New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NZ_CP009273 | 2654891 = | 4 (0.050) | 93 (1.050) | 82/494 | 0.1 | 95.9% | intergenic (‑1/+111) | iscS/iscR | cysteine desulfurase/Fe‑S cluster assembly transcriptional regulator IscR |
? | NZ_CP009273 | 3576788 = | NA (NA) | coding (391/417 nt) | BW25113_RS17825 | YrhA family protein |
GTTTTCTCAACAACATTACTTTAGGCGAACTGGTTAATAACCAGGAAGTGCTGGATGTGTCTGGTCGTCAGCATACTCACGACGCGCCACGCACCCGCACACAAGACGCGATCGACGTTAAGTTACGCGCTTAATAAAAAGAATTCAGAATCAGGCCGGAGTGCTAAATACTCCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP009273/2655135‑2654891 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCATTGATATGGCCATGAATGGCGTTGG > NZ_CP009273/3576788‑3577036 GTTTTCTCAACAACATTACTTTAGGCGAACTGGTTAATAACCAGGAAGTGCTGGATGTGTCTGGTCGTCAGCATACTCACGACGCGCCACGCACCCGCACACAAGACGCGATCGACGTTAAGTTACGCGCTTAATAAAAAGAATTCAGAATCAGGCCGGAGTGCTAAATACTCCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGA < 1:460222/250‑1 TTTCTCAACAACATTACTTTAGGCGAACTGGTTAATAACCAGGAAGTGCTGGATGTGTCTGGTCGTCAGCATACTCACGACGCGCCACGCACCCGCACACAAGACGCGATCGACGTTAAGTTACGCGCTTAATAAAAAGAATTCAGAATCAGGCCGGAGTGCTAAATACTCCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATG > 2:114893/1‑250 TTTCTCAACAACATTACTTTAGGCGAACTGGTTAATAACCAGGAAGTGCTGGATGTGTCTGGTCGTCAGCATACTCACGACGCGCCACGCACCCGCACACAAGACGCGATCGACGTTAAGTTACGCGCTTAATAAAAAGAATTCAGAATCAGGCCGGAGTGCTAAATACTCCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGAT < 2:513087/249‑1 TTCTCAACAACATTACTTTAGGCGAACTGGTTAATAACCAGGAAGTGCTGGATGTGTCTGGTCGTCAGCATACTCACGACGCGCCACGCACCCGCACACAAGACGCGATCGACGTTAAGTTACGCGCTTAATAAAAAGAATTCAGAATCAGGCCGGAGTGCTAAATACTCCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGC > 1:212775/1‑250 TTCTCAACAACATTACTTTAGACGAACTGGTTAATAACCAGTAAGTGCTGGAGGTGTCTGGTCGTCAGCATACTCACGACGCGCCACGCACCCGCACGCAAGACGCGATCGACGTTAAGTTACGCTCTTAATAAAAAGAATTCAGAATCAGGCCGGAGTGCTAAATACTCCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATG < 2:825507/249‑1 TCAACAACATTACTTTAGGCGAACTGGTTAATAACCAGGAAGTGCTGGATGTGTCTGGTCGTCAGCATACTCACGACGCGCCACGCACCCGCACACAAGACGCGATCGACGTTAAGTTACGCGCTTAATAAAAAGAATTCAGAATCAGGCCGGAGTGCTAAATACTCCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGC > 1:723873/1‑250 AACAACATTACTTTAGGCGAACTGGTTAATAACCAGGAAGTGCTGGATGTGTCTGGTCGTCAGCATACTCACGACGCGCCACGCACCCGCACACAAGACGCGATCGACGTTAAGTTACGCGCTTAATAAAAAGAATTCAGAATCAGGCCGGAGTGCTAAATACTCCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCA < 1:670579/250‑1 AACAACATTACTTTAGGCGAACTGGTTAATAACCAGGAAGTGCTGGATGTGTCTGGTCGTCAACATACTCACGACGCGCCACGCACCCGCACACAAGACGCGATCGACGTTAAGTTACGCGCTTAATAAAAAGAATTCAGAATCAGGCCGGAGTGCTAAATACTCCGTAAACACTGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCA < 1:413340/250‑1 CATTACTTTAGGCGAACTGGTTAATAACCAGGAAGTGCTGGATGTGTCTGGTCGTCAGCATACTCACGACGCGCCACGCACCCGCACACAAGACGCGATCGACGTTAAGTTACGCGCTTAATAAAAAGAATTCAGAATCAGGCCGGAGTGCTAAATACTCCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTA < 1:88348/250‑1 TTACTTTAGGCGAACTGGTTAATAACCAGGAAGTGCTGGATGTGTCTGGTCGTCAGCATACTCACGACGCGCCACGCACCCGCACACAAGACGCGATCGACGTTAAGTTACGCGCTTAATAAAAAGAATTCAGAATCAGGCCGGAGTGCTAAATACTCCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACT > 2:570081/1‑250 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AACTGGTTAATAACCAGGAAGTGCTGGATGTGTCTGGTCGTCAGCATACTCACGACGCGCCACGCACCCGCACACAAGACGCGATCGACGTTAAGTTACGCGCTTAATAAAAAGAATTCAGAATCAGGCCGGAGTGCTAAATACTCCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT < 1:169500/250‑1 AACTGGTTAATAACCAGGAAGTGCTGGATGTGTCTGGTCGTCAGCATACTCACGACGCGCCACGCACCCGCACACAAGACGCGATCGACGTTAAGTTACGCGCTTAATAAAAAGAATTCAGAATCAGGCCGGAGTGCTAAATACTCCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT > 1:386837/1‑250 CCAGGAAGTGCTGGATGTGTCTGGTCGTCAGCATACTCACGACGCGCCACGCACCCGCACACAAGACGCGATCGACGTTAAGTTACGCGCTTAATAAAAAGAATTCAGAATCAGGCCGGAGTGCTAAATACTCCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGCGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGAATGTTGGTGTTTTTG > 2:491191/1‑250 CCAGGAAGTGCTGGATGTGTCTGGTCGTCAGCATACTCACGACGCGCCACGCACCCGCACACAAGACGCGATCGACGTTAAGTTACGCGCTTAATAAAAAGAATTCAGAATCAGGCCGGAGTGCTAAATACTCCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG < 1:220568/250‑1 CCAGGAAGTGCTGGATGTGTCTGGTCGTCAGCATACTCACGACGCGCCACGCACCCGCACACAAGACGCGATCGACGTTAAGTTACGCGCTTAATAAAAAGAATTCAGAATCAGGCCGGAGTGCTAAATACTCCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT > 1:259280/1‑249 AGGAAGTGCTGGATGTGTCTGGTCGTCAGCATACTCACGACGCGCCACGCACCCGCACACAAGACGCGATCGACGTTAAGTTACGCGCTTAATAAAAAGAATTCAGAATCAGGCCGGAGTGCTAAATACTCCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATCTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG > 2:670406/1‑250 GAAGTGCTGGATGTGTCTGGTCGTCAGCATACTCACGACGCGCCACGCACCCGCACACAAGACGCGATCGACGTTAAGTTACGCGCTTAATAAAAAGAATTCAGAATCAGGCCGGAGTGCTAAATACTCCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT < 2:2749/250‑1 GAAGTGCTGGATGGGTCTGGTCGTCAGCATACTCACGACGCGCCACGCACCCGCACACAAGACGCGATCGACGTTAAGTTACGCGCTTAATAAAAAGAATTCAGAATCAGGCCGGAGTGCTAAATACTCCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGTTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT < 2:673516/250‑1 TGCTGGATGTGTCTGGTCGTCAGCATACTCACGACGCGCCACGCACCCGCACACAAGACGCGATCGACGTTAAGTTACGCGCTTAATAAAAAGAATTCAGAATCAGGCCGGAGTGCTAAATACTCCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTC > 2:223278/1‑250 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ACGCGCTTAATAAAAAGAATTCAGAATCAGGCCGGAGTGCTAAATACTCCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCG < 2:105412/249‑1 CGCGCTTAATAAAAAGAATTCAGAATCAGGCCGGAGTGCTAAATACTCCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCC < 1:28264/250‑1 CGCGCTTAATAAAAAGAATTCAGAATCAGGCCGGAGTGCTAAATACTCCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCC < 1:847568/250‑1 TAATAAAAAGAATTCAGAATCAGGCCGGAGTGCTAAATACTCCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGCCAT > 2:557203/1‑250 AAAGAATTCAGAATCAGGCCGGAGTGCTAAATACTCCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAATGCACCGCCGGACATCAGCGC > 2:657750/1‑250 GAATTCAAAATCAGGCTGGAGTGATAAATACTCCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTAT < 1:409106/250‑1 AATTCAGAATCAGGCCGGAGTGCTAAATACTCCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATC > 2:780311/1‑250 ATTCAGAATCAGGCCGGAGTGCTAAATACTCCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACCTCAGCGCTATCT > 1:514297/1‑250 AATCAGGCCGGAGTGCTAAATACTCCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTC > 2:643139/1‑250 ATCAGGCCGGAGTGCTAAATACTCCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCT < 1:8239/250‑1 CAGGCCGGAGTGCTAAATACTCCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCCTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCA < 2:266177/250‑1 GCTAAATACTCCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAA > 2:234859/1‑250 CCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTGCGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTGGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACGGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACT < 2:190092/250‑1 TAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTG > 2:554891/1‑248 AACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGT > 1:318094/1‑250 ACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTT < 2:773729/250‑1 ACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCA < 1:130326/250‑1 GTCGTACATCCAGCCGGTGGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTT < 2:362458/250‑1 CGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTAC > 1:155033/1‑250 GTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACA < 1:153679/250‑1 ATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGC < 2:402284/250‑1 CCAGCTGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTT > 1:826344/1‑250 AGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACCTGGCAACTGCAGTGCACTTACCCCGCTTCT > 2:274318/1‑250 CCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCA < 1:429524/250‑1 CGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAA > 1:338439/1‑250 GCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGG < 1:383770/250‑1 GCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCG < 1:39336/249‑1 GCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCG < 1:160691/249‑1 CTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACAGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTA > 2:181371/1‑250 TGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTAC > 2:248580/1‑250 TTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCA > 2:652030/1‑250 CCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCAC < 1:569714/249‑1 GCATTGAGTGAGGTTCGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTAACTGATTTAGTGTAGGTGGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAG < 2:39247/248‑1 ATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAA > 1:101830/1‑250 ATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCGGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAA < 2:417312/250‑1 TTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAAT < 1:376476/250‑1 GTGATGTACGGAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCATT > 2:705328/1‑250 GAGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCATTGATATGGCCA < 1:570081/250‑1 AGTTTATAGAGCAGTTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGGATGATGTGGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCAGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCATTGATATGGCCAT < 2:648380/250‑1 AGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCATTGATATGGCCAT < 1:693441/250‑1 AGTTTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGGATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCATTGATATGGCCAT < 1:24667/250‑1 TTATAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCATTGATATGGCCATGAA > 2:845432/1‑250 TAGAGCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCATTGATATGGCCATGAATGG < 1:749329/250‑1 CAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCATTGATATGGCCATGAATGGCGTTG > 1:438991/1‑250 AGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAACATCATTGATATGGCCATGAATGGCGTTGG > 2:459225/1‑250 AGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCATTGATATGGCCATGAATGGCGTTGG < 2:188047/250‑1 AGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCATTGATATGGCCATGAATGGCGTTG > 1:545188/1‑249 AGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCATTGATATGGCCATGAATGGCGTTG > 1:451029/1‑249 GTTTTCTCAACAACATTACTTTAGGCGAACTGGTTAATAACCAGGAAGTGCTGGATGTGTCTGGTCGTCAGCATACTCACGACGCGCCACGCACCCGCACACAAGACGCGATCGACGTTAAGTTACGCGCTTAATAAAAAGAATTCAGAATCAGGCCGGAGTGCTAAATACTCCGTAAACACGGTCGTACATCCAGCCGGTAGCCTGATTCCTTGCATTGAGTGATGTACGGAGTTTATAGAGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP009273/2655135‑2654891 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCATTGATATGGCCATGAATGGCGTTGG > NZ_CP009273/3576788‑3577036 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |