Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 2,221,754 | 0 | T | C | 39.4% | 66.9 / 17.1 | 71 | pseudogene (484/1436 nt) | mdtQ | multidrug resistance outer membrane protein MdtQ |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/14); new base C (8/20); total (37/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.71e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
GGTTTTGCTGGCATTAATATCGGTTTCCACACCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTA‑TTTGCTGCAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGTTTG‑CTCGC‑GTTCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTA‑CCCAGGC‑GGGCAGTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGG‑CCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTCGCCTGGGCTTCAGCTAGCTGAATGCGCTGTTCAGCCACCTGC > NZ_CP009273/2221510‑2221996 | ggTTTTGCTGGCATTAATATCGGTTTCCACACCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTA‑TTTGCTGCAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGTTTG‑CTCGC‑GTTCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTA‑CCCAGGC‑GGGCAGTAACCTCCGcc < 2:437188/250‑1 (MQ=255) ggTTTTGCTGGCATTAATATCGGTTTCCACACCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTA‑TTTGCTGCAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGGTTG‑CTCGC‑GTTCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAAACGTA‑CCCAAGC‑GGGCAGTAACCTCCGcc > 1:141934/1‑250 (MQ=255) ttttGCTGGCATTAATATCGGTTTCCACACCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTA‑TTTGCTGCAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGTTTG‑CTCGC‑GTTCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTA‑CCCAGGC‑GGGCAGTAACCTCCGCCCg < 1:845843/250‑1 (MQ=255) ttttGCTGGCATTAATATCGGTTTCCACACCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTA‑TTTGCTGCAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGTTTG‑CTCGC‑GTTCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTA‑CCCAGGC‑GGGCAGTAACCTCCGCCCg < 1:25150/250‑1 (MQ=255) cTGGCATTAATATCGGTTTCCACACCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTA‑TTTGCTGCAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGTTTG‑CTCGC‑GTTCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTA‑CCCAGGC‑GGGCAGTAACCTCCGCCCGATTCt < 1:350865/250‑1 (MQ=255) tGGCATTAATATCGGTTTCCACACCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTA‑TTTGCTGCAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGTTTG‑CTCGC‑GGTCCC‑CCGCCCG‑CG‑C‑TTTTACCGTA‑CCCAGGC‑GGGCCGTAACCTCCCCCCGGTTCtt > 1:900660/1‑250 (MQ=255) cATTAATATCGGTTTCCACACCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTA‑TTTGCTGCAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGTTTG‑CTCGC‑GTTCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTA‑CCCAGGC‑GGGCAGTAACCTCCGCCCGATTCTTTcc < 2:214870/250‑1 (MQ=255) tAATATCGGTTTCCACACCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTA‑TTTGCTGCAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGGTTT‑CCCCC‑GGTCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑CTTAAACCGA‑CCCCGGC‑GGGGCGGAAACTCCCCCCCATTCTTTccccc > 1:592354/1‑249 (MQ=255) aaTATCGGTTTCCACACCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTA‑TTTGCTGCAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCCGGGTTTG‑‑TCGC‑GCTCCG‑CCGCCCC‑TG‑C‑TCTTACCCTA‑CCCAGGC‑GGGGCGTGAACTCCGCCCCCTTCTTTTCCCa > 2:53337/1‑249 (MQ=255) atatCGGTTTCCACACCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTA‑TTTGCTGCAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGTTTG‑CTCGC‑GTTCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTA‑CCCAGGC‑GGGCAGTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGa < 1:147243/250‑1 (MQ=255) atCGGTTTCCACACCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTA‑TTTGCTGCAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGGTTT‑CTCGC‑GTTTCG‑CCGCCCG‑GG‑C‑TTTAACCCTA‑CCCCGGC‑GGGGAGTAACCCCCGCCCGGTTCTTTTCCCCGata > 1:829120/1‑250 (MQ=255) tCGGTTTCCACACCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTA‑TTTGCTGCAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGTTTG‑CTCGC‑GTTCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTA‑CCCAGGC‑GGGCAGTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGatat < 2:390590/250‑1 (MQ=255) gTTTCCACACCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTA‑TTTGCTGCAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGTTTT‑CTCGC‑GTTCCC‑CCCCCCC‑GG‑C‑TTTTACCGTA‑CCCAGGC‑GGGCAGTAAACTCCCCCCCATTCTTTCCCCCGATATc > 1:262820/1‑248 (MQ=255) ccACACCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTA‑TTTGCTGCAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGTTTG‑CTCGC‑GTTCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTA‑CCCAGGC‑GGGCAGTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAG‑At < 1:765911/249‑1 (MQ=255) acacCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTA‑TTTGCTGCAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGGTTG‑CTCGC‑GGTCCG‑CCCCCCG‑GG‑C‑TTTTACCCTA‑ACCAGGC‑GGGCAGTAAACCCCGCCCCGTTCTTTTCCCACATATCGAA‑AT‑Gc > 1:63584/1‑249 (MQ=255) tCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTA‑TTTGCTGCAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGGTTG‑CTCGC‑GTTTCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTA‑CCCAGGC‑GGGGAGTAAACTCCGCCCGATTTTTTTCCCAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAACCaaaaa > 1:285093/1‑248 (MQ=255) cGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTA‑TTTGCTGCAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGGTTG‑CTCGC‑GGTTCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTA‑CCCAGGC‑GGGCAGTAACCTCCGCCCGATTCTTTTCCCCGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCCCCCCTAAGCCAAAAATAcc > 1:835635/1‑250 (MQ=255) gTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTA‑TTTGCTGCAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGTTTG‑GTCGC‑GTTCCG‑CCGCCCG‑GG‑C‑TTTAAACCTA‑CCCCGGC‑GGGGAGGAAACTCCGCCCGCTTCTTTTCCCCGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAACCCAAAATAccc > 1:672277/1‑249 (MQ=255) cTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTA‑TTTGCTGCAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGGTTT‑CTCGC‑GGTCCG‑CCGCCCC‑CG‑CTTTTAACCGAA‑CCCCGCG‑GGGCGGAACCCCCCCCCCCATTTTTTCCCCGGAAACTAGG‑AG‑CCCA‑C‑CCCCCCCTTACGCCAAAACAACCGtg > 2:186350/1‑249 (MQ=255) atatAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTA‑TTTGCTGCAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGTTTG‑CTCGC‑GTTCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTA‑CCCAGGC‑GGGGCGTAACCTCCCCCCCATTCTTTCCCCCGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTTAGCCAAAAGTAACGTTgggg > 1:819477/1‑248 (MQ=255) atggttGGCGATGGGCCGGAATAAGGGTGTTTTGCCTTTTTTCTA‑TTGGCGGAAATACCGTGTTTAC‑CGCCGCCGGGGTTG‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCAAGCCAGAAATGGG‑CGGGTTTG‑CTCGC‑GTTCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTA‑CCCGGGC‑GGGCAGTACCCCCCGCCCGATTCTTTCCCAAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGgtgt < 2:922886/244‑1 (MQ=255) gCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTA‑TTTGCTGCAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGTTTT‑CTCGC‑GGTTCG‑CCGCCCC‑TG‑C‑TTTTACCGTA‑CCCCGGC‑GGGCCGGAACCTCCGCCCGGTTTTTTTCCCCGATATCGAG‑AT‑TGCA‑G‑CCCCCCGTTAAACCCAAAATACCGTTGGTGTACCa > 1:109110/1‑250 (MQ=255) tGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTA‑TTTGCTGCAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGGTTT‑GTCGCGGTTCCC‑CCCCCCG‑‑G‑C‑TTTTACCGTA‑ACCCGGG‑GGGGCGGAAACTCCCCCCCATTTTTTTCCCCGATATCCAGAAT‑GCCA‑C‑CCCCCCGTAAAGCCAAAA‑TAACGGTGGGGTACCAcc > 1:425855/1‑249 (MQ=255) gCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTA‑TTTGCTGCAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGGTTG‑GTCGC‑GTTCCGCCCCCCCC‑GG‑C‑TTTAA‑CGTA‑CCCAGGG‑GGGCGGTAAACTCCGCCCCGTTCTTTTCCCCGATATCGAG‑ATGGCCG‑G‑CCCCCCG‑TAAGCCAAAAGTACCGTTGGGGGGCCACggg > 2:316036/1‑250 (MQ=255) aTCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTA‑TTTGCTGCAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGGTTT‑TTCGC‑GGTTCG‑CCCCCCC‑CG‑C‑TTTTACCCTC‑CCCCCGCGGGGCGGAAACCCCCCCCCCTTTTTTTCCCC‑CAAATCAAG‑GT‑GCCA‑C‑CCCCCCCCTCAGCCCCAAGAAACGCTTGGGTACCCCGGGCCg > 2:90596/1‑250 (MQ=255) ggTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTA‑TTTGCTGCAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGTTTG‑CTCGC‑GTTCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTA‑CCCAGGC‑GGGCAGTACCCCCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAG‑AT‑TCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGt < 1:323991/249‑1 (MQ=255) aTGGTGTTCTGCTCTTTTTCTA‑TTTGCTGCAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGGTTT‑CTCGC‑GTTTCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTTAACGTA‑CCCCGGC‑GGGCAGTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCCAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCCCCGTTAAGCCCAAAATACCGTTTGTGTACCACCGGCCGGTC‑GTACCCGCgg > 1:266611/1‑250 (MQ=255) cttctctTTTTCTT‑TTTGCGGCAAGACTGTTTTTCC‑CCCCGCGGGGGTTT‑G‑CCCCCCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTCCCACCCAGC‑ATTGG‑GGGGTTTGCCTCGC‑GTTCCG‑CCCCCCG‑TG‑T‑TTTACCCGTC‑CCCAGGG‑GGGAAGTAACCCCCGCCCTTTTCTTCCCCCAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATc < 2:615516/246‑1 (MQ=255) cctgcttttttCTT‑TTTTCCTCAACGCCCTTTTTAACCGCCGCCGGGGTTG‑G‑CCACTCCCAGTACGGGCGGG‑CTCGGCTGCCAGCCAGCATGTGG‑GGGTTTTC‑CCCGC‑GTCCCG‑CCCCCCG‑TG‑T‑TTTACCCGTA‑CCCGGGG‑GGGAAGTACCCCCCCCCCGATTCTTCCCCCAAATACCGAG‑AG‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGAt < 2:14772/243‑1 (MQ=255) ctttttttTATTTTGCTGAAAGACGGTGTTAAC‑CGCCGCGGGGGTTT‑G‑CCACCCCAAGTAC‑GGCGGGCCTACGCGCCCAGCAAGAAGTGGG‑GGGTTTTG‑CTCTC‑TTCCCC‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTACCCGTC‑CCCGGGC‑GGGAAGTACCCCCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTc < 2:206874/248‑1 (MQ=255) tttttCTA‑TTTGCTGCAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGGTTT‑CTCCC‑GGTCCGCCCCCCCG‑GG‑T‑TTTAACC‑CA‑CCCACGC‑GGGGGCCAACCTCCCCCCCGTTCTTTTCCCAGAAATTCAG‑AT‑GCCC‑G‑CCCCCCCCTAAGCCCAAAATAACCCTGGGGTAACAAGCGGCGGGC‑GTCACACCGGCCGGAGCGtgtctg > 2:432138/1‑245 (MQ=255) ttCTA‑TTTGCTGCAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑C‑CCACCCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATGGG‑GGGGTTTG‑CTCGC‑GTTCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTA‑CCCAGGG‑GGGCAGTACCCCCCGCCCGATTCTTCCCCCAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGc < 1:922241/249‑1 (MQ=255) tCTA‑TTTGCTGCAAGACCGTGTTTAC‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCCCTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGTTTG‑CTCGC‑GTTCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTA‑CCCAGGC‑GGGCAGTACCCCCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCa < 1:869201/249‑1 (MQ=255) a‑TTTGCTGCAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGTTTT‑TTCCC‑GGTTCC‑CCGCCCC‑CG‑C‑TTTTACCCCA‑CCCCGGC‑GGGGCGGAACCCCCCCCCCGTTCTTTTCCCCGAAATCCAG‑AT‑GGCA‑GCCCCCCCCTTAGCCCAAAAGAACCGTTGGTGGCCCCCGGGCCGGCC‑GACCCTCGGGCGGGACGGTTCAGACAAAAc > 2:888201/1‑250 (MQ=255) ttGCTGCAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGTTTG‑CTCGC‑GTTCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTA‑CCCAGGC‑GGGCAGTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAACCAAAAATACCGTTGGTGTACCCCGGGCCGGGC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGG‑c > 1:711847/1‑250 (MQ=255) gctgcAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGGTTG‑CTCGC‑GTTCCC‑CCGCCCC‑CGCC‑TTTAACCG‑A‑CCCAGGC‑GGGCAGTAAACCCCCCCCCGTTCTTTTCCCCCATATCGAG‑AA‑GGCACG‑CCGCCCGTTAGCCCAAAATAACCGTT‑GTGGACCACCGGCCCGCCGGTCCCGCCGGCCGGACCGTTCGAGGCAACCGG‑cc > 2:893756/1‑250 (MQ=255) ctgcAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGGTTG‑CTCGC‑GTTTCC‑CCCCCCC‑TG‑C‑TTTTACCCGA‑CCCCGGC‑GGGGGGGAAACCCCGCCCCGTTTTTTCCCCCCATATCTAG‑AA‑GCCC‑G‑CCCCCCGCTTAACCACAAAGACCGCTGGTGTACCACGGGGCGGGC‑GCAACTCCGGCCGGCTCGTTCAGAGCAAAAGG‑cccc > 2:225564/1‑250 (MQ=255) tgtTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGTTTG‑CTCGC‑GTTCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTA‑CCCAGGC‑GGGCAGTACCCCCCGCCCGATTCTTCCCCCAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGG‑CCCCATTAAGCCTTc < 1:798386/250‑1 (MQ=255) tttAC‑CGCC‑CCTGGGGTT‑GCCCACCCCCAGACCGGGCGGG‑CTCCGCTGCCAGCCAGCATTTGG‑CGGTTTTG‑CCCGC‑GTCCCC‑CCGCCCG‑TC‑C‑TTTACCCGTC‑CCCGGGC‑GGGAAGTACCCTCCCCCCGATTTTTCCCCCAGATATCGAG‑AG‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGG‑CCCCATTAAGCCTTCt < 2:568460/249‑1 (MQ=255) ggggTTTGG‑CCACCCCCAGTACGGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCAGGAAATTGG‑GGGGTTTG‑CTCGC‑GTCCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTA‑CCCGGCG‑GGGCAGTACCCCCCGCCCGATTCTTTCCCAAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGG‑CCCCATTAAGCCTTCTGCCGACAttttt < 2:888387/249‑1 (MQ=255) ggtttt‑G‑CCACCCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGTTTTG‑CTCGC‑TTCCCG‑CCCCCCG‑TG‑T‑TTTACCCGTC‑CCCAGGG‑GGGCAGTACCCCCCGCCCGATTCTTCCCCCAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGG‑CCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTg < 1:216713/247‑1 (MQ=255) ggTTT‑G‑CCACTCCCAGTACGGGCGGG‑CTCCGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGTTTG‑CTCGC‑GTCCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTACCCGTC‑CCCAGGC‑GGGCAGTACCCCCCGCCCGATTCTTCCCCCAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGG‑CCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGc < 1:800295/250‑1 (MQ=255) tttcccccccccAGTACGGGCGGG‑CTACGCCCCCCGCCAGCAAGGGG‑GGGTTTTG‑CTCGC‑GTCCCG‑CCGCCCG‑TG‑T‑TTTAACCGTC‑CCCGGGC‑GGGAAGTACCCCCCCCCCGTTTCTTCCCCCAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGG‑CCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCg < 2:829120/241‑1 (MQ=255) cACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCGGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGTTTTG‑CTCGC‑TTCCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTC‑CCCAGGC‑GGGCAGTACCCCCCGCCCGATTCTTCCCCCAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGG‑CCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCa < 1:201162/250‑1 (MQ=255) cTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGTTTG‑CTCGC‑GTTCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTA‑CCCAGGC‑GGGCAGTAACCTCCCCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCCCGGGGCGGTc > 1:749304/1‑178 (MQ=255) tCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CCGGGTTG‑CTCCC‑GCTTCG‑CCCCCCGCCG‑C‑TTT‑ACCGCACCCCGGGG‑GGGCGGTAA‑CTCCCCCCCCTTCTTTTTCCCGAAATCCGG‑GA‑GCCA‑G‑CCCCCCCCGTAGCCCAAAGTACCGTTGGGGGTCCACCGGGCGGGC‑GGACCTGCGGCCCGGCCGGTCCGAGCCAACGGCCCCCTTTTGGCCTTCT‑CTGCCACTTTTTGTCGCTcccctt > 2:81808/1‑246 (MQ=255) ccAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGTTTG‑CTCGC‑GTTCCG‑CCGCCCG‑TG‑T‑TTTACCCGTC‑CCCGGGC‑GGGAAGTACCCCCCGCCCGATTCTTCCCCCAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGG‑CCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATcc < 1:615265/250‑1 (MQ=255) tACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGGTTG‑CTCCC‑GTTCCG‑CCCCCCC‑GG‑C‑TTTTACCCCA‑CCCCGGC‑GGGCAGTAAACCCCCCCCCCTTCTTTTCCCCCATATCGAG‑AT‑GCCC‑G‑CCCCCCCGTAAACCCAAAAAACCGGTGGGGGAACACGGGGCGGGC‑GGACCCGCGGGCCGGTCGTTTAGAACCAAACG‑CCCCCTTAAGCCCTCTTCCGCCCCTTTTTTGCGCCCCCTATccgccc > 2:65798/1‑249 (MQ=255) aGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGTTTG‑CTCGC‑GTTCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTC‑CCCAGGG‑GGGCAGTACCCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGG‑CCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGaaa < 1:43707/250‑1 (MQ=255) ggCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGTTTG‑CTCGC‑GTTCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTA‑CCCAGGC‑GGGCAGGAACCTCCGCCCGATTCTTTTCCCCGATATCGAG‑GT‑GCCC‑G‑CCCGCCGTTTAGCCAAAAATACCGTTTGTGTACCACCGGCCGGGC‑GTACCTTCGGCCGGGACGTTCCGAGCAAACGG‑CCCCCTTAAACCTTTTGCCGACCTTTTTTTCCGCCCCCTATCCGCCGgaa > 2:177467/1‑249 (MQ=255) gCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGTTTG‑CTCGC‑GTTCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTA‑CCCAGGC‑GGGCAGTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGG‑CCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGGAAAg > 1:657697/1‑250 (MQ=255) ggg‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGTTTG‑CTCGC‑GTTCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTA‑CCCAGGC‑GGGCCGTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCCGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGGGTAACACGGGCCCGTC‑GTACCCGCGGCCGGGTCGTTCAGAGCAAACCG‑CCCCCTTAAGCCCTCTGCCGACCTTTTTTGCCGCCCCCTATCCCCCGCAAAATc > 2:212008/1‑250 (MQ=255) cGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGTTTG‑CTCGC‑GTTCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTA‑CCCAGGC‑GGGCAGTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGG‑CCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTg > 1:147198/1‑250 (MQ=255) ccagcAATTGG‑CGGGTTTG‑CTCGC‑GGTCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTA‑CCCAGGC‑GGGCAGTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGAACGTTCAGAGCAAACGG‑CCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTTCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATc > 2:259460/1‑250 (MQ=255) agcATTTGG‑CGGGTTTG‑CTCGC‑GTCCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTACCCGTC‑CCCGGGC‑GGGAAGTACCCTCCGCCCGTTTCTTTCCCCAGATACCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGG‑CCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCt < 1:573401/250‑1 (MQ=255) gggTTTG‑CTCGC‑GTTCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTA‑CCCAGGC‑GGGCAGTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGG‑CCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAAc > 2:132358/1‑250 (MQ=255) ggTTTG‑CTCGC‑GTTCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTA‑CCCAGGC‑GGGCAGTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGG‑CCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACt > 1:638160/1‑250 (MQ=255) ttG‑CTCGC‑GTTCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTA‑CCCAGGC‑GGGCAGTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGG‑CCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGcc > 1:716572/1‑250 (MQ=255) cTCGC‑GTTCCC‑CCGCCCG‑TG‑T‑TTTAACCGTC‑CCCGGGG‑GGGAAGAACCCCCCCCCCGATTCTTCCCCCAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGG‑CCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCtt < 1:108954/249‑1 (MQ=255) cTCGC‑GTCCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTA‑CCCAGGC‑GGGCAGTACCCCCCGCCCGATTCTTCCCCCAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGG‑CCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCtt < 1:125007/249‑1 (MQ=255) gTTCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTACCCGTC‑CCCAGGC‑GGGCAGTACCCCCCGCCCGATTCTTCCCCCAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGG‑CCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTCGCCTg < 1:354083/250‑1 (MQ=255) gTTCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTA‑CCCAGGC‑GGGCAGTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGG‑CCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTCGCCTg > 2:605603/1‑250 (MQ=255) tcccg‑cccCCCG‑TT‑C‑TTTACCCTTC‑CCCAGGC‑TGGCAGTACCCTCCGCCCGATTCTTCCCCCAGTTATCGAG‑AT‑CCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGG‑CCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTCGCCTgg < 1:684932/248‑1 (MQ=255) cgccCG‑TG‑T‑TTTAACCGTC‑CCCAGGC‑GGGCAGTACCCTCCGCCCGATTCTTCCCCCAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGG‑CCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTCGCCTGGGCTTCa < 1:291867/250‑1 (MQ=255) tG‑C‑TTTACCCGTC‑CCCAGGC‑GGGCAGTACCCCCCGCCCGATTCTTCCCCCAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGG‑CCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTCGCCTGGGCTTCagctagc < 1:225564/250‑1 (MQ=255) tAACCGTA‑CCCAGGC‑GGGCAGTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGG‑CCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTCGCCTGGGCTTCAGCTAGCTGAAt > 1:560464/1‑250 (MQ=255) gTA‑CCCAGGC‑GGGTAGAACCCTCCGCCCGATTCTTCCCCAAGATACCGAG‑AG‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGG‑CCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTCGCCTGGGCTTCAGCTAGCTGAATGCGCt < 1:458192/250‑1 (MQ=255) aGGC‑GGGCAGTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGG‑CCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTCGCCTGGGCTTCAGCTAGCTGAATGCGCTGTTCAg > 1:288735/1‑250 (MQ=255) ggC‑GGGCTGTACCCCCCCCCCTATTCTTCCCCCAGATAGCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTAACGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGG‑CCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTCGCCTGGGCTTCAGCTAGCTGAATGCGCTGTTCAGc < 2:126885/250‑1 (MQ=255) cAGTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGG‑CCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGTGTGCCAACTGCCTTCGCCTGGGCTTCAGCTAGCTGACTGCGCTGTTCAGCCACCTg > 2:114025/1‑250 (MQ=255) aGTACCCCCCGCCCTATTCTTCCCCCAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGG‑CCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTCGCCTGGGCTTCAGCTAGCTGAATGCGCTGTTCAGCCACCTGc < 1:2776/250‑1 (MQ=255) | GGTTTTGCTGGCATTAATATCGGTTTCCACACCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTA‑TTTGCTGCAAGACCGTGTTTAA‑CGCCGCCTGGGTTT‑G‑CCACTCCCAGTACAGGCGGG‑CTACGCTGCCAGCCAGCAATTGG‑CGGGTTTG‑CTCGC‑GTTCCG‑CCGCCCG‑TG‑C‑TTTAACCGTA‑CCCAGGC‑GGGCAGTAACCTCCGCCCGATTCTTTCCCCAGATATCGAG‑AT‑GCCA‑G‑CCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTC‑GTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGG‑CCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTCGCCTGGGCTTCAGCTAGCTGAATGCGCTGTTCAGCCACCTGC > NZ_CP009273/2221510‑2221996 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |