| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP009273 | 2,897,051 | 0 | C | A | 34.3% | 198.8 / 51.4 | 99 | intergenic (+318/+1055) | ygcE/queE | FGGY‑family carbohydrate kinase/7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase QueE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (8/57); new base A (34/0); total (42/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.08e-19 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.44e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |