New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NZ_CP009273 | 3576788 = | NA (NA) | 88 (1.070) | 81/494 | 0.1 | 98.9% | coding (391/417 nt) | BW25113_RS17825 | YrhA family protein |
? | NZ_CP009273 | = 3790487 | 1 (0.010) | coding (180/1260 nt) | waaL | O‑antigen ligase |
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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |