| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP009273 | = 360286 | 41 (0.400) | 19 (0.190) +AATTC |
18/486 | 10.4 | 25.9% | intergenic (‑217/+69) | lacZ/BW25113_RS23320 | beta‑galactosidase/relaxase/mobilization nuclease domain‑containing protein |
| ? | NZ_CP009273 | 3416618 = | 70 (0.680) | intergenic (+65/+166) | yhdZ/rrf | amino acid ABC transporter ATP‑binding protein/5S ribosomal RNA | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
AGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑CAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAG‑ATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCA‑GTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAG > NZ_CP009273/3416378‑3416855 | aGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGtt > 1:505761/1‑249 (MQ=255) tCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTAt < 1:845194/250‑1 (MQ=255) gTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGAAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATggcg < 1:967550/250‑1 (MQ=255) tATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATggcgg > 1:554766/1‑250 (MQ=255) gACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATggcggggg > 2:729975/1‑248 (MQ=255) aaTGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTcc > 1:57068/1‑250 (MQ=255) gtgtgtAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCTGcccc > 1:344217/1‑249 (MQ=255) tgtgtAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCg < 1:388793/249‑1 (MQ=255) tgtAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCa < 2:231115/250‑1 (MQ=255) acaTGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCTGCCCCCCAcccccc > 1:746974/1‑250 (MQ=255) aTGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCgg < 1:677655/250‑1 (MQ=255) gTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCCCCCCCCTCCCGGCCGTTGCtt > 1:761083/1‑250 (MQ=255) gTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGCGCTGCCCCCCCCCCCCCccgccgcttcct > 2:971863/1‑244 (MQ=255) cGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACg < 1:797917/250‑1 (MQ=255) aaCCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCg < 1:766689/235‑1 (MQ=255) aCCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTTCCCCCCCCCCCCCCCGCCCTTGCTTTGccaactt > 1:673452/1‑243 (MQ=255) cGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTTCCCGCCACCCCCCCGGCCGCTGTTTTGC‑AACCTT‑cc > 1:805772/1‑248 (MQ=255) gTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑Caaa < 2:361189/250‑1 (MQ=255) tCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑CAAAt < 2:12754/250‑1 (MQ=255) gCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑CAAATcc < 2:34665/250‑1 (MQ=255) gCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑CAAATc < 1:66573/249‑1 (MQ=255) tGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGGCCCGCCCCCCCCCCCCCCCGCCGGTGCTTCTC‑CAAGTT‑CCAAACCGc > 2:425840/1‑250 (MQ=255) 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aaTTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGc < 1:224440/221‑1 (MQ=255) aaTTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCTCCCCCCCCCCCCCCCGGCCGTTTCTTCCC‑CACGTT‑TAAAACCCCCCCccgcgg > 1:840613/1‑250 (MQ=255) aTTTTGATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑CAAATCCGCTCCCGGCGGa < 2:145338/250‑1 (MQ=255) tttttATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGTGGGCCTGCCCCCCCCCCCCCCCGCCGTGGCGTTTC‑TACGTTCCAAATCCCCCCCcgccggc > 2:532927/1‑249 (MQ=255) tttttATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTCCCCGCCCCCCCCCCCGCCGTTTCTTTGC‑AACGTT‑CAAAACCCCCCCccgcgggt > 1:363200/1‑248 (MQ=255) tttATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTG‑CCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑CAAATCCGCTCCCGGCGGAttt < 2:34551/249‑1 (MQ=255) tATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑CAAATCCGCTCCCGGCGGATTTg < 2:839840/249‑1 (MQ=255) cGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCCCCCCCCTCCCGGCCGTTTCTTTGC‑CACGTT‑TAAATCCCCTCCCCGCGGGGTTGTCCTACTc > 1:761817/1‑250 (MQ=255) aaaTAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑CAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGagag < 2:18057/250‑1 (MQ=255) aaaTAGGGGAGCAAGCTGAACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTGCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTAGGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑CAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGagag < 2:244305/250‑1 (MQ=255) gTGGGGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAGGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑CAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTc < 2:184950/250‑1 (MQ=255) cACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑CAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGacaaaca < 2:449540/248‑1 (MQ=255) cACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑CAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGacaaaca < 1:944553/248‑1 (MQ=255) atgaATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑CAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAG‑At < 1:273779/248‑1 (MQ=255) atgaATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑CAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAG‑ATa < 1:705062/249‑1 (MQ=255) gaATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCCGCCCCCCCCCCCCCCGGCCGCTGCTTCGC‑AACGTT‑TCAAACCCCTCCCCGCGGGTTTGTTCTACTCCGGAGAGTGTTTACCCCCAAAACACAG‑ATaaa > 1:693547/1‑249 (MQ=255) aaTTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑CAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAG‑ATAAAAc < 1:3868/250‑1 (MQ=255) cATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑CAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAG‑ATAAAACAAAAGGCCCAg < 1:639328/250‑1 (MQ=255) aaacAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑CAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAG‑ATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCg < 1:415832/247‑1 (MQ=255) tCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCCCCCCCCCCCCGGCCGTTGCTTTGC‑AACGTT‑CAAATCCGCTCCCCGCGGGTTTGTCCTACTCCGGGGAGGGTTCACCGACAAAAAAAAG‑ATAAAAAAAAAAGCCCAGTCTTCCGAc > 1:887143/1‑250 (MQ=255) tACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCCCCACCCCCCCGGCCGTTGCTTTGC‑AACGTT‑CAAATCCGCCCCCCGCGGGTTTGTCCTACTCGGGAGAGGGGTTACCCACAAACAACAG‑ATAAAAAAAAAAGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCtt > 1:592289/1‑250 (MQ=255) 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aGGAAATCAATAAATGGAATGTTGGTTCGAAAAGAAAAAGGGCCATCTTTTCGGATGGCCTTTCGTTTGAGTTGATGTCTGGCAGTTTAGGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑CAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAG‑ATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTgg < 2:40987/250‑1 (MQ=17) ggTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑CAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAG‑ATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGc < 2:554766/250‑1 (MQ=255) tAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGGCCTGCCCCCCCCCCCCCCCGCCGCTGCTTTTC‑AACGGT‑CCAATTCCCCCCCCCCGGGGTTTTTCTTCTCTGGGGAGGGGTTTCCCCCCAACAACAGAAAAAAAAAAAAGACCCATCCTCCCCCCTAGGCCTttttttttttttttttcttgccg > 2:292847/1‑239 (MQ=255) aTCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑CAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAG‑ATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCA‑Gtt < 2:328546/250‑1 (MQ=255) cATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCTTCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑CAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAG‑ATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCA‑GTTccc < 2:158846/250‑1 (MQ=255) cATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑CAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAG‑ATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCA‑GTTccc < 1:626646/250‑1 (MQ=255) aTTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGGCCTTCCCGCCCCCCCCCCGGCCGCTGCTTCTC‑AACGTT‑TAAAACCGCCCCCCGCCGGTTTTTTCTACTCCCGGGAGGGGTTCCCCCCAAACAAAAA‑CTAAAAAAAAAAAACCCCACTTCCCCCCGCGCCCTTTTTTTTTTTTTATGTTTTGCA‑GTTCCCt > 2:59607/1‑250 (MQ=255) tAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCCCCCCCCCGGCCGTTTCTTCGC‑AACGTT‑CAAATCCCCCCCCCGCGGGTTTTTCCTACTCCGGAGAGGGGTCACCCACAAACAACAA‑ATAAAAAAAAAAGCCCAGACTTCCCACTGAGCCTTTTTTTTTTTTTTATGTTTGGCC‑GTTTCCTAc > 1:851839/1‑250 (MQ=17) tGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGGGGCCTTCCCCCCACCCCCCCGGCCGCTGCTTCCCAAACTTC‑CAAATCC‑CCCCCCCCGGAGTTTTTCTTCTCCGGGGGGGGGTCACCGCCAAACAAACA‑AAAAAAAAAAAAAACCAATCTTCCCACTGAGCCCTTTTTTTTTTTTTTTGTTCGGCACGTTccccctccc > 2:671517/1‑244 (MQ=255) aGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGAGGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑CAAATCCGCTCTCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAG‑ATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCA‑GTTCCCTACTCTCGCATggg < 2:474316/249‑1 (MQ=255) gTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCCGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑CAAATCCCCTCCCCGCGGGTTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAAAAACAG‑ATAAAACAAAAAGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTTTTTGATGTCTGGCA‑GTTCCCTACTCTCCCATggggg > 1:123338/1‑249 (MQ=17) ttCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑CAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAG‑ATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCA‑GTTCCCTACTCTCGCATGGGgag < 1:311522/250‑1 (MQ=255) aGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑CAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAG‑ATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCA‑GTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCcac < 1:415813/250‑1 (MQ=255) ggATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑CAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAG‑ATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCA‑GTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGc < 2:191721/250‑1 (MQ=255) gcttttCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑CAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAG‑ATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCA‑GTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTc < 2:443678/247‑1 (MQ=255) gCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑CAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAG‑ATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCA‑GTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGttt < 2:708222/249‑1 (MQ=255) gctcTTGATTTGATGTCTGGCATTTTATGTCGCGCGTCCCTCCCCCCACCCCCCGCGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑CAAATCCGCTCCCGACGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAG‑ATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTAGCA‑GTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACTCTTCCATCGGCGCTACGGCGTTTCACtt < 2:838924/246‑1 (MQ=14) gatttgatGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑CAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAG‑ATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCA‑GTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAg < 2:505761/248‑1 (MQ=40) | AGTCGGGTATGACAATGTTGTGTGTAACACATGAGATGGGGTTTGCACGAACCGTCGCTGACCGGGTAATTTTTATGGATCGTGGGGAAATAGTGGAGCAAGCTGCACCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGC‑AACGTT‑CAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTGTTCACCGACAAACAACAG‑ATAAAACAAAAGGCCCAGTCTTCCGACTGAGCCTTTTGTTTTATTTGATGTCTGGCA‑GTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAG > NZ_CP009273/3416378‑3416855 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |