Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NZ_CP009273 | 4,277,647 | 0 | T | A | 31.5% | 213.1 / 45.0 | 111 | intergenic (‑348/‑45) | acs/nrfA | acetate‑‑CoA ligase/ammonia‑forming nitrite reductase cytochrome c552 subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (63/13); new base A (1/34); total (64/47) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e-16 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
AAAAGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGAAGGTCAGCAACAAAAGTTGATTAATTCTTTGAGGAACATGCA‑GTTATGCATGCTGTTGAAAAAGAGGAAGATACTGACTAACTCTAAAGT‑GGTATTTTACATGCAC‑TTACAATTG‑ATTAAAGACAACATTCACAGT‑GTGGTTATTT‑GTTACAC‑ATAGGGGCGAGCAATGTCATG‑AC‑AGTGTAGGTGCGGTTACT‑GTCGTGAAAAAC‑AATAAAAA‑CCG‑CCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGCCCCTATGACAAGGATAAAAATAAACGCACGCCGTATCTTCAGCTTATTGATTCCTTTTTTCTTTTTCACTTCTGTTCACGCTGAACAAACGGCTGCTCCCGCAAAACCTGTAACTGTGGAAGCGAAGAATGAAACCTTTGCCCCGCAGCATCCCGATCAATATCTCTCCTGGAAAGCCACCTCGGAACAGTCAGAGCGTGTTGACGCCC > NZ_CP009273/4277398‑4277896 | aaGTAGAATTGTGCAAATAAACGGCAGGGTAATTTTTGAAGGTCAGCAACAAAAGTTGATTAATTCTTTGAGGAACATGCA‑GTTATGCATGCTGTTGAAAAAGAGGAAGATACTGACTAACTCTAAAGT‑GGTATTTTACATGCAC‑TTACAATTG‑ATTAAAGACAACATTCACAGT‑GTGGTTATTT‑GTTACAC‑ATAGGGGCGAGCAATGTCATG‑AC‑AGTGTAGGTGCGGTTACT‑GTCGTGAAAAAC‑AATa > 1:91356/1‑249 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |