New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NZ_CP009273 | 3416618 = | 73 (0.720) | 9 (0.140) +GAATTAATTCCCCAGGCATCAAATAAAACGAAAGGCTCAGTCGAAAGACTGGGCCTTTCGTTTTATCTGTTGTTTGTCGGTGAACGCTCTCCT |
9/310 | 9.5 | 15.9% | intergenic (+65/+166) | yhdZ/rrf | amino acid ABC transporter ATP‑binding protein/5S ribosomal RNA |
? | NZ_CP009273 | = 3416707 | 79 (0.780) | intergenic (+154/+77) | yhdZ/rrf | amino acid ABC transporter ATP‑binding protein/5S ribosomal RNA | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTG‑AGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGG > NZ_CP009273/3416369‑3416865 | ggCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTc < 2:616374/250‑1 (MQ=255) gCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCt > 1:512557/1‑250 (MQ=255) gcgcAGTCGGGTATTACAATGTTGTGTGTAACACATTAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCa < 2:211953/250‑1 (MQ=255) cgcAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAg > 1:191200/1‑250 (MQ=255) gTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGCTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATTCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGCTGTCTGTCAGTTTa > 2:244088/1‑250 (MQ=255) gTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATggcg < 2:245103/250‑1 (MQ=255) tGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTCATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATggcgggg > 2:9806/1‑249 (MQ=255) tGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATggcggg < 1:678484/249‑1 (MQ=255) cAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATggcggggggc > 1:534495/1‑246 (MQ=255) cAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATggcgggcggc > 1:913996/1‑248 (MQ=255) gttgtGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTGCttg > 2:390713/1‑248 (MQ=255) tggttggtAACACATTAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTGTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGc < 2:907321/243‑1 (MQ=255) gtAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGTccgttccccccc > 2:85547/1‑240 (MQ=255) tAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGTCCtcgcccccccc > 1:686849/1‑240 (MQ=255) cacaTGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGGGCTGcccccccccccc > 1:544787/1‑248 (MQ=255) acaTGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGGCCCTCCCCCCAcccccc > 2:460020/1‑250 (MQ=255) acaTGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTcc < 1:710385/250‑1 (MQ=255) acaTGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCTGCcccccccccccc > 1:696295/1‑250 (MQ=255) agaTGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGc < 2:333248/249‑1 (MQ=255) cagAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCGTCACCTGATGAATTTTGTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTAGCGCAGGTAATCCATTAATTGGATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTGCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAAc < 2:378331/248‑1 (MQ=255) cGAACCGTGGCTGGCCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCGAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGGGGGCATTTTTAGCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTATTTGGAAAAGCAAAAAGTCCATCGTTGCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCTGCCCGGCGCCCTCCGGGCCGTTGGTTCGCAACg < 2:259880/250‑1 (MQ=255) cGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACg < 1:55123/250‑1 (MQ=255) aCCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCGCCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTc < 1:229135/250‑1 (MQ=255) aCCGGCGCTGGCCGGGTAATTGTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCCCCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTc < 2:739485/250‑1 (MQ=255) cGTGGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGTCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCaa < 2:514509/250‑1 (MQ=255) gTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGCGCCTTCCCGCCCCCCCCCCGGCCCTTGCTTCGCAACGTTcca > 1:631150/1‑247 (MQ=255) gggTAATGTTTATAGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAGGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGACATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCcg < 2:894161/250‑1 (MQ=255) gTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCcggc < 1:621455/250‑1 (MQ=255) aTTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAGTCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGa < 2:476389/250‑1 (MQ=255) ttATGGTTCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGAttt < 2:723529/249‑1 (MQ=255) tGGGTCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTcc < 1:405937/250‑1 (MQ=255) gggAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑Cggg < 1:674741/249‑1 (MQ=255) gAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGgaga < 1:430360/250‑1 (MQ=255) aGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGTCTGCCCGCCCCCCCCCCGGGCGGTGCTTCGGAAAGGTTAAATCCGCTCCCCGCGGGTTTTTTCTACT‑Ccggggaggggt > 1:171350‑M1/1‑239 (MQ=255) cAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGac < 2:276926/250‑1 (MQ=255) cACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAaacaac < 2:348768/250‑1 (MQ=255) atgaATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATaa < 1:154051/250‑1 (MQ=255) atgaATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATa < 2:229007/249‑1 (MQ=255) aaTTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCGGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATaaaa < 2:417974/249‑1 (MQ=255) ttttttGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACaa < 1:301564/250‑1 (MQ=255) aaTCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTc < 1:835518/248‑1 (MQ=255) agagGGTACGAGGGCATTGTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTGAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTGCGGATGGCCTTTCGCTGGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTg < 2:471489/250‑1 (MQ=255) agagCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCTGCCCCCCCCCCCCCCGGCCGGTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCCCCCCGCGGGGTTGTCCTACT‑CCGGAGAGGGGTTACCGACAAAAAACAAATAAAACAAAAAGCCCACTCTTCCCACTg > 1:634792/1‑250 (MQ=255) gagCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTG‑a < 2:337596/250‑1 (MQ=255) gCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTGGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTG‑AGc < 2:668243/250‑1 (MQ=255) cGAGGGCATTTTAGTCGGAGGTAATCCATTAATGGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGACATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCGGCCCGCCGCCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTG‑AGCCtttt < 2:949841/250‑1 (MQ=255) gggCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTG‑AGCCTTTTGtt < 2:159941/250‑1 (MQ=255) ggCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTG‑AGCCTTTTGttt < 2:758039/250‑1 (MQ=255) gCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTG‑AGCCTTTTGtttt < 1:762955/250‑1 (MQ=255) aTTTTTAGCGCAGGTAATCCATTAATTGAAGGTGAGTGCGAAAAGAAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTG‑AGCCTTTTGTTTTAt < 2:478531/250‑1 (MQ=255) tttATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTG‑AGCCTTTTGTTTTAttt < 1:530115/249‑1 (MQ=255) ttATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTG‑AGCCTTTTGTTTTATTTg < 2:543028/249‑1 (MQ=255) tATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTG‑AGCCTTTTGTTTTATTTGa < 1:544053/249‑1 (MQ=255) aTCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCCGCCCCCCCCCCCCCCCGCCGCGTCTTCTCCACATTCCAATCCCCCCCCCCCGGGGTTTTTCTACC‑CTGGGGGGGGTTCTACCACCAAAAACAGAAAAAACACAAAGACCACTCTTACCCCTGCAGCCTTTTGttttttttttt > 2:202236/1‑247 (MQ=255) aGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTG‑AGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTgg < 1:201977/250‑1 (MQ=255) aTCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTG‑AGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGtt < 1:594571/250‑1 (MQ=255) aTCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTG‑AGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGt < 1:397599/249‑1 (MQ=255) ttAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTG‑AGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTa < 1:480453/250‑1 (MQ=255) attacaTGTAAGTATGAAAAGGAAAGAGGAGATCGTTCCGGATGTCCTTACGTTTGATTTGAAGTTTGGCAGTTATGGGCGGGGCTCCGACCGGACGCCCGCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTG‑AGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTActc < 2:762802/245‑1 (MQ=14) aTTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTG‑AGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTAct < 2:29387/249‑1 (MQ=255) aaTGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCTTCCTTTCGGATTGCCTTCCGCTTGATTTGATGTCTGGCATTTTATGGCGGTCGTCCTGCCCGCCCCCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTG‑AGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCg < 2:425913/249‑1 (MQ=255) gTTCGAAAAGCAAAAGGGCCCTTCTTTCGGATGCCCTGTCGCTGGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTG‑AGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGga < 2:538631/250‑1 (MQ=255) gTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTG‑AGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGga < 1:225011/250‑1 (MQ=255) ttCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCCCCCCCCCCCCGGCCGGTGCGTTGCAACGTTCAAATACCCCCCCCCCGGGGTTGTTCTACTCCGGGGGGGGGTTC‑CCCCCAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAGCCCAGTCCTCCGACTG‑GGACCTTTGTTTTTTTTTATGTCTGGCAGGTCCCTACtctctctcgggggg > 2:226456/1‑240 (MQ=255) aaaaaGGCCATCCTTTCGGAAGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTG‑AGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACt < 2:116517/250‑1 (MQ=255) ggCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCGGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTG‑AGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCAt < 2:876831/250‑1 (MQ=255) tCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTG‑AGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTa < 1:698305/248‑1 (MQ=255) tCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTG‑AGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTa < 1:390713/248‑1 (MQ=255) ggATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTG‑AGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGc < 1:861461/250‑1 (MQ=255) gATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCCCCACCCTCCCGGCCGTTGCTTCGCAACCTTCAAATCCGCTCCCGGCGGGTTTTTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTTACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAAGCCCAGTCTTTCCCCTG‑AGCCTTTTGTTTTTTTTGATGTCTGGCAGTTTCCTACTCTCTCCTGGGGAGACCCCCCACTACCATCGGCGCTACGGCg > 1:562701/1‑250 (MQ=255) ccTTGCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTG‑AGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCa < 1:909524/250‑1 (MQ=255) gCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTG‑AGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCt < 1:460020/249‑1 (MQ=40) atttgatGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTG‑AGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGtt < 2:161753/249‑1 (MQ=39) tgatGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTG‑AGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCgg < 1:252966/249‑1 (MQ=39) cTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑Caggagagcgttcaccgacaaacaacagataaaacgaaaggcccagtctttcgactgagcctttcgttttatttgatgcctggggaattaattcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgcttcgcaacgttcaaatcc < 1:714982‑M1/249‑160 (MQ=255) | GGCTGGCGCAGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACT‑CGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTG‑AGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGG > NZ_CP009273/3416369‑3416865 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |