New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NZ_CP009273 | 121569 = | 1 (0.010) | 76 (1.080) | 73/494 | 0.1 | 98.7% | coding (2066/2664 nt) | aceE | pyruvate dehydrogenase (acetyl‑transferring), homodimeric type |
? | NZ_CP009273 | = 312193 | NA (NA) | intergenic (+29/+1) | BW25113_RS01545/BW25113_RS01550 | IS3‑like element IS3 family transposase/helix‑turn‑helix domain‑containing protein |
ACCATCACGCGCCAGCTCGGTGAAGGAGGTCACGCTATAAACGTCAGAACCTACGCCGTAATCTTTCGCCAGGATCTCAGCTGCTTCACGGACGTGACGCAGGATAGAACCGGAGCCGAGCAGCTGAACTTTACCTTTGCTACCTTCAATAGTTTCGAGTTTGTAGATACCTTTACGGATACCTTCCTCAGCACCTTCCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP009273/121810‑121569 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAATGAAAGAAGCTTTCCACGCAGGCATTATCGTAGCAGCAACCTTTTGCGCTCATACTT < NZ_CP009273/312193‑311945 ACCATCACGCGCCAGCTCGGTGAAGGAGGTCACGCTATAAACGTCAGAACCTACGCCGTAATCTTTCGCCAGGATCTCAGCTGCTTCACGGACGTGACGCAGGATAGAACCGGAGCCGAGCAGCTGAACTTTACCTTTGCTACCTTCAATAGTTTCGAGTTTGTAGATACCTTTACGGATACCTTCCTCAGCACCTTCCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGTGATCCTA < 1:289514/249‑1 ACCATCACGCGCCAGCTCGGTGAAGGAGGTCACGCTATAAACGTCAGAACCTACGCCGTAATCTTTCGCCAGGATCTCAGCTGCTTCACGGACGTGACGCAGGATAGAACCGGAGCCGAGCAGCTGAACTTTACCTTTGCTACCTTCAATAGTTTCGAGTTTGTAGATACCTTTACGGATACCTTCCTCAGCACCTTCCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGTGATCCT < 2:460561/248‑1 GCGCCAGCTCGGTGAAGGAGGTCACGCTATAAACGTCAGAACCTACGCCGTAATCTTTCGCCAGGATCTCAGCTGCTTCACGGACGTGACGCAGGATAGAACCGGAGCCGAGCAGCTGAACTTTACCTTTGCTACCTTCAATAGTTTCGAGTTTGTAGATACCTTTACGGATACCTTCCTCAGCACCTTCCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGTGATCCTACCCACGTAA > 1:176528/1‑250 CCAGCTCGGTGAAGGAGGTCACGCTATAAACGTCAGAACCTACGCCGTAATCTTTCGCCAGGATCTCAGCTGCTTCACGGACGTGACGCAGGATAGAACCGGAGCCGAGCAGCTGAACTTTACCTTTGCTACCTTCAATAGTTTCGAGTTTGTAGATACCTTTACGGATACCTTCCTCAGCACCTTCCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGTGATCCTACCCACGTAATAT < 1:407683/250‑1 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CTTCACGGACGTGACGCAGGATAGAACCGGAGCCGAGCAGCTGAACTTTACCTTTGCTACCTTCAATAGTTTCGAGTTTGTAGATACCTTTACGGATACCTTCCTCAGCACCTTCCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCG < 1:334498/248‑1 CACGGACGTGACGCAGGATAGAACCGGAGCCGAGCAGCTGAACTTTACCTTTGCTACCTTCAATAGTTTCGAGTTTGTAGATACCTTTACGGATACCTTCCTCAGCACCTTCCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGC > 1:172206/1‑249 GACGTGACGCAGGATAGAACCGGAGCCGAGCAGCTGAACTTTACCTTTGCTACCTTCAATAGTTTCGAGTTTGTAGATACCTTTACGGATACCTTCCTCAGCACCTTCCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCG < 1:292436/250‑1 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CTTTACCTTTGCTACCTTCAATAGTTTCGAGTTTGTAGATACCTTTACGGATACCTTCCTCAGCACCTTCCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTACCC > 1:464656/1‑250 TTACCTTTGCTACCTTCAATAGTTTCGAGTTTGTAGATACCTTTACGGATACCTTCCTCAGCACCTTCCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGC > 2:490287/1‑250 ACCTTTGCTACCTTCAATAGTTTCGAGTTTGTAGATACCTTTACGGATACCTTCCTCAGCACCTTCCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCA < 1:34238/249‑1 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TACCTTCAATAGTTTCGAGTTTGTAGATACCTTTACGGATACCTTCCTCAGCACCTTCCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCC > 1:430272/1‑250 TTTCGAGTTTGTAGATACCTTTACGGATACCTTCCTCAGCACCTTCCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGT > 2:32276/1‑250 GAGTTTGTAGATACCTTTACGGATACCTTCCTCAGCACCTTCCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTC > 1:588666/1‑250 TTTGTAGATACCTTTACGGATACCTTCCTCAGCACCTTCCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGGGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCC < 2:366954/250‑1 TGTAGATACCTTTACGGATACCTTCCTCAGCACCTTCCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGCGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATCATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAACGTGTTCTCCAT > 2:345433/1‑250 ttcGATACGTTTACGGTTCCCTTCCTAACCTCCTGCGGTCATTTCGGGTATGTGTTATTTTTCGTTCAGCGTAGTGTTGTGATCTTATCCTCGTAATATGGACTCAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTTTCCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACTCCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCAT < 2:199521/246‑1 AGATACCTTTACGGATACCTTCCTCAGCACCTTCCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGA > 1:35256/1‑250 ATACCTTTACGGATACCTTCCTCAGCACCTTCCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGGTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAACCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATA > 1:150316/1‑250 TACCTTTACGGATCCCTTCCTCAGCACCTTCCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATAC < 2:196161/250‑1 TTTACGGATACCTTCCTCAGCACCTTCCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTC > 1:659085/1‑250 TACGGATACCTTCCTCAGCACCTTCCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCC < 1:522372/249‑1 GGATACCTTCCTCAGCACCTTCCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTT > 1:292221/1‑250 GATACCTTCCTCAGCACCTTCCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTT > 1:287989/1‑250 ACCTTCCTCAGCACCTTCCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGCTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAG > 2:600599/1‑250 TCCTCAGCACCTTCCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAA > 2:65531/1‑250 CCTCAGCACCTTCCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAAT > 1:203158/1‑250 CCTCAGCACCTTCCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAAT > 1:313620/1‑250 CTCAGCACCTTCCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAAT > 1:403143/1‑249 CTCAGCACCTTCCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAAT < 2:409144/249‑1 AGCACCTTCCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAATGA < 1:382338/248‑1 ACCTTCCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTAATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCCCCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCCTTATTTCCTGGCTGATAAAGGGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCCGCGAATGAAAG > 2:288227/1‑248 CCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAATGAAAGAAGCTTT > 1:288497/1‑250 GCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAATGAAAGAAGCTTTCCACGCA < 1:536442/249‑1 AGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAATGAAAGAAGCTTTCCACGCAGGCATTATCGTAG > 1:13197/1‑249 TTCTTTCAGCGTAGTGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTTTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAATGAAAGAAGCTTTCCACGCAGGCATTATCGTAGCAGC < 1:518693/249‑1 CGTAGTGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAATGAAAGAAGCTTTCCACGCAGGCATTATCGTAGCAGCAACCTTTTGC > 2:334004/1‑250 GTGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAATGAAAGAAGCTTTCCACGCAGGCATTATCGTAGCAGCAACCTTTTGCGCTC < 1:608454/250‑1 GTGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAATGAAAGAAGCTTTCCACGCAGGCATTATCGTAGCAGCAACCTTTTGCGCT < 1:603897/249‑1 GTGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAATGAAAGAAGCTTTCCACGCAGGCATTATCGTAGCAGCAACCTTTTGCGCT > 1:321345/1‑249 TGATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAATGAAAGAAGCTTTCCACGCAGGCATTATCGTAGCAGCAACCTTTTGCGCTCA > 1:487798/1‑250 GATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAATGAAAGAAGCTTTCCACGCAGGCATTATCGTAGCAGCAACCTTTTGCGCTCA > 1:277662/1‑249 ATGTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAATGAAAGAAGCTTTCCACGCAGGCATTATCGTAGCAGCAACCTTTTGCGCTCATA < 2:321345/250‑1 TGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAATGAAAGAAGCTTTCCACGCAGGCATTATCGTAGCAGCAACCTTTTGCGCTCATACTT > 2:20157/1‑250 TGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAATGAAAGAAGCTTTCCACGCAGGCATTATCGTAGCAGCAACCTTTTGCGCTCATACTT > 2:664011/1‑250 TGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTCCCGGCCTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAATGAAAGAAGCTTTCCACGCAGGCATTATCGTAGCAGCAACCTTTTGCGCTCATACT < 1:172436/249‑1 ACCATCACGCGCCAGCTCGGTGAAGGAGGTCACGCTATAAACGTCAGAACCTACGCCGTAATCTTTCGCCAGGATCTCAGCTGCTTCACGGACGTGACGCAGGATAGAACCGGAGCCGAGCAGCTGAACTTTACCTTTGCTACCTTCAATAGTTTCGAGTTTGTAGATACCTTTACGGATACCTTCCTCAGCACCTTCCGGCATTGCCGGCATGTGGTAGTTTTCGTTCAGCGTAGTGATGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP009273/121810‑121569 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAATGAAAGAAGCTTTCCACGCAGGCATTATCGTAGCAGCAACCTTTTGCGCTCATACTT < NZ_CP009273/312193‑311945 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |