| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 3,806,632 | 0 | C | T | 34.9% | 56.9 / 15.9 | 44 | S181L (TCG→TTG) | coaBC | bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate‑‑cysteine ligase CoaBC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/26); new base T (15/0); total (18/26) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.97e-10 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGGTATCGACGATTTGTCTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTCGCCCGTCAACG‑A‑CC‑TGAAACATCTGAACATTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGTTTCACTACCGACGCCACCGTTTGTTAAACGTGTTGATGTGATGACCGCGCTGGAAATGGAAGC > NZ_CP009273/3806384‑3806866 | tgctgcCGGAAGGGCGAATGCCCTGGTATCGCCGATTTGTCTGGCTACCCCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTc < 1:185095/249‑1 (MQ=255) gacattttGTCTGGCTACCCCGTCGCGTGTAGCCGTCCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTCGCCCGTCAACG‑A‑CC‑TGAAACATCTGAACAtt < 1:931/245‑1 (MQ=255) cgaTTTGTCTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTTGCCCCGCAACC‑A‑CC‑CGTAACATCTGAACAATaa > 1:282669/1‑249 (MQ=255) ttGTCTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGGAGG‑GCATTTTTTGCCCGGCAACG‑A‑AC‑TGAAACATCTGAAAATTATGttt > 1:193419/1‑250 (MQ=255) tGTCTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGGGGG‑GGGATTTTTGCCCGTCCACGAA‑CC‑TGAACAACCTGaaacttttatta > 2:1860/1‑240 (MQ=255) cgtcccccccGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTCGCCCGTCAACG‑A‑CC‑TGAAACATCTGAACATTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTc < 2:43105/244‑1 (MQ=255) gggtcccccGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTCCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTCGCCCGTCAACG‑A‑CC‑TGAAACATCTGAACATTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCg < 1:402277/245‑1 (MQ=255) cgccgtggcccAGCGGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCGGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTCGCCCGTCAACG‑A‑CC‑TGAAACATCTGAACATTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTg < 2:98414/241‑1 (MQ=255) ccATGAACCGGCAGATGTGCGGTGCCGCTGCCGAGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGTTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCGTTCAGGGTGGTGGTGATATGGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTCGCCCGTCAACG‑A‑CC‑TGAAACATCTGAACATTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCg < 2:673238/250‑1 (MQ=255) aaCCAGCAGATGTCCCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTCGCCCGTCAACG‑A‑CC‑TGAAACATCTGAACATTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTtata < 1:579535/250‑1 (MQ=255) aaCCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTATG‑GCGTTTTTTTCCCGTCCACG‑A‑CCTTAAAAAATTTGAACTTTTTATTTATC‑CCGGCCCCACGCGCGAAACGGTCCATGCgcgggggtttt > 2:481518/1‑240 (MQ=255) ccAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTCGCCCGTCAACG‑A‑CC‑TGAAACATCTGAACATTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCATTATAtc < 1:470938/250‑1 (MQ=255) cagATGGACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCGGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTCGCCCGTCAACG‑A‑CC‑TGAAACATCTGAACATTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTa < 1:170258/250‑1 (MQ=255) tGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTCGCCCGTCAACG‑A‑CC‑TGAAACATCTGAACATTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATca < 1:25725/250‑1 (MQ=255) gTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTTGCCCGTCAACG‑A‑CC‑TGAAACATCTGCACATTATTATTACCGCCGGCCCGACCCCGGAAACGCTCGATCCGGTGCGGTATATCTCTAATca > 1:423207/1‑249 (MQ=255) aCCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTTGCCCGTCAACG‑A‑CC‑TGAAACATTTGAACATTATGGTTACCGCCGGCCCGACGCGGGAACCGCCCGCTCCGGGGCGTTTTATTTCTAATCACAg > 1:466383/1‑250 (MQ=255) gCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTTTCCCGCCCACG‑A‑CC‑TGAAAAATCTGCAAAATATGATTAACCCCCGCCCCACCCGTGAAACGCTCGCTCCGGTGCGGTTTTTCTCtcatcaaaaccccg > 1:495611/1‑242 (MQ=255) cGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGTTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGGAGCGGCATTTTT‑GCCCGTCTAAG‑A‑CC‑TGAAACAACTCGACATTATTATTACCGCCCGCCCCGCCCGCGGACCCCTCCGTCCGGCGCGTTTTTTTTCTCATcactcaccccg > 2:347406/1‑241 (MQ=255) cACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTTGC‑GCGGTTTTTGCCCGGTAAAC‑A‑CC‑CGACAAAACTGTACATTATGATTTACGCCGGCCCCACGCGCGAACACCCCGATCCCGTCAGTCAGTTTTTTAATCACAGTACCCGCaaaaag > 2:20504/1‑246 (MQ=255) gcaTAATTTAGAGTTGCTTGCTCCCGGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTCGCCCGTCAACG‑A‑CC‑TGAAACATCTGAACATTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGtttt < 2:426486/250‑1 (MQ=255) aTAATTTAGAGGTGTTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAAGCAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTCGCCCGTCAACG‑A‑CC‑TGAAACATCTGAACATTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGc < 1:429440/250‑1 (MQ=255) tAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTTGCCCGTCAACG‑A‑CC‑CGAAAAATCTGAACATTATGATTAACGCCGGCCCGACGCGTGAAACGCCCGATCCGGGGCGTTATATTTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGgttttgt > 1:693528/1‑247 (MQ=255) agGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCACCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTCGCCCGTCAACG‑A‑CC‑TGAAACATCTGAACATTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATcgccgc < 1:693922/250‑1 (MQ=255) gTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTTGCCCGTCAACG‑A‑CC‑TGAAAAATCTGAACATTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAAACGCTCGATCCGGGGCGGTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCCAGATGGGGTTTTCTATcgccgccg > 1:491709/1‑250 (MQ=255) cttgcttCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTTGCCCGTCAACG‑A‑CC‑TGAAACATCTGAACATTATGATTAACGCCGGCCCCACGCGTGAAACGCCCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAAACACAGCTCCGGCAAGAGGGGGTTTGCTATcgccgccgccg > 1:630517/1‑250 (MQ=255) cttgcttCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTTGCCCCTCAACG‑A‑CC‑CGAAAAATCTTAACATTATGATTAACCCCGGCCCCACGCGTGGACCGCCCGATCCCGGGCGGTTTATCTCTAATCACAGCTCCCGCCAGATGGGGTTTTCTTTctcccccgccg > 1:77712/1‑250 (MQ=255) ttCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAAC‑GCGTTCTTTTCCCGTCAAAC‑A‑CC‑TGCAACATCTGAACAATATGTATAACGCCCGCCCCACGCGTGCAACTCGCGCGACGGTGTGCTCTATCTCTATAACCACCGCCCGCGAAATGGGTGTTTCTATCGCCGCCCCCCCTGcc > 2:371287/1‑250 (MQ=255) tCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTTGCCCGTCAAAG‑A‑CC‑TGAAACATCTGAAAATTATGATTACCCCCGGCCCCGCGCGGGAACCGCCCGCTCCGGGGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGGTTTGGTATCGCCCCCGCCCCTGccc > 1:655444/1‑250 (MQ=255) gTTTGCTCACCGGGGGGCCAGACGGTGGCAGTCTGGCTTGTGGTGATTTCGGTCCTGGGCGAATGCTGGATCCGTTACCTATTGTGGATAGGGCGGTGGC‑GCTTTTTTCGCCCGTCAACG‑C‑CT‑TGAAACATCTGAACTTTATGATTCCCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTgg < 2:579429/250‑1 (MQ=255) ccAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTCGCCCGTCAACG‑A‑CC‑TGAAACATCTGAACATTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTgg < 1:288748/250‑1 (MQ=255) gACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGACCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTCGCCCGTCAACG‑A‑CC‑TGAAACATCTGAACATTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTAt < 1:739075/250‑1 (MQ=255) aCAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTCGCCCGTCAACG‑A‑CC‑TGAAACATCTGAACATTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTATc < 1:679456/250‑1 (MQ=255) aCAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTCGCCCGTCAACG‑A‑CC‑TGAAACATCTGAACATTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGAATc < 1:679472/250‑1 (MQ=255) gCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTCGCCCGTCAACG‑A‑CC‑TGAAACATCTGAACATTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTATCAGGTcc < 1:191692/250‑1 (MQ=255) tCAGGTTTGTGGTGATATCGGTCCGGGTGGAGTGCGCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTGGC‑GCTTTTTCCGCCCGTCAACG‑A‑CC‑TGAAACATCTGAACATTATGATTCCCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGtt < 2:469084/250‑1 (MQ=255) gCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTCGCCCGTCAACG‑C‑CC‑TGAAACATCTGAACATTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGTTTCAc < 1:99214/250‑1 (MQ=255) tgATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTCGCCCGTCAACG‑A‑CC‑TGAAACATCTGAACATTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGTTTCACTACCGACg < 1:546796/250‑1 (MQ=255) gTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTCGCCCGTCAACG‑A‑CC‑TGAAACATCTGAACATTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGTTTCACTACCGACGCCACCGtt < 1:135702/250‑1 (MQ=255) gggggCGAGTGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTCGCCCGTCAACG‑A‑CC‑TGAAACATCTGAACTTTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGTTTCACTACCGACGCCACCGTTTGt < 2:243647/248‑1 (MQ=255) aaTGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTTGCCCGGCAAAG‑ACCC‑TGAAA‑ATCTTAACATTATGATTACCGCCGGCCCGACCCGGGGACCCCTCCATCCGGGGCGGTTTTTCTCTTATCACAGCGCCCGCCAGAAGGGGTTTTCTATCCCCGCCGCCGCCGCCCCCCCTGGCGCGGACGCCCCGCTGGTATTAGGTGCCGCTTCCCCACCGTCGCCCCCGCTTGTTAAACgt > 2:263452/1‑250 (MQ=255) aaCCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTCGCCCGTCAACG‑A‑CC‑TGAAACATCTGAACATTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGTTTCACTACCGACGCCACCGTTTGTTAAACGTGTTGATGTGATGAc < 1:593720/249‑1 (MQ=255) tatGGCGGTAGC‑GCATTTTTCGCCCGTCAACG‑A‑CC‑TGAAACATCTGAACATTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGTTTCACTACCGACGCCACCGTTTGTTAAACGTGTTGATGTGATGACCGCGCTGGAAATg < 1:537161/250‑1 (MQ=255) tGGCGGTGTC‑GCATTTTCCGCCGTGCAACG‑A‑CT‑GAAAACATCTGAACATTATGATTCCCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGTTCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGTTTCACTACCGACGCCACCGTTTGTTAAACGTGTTGATGTGATGACCGCGCTGGAAATgg < 2:346248/249‑1 (MQ=255) ggCGGTAGC‑GCATTTTTCGCCCGTCAACG‑A‑CC‑TGAAACATCTGAACATTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGTTTCACTACCGACGCCACCGTTTGTTAAACGTGTTGATGTGATGACCGCGCTGGAAATgg > 1:137692/1‑248 (MQ=255) cGGTAGC‑GCATTTTTCGCCCGTCAACG‑A‑CC‑TGAAACATCTGAACATTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGTTTCACTACCGACGCCACCGTTTGTTAAACGTGTTGATGTGATGACCGCGCTGGAAATGGAAgc > 2:496611/1‑250 (MQ=255) | TGCTGCCGGAATGGCGAATGACCTGGTATCGACGATTTGTCTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGC‑GCATTTTTCGCCCGTCAACG‑A‑CC‑TGAAACATCTGAACATTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGTTTCACTACCGACGCCACCGTTTGTTAAACGTGTTGATGTGATGACCGCGCTGGAAATGGAAGC > NZ_CP009273/3806384‑3806866 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |