| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NZ_CP009273 | 3,794,325 | T→G | M1M (ATG→CTG) † | rfaY ← | lipopolysaccharide core heptose(II) kinase RfaY |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP009273 | 3,794,325 | 0 | T | G | 99.4% | 655.1 / NA | 164 | M1M (ATG→CTG) † | rfaY | lipopolysaccharide core heptose(II) kinase RfaY |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base G (69/93); total (70/94) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.29e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |