| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 1,598,494 | 0 | C | T | 32.6% | 67.3 / 15.4 | 44 | S64L (TCG→TTG) | lsrD | autoinducer 2 ABC transporter permease LsrD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (7/22); new base T (14/0); total (22/22) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.48e-06 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.78e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CGCCACCGCCATCCGTTAAACCCGCTTCGTCAGGTAAAAAACGGGAGGCCGCATAATGCGTATTCGCTACGGTTGGGAACTGGCTCTTGCCGCACTGCTCGTTATTGAGATTGTCGCATTTGGTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATTGG‑GCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTG‑CCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCTCGGCGCATTGTGCGGGCTGATCAACGCCGGATTAATTATCTATA‑CCAAAGTTAACCCGCTGGTGATTACGCTTGGCACGC‑TGTATCTGTTTGCCGGAAGCGCTCTGCTGCTTTCCGGTATGGCCGGAGCGACGGGGTACGAAGGTATTGGTGG > NZ_CP009273/1598249‑1598743 | cGCCACCGCCATCCGTTAAACCCGCTTCGTCAGGTAAAAAACGGGAGGCCGCATAATGCGTATTCGCTACGGTTGGGAACTGGCTCTTGCCGCACTGCTCGTTATTGAGATTGTCGCATTTGGTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGATCGATATTTCGttt < 1:152642/250‑1 (MQ=255) gCCACCGCCATCCGTTAAACCCGCTTCGTCAGGTAAAAAACGGGAGGCCGCATAATGCGTATTCGCTACGGTTGGGAACTGGCTCTTGCCGCACTGCTCGTTATTGAGATTGTCGCATTTGGTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGCCGGGATCGATATTTCGTTTg > 1:458732/1‑250 (MQ=255) cGCCATCCGTTAAACCCGCTTCGTCAGGTAAAAAACGGGAGGCCGCATAATGCGTATTCGCTACGGTTGGGAACTGGCTCTTGCCGCACTGCTCGTTATTGAGATTGTCGCATTTGGTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGATCGATATTTCGTTTGGTTCg < 1:604722/250‑1 (MQ=255) cGTCAGGTAAAAAACGGGCGGCCGCATAATGCGTATTCGCTACGGTTGGGAACTGGCTCTTGCCGCACTGCTCGTTATTGAGATTGTCGCATTTGGTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGGTGGGTTTTTTGTTTGGTTTGTCGCTCGGCCTCTggtcccat > 2:602396/1‑243 (MQ=255) aaaaaCGGGAGGCCGCATAATGCGTCTTCGGTGCGGTTGGGAACTGGCTCTTGCCGCACTGCTCGTTATTGAGATTGTCGCATTTGGTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATTGG‑Gc < 2:615445/250‑1 (MQ=255) aaaaaCGGGAGGCCGCATAATGCGTATTCGCTACGGTTGGGAACTGGCTCTTGCCGCACTGCTCGTTATTGAGATTGTCGCATTTGGTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATTGG‑Gc < 1:79956/250‑1 (MQ=255) aCGGGAGGCCGCATAATGCGTATTCGCTACGGTTGGGAACTGGCTCTTGCCGCACTGCTCGTTATTGAGATTGTCGCATTTGGTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATTGG‑GCGTAc < 1:500983/250‑1 (MQ=255) aGGCCGCATAATGCGTATTCGCTACGGTTGGGAACTGGCTCTTGCCGCACTGCTCGTTATTGAGATTGTCGCATTTGGTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGATCGGTATTTCGTTTTGGTTGACCCTCTGCCTCTCTGCCCCTGCATTTG‑GCGGACTGttt > 1:654329/1‑250 (MQ=255) cATAATGCGTATTCGCTACGGTTGGGAACTGGCTCTTGCCGCACTGCTCGTTATTGAGATTGTCGCATTTGGTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGGTTGGTATTTTGTTTTGTTTTGCCCTCCGGCTCTGCGCGATTTCCTTTG‑GGGGACGGTTTTCAAgt > 2:541339/1‑250 (MQ=255) cATAATGCGTATTCGCTACGGTTGGGAACTGGCTCTTGCCGCACTGCTCGTTATTGAGATTGTCGCATTTGGTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGGACGATATTTCGTTTTGTTCTTCCCTCGGCCTCTGCTCCCTTGCAATTG‑GGGTACTGttttctatt > 2:606630/1‑244 (MQ=255) aTAATGCGTATTCGCTACGGTTGGGAACTGGCTCTTGCCGCACTGCTCGTTATTGAGATTGTCGCATTTGGTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGATTGGGATTTGTGTTGGTTGGAGCATCGGTCTCTGCGGCGCTGCATTTG‑GGGGGCTGTTTTaacagg > 2:542827/1‑246 (MQ=255) tAATGCGTATTCGCTACGGTTGGGAACTGGCTCTTGCCGCACTGCTCGTTATTGAGATTGTCGCATTTGGTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGAATTGATATTTTGTTTTGTTTGACCCTCTCGCCCTGCGCCCTGTCCTTTG‑GCGTGCTTTTTcttaaggg > 2:605739/1‑243 (MQ=255) gCGTATTCGCTACGGTTGGGAACTGGCTCTTGCCGCACTGCTCGTTATTGAGATTGTCGCATTTGGTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATTGG‑GCGTACTGTTTCAAAGTGGtgtg < 2:237922/250‑1 (MQ=255) gTTGGGAACTGGCTCTTGCCGCACTGCTCGTTATTGAGATTGTCGCATTTGGTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATTGG‑GCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTG‑CCGATGCCGCTGGc < 1:243765/250‑1 (MQ=255) gTTGGGAACTGGCTCTTGCCGCACTGCTCGTTATTGAGATTGTCGCATTTGGTGCAATTAACCCGCGAATGGTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATTGG‑GCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTG‑CCGATGCCGCTGGc < 1:204475/250‑1 (MQ=255) cTGGCTCTTGCCGCACTGCTCGTTATTGAGATTGTCGCATTTGGTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATTGG‑GCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTG‑CCGATGCCGCTGGCGATACTcc < 2:217385/250‑1 (MQ=255) agaTTGTCGCATTTGGTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCGCCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATTGG‑GCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTG‑CCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCTCGGCGCATTGTGCgg < 1:435531/250‑1 (MQ=255) tGTCGCATTTGGTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGATCGATATTTTGTTTTGTTCGTCCCTCGGCCTCTGCGCCATTGCCTTTG‑GGGTACTGTTTCTAAATGGGGGG‑TCGATGCCGCTGGCGATACTCCCGTCCCTATTTCTCGGCGCCTTGTGCGGGCTg > 2:8795/1‑250 (MQ=255) tCGCATTTGGTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGGGCGATATTTCGTTTTGTTCGACCCTCGGCCTCTGCGCCATTTCATTTG‑GCGTACTGTTTTTAAGGGTGGTG‑CCCGTGCCGCCGGCGCTACTCCCGCCCCTTCTGTCCGGCGCTTTGTTCGGGGTgtt > 2:462055/1‑248 (MQ=255) gCATTTGGTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATTGG‑GCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTG‑CCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCTCGGCGCATTGTGCGGGCTGATCa < 2:20643/250‑1 (MQ=255) ttGGTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGATCGGTATTTTGTTTTGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATTGG‑GGGTTCTGTTTTCAAGTGGTGTG‑GCGATGCCGCTGGCGGGTCTCCTTTCCTTTCTGCTCCGCGCCTTGTGCGGGGTGTTCAAAGc > 2:304445/1‑250 (MQ=255) tGGTGCAATTCACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATTGG‑GCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTG‑CCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCTCGGCGCATTGTGCGGGCTGATCAACGc < 1:652941/249‑1 (MQ=255) tGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATTGG‑GCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTG‑CCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCTCGGCGCATTGTGCGGGCTGATCAACGCCGGa < 1:483068/250‑1 (MQ=255) aTTAACCCGCGAATGGTAGATTTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATTGG‑GCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTG‑CCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCTCGGCGCATTGTGCGGGCTGATCAACGCCGGattaa < 2:71946/250‑1 (MQ=255) aaCCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGGTTGATATTTTGTTTTGGTCGACCCACAGCCTCCGCGCCCTTGCATTGGTGGGGATGTTTTCAAAG‑GGTGGG‑CCGGAGCCGCTGGCGGTGATCCCGACCTTACTTATCCGCGCACTGTGCGGGGGGAGCTACACCGGtctaatta > 2:207942/1‑250 (MQ=255) aaCCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGATCGGTATTTTGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATTGG‑GCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTG‑GCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGCCCTTACTGCTCGGCGCATTGTGCGGGCTGGTCAACGCCGGattaatta > 1:318813/1‑250 (MQ=255) aaCCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATTGG‑GCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTG‑CCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCTCGGCGCATTGTGCGGGCTGATCAACGCCGGattaatt < 2:486952/249‑1 (MQ=255) cgcgAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATTGG‑GCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTG‑CCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCTCGGCGCATTGTGCGGGCTGATCAACGCCGGATTAATTATCta < 1:111598/250‑1 (MQ=255) cgAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGGTCGATATTTTGTTTTGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATTGG‑GCGTACTGTTTCTAAGTGGGGTG‑CCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCTCGGCGCATTGTGGGGGGTTGTCAACGCCGGGTTAATTATCttta > 1:315380/1‑250 (MQ=255) cgAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGATCGGTATTTTGTTTTGTTCGGCCATCGGGCCCTGCGCCCTTGCATTGG‑GGGTACTGTTTTAAAGTGGTGGG‑CCGCTGCCGCTGGCGATACTCCCTACCTTACTGCTCGGCGCGTTTTGCGGGGTGGTCAACGCCGGGTTAATTTTCtata > 2:131747/1‑250 (MQ=255) aGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGGTCGATATTTTTTTTTGTTTGACCATCCGCCCCTGCGCCCTTGGCTTGG‑GGGGAGTGTTTCCAAAGGGTGGGCCCGGTG‑CGCCGGCCGTAATCCTGCCCTTACTGCTCTGCGGTGTGTGGGGGGTGCTTAACCCCGCCTTAACTATCTATA‑CCAAAGt > 2:177608/1‑249 (MQ=255) cAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGGTCGATATTTTTTTTTGTTTGACCATCGGCCTCTGGGCCCTTGCATTTG‑GGGGACTGTTTTTAAGTGGTGTG‑CCGATGCCGCTGGCGGTACTCCTGCCCTTTTTGCTCGGGGCGTTTTGGGGGCTGGTTCACGCCGGGTTAATTTTTTTTACCCAAAGTAAAcac > 2:261413/1‑248 (MQ=255) aaTATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATTGG‑GCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTG‑CCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCTCGGCGCATTGTGCGGGCTGATCAACGCCGGATTAATTATCTATA‑CCAAAGTTAAccc < 2:156625/248‑1 (MQ=255) ttCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGATCGGTATTTTCTTTTGTTCGACCCTCGGCCTCTGCGCCCTTTCATTGG‑GGGGACTGTTTTAAAGGGGGGTG‑CCGAAGCCGCTGGCGATACTCCCTTCCTTACTTCTCGGCGCCCTTTGCGGGCCGGTCAACGCCGGGTTAATTATCCTTA‑CCAAAATTAAACCCCTCGGGATTTCGc > 2:596288/1‑250 (MQ=255) aCCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATTGG‑GCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTG‑CCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCTCGGCGCATTGTGCGGGCTGATCAACGCCGGATTAATTATCTATA‑CCAAAGTTAACCCGCTGGTGATTACGCTTGGCa < 2:616058/250‑1 (MQ=255) cAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATTGG‑GCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTG‑CCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCTCGGCGCATTGTGCGGGCTGATCAACGCCGGATTAATTATCTATA‑CCAAAGTTAACCCGCTGGTGATTACGCTTGGCACg < 1:541339/250‑1 (MQ=255) gcattggcattgTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCCTCGGCCTCTGCGCCATTGCATTGG‑GCGTACTGTTTTAAAGGGGGGTG‑GCGATGCCGCTGGCGGTACTCCTGACCTTACTGCTCGGGGCATTGTGGGGGGTGGTCAACGCCGGGTTAATTATCTATA‑CCAAAGTTAAACCGCTGGTGGTTAAGCTTGGGCCGC‑TGTGTCTGttttg > 2:71518/1‑248 (MQ=255) tggcattgTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGGACGATATTTCTTTTTTTTTTACCCTCCGCCTCTGCGCCCTTGCCTTTG‑GCGTCCTGTTTCAAAGTGGGGGG‑CCGTTGCCGCTGGCGGTACCCCTGACCTTACTGTGCGGTGCGTTGGGTGGGCTGATCAATACCGGTTAAACTATCTATC‑CCAAAGTTATACCTCGGGGGATTATGCTGGGCACGC‑TTCATCTGTTTTCCgg > 2:257439/1‑249 (MQ=255) ggcattgTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGATCGATATTTTGTTTGGGTCGGCCCTCGGCCCCTGCGCCCTTGCATTGG‑GGGGTCTGTTTCAAAGTGGGGTG‑CCGCTGCCGCCGGCGGGACTCCTTACCTTACTTCTCGGCGCCTTGTGTGGGCTGGTCCACGCCGGGTTTTTTTTCTATA‑CCAAAGGTAAACCGCTGGTGGTTACGCCTTGTACGC‑TGGATCTTTTTGCCgggc > 2:81739/1‑248 (MQ=255) cGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGGTCGGTTTTTTGTTTTGGTTGACCACCGGCCCCCGCGCCCTATTATTGG‑GGGGACTGTTTCAAAGAGGGGTG‑GCGGCGCCGCCGGCGTTACTCCTCACCTTATTGCTCGGGGGATTGTTCGGGCCGGGCAACACCGGGGTATTTATCTATT‑CCACAGTTTAACCCCTGGGGGTTTTCCTGGGGACCCTTGTA‑CTTTTTGCCGGAAGCGCGctg > 2:405399/1‑250 (MQ=255) aCGATGGTGTTTGCCTGTGGCGGGATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCTTTGCATGGG‑GCGTACTGTTGCAAAGTGGTGTG‑CCAATGACGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCTCGGCGCATTGTGCGGGCTGATCAACGCCGGATTAATTATCTATA‑CCAAAGTTAACCCGCTGGTGATTACGCTTGGCACGC‑TGTATCTGTTTGCCGGAAGCGCTCTGCTGCTTTCCGGt < 2:124880/249‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATTGG‑GCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTG‑CCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCTCGGCGCATTGTGCGGGCTGATCAACGCCGGATTAATTATCTATA‑CCAAAGTTAACCCGCTGGTGATTACGCTTGGCACGC‑TGTATCTGTTTGCCGGAAGCGCTCTGCTGCTTTCCgg < 1:119832/248‑1 (MQ=255) gCGGGATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATTGG‑GCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTG‑CCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCTCGGCGCATTGTGCGGGCTGATCAACGCCGGATTAATTATCTATA‑CCAAAGTTAACCCGCTGGTGATTACGCTTGGCACGC‑TGTATCTGTTTGCCGGAAGCGCTCTGCTGCTTTCCGGTATGGCCGGAGCGACGGGGt < 1:397151/249‑1 (MQ=255) gggATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATTGG‑GCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTG‑CCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCTCGGCGCATTGTGCGGGCTGATCAACGCCGGATTAATTATCTATA‑CCAAAGTTAACCCGCTGGTGATTACGCTTGGCACGC‑TGTATCTGTTTGCCGGAAGCGCTCTGCTGCTTTCCGGTATGGCCGGAGCGACGGGGTAc > 1:543672/1‑249 (MQ=255) cGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATTGG‑GCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTG‑CCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCTCGGCGCATTGTGCGGGCTGATCAACGCCGGATTAATTATCTATA‑CCAAAGTTAACCCGCTGGTGATTACGCTTGGCACGC‑TGTATCTGTTTGCCGGAAGCGCTCTGCTGCTTTCCGGTATGGCCGGAGCGACGGGGTACGAAGGTATtggtgg > 2:230626/1‑250 (MQ=255) | CGCCACCGCCATCCGTTAAACCCGCTTCGTCAGGTAAAAAACGGGAGGCCGCATAATGCGTATTCGCTACGGTTGGGAACTGGCTCTTGCCGCACTGCTCGTTATTGAGATTGTCGCATTTGGTGCAATTAACCCGCGAATGTTAGATCTCAATATGTTGCTGTTCAGCACCAGTGACTTTATCTGCATTGGCATTGTCGCCCTACCGCTAACGATGGTGATTGTCAGTGGCGGGATCGATATTTCGTTTGGTTCGACCATCGGCCTCTGCGCCATTGCATTGG‑GCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTG‑CCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCTCGGCGCATTGTGCGGGCTGATCAACGCCGGATTAATTATCTATA‑CCAAAGTTAACCCGCTGGTGATTACGCTTGGCACGC‑TGTATCTGTTTGCCGGAAGCGCTCTGCTGCTTTCCGGTATGGCCGGAGCGACGGGGTACGAAGGTATTGGTGG > NZ_CP009273/1598249‑1598743 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |