| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 1,870,272 | 0 | A | G | 30.4% | 103.8 / 11.1 | 58 | I115V (ATT→GTT) | nimT | 2‑nitroimidazole transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (12/27); new base G (17/0); total (31/27) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.16e-07 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GCAGCACCGTTACTGGATACGATTCGTTCCGCTTACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGA‑TCGGCTATGGTCGTG‑CCGCTGGC‑TTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGC‑GTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTCTGCTGGCTCTTTTTTTATGGCTGCCACAGTGGCGAAGTCAACAACATGCAAAT > NZ_CP009273/1870026‑1870514 | gcagccCCGTTACTGGATACGTTTCGTCCCGCTTACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTg < 2:150596/250‑1 (MQ=255) cagcaCCGTTACTGGTTACGATTCGTTCCGCTTACTCGCGGACGACAGCGCAAACCGTCTTATTGACCCCCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCGTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGc < 2:651699/250‑1 (MQ=255) agcaCCGTTACTGGATACGATTCGTTCCGCTTACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGGTTGCa > 1:125235/1‑250 (MQ=255) ccGTTACTGGATACGATTCGTTCCGCTTACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAg < 1:248930/250‑1 (MQ=255) gATACGATTCGTTCCGCTTACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTc < 2:223123/249‑1 (MQ=255) aTACGATTCGTTCCGCTTACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCtt < 1:213613/250‑1 (MQ=255) aaCGATACGTTCCGCTTACTCTCTGACAACAGCCAAAACCGACTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCGTTGCGCTAATCTCTCCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTATTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTGTCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTAGGATTGCATTAGGCAATGTCTTa < 2:213325/249‑1 (MQ=255) cGATTCGTTCCGCTTACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCGCCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACt < 1:229671/250‑1 (MQ=255) ttCCGCTTACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGa < 1:183041/250‑1 (MQ=255) cGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAAcg > 1:273442/1‑250 (MQ=255) aaaCCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGGTTGCCTTATGCAATGTCTTTCTGCCCGGATTAATTTAACGCGATTTTCCTCATTc > 2:340355/1‑250 (MQ=255) cccGGCTTATTGACCCCCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCTCATTCCg < 1:551235/249‑1 (MQ=255) cccGCCTTTTTGCCCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCACATTCCg < 2:56735/249‑1 (MQ=255) ttATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGGTTGGCTTAGGCAAAGTTTTTCTTACAGGGTTAGTTTAAAGAGATTTCCCTCACTCCGACGcgc > 2:387186/1‑248 (MQ=255) ttGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGAc < 1:200302/250‑1 (MQ=255) cccTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTATGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCgg < 1:189766/250‑1 (MQ=255) tGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGGTTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGGTTAATTAAACGCGATTTTCCCCCTTCCCTCGCCAGACTTACCGgcg > 1:571029/1‑249 (MQ=255) gCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTTTTTCTGCCAGGATTAATTAAAAGCGATTTCCCTCATTCCCTCGCCACACTTACCGGCGCa > 1:153616/1‑250 (MQ=255) gcTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGa < 1:238262/250‑1 (MQ=255) gcTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGa < 1:652122/250‑1 (MQ=255) cTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAg > 1:213423/1‑250 (MQ=255) tAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGGTTTCATTTGGCCATGTCTTACTTCCCGGATTAATTAAACGCGATTTTCCTCTTTCCCTCGCCCGACTTACCGGCGCATATTTCCTTTCAATTGGGGc > 1:394507/1‑250 (MQ=255) tAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGc > 1:571176/1‑250 (MQ=255) ctcACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGGTTGCCTTAGGCAATGTCTTTCTTCCAGGGTTAATTAAACGCGATTTCCCTCATTTCGTCGCCCGACTTACCCGGGCATATTTCCTGACAATGGGGGCTGcc > 2:422266/1‑249 (MQ=255) aCCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTTCAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGGCTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCg < 2:418103/250‑1 (MQ=255) aCCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCg < 2:61962/250‑1 (MQ=255) tGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGGGTTCCTTTAGAAACGTCTTACCGCCAGGATGCATTACAAGCGACTTCCCTCATTTCGGCGGCTTCCTTACCGGCGCACAGTTCCTTGCCACGGGAGCtcgcgtggcacc > 2:405720/1‑239 (MQ=255) cTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGGTTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTggg > 1:479867/1‑250 (MQ=255) gCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGGTTGCATTAGGCAATGTCTTTCTGCCAGGGTTAATTAAACGCGATTTCCCTCCTTCCCTCGCCAGACTTTCCGGCGCATATTCCCTGACACTGGGGGCTGCAGCGGCACTggggt > 2:348343/1‑248 (MQ=255) ccGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGA‑TCgg < 2:273442/250‑1 (MQ=255) ccGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCCCATTCCGTTGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCCGCAGCGGGACTGGGG‑TCgg > 1:164983/1‑250 (MQ=255) cgcgACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTTGGTGTTCATTTGGCAATGTCTTTCTCCCCAGCATAATTAAAAGCGCGTTTCCTCCTTCCTTTGCCCGACCTACCCGCGCATTTTCCCTGCCAATGCGCGCTGCCGCGGCCCCGGGA‑TCGGccctggg > 2:486045/1‑244 (MQ=255) ggTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGA‑TCGGCTATGGTCGTG‑CCGCTgg > 1:33420/1‑250 (MQ=255) aCGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGGTTGCATTATGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACCTACCGGCGCATATTTCCTTACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGA‑TCGGCCATGGTCGTT‑CCGCTGGC‑TTTGAAc > 1:552520/1‑250 (MQ=255) aCGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGGTTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAAAGCGATTTTCCTCATTCCGTTGCCAGAACTACCGGCGCATATTTCCTGACAATGGGGGCTGCAGCGGCACTGGGA‑TCGGGCATGGTCGTG‑CCGCTggggttggac > 2:60209/1‑242 (MQ=255) aCGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGA‑TCGGCTATGGTCGTG‑CCGCTGGC‑TTTGAAc < 1:593117/250‑1 (MQ=255) tttGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGA‑TCGGCTATGGTCGTG‑CCGCTGGC‑TTTGAACGGTTTtgg < 1:214761/248‑1 (MQ=255) cgcgTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGCTTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGA‑TCGGCTATGGTCGTG‑CCGCTGGC‑TTTGAACGGTTTtgtctggc > 1:288471/1‑248 (MQ=255) cgTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTAACGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGG‑TCGGCTATGGTCGTG‑CCGCTGGC‑TTTGAACGGGTTTGGCTGGCaaag > 1:360540/1‑248 (MQ=255) gTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGGGGGGTTGCATTAGGCAATGTCTTTCTCCCAGGGTTTATTAAACGCGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCCGCGCTTATTCCCTGACCATGGGAGCTGCAGAGGCACTTGGA‑ATCGCCATGGGTGGG‑GCGCTGGG‑TTTGTAAGGGTTTTGCTTGCGAGgc > 2:209907/1‑250 (MQ=255) ttACTTTTGATTTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGTTTGCCTTATGCAATATCTTACTGCCAGGGTTTATTTAACGCGATTTTCCTCATTACAGCGGCAGACTTAACCGAGCCCATTCCCTTAAAATGGGGGTAGCAGCGGATCTGTGAGCCGGCTA‑GCTCGTG‑CCGCTGGG‑TCTGTCCGGGTTTTGGTGGCaaaggg > 2:517245/1‑246 (MQ=255) cTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGGTTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGCTTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGA‑TCGGCTATGGTCGTG‑CCGCTGGC‑TTTGAACGGTTTTGGCTTGCAAAGCGC‑Gt > 1:371998/1‑250 (MQ=255) tGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGGTTGCATTATGCAATGTCTTATCTCCAGGGTTAATTAAACGCGCTTTTCCTCATTCCGTCGCCCGACTTATCGGCGCATATTCCCTGTCAATGGGGGCTGCCGCGGCACTGGGA‑TCGGCCATTGTCTTG‑CCGGTCGCTTTTGACCGTTTTTGGTGGGCAGGgccggtgct > 2:478380/1‑243 (MQ=255) tgCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGA‑TCGGCTATGGTCGTG‑CCGCTGGC‑TTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGC‑GTTGCTCATGCTg < 2:571176/250‑1 (MQ=255) cTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGGTTGCCTTAGGCAATGTCTTTCTGCCAGGGTTAATTAAAAGCGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTTCCTGACAATGGGAGCTGCCGCGGCACTGGGA‑TCGGCTATGGTCGTG‑CCGCTGGG‑TTTGGACGGGTTTGGCTGGCAAGGCGC‑GGTGGTCACGCTggt > 2:135435/1‑248 (MQ=255) tCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTTCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGA‑TCGGCTATGGTCGTG‑CCGCTGGC‑TTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGC‑GTTGCTCATGCTGATGTGttt > 1:498286/1‑250 (MQ=255) tcCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGA‑TCGGCTATGGTCGTG‑CCGCTGGC‑TTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGC‑GTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTCTGCTGGct < 1:340355/248‑1 (MQ=255) gCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGA‑TCGGCTATGGTCGTG‑CCGCTGGC‑TTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGC‑GTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTCTGCTGGCTCTTTTTTTa < 1:58816/250‑1 (MQ=255) acttaTTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGA‑TCGGCTATGGTCGTG‑CCGCTGGC‑TTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGC‑GTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTCTGCTGGCTCTTTTTTTATGGc < 1:336346/249‑1 (MQ=255) acgtatgatTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGA‑TCGGCTATGGTCGTG‑CCGCTGGC‑TTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGC‑GTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTCTGCTGGCTCTTTTTTTATGGc < 2:459966/246‑1 (MQ=255) ttattaTTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGGTTGCCTTTAGCAATTTCTTTCTGCCAGGGTTAATTAAACGCGATTTTCCTCCTTCCGTCGCCCGACTTACCCGCGCATATTCCCTGACAATTGGAGCTGCCGCGGCCCTGGGG‑TCGGCTCTGGTCCTG‑CCGCTGGC‑TTTTAGCGGGTTTTGCTGGCCAATGGC‑GTTGTTCCTGCCGGTGGTGTTTCTTCTTCTGTGCCttttttttttgtcgc > 2:230375/1‑242 (MQ=255) tttGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGA‑TCGGCTATGGTCGTG‑CCGCTGGC‑TTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGC‑GTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTCTGCTGGCTCTTTTTTTATGGCTGCCACAg < 2:92232/249‑1 (MQ=255) ggCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGGGTGCCTTTGGCAAAGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCTCATTTCGTCGCCAGACTTACCAGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGGCCTGGGA‑TCGGGTTTGGTCGTGCCCCCTGGC‑‑TTGTACGGGTTTTGCTGGCAAGGCGCGGTTGC‑CATGTTGGATTGTTTTCCTCTGTTGGTCCTTTTTTTTTTGCTTCCACAGTTGc > 2:163634/1‑250 (MQ=255) ggTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGGGCTGCAGCGGCACTGGGA‑TCGGCTATGGTCGTG‑CCGCTGGC‑TTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGC‑GTTGCTCATGCTGGTGTGTTTTCCTCTGCTGGCTCTTTTTTTATGGCTGCCACAGTgggg > 1:266410/1‑246 (MQ=255) gTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGA‑TCGGCTATGGTCGTG‑CCGCTGGC‑TTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGC‑GTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTCTGCTGGCTCTTTTTTTATGGCTGCCACAGTGGCGAAg < 1:60209/250‑1 (MQ=255) cGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGA‑TCGGCTATGGTCGTG‑CCGCTGGC‑TTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGC‑GTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTCTGCTGGCTCTTTTTTTATGGCTGCCACAGTGGCGAAGTcaaca < 2:558738/250‑1 (MQ=255) tGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGA‑TCGGCTATGGTCGTG‑CCGCTGGC‑TTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGC‑GTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTCTGCTGGCTCTTTTTTTATGGCTGCCACAGTTGCGAAggccaccaactgc > 2:347573/1‑237 (MQ=255) cGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGA‑TCGGCTATGGTCGTG‑CCGCTGGC‑TTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGC‑GTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTCTGCTGGCTCTTTTTTTATTGCTGCCACCGTGGCCGAGTCAACAACATGCTAAt > 2:309486/1‑250 (MQ=255) | GCAGCACCGTTACTGGATACGATTCGTTCCGCTTACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACGCGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGA‑TCGGCTATGGTCGTG‑CCGCTGGC‑TTTGAACGGTTTTGGCTGGCAAGGCGC‑GTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTCTGCTGGCTCTTTTTTTATGGCTGCCACAGTGGCGAAGTCAACAACATGCAAAT > NZ_CP009273/1870026‑1870514 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |