New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NZ_CP009273 | 3416618 = | 62 (0.590) | 9 (0.090) +GAATTAATTCC |
8/474 | 13.2 | 10.5% | intergenic (+65/+166) | yhdZ/rrf | amino acid ABC transporter ATP‑binding protein/5S ribosomal RNA |
? | NZ_CP009273 | 4161677 = | 99 (0.950) | noncoding (111/116 nt) | rrf | 5S ribosomal RNA | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATG > NZ_CP009273/3416371‑3416864 | cTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTg < 1:464365/250‑1 (MQ=255) cGGGTATGTGAATGCTGTGCGAAACCGATGCAATGGGGGTTGCACGTAGCGTCGCTGAACGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGCGGAGGCAGCTTCACCTGATTAATTTTTTGGGCATACTAAATCAGAGCGCACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAAATGAATGTTAGTTCGTCACGCAAAAAGGCAATTCTGTCGAATGGCCTTTCGATTGATTTGATATCTGGCAGTTTa > 2:687678/1‑248 (MQ=255) ggTATGACACTGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGCAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGACGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATggc > 1:298212/1‑250 (MQ=255) gTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATggc‑g < 1:194413/250‑1 (MQ=255) tATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATggc‑gg > 1:1004262/1‑250 (MQ=255) tGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGGTGGGGGTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTATGAGTGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAAGTGAATGTTAGTTCGGAAAACAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATggc‑ggg < 2:964580/249‑1 (MQ=255) tAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCAc < 1:752042/249‑1 (MQ=255) tGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGTGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCggg < 1:757476/250‑1 (MQ=255) gagaTGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTCTGGC‑GGGGGGTCTGCGCgccgccactcggcg > 2:220898/1‑242 (MQ=255) ggggTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGCGCCGCccccccccccccccgcccctt > 1:694347/1‑241 (MQ=255) gggTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGc < 1:309856/250‑1 (MQ=255) gggTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGc < 1:78601/250‑1 (MQ=255) tGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGGTCCTCCCCCCCCCCCCCCgccccggccgctg > 2:729922/1‑237 (MQ=255) cACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑aa < 1:252529/250‑1 (MQ=255) ccttCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGTAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCa < 1:657899/247‑1 (MQ=255) tCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAAt < 2:879032/250‑1 (MQ=255) cTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGGCCTGCCCGCCCCCCCCCCGGCCGTTGCTTTGC‑AACGTTTAAATCCg > 1:487221/1‑250 (MQ=255) cTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGGCCCGCCCGCCACCCCCCCGGCGGTTGTTTCCC‑CACATCCaaaaacg > 1:768668/1‑246 (MQ=255) aCCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGGCCTGCCCCCCCCCCCCCCCGCCGTTGCGTTTC‑CAAGATCTAATCCGCTc > 2:487757/1‑250 (MQ=255) cGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAATCCGCTccc < 2:577158/250‑1 (MQ=255) gggTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAATCCGCTCCcg < 1:142573/250‑1 (MQ=255) aTTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCCCCCCCCCCCCGGCCCGTTCTTCGC‑AACCTTTTAATTCCCCCCccgc‑ggg > 1:861854/1‑249 (MQ=255) gTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCg < 1:319589/250‑1 (MQ=255) ggAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGgag < 1:378492/250‑1 (MQ=255) gAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGgaga < 1:1001879/250‑1 (MQ=255) aaaTAGTGGAGCAAGCTGCCCCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGATCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGagag < 2:1003683/250‑1 (MQ=255) aaaTAGTGGAGCAAGCGGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGagag < 2:561660/250‑1 (MQ=255) aaTAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGGGTCCTGCCCGCCCCCCCCCCGGCCGTTGCTTTGC‑AACCTTCTAATCCGCCCCCCGC‑GGGGTTGTCCTTCTCTGGggagg > 1:730658/1‑249 (MQ=255) aTAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTACTTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGGCCCGTCCGCCCCCCCCCGCGCCGTTGCTTCGC‑AACACGCTAATCATCTCCCCGC‑GGGCTTGTCCCACCCgccggggtg > 2:330071/1‑242 (MQ=255) tAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGAGAgtgt < 1:332044/250‑1 (MQ=255) aGTGGAGCAAGCTCCACCTGTTGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGtt < 2:522740/250‑1 (MQ=255) tGGATCAAGCTGCACCTGATAAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGGTCGATGTCATTTTTATCGCAGTTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCGCCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAATCCGCGCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCa < 2:794424/250‑1 (MQ=25) tGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATATTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCa < 1:99684/250‑1 (MQ=255) ggAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCAc < 2:865162/250‑1 (MQ=255) cAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTAGCGCAGGTAATCCATTAATCGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTGGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCGGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACGCGGGAGAGTGTTCACCGac < 2:952758/250‑1 (MQ=255) gatgaATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGGGTCCTGCCCCCCCCCCCCCCGGCCGTTGCTTCGCAAACGTT‑AAAACCGCCCCCCGCGGGGTTTGT‑CTACTCTGGGGAGTGTTCACCGCCAAACAACAGAt > 1:216074/1‑249 (MQ=255) atgaATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATaa < 2:756585/250‑1 (MQ=255) aTTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTAGCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACa < 2:88264/250‑1 (MQ=255) ttttGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACaaa < 1:262767/249‑1 (MQ=255) ttGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTTCCCCCCCCCCCCCCGGCCGTTTCTTCGC‑CAAGTTCTAATCCCCCCCCCGC‑GGGTTTTTCCTTCTCCGGAGAGGGTTTACCCACAAACAACCAATAAAACaaaaag > 1:254646/1‑248 (MQ=255) 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cGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCtttt < 2:128612/250‑1 (MQ=255) gAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCCCCCCCCCCCGGGCCGTTGCTTTGC‑CACCTTCAAATCCGCTCCCCGC‑GGGTTTTTCCTTCTCCGGAGAGGGGTTACCGACAAACAACAGATAAAAAAAAAAGCCCAGTCTTCCGCCTGAGCCctttt > 1:352837/1‑249 (MQ=255) ggCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGGCCTGCCCCCCCCCCCCCCGGCCGCTGCTTTTC‑CACGGTCAAATCCCCTCCCCGC‑CGGGTTTTTCTCCCCTCGGGAGGGTTTACCGACCAACAAACAAAAAAAAAAAAAACCCACGCTTCCGCCCGGGGCCTTTGttt > 2:297884/1‑250 (MQ=255) aTCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGAt < 1:374625/249‑1 (MQ=255) tCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAATCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGt < 1:894151/250‑1 (MQ=255) cAGGTAATCCATTAATTTAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCTTTTTGTTTTATTTGATGTCTg < 1:33274/250‑1 (MQ=255) 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gTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCa < 2:354357/250‑1 (MQ=255) cATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCCCCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTcc < 2:21281/249‑1 (MQ=255) aaTTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTAc < 1:39772/249‑1 (MQ=255) aaTTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGAGGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTAc < 2:771096/249‑1 (MQ=255) gAATTTTAGATCTAAAATCAAGAAGGCAATCTATCCGATTGGGTTTTCGTTTGTTTTGATGTAGGGCTGTTAATGGC‑AGGCGTCCTGCCCGCCGCCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGATAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAAGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTAATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTActccc < 2:789707/249‑3 (MQ=14) aaTGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGc < 1:666002/250‑1 (MQ=255) gATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCg < 2:53544/250‑1 (MQ=255) gCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGttt < 1:453910/249‑1 (MQ=255) tttgatGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCg < 2:242475/250‑1 (MQ=39) tGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATg < 1:421578/250‑1 (MQ=39) | CTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGC‑GGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTTCAAATCCGCTCCCGGC‑GGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATG > NZ_CP009273/3416371‑3416864 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |