| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NZ_CP009273 | 3,336,757 | (AAAC)3→2 | coding (563‑566/576 nt) coding (19‑22/558 nt) |
lptC → lptA → |
LPS export ABC transporter periplasmic protein LptC lipopolysaccharide ABC transporter substrate‑binding protein LptA |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NZ_CP009273 | 3336749 | 3336752 | 4 | 73 [0] | [0] 73 | lptC lptA |
LPS export ABC transporter periplasmic protein LptC lipopolysaccharide ABC transporter substrate‑binding protein LptA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP009273 | 3336753 = | 0 (0.000) | 70 (1.030) | 63/480 | 0.2 | 100% | coding (559/576 nt) coding (15/558 nt) |
lptC lptA |
LPS export ABC transporter periplasmic protein LptC lipopolysaccharide ABC transporter substrate‑binding protein LptA |
| ? | NZ_CP009273 | = 3336748 | 0 (0.000) | coding (554/576 nt) coding (10/558 nt) |
lptC lptA |
LPS export ABC transporter periplasmic protein LptC lipopolysaccharide ABC transporter substrate‑binding protein LptA |
|||||
GTAGCCGTCAATCACTTCTTTACCTTGTTCGCCGCCCGGACGGGTAACGACCACTTTGTCGGCATTAATTTTGATGGTGCCCTGGGTGACGATGACATTACCGGTAAAGGTAACCACGTTGCCTTGCATATCAAGAGATTGCTGGTCCGATTCAATGTGGATCGGCTGATCAGTGTCTCCGGTTACGGCAAATGCCGGAATGCTGGCGGCCAGAAGTGAGCTGGCAAGCACAAGATTAAGGCTGAGTTTGTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP009273/3337005‑3336753‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gtttgtttTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTGCGTAAGTTGCCGCGCATTTTCAGACCGCTGGAGTTAAATGTTGTTCCGTATAACGTGACGAGGTCTTCAGAGGTAACATCCTGCGTCACCAGATTGATCTGCGCGTTATCCGTCGTGATTCTGCGAAGTTGAGAGTCTGGCACAAGTGCGTTGACTTCAACGTGTCCATATAAATAGAGCATCCGGTCATTGGTCAG < NZ_CP009273/3336748‑3336501 GTAGCCGTCAATCACTTCTTTACCTTGTTCGCCGCCCGGACGGGTAACGACCACTTTGTCGGCATTAATTTTGATGGTGCCCTGGGTGACGATGACATTACCGGTAAAGGTAACCACGTTGCCTTGCATATCAAGAGATTGCTGGTCCGATTCAATGTGGATCGGCTGATCAGTGTCTCCGGTTACGGCAAATGCCGGAATGCTGGCGGCCAGAAGTGAGCTGGCAAGCACAAGATTAAGGCTGAGTTTG < 1:581528/250‑1 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CACTTCTTTACCTTGTTCGCCGCCCGGACGGGTAACGACCACTTTGTCGGCATTAATTTTGATGGTGCCCTGGGTGACGATGACATTACCGGTAAAGGTAACCACGTTGCCTTGCATATCAAGAGATTGCTGGTCCGATTCAATGTGGATCGGCTGATCAGTGTCTCCGGTTACGGCAAATGCCGGAATGCTGGCGGCCAGAAGTGAGCTGGCAAGCACAAGATTAAGGCTGAGTTTGTTTTGAATTTCA > 1:652216/1‑250 TCTTTACCTTGTTCGCCGCCCGGACGGGTAACGACCACTTTGTCGGCATTAATTTTGATGGTGCCCTGGGTGACGATGACATTACCGGTAAAGGTAACCACGTTGCCTTGCATATCAAGAGATTGCTGGTCCGATTCAATGTGGATCGGCTGATCAGTGTCTCCGGTTACGGCAAATGCCGGAATGCTGGCGGCCAGAAGTGAGCTGGCAAGCACAAGATTAAGGCTGAGTTTGTTTTGAATTTCATAG > 1:663011/1‑249 TTTACCTTGTTCGCCGCCCGGACGGGTAACGACCACTTTGTCGGCATTAATTTTGATGGTGCCCTGGGTGACGATGACATTACCGGTAAAGGTAACCACGTTGCCTTGCATATCAAGAGATTGCTGGTCCGATTCAATGTGGATCGGCTGATCAGTGTCTCCGGTTACGGCAAATGCCGGAATGCTGGCGGCCAGAAGTGAGCTGGCAAGCACAAGATTAAGGCTGAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGAT > 2:611528/1‑250 CTTGTTCGCCGCCCGGACGGGTAACGACCACTTTGTCGGCATTAATTTTGATGGTGCCCTGGGTGACGATGACATTACCGGTAAAGGTAACCACGTTGCCTTGCATATCAAGAGATTGCTGGTCCGATTCAATGTGGATCGGCTGATCAGTGTCTCCGGTTACGGCAAATGCCGGAATGCTGGCGGCCAGAAGTGAGCTGGCAAGCACAAGATTAAGGCTGAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCT < 1:55187/250‑1 GTTCGCCGCCCGGACGGGTAACGACCACTTTGTCGGCATTAATTTTGATGGTGCCCTGGGTGACGATGACATTACCGGTAAAGGTAACCACGTTGCCTTGCATATCAAGAGATTGCTGGTCCGATTCAATGTGGATCGGCTGATCAGTGTCTCCGGTTACGGCAAATGCCGGAATGCTGGCGGCCAGAAGTGAGCTGGCAAGCACAAGATTAAGGCTGAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTA < 1:673654/248‑1 CGCCCGGACGGGTAACGACCACTTTGTCGGCATTAATTTTGATGGTGCCCTGGGTGACGATGACATTACCGGTAAAGGTAACCACGTTGCCTTGCATATCAAGAGATTGCTGGTCCGATTCAATGTGGATCGGCTGATCAGTGTCTCCGGTTACGGCAAATGCCGGAATGCTGGCGGCCAGAAGTGAGCTGGCAAGCACAAGATTAAGGCTGAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTT > 1:502469/1‑249 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GGACGGGTAACGCCCACTTGGTCGGCATTAAGTTTGATGGTGCCCTGGGTGACGATGACATTACCGGTAAAGGTAAACACGTTGCCTTGCATATCAAGAGATTGCTGGTCCGATTCAATGTGGATCGGCTGATCAGTGGCTCCGGTTACGGCAAATGCCGGAATGCTGGCGGCCAGAAGTGAGCTGGCAAGCACAAGATTAAGGCTGAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCA < 2:556679/250‑1 GGACGGGTAACGACCACTTTGTCGGCATTAATTTTGATGGTGCCCTGGGTGACGATGACATTACCGGTAAAGGTAACCACGTTGCCTTGCATATCAAGAGATTGCTGGTCCGATTCAATGTGGATCGGCTGATCAGTGTCTCCGGTTACGGCAAATGCCGGAATGCTGGCGGCCAGAAGTGAGCTGGCAAGCACAAGATTAAGGCTGAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCA < 1:135572/250‑1 GACGGGTAACGACCACTTTGTCGGCATTAATTTTGATGGTGCCCTGGGTGACGATGACATTACCGGTAAAGGTAACCACGTTGCCTTGCATATCAAGAGATTGCTGGTCCGATTCAATGTGGATCGGCTGATCAGTGTCTCCGGTTACGGCAAATGCCGGAATGCTGGCGGCCAGAAGTGAGCTGGCAAGCACAAGATTAAGGCTGAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAG > 2:231192/1‑250 ACTTTGTCGGCATTAATTTTGATGGTGCCCTGGGTGACGATGACATTACCGGTAAAGGTAACCACGTTGCCTTGCATATCAAGAGATTGCTGGTCCGATTCAATGTGGATCGGCTGATCAGTGTCTCCGGTTACGGCAAATGCCGGAATGCTGGCGGCCAGAAGTGAGCTGGCAAGCACAAGATTAAGGCTGAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGC > 2:427821/1‑250 TTTGTCGGCATTAATTTTGATGGTGCCCTGGGTGACGATGACATTACCGGTAAAGGTAACCACGTTGCCTTGCATATCAAGAGATTGCTGGTCCGATTCAATGTGGATCGGCTGATCAGTGTCTCCGGTTACGGCAAATGCCGGAATGCTGGCGGCCAGAAGTGAGCTGGCAAGCACAAGATTAAGGCTGAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTG > 1:670144/1‑250 TCGGCATTAATTTTGATGGTGCCCTGGGTGACGATGACATTACCGGTAAAGGTAACCACGTTGCCTTGCATATCAAGAGATTGCTGGTCCGATTCAATGTGGATCGGCTGATCAGTGTCTCCGGTTACGGCAAATGCCGGAATGCTGGCGGCCAGAAGTGAGCTGGCAAGCACAAGATTAAGGCTGAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTGCGT > 2:193323/1‑249 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CCTGGGTGACGATGACATTACCGGTAAAGGTAACCACGTTGCCTTGCATATCAAGAGATTGCTGGTCCGATTCAATGTGGATCGGCTGATCAGTGTCTCCGGTTACGGCAAATGCCGGAATGCTGGCGGCCAGAAGTGAGCTGGCAAGCACAAGATTAAGGCTGAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTGCGTAAGTTGCCGCGCATTTTCAGACC < 1:281591/250‑1 GGTGACGATGACATTACCGGTAAAGGTAACCACGTTGCCTTGCATATCAAGAGATTGCTGGTCCGATTCAATGTGGATCGGCTGATCAGTGTCTCCGGTTACGGCAAATGCCGGAATGCTGGCGGCCAGAAGTGAGCTGGCAAGCACAAGATTAAGGCTGAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTGCGTAAGTTGCCGCGCATTTTCAGACCGCTG > 2:224135/1‑250 GGTGACGATGACATTACCGGTAAAGGTAACCACGTTGCCTTGCATATCAAGAGATTGCTGGTCCGATTCAATGTGGATCGGCTGATCAGTGTCTCCGGTTACGGCAAATGCCGGAATGCTGGCGGCCAGAAGTGAGCTGGCAAGCACAAGATTAAGGCTGAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTGCGTAAGTTGCCGCGCATTTTCAGACCGC < 1:450041/248‑1 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CCGGTTACGGCAAATGCCGGAATGCTGGCGGCCAGAAGTGAGCTGGCAAGCACAAGATTAAGGCTGAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTGCGTAAGTTGCCGCGCATTTTCAGACCGCTGGAGTTAAATGTTGTTCCGTATAACGTGACGAGGTCTTCAGAGGTAACATCCTGCGTCACCAGATTGATCTGCGCGTTATCCGTCGTGATTCTGC > 1:447751/1‑250 CGGTTACGGCAAATGCCAGAATGCTGGCGGCCAGAAGTGTGCTGGCAAGCACAAGATTAAGGCTGAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTGCGTAAGTTGCCGCGCATTTTCAGACCGCTGGAGTTAAATGTTGTTCCGTATAACGTGACGAGTTCTTCAGAGGTAACATCCTGCGTCACCAGATTGATCTGCGCGTTATCCGTCGTGATTCT < 2:429070/247‑1 GGTTACGGCAAATGCCGGAATGCTGGCGGCCAGAAGTGAGCTGGCAAGCACAAGATTAAGGCTGAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTGCGTAAGTTGCCGCGCATTTTCAGACCGCTGGAGTTAAATGTTGTTCCGTATAACGTGACGAGGTCTTCAGAGGTAACATCCTGCGTCACCAGATTGATCTGCGCGTTATCCGTCGTGATTCTGCGA < 2:128755/250‑1 CTGGCGGCCAGAAGTGAGCTGGCAAGCACAAGATTAAGGCTGAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTGCGTAAGTTGCCGCGCATTTTCAGACCGCTGGAGTTAAATGTTGTTCCGTATAACGTGACGAGGTCTTCAGAGGTAACATCCTGCGTCACCAGATTGATCTGCGCGTTATCCGTCGTGATTCTGCGAAGTTGAGAGTCTGGCACAAGTG > 2:89784/1‑250 GCGGCCAGAAGTGAGCTGGCAAGCACAAGATTAAGGCTGAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTGCGTAAGTTGCCGCGCATTTTCAGACCGCTGGAGTTAAATGTTGTTCCGTATAACGTGACGAGGTCTTCAGAGGTAACATCCTGCGTCACCAGATTGATCTGCGCGTTATCCGTCGTGATTCTGCGAAGTTGAGAGTCTGGCACAAGTGCGT > 1:74146/1‑250 CGGCCAGAAGTGAGCTGGCAAGCACAAGATTAAGGCTGAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTGCGTAAGTTGCCGCGCATTTTCAGACCGCTGGAGTTAAATGTTGTTCCGTATAACGTGACGAGGTCTTCAGAGGTAACATCCTGCGTCACCAGATTGATCTGCGCGTTATCCGTCGTGATTCTGCGAAGTTGAGAGTCTGGCACAAGTGCGTT > 1:408416/1‑250 AGAAGTGAGCTGGCAAGCACAAGATTAAGGCTGAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTGCGTAAGTTGCCGCGCATTTTCAGACCGCTGGAGTTAAATGTTGTTCCGTATAACGTGACGAGGTCTTCAGAGGTAACATCCTGCGTCACCAGATTGATCTGCGCGTTATCCGTCGTGATTCTGCGAAGTTGAGAGTCTGGCACAAGTGCGTTGACTT < 1:230094/250‑1 AAGTGAGCTGGCAAGCACAAGATTAAGGCTGAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTGCGTAAGTTGCCGCGCATTTTCAGACCGCTGGAGTTAAATGTTGTTCCGTATAACGTGACGAGGTCTTCAGAGGTAACATCCTGCGTCACCAGATTGATCTGCGCGTTATCCGTCGTGATTCTGCGAAGTTGAGAGTCTGGCACAAGTGCGTTGACTTC > 1:81269/1‑249 AGTGAGCTGGCAAGCACAAGATTAAGGCTGAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTGCGTAAGTTGCCGCGCATTTTCAGACCGCTGGAGTTAAATGTTGTTCCGTATAACGTGACGAGGTCTTCAGAGGTAACATCCTGCGTCACCAGATTGATCTGCGCGTTATCCGTCGTGATTCTGCGAAGTTGAGAGTCTGGCACAAGTGCGTTGACTTCAA < 1:608788/250‑1 GAGCTGGCAAGCACAAGATTAAGGCTGAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTGCGTAAGTTGCCGCGCATTTTCAGACCGCTGGAGTTAAATGTTGTTCCGTATAACGTGACGAGGTCTTCAGAGGTAACATCCTGCGTCACCAGATTGATCTGCGCGTTATCCGTCGTGATTCTGCGAAGTTGAGAGTCTGGCACAAGTGCGTTGACTTCAACGT > 2:107772/1‑250 AGCTGGCAAGCACAAGATTAAGGCTGAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTGCGTAAGTTGCCGCGCATTTTCAGACCGCTGGAGTTAAATGTTGTTCCGTATAACGTGACGAGGTCTTCAGAGGTAACATCCTGCGTCACCAGATTGATCTGCGCGTTATCCGTCGTGATTCTGCGAAGTTGAGAGTCTGGCACAAGTGCGTTGACTTCAACGTG < 2:302336/250‑1 AGCTGGCAAGCACAAGATTAAGGCTGAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTGCGTAAGTTGCCGCGCATTTTCAGACCGCTGGAGTTAAATGTTGTTCCGTATAACGTGACGAGGTCTTCAGAGGTAACATCCTGCGTCACCAGATTGATCTGCGCGTTATCCGTCGTGATTCTGCGAAGTTGAGAGTCTGGCACAAGTGCGTTGACTTCAACGT < 1:224135/249‑1 AAGCACAAGATTAAGGCTGAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTGCGTAAGTTGCCGCGCATTTTCAGACCGCTGGAGTTAAATGTTGTTCCGTATAACGTGACGAGGTCTTCAGAGGTAACATCCTGCGTCACCAGATTGATCTGCGCGTTATCCGTCGTGATTCTGCGAAGTTGAGAGTCTGGCACAAGTGCGTTGACTTCAACGTGTCCATAT < 1:83918/250‑1 GATTAAGGCTGAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTGCGTAAGTTGCCGCGCATTTTCAGACCGCTGGAGTTAAATGTTGTTCCGTATAACGTGACGAGGTCTTCAGAGGTAACATCCTGCGTCACCAGATTGATCTGCGCGTTATCCGTCGTGATTCTGCGAAGTTGAGAGTCTGGCACAAGTGCGTTGACTTCAACGTGTCCATATAAATAGAG > 2:300947/1‑250 AAGGCTGAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTGCGTAAGTTGCCGCGCATTTTCAGACCGCTGGAGTTAAATGTTGTTCCGTATAACGTGACGAGGTCTTCAGAGGTAACATCCTGCGTCACCAGATTGATCTGCGCGTTATCCGTCGTGATTCTGCGAAGTTGAGAGTCTGGCACAAGTGCGTTGACTTCAACGTGTCCATATAAATAGAGCATC > 1:636206/1‑250 AAGGCTGAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTGCGTAAGTTGCCGCGCATTTTCAGACCGCTGGAGTTAAATGTTGTTCCGTATAACGTGACGAGGTCTTCAGAGGTAACATCCTGCGTCACCAGATTGATCTGCGCGTTATCCGTCGTGATTCTGCGAAGTTGAGAGTCTGGCACAAGTGCGTTGACTTCAACGTGTCCATATAAATAGAGCATC > 2:274313/1‑250 AGGCTGAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTGCGTAAGTTGCCGCGCATTTTCAGACCGCTGGAGTTAAATGTTGTTCCGTATAACGTGACGAGGTCTTCAGAGGTAACATCCTGCGTCACCAGATTGATCTGCGCGTTATCCGTCGTGATTCTGCGAAGTTGAGAGTCTGGCACAAGTGCGTTGACTTCAACGTGTCCATATAAATAGAGCATCC > 1:622246/1‑250 GCTGAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTGCGTAAGTTGCCGCGCATTTTCAGACCGCTGGAGTTAAATGTTGTTCCGTATAACGTGACGAGGTCTTCAGAGGTAACATCCTGCGTCACCAGATTGATCTGCGCGTTATCCGTCGTGATTCTGCGAAGTTGAGAGTCTGGCACAAGTGCGTTGACTTCAACGTGTCCATATAAATAGAGCATCCGG < 1:65403/250‑1 TGAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTGCGTAAGTTGCCGCGCATTTTCAGACCGCTGGAGTTAAATGTTGTTCCGTATAACGTGACGAGGTCTTCAGAGGTAACATCCTGCGTCACCAGATTGATCTGCGCGTTATCCGTCGTGATTCTGCGAAGTTGAGAGTCTGGCACAAGTGCGTTGACTTCAACGTGTCCATATAAATAGAGCATCCGGT > 1:677071/1‑249 GAGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTGCGTAAGTTGCCGCGCATTTTCAGACCGCTGGAGTTAAATGTTGTTCCGTATAACGTGACGAGGTCTTCAGAGGTAACATCCTGCGTCACCAGATTGATCTGCGCGTTATCCGTCGTGATTCTGCGAAGTTGAGAGTCTGGCACAAGTGCGTTGACTTCAACGTGTCCATATAAATAGAGCATCCGGTCA > 1:637731/1‑250 AGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTGCGTAAGTTGCCGCGCATTTTCAGACCGCTGGAGTTAAATGTTGTTCCGTATAACGTGACGAGGTCTTCAGAGGTAACATCCTGCGTCACCAGATTGATCTGCGCGTTATCCGTCGTGATTCTGCGAAGTTGAGAGTCTGGCACAAGTGCGTTGACTTCAACGTGTCCATATAAATAGAGCATCCGGTCAT < 1:466712/250‑1 AGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTGCGTAAGTTGCCGCGCATTTTCAGACCGCTGGAGTTAAATGTTGTTCCGTATAACGTGACGAGGTCTTCAGAGGTAACATCCTGCGTCACCAGATTGATCTGCGCGTTATCCGTCGTGATTCTGCGAAGTTGAGAGTCTGGCACAAGTGCGTTGACTTCAACGTGTCCATATAAATAGAGCATCCGGTC < 1:368650/248‑1 AGTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTGCGTAAGTTGCCGCGCATTTTCAGACCGCTGGAGTTAAATGTTGTTCCGTATAACGTGACGAGGTCTTCAGAGGTAACATCCTGCGTCACCAGATTGATCTGCGCGTTATCCGTCGTGATTCTGCGAAGTTGAGAGTCTGGCACAAGTGCGTTGACTTCAACGTGTCCATATAAATAGAGCATCCGGTC < 1:69076/248‑1 GTTTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTGCGTAAGTTGCCGCGCATTTTCAGACCGCTGGAGTTAAATGTTGTTCCGTATAACGTGACGAGGTCTTCAGAGGTAACATCCTGCGTCACCAGATTGATCTGCGCGTTATCCGTCGTGATTCTGCGAAGTTGAGAGTCTGGCACAAGTGCGTTGACTTCAACGTGTCCATATAAATAGAGCATCCGGTCATT < 1:174183/250‑1 TTGTTTTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTGCGTAAGTTGCCGCGCATTTTCAGACCGCTGGAGTTAAATGTTGTTCCGTATAACGTGACGAGGTCTTCAGAGGTAACATCCTGCGTCACCAGATTGATCTGCGCGTTATCCGTCGTGATTCTGCGAAGTTGAGAGTCTGGCACAAGTGCGTTGACTTCAACGTGTCCATATAAATAGAGCATCCGGTCATTGG > 1:370962/1‑250 TTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTGCGTAAGTTGCCGCGCATTTTCAGACCGCTGGAGTTAAATGTTGTTCCGTATAACGTGACGAGGTCTTCAGAGGTAACATCCTGCGTCACCAGATTGATCTGCGCGTTATCCGTCGTGATTCTGCGAAGTTGAGAGTCTGGCACAAGTGCGTTGACTTCAACGTGTCCATATAAATAGAGCATCCGGTCATTGGTCAG < 1:427821/249‑1 GTAGCCGTCAATCACTTCTTTACCTTGTTCGCCGCCCGGACGGGTAACGACCACTTTGTCGGCATTAATTTTGATGGTGCCCTGGGTGACGATGACATTACCGGTAAAGGTAACCACGTTGCCTTGCATATCAAGAGATTGCTGGTCCGATTCAATGTGGATCGGCTGATCAGTGTCTCCGGTTACGGCAAATGCCGGAATGCTGGCGGCCAGAAGTGAGCTGGCAAGCACAAGATTAAGGCTGAGTTTGTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP009273/3337005‑3336753‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gtttgtttTGAATTTCATAGGATGTTCTAACCTTTTCAATCAGCTCGGCGTTCTTGCTGCGTAAGTTGCCGCGCATTTTCAGACCGCTGGAGTTAAATGTTGTTCCGTATAACGTGACGAGGTCTTCAGAGGTAACATCCTGCGTCACCAGATTGATCTGCGCGTTATCCGTCGTGATTCTGCGAAGTTGAGAGTCTGGCACAAGTGCGTTGACTTCAACGTGTCCATATAAATAGAGCATCCGGTCATTGGTCAG < NZ_CP009273/3336748‑3336501 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |