| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 3,806,632 | 0 | C | T | 42.9% | 49.5 / 20.8 | 50 | S181L (TCG→TTG) | coaBC | bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate‑‑cysteine ligase CoaBC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (4/24); new base T (21/0); total (26/24) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.76e-10 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GCGAATGACCTGGTATCGACGATTTGTCTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCG‑TGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGA‑TTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGC‑GAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGTTTCACTACCGACGCCACCGTTTG‑TTAAACGTGTTGATGTGATGACCGCGCTGGAAATGGAAGCCGCCGTGAA > NZ_CP009273/3806397‑3806875 | gCGAATGACCTGGTATCGACGATTTGTCTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCG‑TGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGGGCCTTTTTTGCCCGCCACCGAca > 2:228786/1‑249 (MQ=255) ggtacggccgttttGTCGGGCTCCCCCGGCGCCTGT‑GCCGTTGCCCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTg < 2:702322/239‑1 (MQ=255) tATCGACGATTTGTCTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCG‑TGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTTGCCCCTCAACGACCCGGAAAATCTGa > 1:719908/1‑249 (MQ=255) gttttGTCTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCG‑TGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATg < 1:570650/248‑1 (MQ=255) gaTTTGTCTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCG‑TGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTTGCCCCGCAACGAACCGAAACATCTTAAAATTAt > 1:59920/1‑249 (MQ=255) tCTGGCTACACCTGCGCCTGTAGCCG‑TGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTTGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGA‑TTAcc > 1:210664/1‑250 (MQ=255) cTGGCTACACCGGCGCCTGTAGCCG‑TGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGA‑TTAccg < 1:522561/250‑1 (MQ=255) cgcccctgtcgcccG‑TCCCCCCCGCCATGAACCAGGAGATGTCCCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGA‑TTACCGCCGGCCCGAc < 2:351523/238‑1 (MQ=255) cgcCTGTGCCCG‑TGCCCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGA‑TTACCGCCGGCCCGAcg < 1:860332/248‑1 (MQ=255) gcCTGTACCCG‑GCCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGA‑TTACCGCCGGCCCGACGCGt < 1:866704/250‑1 (MQ=255) gttcccccccGCCATGAACCAGCAGATGTACCGGGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATTTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGA‑TTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTc < 2:752467/244‑1 (MQ=255) g‑TGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGA‑TTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCg < 1:51423/250‑1 (MQ=255) cggccaccccGCCATGAACCAGCAGATGTACCGGGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGA‑TTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTc < 1:432733/244‑1 (MQ=255) ccccccGCCAGGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGA‑TTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATc < 1:470494/248‑1 (MQ=255) cccccGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGCCCTGAAACATCTGAACATTATGA‑TTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATcc < 1:397151/249‑1 (MQ=255) ccGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGGAGCGCATTTTTTTCCCGTCAACGACCCGACACAACTGTAAAATTTGA‑TTACCACCCGCCCCCCGCCGGAAccccccggagccgc > 2:109429/1‑238 (MQ=255) tGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGA‑TTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTta < 1:342502/250‑1 (MQ=255) agcagATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTTGCCCGTCAACGACCCTAAAAATCTGAAAAATATGA‑TTAACCCCCGCCCCCCGCGGGGACCGCCCCATCCCGGGCGGTATAtctc > 1:489246/1‑250 (MQ=255) aTGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTTGCCCGTCAACGACCTGAAAAATCTGAACATTATGA‑TTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTTTATCTCTAAt > 1:82073/1‑249 (MQ=255) aTGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGA‑TTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATc < 1:70008/250‑1 (MQ=255) aTGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGAGCATTTTTTGCCCGTCAACGACCTGAAAAATCTGAACATTATGA‑TTAACGCCGGCCCGCCGCGTGAACCCCTCGATCCGGTGCGTTTTATCTCTaaa > 1:29958/1‑248 (MQ=255) aCCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTTGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGA‑TTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGGTATATTTCTAATCACAg > 1:85349/1‑250 (MQ=255) aCCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGGAGGGGCTTTTTTGCCCGGCAACGACCTGAAAAATCTGAACAATATGATTTACGGCCGCCCCG‑CGCCGGAACCGCCCGGACCGGGGGGGTTTATTTCTTATcacaa > 2:548320/1‑249 (MQ=255) tGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCAGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATAGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAACCATCTGAACATTATGA‑TTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCCCGATCCGGTGCGTTATAGCTCTAATCACAGATcc > 2:331328/1‑250 (MQ=255) gCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCAAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGGGGGGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCTTTGTGGATAGGGCGGTAGGGCATTTTTGCCCCGTCCACGACCTGAAAAAACTTAAAATTTTTT‑TTACCCCCGGCCCGCCCGGGGAACCCCCCCATCCGTGGGGTTATATCCCTCACcacacacccg > 2:135338/1‑244 (MQ=255) cTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTTGCCCGTCAACGACCCGAAACATCTGAACATTTTTA‑TTTACGCCCGCCCCACGCGTGAAACGCTCCATCCCGGGCGGTTTATCTCTAATCACAGCTCCCGc > 1:786756/1‑248 (MQ=255) ccACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTTGCCCGTCAACCCACTGCAAAATCTTAACATTATTA‑TTTTCGCCCGGCCCACGCGTGGAACCCCCGCACCGGTGGGTTTTATCTCTAATCACAGCCCCCGCCAg > 2:638598/1‑248 (MQ=255) gcaTAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTTGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGA‑TTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGGGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGgttt > 1:574476/1‑250 (MQ=255) gcaTAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGA‑TTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGtttt < 1:324768/250‑1 (MQ=255) caTAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGTGCCATTTTTGCCCCCTAACTACCTTAAAAAACTGAAAAATTAGA‑TTACCGCCGGGCCGACGCGTGAACCGCCCGACCCGGGGCGTTTTATTTCTAATCACAGCTCCCGCCAAATGGGGTTTg > 1:609757/1‑250 (MQ=255) aTCTGGGGGCCAGACAGGGGCAGTCAGGCTTGTGTTGATATGGGTCCTGGGGGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGA‑TTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGC‑GAAc < 2:831248/249‑1 (MQ=255) tggtgATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGA‑TTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGC‑GAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGTTTCACTAcc < 1:786486/249‑1 (MQ=255) atatCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCCTTTTTTTCCCGTTCACGACCTGAAACATCTTGAAAATATGA‑TTATCGCCCGCCCCACCCGGGCACCGCTCGATCCGGTGCGCTATATCTCCACTCACACCACCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCCGCCCCCCGTGGCGC‑GAACGGCCCCCCGGTGACCGGGCCGGTTTCACTCCCCAcccc > 2:801080/1‑250 (MQ=255) ggTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGA‑TTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGC‑GAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGTTTCACTACCGACGCCACCg < 1:822979/249‑1 (MQ=255) gTCGTGGGCGAAGGCTCGATCCGTAAACCATTGTGGATATGGCGGTGGCGCATTTTTCGCCGGTAAACGACCTGAACCATCGAAACATTATGA‑TTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGC‑GAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGTTTCACTACCGACGCCACCGtt < 2:305856/250‑1 (MQ=255) gTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGA‑TTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGC‑GAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGTTTCACTACCGACGCCACCGtt < 1:419900/250‑1 (MQ=255) aaTGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTTGCCCGTCAACCACCTGAAACATCTGAACATTATGA‑TTAACGCCGGCCCGACGCGTGAACCCCCCGCGCCGGTGCGGTATATCTCTAATACCAGCCCCCGCAAGGGGGGGTTTGCTATCGCCGCCGCCGCCGCCCCTCGTGGCGCGGAACG‑CACGCCGGTATCAGGGCCGGTTTCACCACCGCCGCCACCGCTTT‑TTaaaa > 2:23985/1‑247 (MQ=255) 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ggCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGA‑TTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGC‑GAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGTTTCACTACCGACGCCACCGTTTG‑TTAAACGTGTTGATGTGATGACCGCGCTGGAAATgg > 2:572784/1‑248 (MQ=255) gttggcgcTTTTTTCCCCCTCCAACGACCTGAACCATCTGAACATTATGA‑TTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGC‑GAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGTTTCACTACCGACGCCACCGTTTG‑TTAAACGTGTTGATGTGATGACCGCGCTGGAAATGGAAgcc < 2:888798/246‑1 (MQ=255) aTTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACATTATGA‑TTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGC‑GAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGTTTCACTACCGACGCCACCGTTTG‑TTAAACGTGTTGATGTGATGACCGCGCTGGAAATGGAAGCCGCCGTGaa < 1:59045/250‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |