| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 3,806,632 | 0 | C | T | 38.0% | 44.8 / 23.4 | 50 | S181L (TCG→TTG) | coaBC | bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate‑‑cysteine ligase CoaBC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (10/21); new base T (19/0); total (29/21) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.40e-07 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CGGAATGGCGAATGACCTGGTATCGACGATTTGTCTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTA‑GCGC‑ATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGATTACC‑G‑CCGGCCCGAC‑GCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGTTTCACTACCGACG‑CCACCGTTTGTTAAACGTGTTGATGTGATGACCGCGCTGGAAATGGAAGCCGCCGTGAATGCT > NZ_CP009273/3806390‑3806879 | cGGAATGGCGAATGACATGGTATCGACGATTTGTCTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACAAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCAGTTAACCATTGTGGATATGGG‑GGTA‑GCGC‑GTGTTTTTCCCgcc > 2:868357/1‑248 (MQ=255) aTGGCGAATGACCTGGTATCGACGATTTGTCTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTC‑GCGC‑AATTTTCTCCCGTCAAc > 1:762354/1‑249 (MQ=255) cGAATGACCTGGTATCGCCGTTTTGTCTGGCTACCCCTGCGCCTGTGGCCGTGCCCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTA‑GCGC‑ATTTTTCGCCCGTCAACGACCt < 1:274394/250‑1 (MQ=255) gAATGACCTGGTATCGACGATTTGTCTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGGGG‑GCGA‑GTTTTTTGCCCGCCAACgcc > 2:718964/1‑246 (MQ=255) atgtcaTCGCCGTTTTGCCTGTCTACCCCTTCCCCTGTCCCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTA‑GCGC‑ATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATc < 2:966367/245‑1 (MQ=255) gacgaTTTGTCTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTA‑GGGC‑ATTTTTTTCCCGTCCACGACCTGGAACAACTGAACaat > 1:556933/1‑248 (MQ=255) cgaTTTGTCTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTAGGCGC‑TTTTTTTGCCC‑TCCAAGACCTCACACCACTGAAAATTAt > 2:370317/1‑250 (MQ=255) gaTTTGTCTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTA‑GAGC‑ATTTTTTGCCCGGCCACGAACTGAAACATCTGAACAatat > 1:563139/1‑249 (MQ=255) ttttGTCGGGCTACACCTGCGCCTGTGGCCTTGCCCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTA‑GCGC‑ATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTAt < 1:866353/247‑1 (MQ=255) tGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTA‑GCGC‑ATTTTTCTCCCGTCAAAGACCCGAAACAACTGAAAAATATGATTatacc > 1:389095/1‑246 (MQ=255) ggCTACACCGGCGCCTGGAGCCGTGCCCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTA‑GCGC‑ATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGATTAcc‑g‑cc < 1:467300/250‑1 (MQ=255) cggcCTGTCGCCGTCCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTA‑GCGC‑ATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGATTACC‑G‑CCGGCCCGAc‑gc < 1:155901/248‑1 (MQ=255) gcCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTA‑GCGC‑ATTTTTTTCCCGTCCACGACCTGGAAAATCTGAACATTATGATTACC‑G‑CCGGCCCGCc‑gcgg > 1:856149/1‑249 (MQ=255) gcCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTA‑GCGC‑ATTTTTTTCCCGTCCACAGCCTGAAAAATCTGAACATTATTATTACC‑C‑CCGGccccccgccg > 1:66984/1‑243 (MQ=255) gcCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTA‑GCGC‑ATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAAAATTATGATTACC‑G‑CCGGCCCGAC‑GCGt > 1:732427/1‑250 (MQ=255) tGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGTCAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGCA‑GCGC‑CATTTTCGCCCGCCACAGACCCGAAACAACTAAACAATATTTTTTCC‑G‑CCCGCCcgcc‑gccgcaa > 1:965375/1‑245 (MQ=255) aGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTA‑GCGC‑ATTTTTTTCCCCTCCAAGACCCTGCACATCTGAAACTTAATATTACA‑C‑CCGGCCCCCC‑GCGTGAACCg > 2:576336/1‑250 (MQ=255) ccGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGGA‑GCGC‑ACTTTTTGCCCGCCAACAACCTGAAACATCTGAACATTATGTTTTCC‑GCCCGGCCCG‑C‑CCGTGaaacccc > 2:374156/1‑245 (MQ=255) ccccGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTA‑GCGC‑ATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGATTACC‑G‑CCGGCCCGAC‑GCGTGAACCGCTCGATCCg < 1:400868/250‑1 (MQ=255) ccgtGAACCAGCAGATGTGCCGGTCCGCGGCCACGCAGCATAATGTAGAGTTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATTGGGGGGCCAGGCGGTGGCAGTCGGGCTTGTGGTGATCTCGGCCCTGGGAGATTTCTCGTTCCTTTAACCATTGGGGATATGGC‑GGTA‑GCGC‑ATTTTTCGCCCGTCACCGACCTGAAACATCTGAACATTATGATTACC‑G‑CCGGCCCGAC‑GCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCg < 2:938747/247‑1 (MQ=255) aaCCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTA‑GCGC‑ATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGATTACC‑G‑CCGGCCCGAC‑GCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTtat < 1:331705/249‑1 (MQ=255) aCCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTT‑GGGC‑CTTTTTTGTCCCTCCACCACCCGGAACAACTGTACACTATTATTTCCGG‑CCGCCCCGCC‑CCGTGACCCCCCCGTTCCgtcgggtctta > 2:746556/1‑240 (MQ=255) ccGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTA‑GCGC‑ATTTTTTGCCCGTCAACGAACCGAAACATCTGAAAAATATGATTAAC‑G‑CCGGCCCGGC‑GCGGGGAACGCCCGATCCGGGGCGGTATATCTCTAATcaaaac > 1:373960/1‑246 (MQ=255) ccACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGGA‑GCGC‑ATTTTTCGCCCGGCAAACACCCGGAAAATCTGAACATTATGATTAAC‑G‑CCCGCCCCAC‑GCGGGAAACGCTCCAACCCGGGGGGTATTTCTTTAATCACAACCCCCGCaaa > 1:869626/1‑247 (MQ=255) aCGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTA‑GCGC‑ATTTTTTTCCCCTCAACGACCCGAAACATCTGAACATTATGATTTCC‑C‑CCCGCCCCAC‑GCGTGAAACGCTCGCTCCGGTGCGGTTTTTTTCTAATCACAACTCCGGCAAAATgg > 1:676805/1‑250 (MQ=255) cGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTA‑GGGC‑ATTTTTTGCCCCTCAACGACCCGAAACATCTGAACATTATTATTTCC‑G‑CCCGCCCCCC‑CCGTGAACCCCCCGATCCGGGGCGTTTTATCTCTTATAACACACCCGGCAAGCTggg > 1:723873/1‑250 (MQ=255) cGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTA‑GCGC‑ATTTTTTGCCCACCCACGACCCGAAAAATATGAAAATTATGATTACC‑G‑CCCGGCCGCCAGCG‑GCACCGACCGATCCGGGGGCGTCTTTCTTCAATTACAACCCCCGCAAGATggg > 2:350897/1‑250 (MQ=255) cGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTA‑GCGC‑ATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGATTACC‑G‑CCGGCCCGAC‑GCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATggg < 1:591927/250‑1 (MQ=255) tAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTA‑GCGC‑ATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGATTACC‑G‑CCGGCCCGAC‑GCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCt < 1:132546/250‑1 (MQ=255) agagGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTA‑GCGC‑CTTTTTCGCCCGTCAACCACCTTAAAAATCTGAACAATATGATTACC‑G‑CCGGCCCCAC‑GCGTGAACCGCTCGATCCGGGGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCCAAAAGGGGTTTTCTATcgcc > 1:722558/1‑250 (MQ=255) ttGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTA‑GCGC‑ATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGATTACC‑G‑CCGGCCCGAC‑GCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGgc < 1:73939/249‑1 (MQ=255) ggggggCCAGCGAGGGGCGGTCGGGTTTGTGGTGATACCGGCCGTGGGCGAATGCCCGTTCCGTTAACCATTGTGGTTATGGC‑GGTA‑GCGC‑ATTTTTCCCCCGTCAACGCCCTGAAACATCTGAACATTATGATTACC‑G‑CCGGCCCGAC‑GCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTc < 2:856149/248‑1 (MQ=255) ggggCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTA‑GCGC‑ATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGATTACC‑G‑CCGGCCCGAC‑GCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCa < 1:26848/248‑1 (MQ=255) tGGCAGTCGGGCTTGTGGTGTTAGCGGTCCTGGGCAAATGCTCGATCCTTTAACCATTGTGGATATGGC‑TGTA‑GCGC‑ATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACTTCTGAACATTATGATTACC‑G‑CCGGCCCGAC‑GCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTATCAGGt < 2:229496/250‑1 (MQ=255) ggCAGTCGGGCTTGTGGTGATATCGGCCCGGGGGGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTG‑GCGC‑ATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGATTACC‑G‑CCGGCCCGAC‑GCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTATCAGGTc < 2:397113/250‑1 (MQ=255) ggtgtttGTGGTGATATCGTTCCTGGGGTAATGCTCGTTCCGTTAACCATTGGGGATATGGC‑GGTA‑GCGC‑ATTTTTCGCCCGTCAACGCCCTGAAACATCTGAACATTATGATTCCC‑G‑CCGGCCCGAC‑GCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGtt < 2:603903/244‑1 (MQ=255) gtggtgATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTA‑GCGC‑CTTTTTTGCCCGTCCACGACCTGAAACATCTGAACATTATTATTAAC‑G‑CCGGCCCCCC‑GCGTGAACCCCCCCATCCCGGGCGGTATATCTCTAATCACCACCCCCGCAAGATGGGGTTTTTTATCCCCCCCGCCCCCGCCCCCCCTGGGGCGGACGTCCCGCTGGTATCAGGTCCGGGTTTTCTAcc > 2:93308/1‑250 (MQ=255) 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gATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTA‑GCGC‑ATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGATTACC‑G‑CCGGCCCGAC‑GCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGTTTCACTACCGACG‑CCACCGTTTGTTAAACGTGTtgat < 1:132068/249‑1 (MQ=255) ccGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTA‑GCGC‑ATTTTTTGCCCCGCTACGACCTGAAAAATCTGAACATTATGATTACC‑G‑CCCGCCCGAC‑GCGTGGAACGCTCGCTCCCGGGGGTTATATCTCTAATCACAGCCCCCGCAAAATGGGGTTTTCTTTTCCCGCCGCCCCCGCCCCGCCTGGCGCGAAAGGCCCCCTGGGATCCGGTCCGGGTTTCCCACCCACGCCCCCCGTTTGTTaaaggggtggtgtgg > 2:287946/1‑238 (MQ=255) tagggC‑GGTA‑GCGC‑ATTTTTCGCCCGGCAACGCCCTGAAACTTCTGAAAATTATGATTACC‑G‑CCGGCCCGAC‑GCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGTTTCACTACCGACG‑CCACCGTTTGTTAAACGTGTTGATGTGATGACCGCGCTGGAAATg < 2:744249/247‑1 (MQ=255) ggTA‑GCGC‑ATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGATTACC‑G‑CCGGCCCGAC‑GCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGTTTCACTACCGACG‑CCACCGTTTGTTAAACGTGTTGATGTGATGACCGCGCTGGAAATGGAAgcc < 1:356262/250‑1 (MQ=255) c‑ATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGATTACC‑G‑CCGGCCCGAC‑GCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGTTTCACTACCGACG‑CCACCGTTTGTTAAACGTGTTGATGTGATGACCGCGCTGGAAATGGAAGCCGCCGTg > 1:444729/1‑249 (MQ=255) c‑ATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGATTACC‑G‑CCGGCCCGAC‑GCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGAGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGGATCAGGTACGGTTTCACTACCGATG‑CCACCGTTTGTTACACGTGGTGATGTGATGACCGCGCTGGAAATGGAAGccgccgag > 2:424948/1‑247 (MQ=255) ttCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGATTACC‑G‑CCGGCCCGAC‑GCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGTTTCACTACCGACG‑CCACCGTTTGTTAAACGTGTTGATGTGATGACCGCGCTGGAAATGGAAGCCGCCGTGAATGCt > 2:839513/1‑250 (MQ=255) | CGGAATGGCGAATGACCTGGTATCGACGATTTGTCTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTA‑GCGC‑ATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGATTACC‑G‑CCGGCCCGAC‑GCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGTTTCACTACCGACG‑CCACCGTTTGTTAAACGTGTTGATGTGATGACCGCGCTGGAAATGGAAGCCGCCGTGAATGCT > NZ_CP009273/3806390‑3806879 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |