| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP009273 | = 2283592 | NA (NA) | 142 (1.410) | 111/496 | 0.0 | 57.0% | intergenic (‑68/‑387) | BW25113_RS11435/narP | IS5‑like element IS5 family transposase/nitrate/nitrite response regulator protein NarP |
| ? | NZ_CP009273 | = 3179496 | 107 (1.060) | intergenic (+172/‑50) | ygiL/BW25113_RS15805 | fimbrial‑like protein/IS3‑like element IS2 family transposase | |||||
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
GCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NZ_CP009273/2283344‑2283592‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATGTGGCCGGGCGAACCCGGCCAAATGCGATTACTCGTAAGCAATCTTGTAGTCAGCCTGAGCGTAAACGTTGCCCGGGGTGGCATCTTTGCTTGGGGATT < NZ_CP009273/3179496‑3179254 CATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT < 2:33174/250‑1 CATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT > 1:99190/1‑249 attGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT > 1:826543/4‑248 ATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 1:103495/250‑1 ATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 2:43070/250‑1 ATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 2:586448/250‑1 ATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT > 2:238402/1‑249 ATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT > 2:132637/1‑248 TGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAA < 2:417643/250‑1 TGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAA > 1:269125/1‑250 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GTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTT < 1:768517/248‑1 TCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATC < 1:139345/250‑1 TCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATC < 1:520940/250‑1 TGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCAT > 1:432813/1‑250 GACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCAT > 1:192839/1‑249 ACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATT > 1:764252/1‑249 ACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCA < 1:243478/247‑1 TGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATG > 1:130598/1‑250 AATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATG < 2:872468/248‑1 CACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATGTGGCCG > 2:117700/1‑250 CGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATGTGGCCGGGCGAA > 1:161276/1‑250 AAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATGTGGCCGGGCGAACCCGGCCAAA > 2:530868/1‑250 TGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATGTGGCCGGGCGAACCCGGCCAAATGC > 1:912169/1‑249 GACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATGTGGCCGGGCGAACCCGGCCAAATGCGATTA > 2:52052/1‑250 TCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATGTGGCCGGGCGAACCCGGCCAAATGCGATTACTC > 1:173454/1‑250 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TGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATGTGGCCGGGCGAACCCGGCCAAATGCGATTACTCGTAAGCAATCTTG > 2:878740/1‑250 TTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATGTGGCCGGGCGAACCCGGCCAAATGCGATTACTCGTAAGCAATCTTGT < 2:24493/249‑1 TTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATGTGGCCGGGCGAACCCGGCCAAATGCGATTACTCGTAAGCAATCTTG < 2:371086/248‑1 CTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTCATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTCTACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATGTGGCCGGGCGAACCCGGCCAAATGCGATTACTCGTACGCAATCTTGTAGT > 2:763751/1‑250 CTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATGTGGCCGGGCGAACCCGGCCAAATGCGATTACTCGTAAGCAATCTTGTAGT > 1:901205/1‑250 CTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATGTGGCCGGGCGAACCCGGCCAAATGCGATTACTCGTAAGCAATCTTGTAGT > 2:66820/1‑250 CTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATGTGGCCGGGCGAACCCGGCCAAATGCGATTACTCGTAAGCAATCTTGTAGT > 2:283405/1‑250 CTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATGTGGCCGGGCGAACCCGGCCAAATGCGATTACTCGTAAGCAATCTTGTAG < 1:909590/249‑1 CTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATGTGGCCGGGCGAACCCGGCCAAATGCGATTACTCGTAAGCAATCTTGTAGTCAGCCT < 2:690341/250‑1 GACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATGTGGCCGGGCGAACCCGGCCAAATGCGATTACTCGTAAGCAATCTTGTAGTCAGCCTGAGCGTA > 1:479492/1‑249 CAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATGTGGCCGGGCGAACCCGGCCAAATGCGATTACTCGTAAGCAATCTTGTAGTCAGCCTGAGCGTAAAC > 2:196848/1‑250 ACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATGTGGCCGGGCGAACCCGGCCAAATGCGATTACTCGTAAGCAATCTTGTAGTCAGCCTGAGCGTAAACGTT < 2:895432/250‑1 CATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATGTGGCCGGGCGAACCCGGCCAAATGCGATTACTCGTAAGCAATCTTGTAGTCAGCCTGAGCGTAAACGTTG < 1:408405/250‑1 TCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATGTGGCCGGGCGAACCCGGCCAAATGCGATTACTCGTAAGCAATCTTGTAGTCAGCCTGAGCGTAAACGTTGCCCGG > 1:649335/1‑250 aTCATATCAGGGACTCGTCCGCACCTTTCTTTAGTTATATTGGTTGTCTGGAGATTCCGGGTGTCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACCTCTGATCCACTTATCATTAATCTGGTAATGCTGTTGCCGGGCGAACCCGCCCACATGCGATTATTCGTAAGCAGTCTTGTAGTCAGCCTGAGCGTACACGATGCCCG > 2:499958/2‑248 ATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATGTGGCCGGGCGAACCCGGCCAAATGCGATTACTCGTAAGCAATCTTGTAGTCAGCCTG > 1:737911/1‑226 TCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGTATAATGAACAATAAAGATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATGTGGCCGGGCGAACCCGGCCAAATGCGATTACTCGTAAGCAATCTTGTAGTCAGCCTGAGCGTAAACGTTGCCCGGGGTGGCA < 2:751836/250‑1 TCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATGTGGCCGGGCGAACCCGGCCAAATGCGATTACTCGTAAGCAATCTTGTAGTCAGCCTGAGCGTAAACGTTGCCCGGGGTGGCA > 1:717297/1‑250 TCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATGTGGCCGGGCGAACCCGGCCAAATGCGATTACTCGTAAGCAATCTTGTAGTCAGCCTGAGCGTAAACGTTGCCCGGGGTGGCA < 1:392775/250‑1 TCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCCAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATGTGGCCGGGCGAACCCGGCCAAATGCGATTACTCGTAAGCAATCTTGTAGTCAGCCTGA < 2:737911/226‑1 CAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATGTGGCCGGGCGAACCCGGCCAAATGCGATTACTCGTAAGCAATCTTGTAGTCAGCCTGAGCGTAAACGTTGCCCGGGGTGGCAT > 1:645736/1‑250 CGCACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATGTGGCCGGGCGAACCCGGCCAAATGCGATTACTCGTAAGCAATCTTGTAGTCAGCCTGAGCGTAAACGTTGCCCGGGGTGGCATCTTTGCTTGGG > 1:77887/1‑249 CACCTTCCTTAAGTGATCTTGGGTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATGTGGCCGGTCGAACCCGGCCAAATGCGATTACTCGTAAGCAATCTTGTAGTCAGCCTGAGCGTAAACGTTGCCCGGGGTGGCATCTTTGCTTGGGGAT > 2:634987/1‑250 ACCTTCCTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATGTGGCCGGGCGAACCCGGCCAAATGCGATTACTCGTAAGCAATCTTGTAGTCAGCCTGAGCGTAAACGTTGCCCGGGGTGGCATCTTTGCTTGGGGATT > 2:763682/1‑250 GCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NZ_CP009273/2283344‑2283592‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATAACGGATAATGAACAATAAATATTTTTAATCAATTCGCTTATTGTGGTTAATTTTAATTTTTTATACATCTGATCCACTTATCATTAATCCGTTAATGATGTGGCCGGGCGAACCCGGCCAAATGCGATTACTCGTAAGCAATCTTGTAGTCAGCCTGAGCGTAAACGTTGCCCGGGGTGGCATCTTTGCTTGGGGATT < NZ_CP009273/3179496‑3179254 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |