Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 1,995,392 | 0 | G | A | 43.8% | 49.5 / 25.0 | 48 | intergenic (‑122/+199) | fliA/fliC | RNA polymerase sigma factor FliA/H48 family flagellin FliC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (21/6); new base A (0/21); total (21/27) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.66e-08 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
TCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTGCAGGCGCAATGCTTCGTGACGCACCAGCGGGACATAACGCTGCCACAGCGAGTGTTTATCCATTACACCTTCAGCGGTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCG‑TTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCC‑AGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGCATCAGGCAATTTGGCGTTGCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCAGAGACAGAACCTGCTGCGGTACCTGGTTAGCT > NZ_CP009273/1995146‑1995636 | tCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTGCAGGCGCAATGCTTCGTGACGCACCAGCGGGACATAACGCTGCCACAGCGAGTGTTTATCCATTACACCTTCAGCGGTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCG‑TTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCC‑AGGC‑AGaa > 1:386696/1‑249 (MQ=255) ccACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTGCAGGCGCAATGCTTCGTGACGCACCAGCGGGACATAACGCTGCCACAGCGAGTGTTTATCCATTACACCTTCAGCGGTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCG‑TTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCC‑AGGC‑AGAAAAAAAcc < 1:125566/249‑1 (MQ=255) gcgGGCAGTCGAACCTGCAGGCGCAATGCTTCGTGACGCACCAGCGGGACATAACGCTGCCACAGCGAGTGTTTATCCATTACACCTTCAGCGGTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCG‑TTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCC‑AGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTg > 1:555663/1‑250 (MQ=255) ggCAGTCAAACCTGCGGGCGAAATGTTTCGGGACGCCCCAGGGGGACATACCGCTGCCACAGCGAGTGTTTATCCATTACACCTTCGGGGTTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCT‑TTATATGAGTTATCGGCATGATTACCGTTTTCTGCAGGGTTTTAAATCGGACGATTAGTGGGTGAAAGGAGGGTTTTTTTGGGGGTTACAGGTAAATCCC‑AGGC‑AAAAAAAACCCCCGCCGGTGGCg < 2:140572/250‑1 (MQ=255) gcgcAATGCTTCGTGACGCCCCAGCGGAACATAACGCTGCCCCAGCGAGTTTTTATCCATTACCCCTTAAGCGGTATAGAGTAAATTCACGATAAACAGCCCTGCG‑TTATATGAGTTATCGGAATGATTATCCGTTTCTGCAGGTTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTAAAATGGGGGGTTATTGGGGGGTTACAGGAAAATTCC‑AGGC‑AAAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGa < 1:425880/250‑1 (MQ=255) gcAATGCTTCGTGACGCACCAGCGGGACATAACGCTGCCACAGCGAGTGTTTATCCATTACACCTTCAGCGGTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCG‑TTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCC‑AGGC‑AGaa > 1:316127/1‑212 (MQ=255) cAATGCTTCGTGACGCACCAGCGGGACATAACGCTGCCACAGCGAGTGTTTATCCATTACACCTTCAGCGGTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCG‑TTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCC‑AGGC‑AGaaa < 2:316127/212‑1 (MQ=255) gACGCACCAGCGGGACATAACGCTGCCACAGCGAGTGTTTATCCATTACACCTTCAGCGGTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCG‑TTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCC‑AGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTa > 2:11150/1‑250 (MQ=255) cGCCCCAGCGGGACATAACGCTGCCACAGCGAGTGTTTATCCATTACCCCTTCAGCGGTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCT‑TTATATGATTTATCGGAATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTAAATCGGACGATTAGTGGGTAAAATGAGGGTTTATTTGGGGTTTACAGGTAAATTCC‑AGGC‑AAAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATg < 1:608055/250‑1 (MQ=255) ccAGCGGGACATAACGCTGCCACAGCGAGTGTTTATCCATTACACCTTCAGCGGTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCG‑TTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCC‑AGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGc > 1:235754/1‑250 (MQ=255) aGCGGGACATAACGCTGCCACAGCGAGTGTTTATCCATTACACCTTCAGCGGTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCG‑TTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCC‑AGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCg > 1:200725/1‑250 (MQ=255) aCATAACGCTGCCACAGCGAGTGTTTATCCATTACACCTTCAGCGGTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCG‑TTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCC‑AGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTCGCCGGATgcg > 2:90218/1‑250 (MQ=255) ccAAAGCGAGTTTTTATCCATTACCCCTTCAGCGGTATAGAGTGAATTCACGAAAAACAGCCTTGCT‑TTATATGATTTATCGGCATGATTATCCGTTTCGGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTAAAAGGAGGGGTTTTTGGGGGGTTACAGGAAATTTCA‑AGGC‑AAAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACg < 1:552162/248‑1 (MQ=255) acaGGGGGTTTTTATCCTTTACCCTTGCGGGGGTATAGGGTGAATTCACTAAAAAC‑GCCCTGGGTTTATATGATTTATGGGCATGTTTTTCCTTTTCTGGGGGGTTTTAAATCGGACGATTAGTGGGGAAAAGGGGGGTTTTTTTGGGGGTTACAGGTAAATCCC‑AGGA‑AAAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCtt < 2:561158/250‑1 (MQ=255) acaGCGAGTGTTTATCCATTACACCTTCAGCGGTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCG‑TTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCC‑AGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCt > 2:214166/1‑249 (MQ=255) gAGTGTTTATCCATTCCACCTTCAGCGGTAGAGAGTTATTTCACGATAAACACCCCTGCT‑TTATATGATTTATCGGCATGATTTTCCGTTTCTGCGGGTTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTGGGGGGTTACAGGTAAATCCC‑AGGC‑AAAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCg < 1:427168/250‑1 (MQ=255) tATCCATTCCCCCTTCAGCGGTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCT‑TTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTAAAATGAGGGTTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCC‑AGGC‑AGAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTAc < 1:344786/249‑1 (MQ=255) aTCCATTACACCTTCAGCGGTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCG‑TTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCC‑AGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACa > 2:258079/1‑249 (MQ=255) ccATTACCCCTCCAGGGGTATAGAGTGAATTCACAAAAACCGGCCCTGTT‑TTATAGGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGTTTTTTAAGCGGACGATTAGTGGGTGAAAGGAGGGGTTTTTTGGGGGTTACAGGTAAATTCC‑AGGA‑AAAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTCATCCGGCCTACaaaa < 2:72421/250‑1 (MQ=255) ttccacTTTCAGCGGTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCT‑TTATATGATTTATCGGAATGTTTATCCTTTTCTGCAGGGTTTTTATTCGGACGATTAGTGGGTAAAATGAGGGTTTATTTGGGGTTTACAGTTAAATCCC‑AGCA‑AAAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAtg < 1:286693/247‑1 (MQ=255) gTATAGAGTAAATTCACGATAAACCGCCCTTGT‑TTATATGAGTTATCGGCATGTTTATCGTTTTCTGGAGGGTTTTTAATGGGACGTTTGGGGGGTAAAAGGGGGGTTTTTTTGGGGGTTAAAGGTAATTCCC‑AGCA‑AAAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATaa < 2:372427/250‑1 (MQ=37) cACGATAAACAGCCCTGCG‑TTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCC‑AGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGGGCCAATTCAATAAATTGCAATTCAACt > 2:416691/1‑250 (MQ=255) 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gtaTGTTTCTCCTTTTCTGCAGGTTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAGTGGGGGTTTTTTTGGGGGTTACAGGAAAATCCC‑AGGC‑AAAAAAACCCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGCATCAGGCAAtt < 2:444441/248‑1 (MQ=37) aaTGATTATCCGTTTCTGGAGGGTTTTTAGTCGGACGATGAGTGGGTAAAAGGGGGGTTTTTTTGGGGGTTA‑GGGGAAATTCCAAGGA‑AAAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGCATCAGGCAAttt < 2:509908/249‑1 (MQ=37) aTGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCC‑AGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGCATCAGGCAATTTg > 1:169524/1‑250 (MQ=255) 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aCGATTGGGGGGTGAAAGGGGGGTTTTTTTGGGGGTTACAGGAAAATCCC‑GGGA‑AAAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGCATCAGGCAATTTGGCGTTGCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACa < 2:555663/250‑1 (MQ=37) gggggCGAAATGAGGGTTTTTTGGGGGGTTAAAGATAAATTCC‑AGCC‑AGAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCTGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGCATCAGGCAATTTGGCGTTGCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTa < 1:373523/248‑1 (MQ=38) tGGGTGAAGTGGGGGGTTTTTGGGGAGTTA‑AGGGAAAATCC‑CGGCAAGAAAAACCCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGAGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGCATCAGGCAATTTGGCGTTGCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTaa < 1:65122/250‑1 (MQ=38) gaaaaaggggggtTTATTTGGGGGTAACAGTAAAATCCA‑AGGC‑AAAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTAACCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGCATCAGGCAATTTGGCGTTGCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAAccc < 2:593605/241‑1 (MQ=38) gttgttttGGGGGTTACAGTAAAATGCC‑GGGA‑AAAAAAACCCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGCATCAGGCAATTTGGCGTTGCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCAgaga < 2:187746/245‑1 (MQ=38) ttATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCC‑AGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGCATCAGGCAATTTGGCGTTGCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCAgaga > 2:573200/1‑248 (MQ=255) tATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCC‑AGGC‑AAAAAAAACCCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGCATCAGGCAATTTGGCGTTGCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCAGAGACa < 1:129412/249‑1 (MQ=255) aTTTGGGGGTTACAGGTAAATTCC‑AGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGCATCAGGCAATTTGGCGTTGCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCAGAGACAg > 2:561756/1‑249 (MQ=255) ggggTTACAGGTAAATTCC‑AGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGCATCAGGCAATTTGGCGTTGCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCAGAGACAGAACctg > 2:235450/1‑250 (MQ=255) gTTACAGGTAAATTCC‑AGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGCATCAGGCAATTTGGCGTTGCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCAGAGACAGAACctgctg > 2:322061/1‑250 (MQ=255) ttACAGGTAAATTCC‑AGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGATAAACGCAGCGCATCAGGCAATTTGGCGTTGCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCAGAGACAGAACCtgctgc > 1:190067/1‑250 (MQ=255) aGGTAAATTCC‑AGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGCATCAGGCAATTTGGCGTTGCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCAGAGACAGAACCTGCTGCGGTa > 1:203515/1‑250 (MQ=255) ggTAAATTCC‑AGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGCATCAGGCAATTTGGCGTTGCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCAGAGACAGAACCTGCTGCGGTAc > 2:402745/1‑250 (MQ=255) aGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGCATCAGGCAATTTGGCGTTGCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCAGAGACAGAACCTGCTGCGGTACCTGGTTAGCt > 1:374093/1‑250 (MQ=255) | TCAAGTTCCACGCTCGCGGGCAGTCGAACCTGCAGGCGCAATGCTTCGTGACGCACCAGCGGGACATAACGCTGCCACAGCGAGTGTTTATCCATTACACCTTCAGCGGTATAGAGTGAATTCACGATAAACAGCCCTGCG‑TTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTAATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCC‑AGGC‑AGAAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGCATCAGGCAATTTGGCGTTGCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCAGAGACAGAACCTGCTGCGGTACCTGGTTAGCT > NZ_CP009273/1995146‑1995636 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |