Read alignment evidence... | |||||||||||
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Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
TCATAAGGCGGATAGCGATACAGATGCCGCTATCCGCTTTCACATCAGAACGTATACTCGACACCTGCTTTACGGGTGAAAAAAATCAATATAGCACTTCGATATCCGATAAAGTCGGTTCCCGGTAACAACAACAGAATCCTTTTTTAATTATTGTTTCGTTGTTTTTGGTGTGATTCAGAAAATAAATATTTTAGACAGTAGCCAGTCAGGCGTTAAAAATGGGGCGGATAGTGAGGC‑GGTTTTGGCTGCGCTTATTGAACATTTAGA‑ATTGATCAATCCTTCTGGC‑A‑GATTAAGCC‑AAAATACCCGTTCGGCAATGCTTCAGTTACGCGAAGAGGAATGGTCTGAATTCTTTTTTTGGTTGCTAAATTCTCTGGAGTGT‑CTGGATTATGTGA‑TTATTAATTTAACTCCAGAAAGCAAAAAAACGTTGATGAGTGAACACCGTAACAATATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGC > NZ_CP009273/1240444‑1240934 | tCATAAGGCGGATAGCGATACAGATGCCGCTATCCGCTTTCACATCAGAACGTATACTCGACACCTGCTTTACGGGTGAAAAAAATCAATATAGCACTTCGATATCCGATAAAGTCGGTTCCCGGTAACAACAACAGAATCCTTTTTTAATTATTGTTTCGTTGTTTTTGGTGTGATTCAGAAAATAAATATTTTAGACAGTAGCCAGTCAGGCGTTAAAAATGGGGCGGATAGTGAGGC‑GGTTTTTGCt > 1:292788/1‑250 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |