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aTTATCAAG‑AACTATTCCAGTACGAGAGCAGCTATAAATTAAGCTAGC‑TAAAAATGCCAATAAAATAAATAAAAGACTTGTATTACCTGACGAATATATAAC‑ACTTGAATTTAAAGGTATGAGCGGAGCAGGTGCTATAGAAGTAGATAAAAAT‑CTGACCGTCAGGATTCGCGGATTAAATAACATTCATGTCCTTGACTGCTTTGTTAATGTTGATCTGGAACCAGCTGATGGCGTTGTCGACTTTGGt < 2:572000/250‑1 (MQ=255) ttATCAGT‑AACTTTTCCAGTACGAGTGCAGCTATATATTAAGCTAGC‑TAAAAATGCCAATAAAGTAAATAAAAAACTTGTATTACCTGACGAATATATAGC‑ACTTGAATTTAAAGGTATGAGCGGAGCAGGTGCTATAGAAGTAGATAAAAAT‑CTGACCTTCAGGATTCGCGGATTAAATAACATTCATGTCCTTGACTGCTTTGTTAATGTTGATCTGGAACCAGCTGATGGCGTTGTCGACTTTGGTa < 1:443764/250‑1 (MQ=255) tCAGT‑AACTTTTCCAGTACGAGTGCAGCTATATATTAAGCTAGC‑TAAAAATGCCAATAAAGTAAATAAAAAACTTGTATTACCTGATGAATATATAGC‑ACTTGAATTTAAAGGTATGAGCGGAGCAGGTGCTATAGAAGTAGATAAAAAT‑CTGACCTTCAGGATTCGCGGATTAAATAACATTCATGTACTTGACTGCTTTGTTAATGTTGATCTGGAACCAGCTGATGGCGTTGTCGACTTGGGTaaaa > 1:441553/1‑250 (MQ=255) tCAGT‑AACTTTTCCAGTACGAGTGCAGCTATATATTAAGCTAGC‑TAAAAATGCCAATAAAGTAAATAAAAAACTTGTATTACCTGACGAATATATAGC‑ACTTGAATTTAAAGGTATGAGCGGAGCAGGTGCTATAGAAGTAGATAAAAAT‑CTGACCTTCAGGATTCGCGGATTAAATAACATTCATGTCCTTGACTGCTTTGTTAATGTTGATCTGGAACCAGCTGATGGCGTTGTCGACTTTGGTaaaa > 2:116511/1‑250 (MQ=255) tCAGT‑AACTTTTCCAGTACGAGTGCAGCTATATATTAAGCTAGC‑TAAAAATGCCAATAAAGTAAATAAAAAACTTGTATTACCTGACGAATATATAGC‑ACTTGAATTTAAAGGTATGAGCGGAGCAGGTGCTATAGAAGTAGATAAAAAT‑CTGACCTTCAGGATTCGCGGATTAAATAACATTCATGTCCTTGACTGCTTTGTTAATGTTGATCTGGAACCAGCTGATGGCGTTGTCGACTTTGGTaaa < 2:219002/249‑1 (MQ=255) aGT‑AACTTTTCCAGTACGAGTGCAGCTATATATTAAGCTAGC‑TAAAAATGCCAATAAAGTAAATAAAAAACTTGTATTACCTGACGAATATATAGC‑ACTTGAATTTAAAGGTATGAGCGGAGCAGGTGCTATAGAAGTAGATAAAAAT‑CTGACCTTCAGGATTCGCGGATTAAATAACATTCATGTCCTTGACTGCTTTGTTAATGTTGATCTGGAACCAGCTGATGGCGTTGTCGACTTTGGTAaaat > 1:327697/1‑249 (MQ=255) cTTTTCCAGTACGAGTGCAGCTATATATTAAGCTAGC‑TAAAAATGCCAATAAAGTAAATAAAAAACTTGTATTACCTGACGAATATATAGC‑ACTTGAATTTAAAGGTATGAGCGGAGCAGGTGCTATAGAAGTAGATAAAAAT‑CTGACCTTCAGGATTCGCGGATTAAATAACATTCATGTCCTTGACTGCTTTGTTAATGTTGATCTGGAACCAGCTGATGGCGTTGTCGACTTTGGTAAAATAAATTc > 2:166133/1‑250 (MQ=255) | CAGGAGAAGAATACCCATCTGCATGGGCAAATATAATGATGTTGTTAGCATCAGGTCAAGACTTTTATAATCAAAACTCTTATACTTTCGGTGTAACTTATAATGGGGTTGATTATGATTCTACATCTCCACTACCTATTGCAGCACCTGTATGTATTGATATAAAGGGAGCCGGAACCTTCGGGAATGGCTACAAAAAGCCCGCAGTCTGTAGTGGCGGTCCTGAACCGCAATTATCAGT‑AACTTTTCCAGTACGAGTGCAGCTATATATTAAGCTAGC‑TAAAAATGCCAATAAAGTAAATAAAAAACTTGTATTACCTGACGAATATATAGC‑ACTTGAATTTAAAGGTATGAGCGGAGCAGGTGCTATAGAAGTAGATAAAAAT‑CTGACCTTCAGGATTCGCGGATTAAATAACATTCATGTCCTTGACTGCTTTGTTAATGTTGATCTGGAACCAGCTGATGGCGTTGTCGACTTTGGTAAAATAAATTC > NZ_CP009273/3184214‑3184706 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |