Read alignment evidence... | |||||||||||
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TTATAAAAACCAGGGGACCGCGCAAAACATCCAGTTAGAGCTACAGGATGACAGTGGCAACACATTGAATACTGGCGCAACCAAAACAGTTCAGGTGGATGATTCCTCACAATCAGCG‑CACT‑TCCCGTTACAGGTCAGAGCATTGACAGTAAATGGCGGAGCCACTCAGGGAACCA‑TTCAGGCAGTGATTAGCATCACC‑TATACCTACAGCTGAACCCGAAGAGATGATTGTAATGAAACGAGTTATTACCCTGTTTGCTGTACTGCTGATGGGCTGGTCGGTAAATGCCT‑GGTCATTCGCCTGTAAAACCGCCAATGGTACCGCTATCCCTATTGGC‑GGTGGCAGCGCC‑AATGTTTATGTAAACCTTG‑CGCCCGTCGTGAATG‑TGGGGC‑AAAACCTGGTCGTGGATCTTTCGACGCAAATCTTTTGCCATAACGATTATCCGGAAACCATTACAGACTATGTCACACT‑GCAACGAGGCTCGGCTTATGGCGGCGTGT > NZ_CP009273/4538392‑4538889 | ttatAAAAACCAGGGGACCGCGCAAAACATCCAGTTAGAGCTACAGGATGACAGTGGCAACACATTGAATACTGGCGCAACCAAAACAGTTCAGGTGGATGATTCCTCACAATCAGCG‑CACT‑TCCCGTTACAGGTCAGAGCATTGACAGTAAATGGCGGAGCCACTCAGGGAACCA‑TTCAGGCAGTGATTAGCATCACC‑TATACCTACAGCTGAACCCGAAGAGATGATTGTAATGAAACGAGTTATTAc < 2:17533/250‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |