAAAAAAAAAAAAA‑TTAAAAAAAATACTT‑TTATTT‑TAAAAAAAAAAATAAAAAGCAATAAATTAATTTTTAAAAAATAAAAAATT‑AAAAATttttt > 2:355346/1‑248 (MQ=255) aaTACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT‑AAAATTTCTTAAc < 2:85187/250‑1 (MQ=255) cGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTT‑TAAAAACACACA‑TTATTCT‑C‑CAAACAAA‑AAAAAAA‑ATCCCGATTTTTTATTTTAACAAAAAAAAAAAAAC‑TTAAAAAAAATAATT‑TTATTT‑TTAAAAAAAAAATAAAAAACAATTATTTAAAATTAAAAAAATAAAAAAAT‑AAAAATtttttattatt > 2:798890/1‑243 (MQ=255) aaTCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT‑AAAATTTCTTAACGATTTa < 2:959012/250‑1 (MQ=255) aTCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT‑AAAATTTCTTAACGATTTaa < 1:372129/250‑1 (MQ=255) cACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT‑AAAATTTCTTAACGATTTAAGAAt < 2:457335/250‑1 (MQ=255) cACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑ATAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGAAT‑AAAATTTCTTAACGATTTAAGaag < 2:964000/250‑2 (MQ=255) aCTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTG‑TAAAACAAATCA‑TTAACATCC‑AAAAAAAA‑AAAAAAA‑TTCACAATTTTTTATTTAACAAATAAAAAAAAAAA‑TAAAAAAAAATAAT‑‑TTATTT‑TTAAAAAAAAAATAAAAAGAAATAATTAAATAATAAAAAAAGAAAAGAAT‑AAAAAATATTAAATAATTAAGAAt > 2:956199/1‑249 (MQ=255) aTCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT‑AAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATAc < 1:696995/249‑1 (MQ=255) cAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTT‑TTAAAACACTCA‑TTATCATCC‑AAAAAAAA‑AAAAAAT‑TTACA‑ATTTATTTTTTTAACAAAAAAAAAAAAAA‑CTAAAAAAAATACTT‑TTTTTT‑TAAAAAAAAAAAAAAAAAGCATTAATATAATAATATAAAAAAAAAAAATT‑AAAATTTTTTAAAAAATTTATAATCATaaaa > 2:393847/1‑249 (MQ=255) tttCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTT‑TAAAAAAACACA‑TTAACCT‑C‑AAAAAAAA‑AACAAAA‑ATCCAGATTTTTTATTTTAACAAAAAATAAAAAAC‑TTAAAAAAAATAATT‑TTTTTT‑TAAAAAAAAAAATAAAAAAGATTAATTTAATATTAAAAAAAAAAAAAATT‑AAAAATTTTTAAAGATTTAAGAAaaataaaaataa > 1:294702/1‑249 (MQ=255) aCTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAGAAAATAATAGATT‑AAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACtt < 1:786910/250‑1 (MQ=255) cTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATT‑TTAAACCACTCA‑TTATCCT‑C‑AAAAAAAA‑AAAAAAA‑ATTCAGATTTTTTATTTTAACAAAAAAAAAAAAAC‑TTAAAAAAAAAAATT‑TTATTT‑TTAAAAAAAAAATAAAAAGCATTAATTTAATATTAAAAAAAAAAAAAATT‑AAAAATTTTTTACAATTTTAAAATCATaaaaaaaaaaaatt > 1:461854/1‑244 (MQ=255) gTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTT‑TAAAAAAAATCC‑TTTGCCT‑C‑AAAAAAAA‑AACAAAA‑CTCCAAAATTTTTATTTTAACAAAGAAAAAAAAACTTTAAAAAAAAAATTT‑TTTTTT‑TAAAAAAAAAATAAAAAGAATTTATTTAAAATTTAAAAAAAAAAAAAATA‑AAAATTTTTTAA‑AATTTTAAAAACATAAAAAAAAAACATttatta > 1:795383/1‑249 (MQ=255) aTGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTT‑TTAAAACACCCA‑TTATCCC‑C‑CAAACAAA‑AAAAAAA‑ATCCCAATTTTTTATTTTTACACAGAAAAAAAAAA‑CTAAAAAAAATAATG‑TTTTTT‑TTAAAAAAAAAATAAAAAGCATTAATTTAATATTATAAAAAAAATAAATA‑AAAATTTTTTTACAACTTTTAAATAATACAAAAAAAAAttttttttaat > 2:481462/1‑242 (MQ=255) aTGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTT‑TAAAAACACAAC‑ATAGCCT‑CAAAAACAAA‑AAAAAAC‑‑TCCACCTTTTTTTTTTAACAAAAGAAAAACAAAA‑ATAAAAAAAATAATGTTTTTTT‑TAAAAAAAAAATAAAAAGGATTTAATT‑AATATTATAAAAAAAATATATT‑AAAAATTTTTAACAATTTTAAAATAATACAAAAAAAAAtttttttatat > 2:404566/1‑242 (MQ=255) aTGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT‑AAAAttt < 1:350835/208‑1 (MQ=255) tGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT‑AAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAaat < 1:20894/249‑1 (MQ=255) gAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATT‑TAAAAAAACACA‑TTAAGTT‑C‑AAAAAAAACAAAAAAC‑TTCCCGCTTCTTTACTTAACCAACGAATAAAAACA‑ATTCAAAA‑AAAATC‑TTATTCTTAAAGAAAAAA‑TAAAAAGCATTAATTTAATATTAAAAAAAAAATAAATTAAAAATTTTTTAATAATTTAA‑AATAAATAAAAAAACACTTTTTTTAtattt > 2:444027/1‑250 (MQ=255) tGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTT‑TTAAAAAAAACA‑TTAGACT‑C‑AAAAAAAA‑AAAAAAA‑ATTCACATTTTTTTCTTAAACAAAAAAAAAAAAAC‑CTAAAAAAAAAAATT‑TTTTTT‑TTAAAAAAAAAATAAAAAGCATTAAATTAAATTTAAAAAAAAAAAAAAAT‑AAAAATTTTTAAACATTTTAAAATAATAAAAAAAAAACTTTTTTTAaatttaatt > 2:905514/1‑250 (MQ=255) tCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT‑AAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTg < 1:428185/249‑1 (MQ=255) tATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT‑AAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTa < 2:250436/247‑1 (MQ=255) tATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT‑AAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTAt < 1:291692/248‑1 (MQ=255) tATTCATAAGAACTATTCATCAACAACGTATAGAGGCAGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT‑AAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGt < 2:176235/246‑1 (MQ=255) tCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGGTTTT‑TAAAAACACTCC‑TTATCCC‑C‑AAAAAAAA‑AAAAAAA‑ATACCGATTTATTTATTAAACAATAAAAAACAAAA‑CTAAAAAAAAAAAAT‑TTATTT‑TTAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAATATAAATTAAAAAAAAAAAAAATT‑AAAAATTTTTTAAAATTTAAAAATAATAAAAAAAAAACATTTATTAAATTTAATTTTTTTTAtttat > 2:836307/1‑245 (MQ=255) cATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT‑AAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATa < 2:926955/249‑1 (MQ=255) aTAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAGAAAATAATAGATT‑AAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAAt < 1:989521/250‑1 (MQ=255) aTAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT‑AAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTAATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAAt < 2:25623/250‑1 (MQ=255) aGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT‑AAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATtgt < 2:16647/250‑1 (MQ=255) aGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT‑AAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATtgt < 2:482249/250‑1 (MQ=255) aGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAAAAACTCC‑TTATCCT‑C‑AAAAAAAA‑AAAAAAA‑ATCCAAATTTATTTCTTAACCAAAAAATAAAAAAA‑TTAAAAAAAATAATG‑TTTTTT‑TAAAAAAAAAAATAAAAAGAATTAATTTAATATTAAAAAAAAAAAAAATT‑AAAAATTATTAACAATTTAAAAATAAAATAAAAAAAAATTTTATTTAATTTATTTTTTTTTATTTATAAtttt > 2:143296/1‑248 (MQ=255) aCTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT‑AAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGaa < 2:557951/250‑1 (MQ=255) ttCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT‑AAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAAcc < 1:248314/248‑1 (MQ=255) ttCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT‑AAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACct < 1:197314/249‑1 (MQ=255) atcaACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT‑AAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACctctct < 2:817424/250‑1 (MQ=255) tcaACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT‑AAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTg < 1:358005/250‑1 (MQ=255) taGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT‑AAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCATGGAGaa < 2:880676/249‑1 (MQ=255) gCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT‑AAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCATGGAGAACTAttt < 2:226612/250‑1 (MQ=255) ttATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT‑AAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCATGGAGAACTATTTTGaa > 1:198502/1‑250 (MQ=255) aTG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT‑AAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCATGGAGAACTATTTTGAAc < 1:592182/249‑1 (MQ=255) aaaCCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT‑AAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCATGGAGAACTATTTTGAACATGAg < 2:813183/249‑1 (MQ=255) ccACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT‑AAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCATGGAGAACTATTTTGAACATGAGgtgt > 2:219828/1‑250 (MQ=255) | CAACTTAAAAAATGATAACAAGTCCGGTTTATCCCCGCTGATGCAGGGAACATAATAAAAACTTTAACTAGTTCGGTTTATCCCTGTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATG‑TAAAACCACTCA‑TTAGCCT‑C‑AAAACAAA‑GACAAAC‑TTCCAGATTTATTACTTAACCAATGAATAACAAGC‑TTAAAAAATATACTG‑TTATTC‑TAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATT‑AAAATTTCTTAACGATTTAAGAATCATACAAATAACACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCATGGAGAACTATTTTGAACATGAGGTGT > NZ_CP009273/2896816‑2897300 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |