| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 4,036,390 | 0 | A | G | 41.7% | 63.6 / 11.4 | 48 | N206D (AAT→GAT) | srkA | stress response kinase SrkA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (14/14); new base G (20/0); total (34/14) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.78e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GCGGTTGGGCGTTATTTAGGGCGTATGCACCAGACGGGGCGCAAACAGCTTTTTATCCATCGCCCGACCATCGGTTTGAACGAATATCTCATTGAGCCACGCAAGCTGTTTGAGGACGCTACACTGATACCTTCCGGGTTGAAAGCGGCATTCCTGAAAGCGACAGATGAGCTGATTGCCGCCGTTACAGCACACTGGC‑GGGAAG‑ATTTCACCGTTCTGCGGCTACATGGAGACTGCCACGCCGGGAATATTCTCTGGCGCGATGGTCCAATGTTT‑GTTGATCTGGATGATGCAC‑GTAATGGTCCAGCCGTTCAGGATTTGTGGATGTTGCTC‑AATGGCGATAAAGCCGAG‑CAGCGGATGCAACTGGAAACTATTATTGAAGCTTATGAAGAATTTAGCGAGTTCGACACCGCTGAAATCGGACTGATTGAACCTTTACGCGCCATGCGTTTGGTTTATTATCTTGCCTGGCTAATGCGGCGTTGGGCTGATC > NZ_CP009273/4036144‑4036636 | gCGGTTGGGCGTTATTTAGGGCGTATGCACCAGACGGGGCGCAAACAGCTTTTTATCCATCGCCCGACCATCGGTTTGAACGAATATCTCATTGAGCCACGCAAGCTGTTTGAGGACGCTACACTGATACCTTCCGGGTTGAAAGCGGCATTCCTGAAAGCGACAGATGAGCTGATTGCCGCCGTTACAGCACACTGGC‑GGGAAG‑AGTTTACCGTTTTGCGGCGTCACTGAGACCTGCACCCCGGGGata > 2:326051/1‑250 (MQ=255) ggCGTGTTTTAGGGCTGATGCCCCAGACGGGGCGCAAACAGCTTTTTATCCATCGCCCGACCATCGGTTTGAACGTATATCTCATTGAGCCGCGCAAGCTGTTTGAGGACGCTACACTGATCCCTTCCGGGTTGAAAGCGGCATTCCGGAAAGCGACAGATGAGCTGATTGCCGCCGTTACAGCACACTGGC‑GGGAAG‑ATTTCACCGTTCTGCGGCTACATGGAGACTGCCACGCCGGGAATATTCTCTg < 2:697196/250‑1 (MQ=255) gTTATTTAGGGCGTATGCACCAGACGGGGCGCAAACAGCTTTTTATCCATCGCCCGACCATCGGTTTGAACGAATATCTCATTGAGCCACGCAAGCTGTTTGAGGACGCTACACTGATACCTTCCGGGTTGAAAGCGGCATTCCTGAAAGCGACAGATGAGCTGATTGCCGCCGTTACAGCACACTGGCGGGGAAG‑TTTTACCCGTT‑TGCGGGACAATGGGGAACGGCACGCCGGGGAAATTCTCTgggg > 2:280899/1‑248 (MQ=255) gTTATTTAGGGCGTATGCACCAGACGGGGCGCAAACAGCTTTTTATCCATCGCCCGACCATCGGTTTGAACGAATATCTCATTGAGCCACGCAAGCTGTTTGAGGACGCTACACTGATACCTTCCGGGTTGAAAGCGGCATTCCTGAAAGCGACAGATGAGCTGATTGCCGCCGTTACAGCACACTGGC‑GGGAAG‑ATTTCACCGTTTTGCGGCCACCAGGAGAACGCCACGCCGGGGAAAtttttttggg > 1:243582/1‑242 (MQ=255) gTTATTTAGGGCGTATGCACCAGACGGGGCGCAAACAGCTTTTTATCCATCGCCCGACCATCGGTTTGAACGAATATCTCATTGAGCCACGCAAGCTGTTTGAGGACGCTACACTGATACCTTCCGGGTTGAAAGCGGCATTCCTGAAAGCGACAGATGAGCTGATTGCCGCCGTTACAGCACACTGGC‑GGGAAG‑ATTTCACCGGTCTGCGGCGACATGGAGACTGCCACGCCGGGGATATTTTCTGgcg > 1:536614/1‑250 (MQ=255) ttATTTAGGGCGTATGCACCAGACGGGGCGCAAACAGCTTTTTATCCATCGCCCGACCATCGGTTTGAACGAATATCTCATTGAGCCACGCAAGCTGTTTGAGGACGCTACACTGATACCTTCCGGGTTGAAAGCGGCATTCCTGAAAGCGACAGATGAGCTGATTGCCGCCGTTACAGCACACTGGC‑GGGAAG‑GATTCACCGTTCTGCGGCTGCATTGGGACAGCCACGCCGGGGATATTCTCTTgcgg > 2:827890/1‑249 (MQ=255) gTATGCACCAGACGGGGCGCAAACAGCTTTTTATCCATCGCCCGACCATCGGTTTGAACGAATATCTCATTGAGCCACGCAAGCTGTTTGAGGACGCTACACTGATACCTTCCGGGTTGAAAGCGGCATTCCTGAAAGCGACAGATGAGCTGATTGCCGCCGTTACAGCACACTGGC‑GGGGAG‑ATTTCACCGCTCTGCGGCCACATGGGGGCCGCCCCGCCGGGGATAATTTCTGGCGCGATGGGCCAAt > 2:635140/1‑250 (MQ=255) cACCAGACGGGGCGCAAACAGCTTTTTATCCATCGCCCGACCATCGGTTTGAACGAATATCTCATTGAGCCACGCAAGCTGTTTGAGGACGCTACACTGATACCTTCCGGGTTGAAAGCGGCATTCCTGAAAGCGACAGATGAGCTGATTGCCGCCGTTACAGCACACTGGC‑GGGAAG‑ATTTTACCGTTCTGCGGCTACATCGAGACTGCCACGCCGGGGATATTCTCTGGCGCGCTGGTCCAAtggtt‑g > 1:117204/1‑250 (MQ=255) gCCCGACCATCGGTTTGAACGAATATCTCATTGAGCCACGCAAGCTGTTTGAGGACGCTACACTGATACCTTCCGGGTTGAAAGCGGCATTCCTGAAAGCGACAGATGAGCTGATTGCCGCCGTTACAGCACACTGGC‑GGGAAG‑ATTTTACCGCTCTGCGGCTACATGGAGACTGCCCCGCCGGGGAAATTCTCTTGCGCGGTGGTGCCCTGTTT‑GTTGTTCTGGGTGATGCAC‑GAAATGGGCCAGCCgc > 2:861557/1‑249 (MQ=255) cGACCATCGGTTTGAACGAATATCTCATTGAGCCACGCAAGCTGTTTGAGGACGCTACACTGATACCTTCCGGGTTGAAAGCGGCATTCCTGAAAGCGACAGATGAGCTGATTGCCGCCGTTACAGCACACTGGC‑GGGGAG‑GTTTCACCCTTCTGCGGCTTCCTTGGGACTGCCCCCCCGGGGATAATTTCTTGCGCGCTTGTCCAATGTTT‑TGTTTTCTTGGTTGTGGAA‑GTGATGGTCCAGGCGTTcc > 2:517118/1‑249 (MQ=255) ccATCGGTTTGAACGAATATCTCATTGAGCCACGCAAGCTGTTTGAGGACGCTACACTGATACCTTCCGGGTTGAAAGCGGCATTCCTGAAAGCGACAGATGAGCTGATTGCCGCCGTTACAGCACACTGGC‑GGGAAG‑ATTTCACCGTTCTGCGGCTACATGGAGACTGCCACGCCGGGAATATTCTCTGGCGCGATGGTCCAATGTTT‑GTTGATCTGGATGATGCAC‑GTAATGGTCCAGCCGTTCAGGa > 1:339336/1‑250 (MQ=255) ggTTTGAACGAATATCTCATTGAGCCACGCAAGCTGTTTGAGGACGCTACACTGATACCTTCCGGGTTGAAAGCGGCATTCCTGAAAGCGACAGATGAGCTGATTGCCGCCGTTACAGCACACTGGC‑GGGAAG‑ATTTCACCGTTCTGCGGCTACATGGGGACTGCCACGCCGGGGATATTCTCTGGCGCGATGGTCCCATGTTT‑GTTGATCTGGGTGATGCAC‑GTAATGGTCCAGCCGGTCAGGGttttt > 1:452503/1‑248 (MQ=255) gTTTGAACGAATATCTCATTGAGCCACGCAAGCTGTTTGAGGACGCTACACTGATACCTTCCGGGTTGAAAGCGGCATTCCTGAAAGCGACAGATGAGCTGATTGCCGCCGTTACAGCACACTGGC‑GGGGAGAATTTTCCCGTT‑TTCGGCCAACTTGGGACCTGCACGCCGGGGATATTTTCTTGCGCGGTGGTCCCCAGTTTGGTTGTTTTGGATG‑TGGACGGTATTGGTCC‑GCCGGTCAGGATTtttg > 2:309887/1‑250 (MQ=255) tttGAACGAATATCTCATTGAGCCACGCAAGCTGTTTGAGGACGCTACACTGATACCTTCCGGGTTGAAAGCGGCATTCCTGAAAGCGACAGATGAGCTGATTGCCGCCGTTACAGCACACTGGC‑GGGAAG‑ATTTTACCGTTCTGCGGGTACATGGAGACTGCCACGCCGGGAATATTTTCTGGCGCGATGGGCCAATGTTT‑GTTGATCTGGATGATGCAC‑GGAATGGGCCAGCCGTTCAGGGTTTGTgg > 1:746764/1‑250 (MQ=255) aaTATCTCATTGAGCCACGCAAGCTGTTTGAGGACGCTACACTGATACCTTCCGGGTTGAAAGCGGCATTCCTGAAAGCGACAGATGAGCTGATTGCCGCCGTTACAGCACACTGGC‑GGGGAG‑GTTTTACCGTGCTGCGGCTCCATGGAGACCGCCACGCCGGGGATATTTTCTGGGGCGATGGTCCCCTGTTT‑GTTGTTTTGGGTGATGTCA‑GTAAGGGGACAGTCGGTCCGGGTTTTTGGGTGTTTCt > 2:446507/1‑250 (MQ=255) aTTGAGCCACGCAAGCTGTTTGAGGACGCTACACTGATACCTTCCGGGTTGAAAGCGGCATTCCTGAAAGCGACAGATGAGCTGATTGCCGCCGTTACAGCACACTGGC‑GGGAAG‑ATTTCACCGTTCTGCGGCTACATGGAGACTGCCACGCCGGGAATATTCTCTGGCGCGATGGTCCAATGTTT‑GTTGATCTGGATGATGCAC‑GTAATGGTCCAGCCGTTCAGGATTTGTGGATGTTGCTC‑AATg < 2:338739/247‑1 (MQ=255) cAAGCTGTTTGAGGACGCTACACTGATACCTTCCGGGTTGAAAGCGGCATTCCTGAAAGCGACAGATGAGCTGATTGCCGCCGTTACAGCACACTGGC‑GGGAAG‑ATTTTACCGGTCTGCGGCTACATGGAGACTGCCACGCCGGGGATATTCTCTGGCGCGGTGGGCCAATGTTT‑GTTGGTCTGGGTGATGCAA‑GGAATGGTCCAGCCGGTCAGGATTTGTGGGGGTTGGTC‑AAATGCGATAAAAACGag > 1:605952/1‑250 (MQ=255) tttGAGGACGCTACACTGATACCTTCCGGGTTGAAAGCGGCATTCCTGAAAGCGACAGATGAGCTGATTGCCGCCGTTACAGCACACTGGC‑GGGAAG‑AATTTACCGTTCTGCGGCCACATGGGGACTTCCACGCCGGGGATATTTTCTGGCGCGCTGGGCCCATGTTT‑TTTGGTCTGGGTGGTGCAC‑GTAATTGGTCAGACGGTCTGGATTTTTGGGTGTTTCTCTAAGGGCG‑TAAAACCGag‑caaga > 2:465467/1‑245 (MQ=255) tACACTGATACCTTCCGGGTTGAAAGCGGCATTCCTGAAAGCGACAGATGAGCTGATTGCCGCCGTTACAGCACACTGGC‑GGGAAG‑ATTTTACCGTTCTGCGGCTACATGGAGACTGCCACGCCGGGGATATTTTCTGGCGCGATGGTCCAATGTTT‑GTTGATCTGGATGATGCAC‑GTAATGGTCCAGCCGGTCAGGGTTTGTGGGTGTTGCTC‑AATGGCGATAAAGGCGGG‑CAGCGGGTGCCACTggt > 1:71406/1‑248 (MQ=255) tACACTGATACCTTCCGGGTTGAAAGCGGCATTCCTGAAAGCGACAGATGAGCTGATTGCCGCCGTTACAGCACACTGGC‑GGGAAG‑ATTTTACCGGTCTGCGGCTACATGGAGACTGCCCCGCCGGGAATATTCTCTGGGGCGGTGGGCCACTGGTT‑TTTGTTTTGGGTGATGCCC‑GGAATTGAGCAGCCGCTTCGGGTTTGTTGATGTTGGTC‑AATTGGGGTTAAACCGAG‑CAACGGGGGCAAATggg > 2:785596/1‑248 (MQ=255) tACACTGATACCTTCCGGGTTGAAAGCGGCATTCCTGAAAGCGACAGATGAGCTGATTGCCGCCGTTACAGCACACTGGC‑GGGAAG‑ATTTCACCGGTCTGCGGCTACATGGAGACTGCCACGCCGGGGATATTCTCTGGCGCGATGGTCCAATGTTT‑GTTGATCTGGATGATGCAC‑GTAATGGTCCAGCCGTTCAGGGTTTGTGGGTGTTGCTC‑AATGGGGGTAAAGCCGAG‑GAGCGGATGCAACTggg > 1:703648/1‑248 (MQ=255) gggTTGAAAGCGGCATTCCTGAAAGCGACAGATGAGCTGATTGCCGCCGTTACAGCACACTGGC‑GGGAAG‑ATTTCACCGTTCTGCGGCTACATGGAGACTGCCACGCCGGGAATATTCTCTGGCGCGATGGTCCAATGTTT‑GTTGATCTGGATGATGCAC‑GTAATGGTCCAGCCGTTCAGGATTTGTGGATGTTGCTC‑AATGGCGATAAAGCCGAG‑CAGCGGATGCAACTGGAAACTATTATTGAAGCtt < 1:861557/250‑1 (MQ=255) 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aTTCCTGAAAGCGACAGTTGAGCTGATTGCCGCCGTGACAGCACAGTGGC‑GGGAAG‑ATTTCACCGTTCTGCGGCTACATGGAGACTGCCACGCCGGGAATATTCTCTGGCGCGATGGTCCAATGTTT‑GTTGATCTGGATGATGCAC‑GTAATGGTCCAGCCGTTCAGGATTTGTGGATGTTGCTC‑AATGGCGATAAAGCCGAG‑CAGCGGATGCAACTGGAAACTATTATTGAAGCTTATGAAGAATTTAGc < 2:754381/250‑1 (MQ=255) aCAGATGAGCTGATTGCCGCCGTTACAGCACACTGGC‑GGGAAA‑ATTTTACCGTTCTGCGGCTACATGGAGACTGCCCCGCCCGGGATATTCTCTGGCGCGATGGTCCCATGTTT‑GTTTTTCTGGATGATGCAC‑GTAATGGTCCAGCCGTTCTGGGTTTTTTGGGGTTTCTC‑AATGGCGATAAAACCGAG‑CAGCGGGTGGCACTGGGAACTATTTTTGAAGCTTTTTGAAAATTTAGCGAGTTCGACAccc > 2:670198/1‑249 (MQ=255) aTTGCCGCCGTTACAGCACACTGGC‑GGGAAG‑ATTTCACCGTTCTGCGGCTACATGGAGACTGCCACGCCGGGAATATTCTCTGGCGCGATGGTCCAATGTTT‑GTTGATCTGGATGATGCAC‑GTAATGGTCCAGCCGTTCAGGATTTGTGGATGTTGCTC‑AATGGCGATAAAGCCGAG‑CAGCGGATGCAACTGGAAACTATTATTGAAGCTTATGAAGAATTTAGCGAGTTCGACACCGCTGAAATCGGAc < 1:517905/250‑1 (MQ=255) gccgccGTTACAGCACACTGGC‑GGGAAG‑ATTTTACCGTTCTTCGGCTACATGGGGAACGCCACCCCGGGGATATTTTCTTGCGCGATGGTCCCATGTTT‑TTTTACCTGGATGATGCAC‑GTAATGGTCCCGCCGTTCCGGATTTGTGGGTGTTGCTC‑CATGGGGATAAAGCCGAG‑CAGCGGGTGCAACTGGAAAATATTTTTGAAGCTTATGAAGAATTTAGCGAGGTCGACAACGCTGAAATCGGACTGa > 1:872666/1‑250 (MQ=255) cgccgTTACAGCACACTGGC‑GGGAAG‑ATTTTACCGTTCTGCGGCCACATGGAGACTGCCACGCCGGGAATATTCTCTGGCGCGATGGTCCAATGTTT‑GTTGATCTGGATGATGCAC‑GTAATGGGCCAGCCGGTCAGGATTTGTGGATGTTGCTC‑AATGGCGATAAAGCCGAG‑CAGCGGACGCAACTGGAAACTATTATTGAAGCTTATGAAGAATTTAGCGAGTTCGACACCGCTGAAATCGGACTGAtt > 1:221789/1‑250 (MQ=255) cgccgTTACAGCACACTGGC‑GGGAAG‑ATTTCACCGTTCTGCGGCTACATGGAGACTGCCACGCCGGGAATATTCTCTGGCGCGATGGTCCAATGTTT‑GTTGATCTGGATGATGCAC‑GTAATGGTCCAGCCGTTCAGGATTTGTGGATGTTGCTC‑AATGGCGATAAAGCCGAG‑CAGCGGATGCAACTGGAAACTATTATTGAAGCTTATGAAGAATTTAGCGAGTTCGACACCGCTGAAATCGGACTGAtt < 1:675998/250‑1 (MQ=255) cAGCACACTGGC‑GGGAAG‑ATTTCACCGTTCTGCGGCTACATGGAGACTGCCACGCCGGGAATATTCTCTGGCGCGATGGTCCAATGTTT‑GTTGATCTGGATGATGCAC‑GTAATGGTCCAGCCGTTCAGGATTTGTGGATGTTGCTC‑AATGGCGATAAAGCCGAG‑CAGCGGATGCAACTGGAAACTATTATTGAAGCTTATGAAGAATTTAGCGAGTTCGACACCGCTGAAATCGGACTGATTGAACCtt < 2:181225/249‑1 (MQ=255) cTGGC‑GGGAAG‑ATTTCACCGTTCTGCGGCTACATGGAGACTGCCACGCCGGGAATATTCTCTGGCGCGATGGTCCAATGTTT‑GTTGATCTGGATGATGCAC‑GTAATGGTCCAGCCGTTCAGGATTTGTGGATGTTGCTC‑AATGGCGATAAAGCCGAG‑CAGCGGATGCAACTGGAAACTATTATTGAAGCTTATGAAGAATTTAGCGAGTTCGACACCGCTGAAATCGGACTGATTGAACCTTTACGCGcc < 2:339336/250‑1 (MQ=255) tGGC‑GGGAAG‑ATTTCACCGTTCTGCGGCTACATGGAGACTGCCACGCCGGGAATATTCTCTGGCGCGATGGTCCAATGTTT‑GTTGATCTGGATGATGCAC‑GTAATGGTCCAGCCGTTCAGGATTTGTGGATGTTGCTC‑AATGGCGATAAAGCCGAG‑CAGCGGATGCCACTGGAAACTTTTATTGAAGCTTATTAAGAATTTAGCGAGTTCGACACCGCTGAAATCGGACTGATTGAACCTTTACGCGCCa > 2:158045/1‑250 (MQ=255) g‑ATTTCACCGTTCTGCGGCTACATGGAGACTGCCACGCCGGGAATATTCTCTGGCGCGATGGTCCAATGTTT‑GTTGATCTGGATGATGCAC‑GTAATGGTCCAGCCGTTCAGGATTTGTGGATGTTGCTC‑AATGGCGATAAAGCCGAG‑CAGCGGATGCAACTGGAAACTATTATTGAAGCTTATGAAGAATTTAGCGAGTTCGACACCGCTGAAATCGGACTGATTGAACCTTTACGCGCCATGCGTTTgg < 1:116462/250‑1 (MQ=255) cACCGTTCTGCGGCTACATGGAGACTGCCACGCCGGGAATATTCTCTGGCGCGATGGTCCAATGTTT‑GTTGATCTGGATGATGCAC‑GTAATGGTCCAGCCGTTCAGGATTTGTGGATGTTGCTC‑AATGGCGATAAAGCCGAG‑CAGCGGATGCAACTGGAAACTATTATTGAAGCTTATGAAGAATTTAGCGAGTTCGACACCGCTGAAATCGGACTGATTGAACCTTTACGCGCCATGCGTTTGGTttat > 1:806081/1‑250 (MQ=255) aCCGTTCTGCGGCTACATGGAGACTGCCACGCCGGGAATATTCTCTGGCGCGATGGTCCAATGTTT‑GTTGATCTGGATGATGCAC‑GTAATGGTCCAGCCGTTCAGGATTTGTGGATGTTGCTC‑AATGGCGATAAAGCCGAG‑CAGCGGATGCAACTGGAAACTATTATTGAAGCTTATGAAGAATTTAGCGAGTTCGACACCGCTGAAATCGGACTGATTGAACCTTTACGCGCCATGCGTTTGGTttat > 1:782374/1‑249 (MQ=255) ccGTTCTGCGGCTACATGGAGACTGCCTCGCCGGGAATATTCTCTGGCGCGATGGTCCAATGTTT‑GTTAATCTGGATGATGCAC‑GTAATGGTCCAGCCGTTCAGGATTTGTGGATGTTGCTC‑AATGGCGATAAAGCCGAG‑CAGCGGATGCAACTGGAAACTATTATTGAAGCTTATGAAGAATTTAGCGAGTTCGACACCGCTGAAATCGGACTGATTGAACCTTTACGCGCCATGCGTTTGGTttatta < 2:231612/250‑1 (MQ=255) aCATGGAGACTGCCACGCCGGGAATATTCTCTGGCGCGATGGTCCAATGTTT‑GTTGATCTGGATGATGCAC‑GTAATGGTCCAGCCGTTCAGGATTTGTGGATGTTGCTC‑AATGGCGATAAAGCCGAG‑CAGCGGATGCAACTGGAAACTATTATTGAAGCTTATGAAGAATTTAGCGAGTTCGACACCGCTGAAATCGGACTGATTGAACCTTTACGCGCCATGCGTTTGGTTTATTATCTTGCCTGGCt > 2:542672/1‑249 (MQ=255) aTGGAGACTGCCACGCCGGGAATATTCTCTGGCGCGATGGTCCAATGTTT‑GTTGATCTGGATGATGCAC‑GTAATGGTCCAGCCGTTCAGGATTTGTGGATGTTGCTC‑AATGGCGATAAAGCCGAG‑CAGCGGATGCAACTGGAAACTATTATTGAAGCTTATGAAGAATTTAGCGAGTTCGACACCGCTGAAATCGGACTGATTGAACCTTTACGCGCCATGCGTTTGGTTTATTATCTTGCCTGGCTAAt > 2:350340/1‑250 (MQ=255) agaCTGCCACGCCGGGAATATTCTCTGGCGCGATGGTCCAATGTTT‑GTTGATCTGGATGATGCAC‑GTAATGGTCCAGCCGTTCAGGATTTGTGGATGTTGCTC‑AATGGCGATAAAGCCGAG‑CAGCGGATGCAACTGGAAACTATTATTGAAGCTTATGAAGAATTTAGCGAGTTCGACACCGCTGAAATCGGACTGATTGAACCTTTACGCGCCATGCGTTTGGTTTATTATCTTGCCTGGCTAATgcgg > 1:272450/1‑250 (MQ=255) agaCTGCCACGCCGGGAATATTCTCTGGCGCGATGGTCCAATGTTT‑GTTGATCTGGATGATGCAC‑GTAATGGTCCAGCCGTTCAGGATTTGTGGATGTTGCTC‑AATGGCGATAAAGCCGAG‑CAGCGGATGCAACTGGAAACTATTATTGAAGCTTATGAAGAATTTAGCGAGTTCGACACCGCTGAAATCGGACTGATTGAACCTTTACGCGCCATGCGTTTGGTTTATTATCTTGCCTGGCTAATgcgg < 1:634967/250‑1 (MQ=255) gaCTGCCACGCCGGGAATATTCTCTGGCGCGATGGTCCAATGTTT‑GTTGATCTGGATGATGCAC‑GTAATGGTCCAGCCGTTCAGGATTTGTGGATGTTGCTC‑AATGGCGATAAAGCCGAG‑CAGCGGATGCAACTGGAAACTATTATTGAAGCTTATGAAGAATTTAGCGAGTTCGACACCGCTGAAATCGGGCTGATTGAGCCTTTACGCGCCATGCGTTTGGTTTATTATCTTGCCTGGCTAATgcggc < 2:323626/250‑1 (MQ=255) tGCCACGCCGGGAATATTCTCTGGCGCGATGGTCCAATGTTT‑GTTGATCTGGATGATGCAC‑GTAATGGTCCAGCCGTTCAGGATTTGTGGATGTTGCTC‑AATGGCGATAAAGCCGAG‑CAGCGGATGCAACTGGAAACTATTATTGAAGCTTATGAAGAATTTAGCGAGTTCGACACCGCTGAAATCGGACTGATTGAACCTTTACGCGCCATGCGTTTGGTTTATTATCTTGCCTGGCTAATGCGGCGtt > 1:510357/1‑250 (MQ=255) ccACGCCGGGAATATTCTCTGGCGCGATGGTCCAATGTTT‑GTTGATCTGGATGATGCAC‑GTAATGGTCCAGCCGTTCAGGATTTGTGGATGTTGCTC‑AATGGCGATAAAGCCGAG‑CAGCGGATGCAACTGGAAACTATTATTGAAGCTTATGAAGAATTTAGCGAGTTCGACACCGCTGAAATCGGACTGATTGAACCTTTACGCGCCATGCGTTTGGTTTATTATCTTGCCTGGCTAATGCGGCGTTgg > 1:328179/1‑250 (MQ=255) ccACGCCGGGAATATTCTCTGGCGCGATGGTCAAATGTTT‑GTTGATCTGGATGATGCAC‑GTAATGGTCCAGCCGTTAAGGATTTGTGGATGTTGCTC‑AATGGCGATAAAGCCGAG‑CAGCGGATGCAACTGGAAACTATTATTGAAGCTTATGAAGAATTTAGCGAGTTCGAGACCGCTGAAATCGGACTGATTGAACCTTTACGCGCCATGCGTTTGGTTTATTATCTTGCCTGGCTAATGCGGCGtt < 1:454867/248‑1 (MQ=255) gCCGGGAATATTCTCTGGCGCGATGGTCCAATGTTT‑GTTGATCTGGATGATGCAC‑GTAATGGTCCAGCCGTTCAGGATTTGTGGATGTTGCTC‑AATGGCGATAAAGCCGAG‑CAGCGGATGCAACTGGAAACTATTATTGAAGCTTATGAAGAATTTAGCGAGTTCGACACCGCTGAAATCGGACTGATTGAACCTTTACGCGCCATGCGTTTGGTTTATTATCTTGCCTGGCTAATGCGGCGTTGGGCt > 1:842017/1‑249 (MQ=255) gggAATATTCTCTGGCGCGATGGTCCAATGTTT‑GTTGATCTGGATGATGCAC‑GTAATGGTCCAGCCGTTCAGGATTTGTGGATGTTGCTC‑AATGGCGATAAAGCCGAG‑CAGCGGATGCAACTGGAAACTATTATTGAAGCTTATGAAGAATTTAGCGAGTTCGACACCGCTGAAATCGGACTGATTGAACCTTTACGCGCCATGCGTTTGGTTTATTATCTTGCCTGGCTAATGCGGCGTTGGGCTGATc > 1:11759/1‑250 (MQ=255) | GCGGTTGGGCGTTATTTAGGGCGTATGCACCAGACGGGGCGCAAACAGCTTTTTATCCATCGCCCGACCATCGGTTTGAACGAATATCTCATTGAGCCACGCAAGCTGTTTGAGGACGCTACACTGATACCTTCCGGGTTGAAAGCGGCATTCCTGAAAGCGACAGATGAGCTGATTGCCGCCGTTACAGCACACTGGC‑GGGAAG‑ATTTCACCGTTCTGCGGCTACATGGAGACTGCCACGCCGGGAATATTCTCTGGCGCGATGGTCCAATGTTT‑GTTGATCTGGATGATGCAC‑GTAATGGTCCAGCCGTTCAGGATTTGTGGATGTTGCTC‑AATGGCGATAAAGCCGAG‑CAGCGGATGCAACTGGAAACTATTATTGAAGCTTATGAAGAATTTAGCGAGTTCGACACCGCTGAAATCGGACTGATTGAACCTTTACGCGCCATGCGTTTGGTTTATTATCTTGCCTGGCTAATGCGGCGTTGGGCTGATC > NZ_CP009273/4036144‑4036636 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |