| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP043523 | = 1861974 | 20 (0.040) | coding (206/249 nt) | FTN78_chr1910 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 618 total aligned reads displayed.
ATTGACAGCTTCCCCATTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAATGCTACAAAGGGACAGTACTTCTATGGATGTAAATGTCATGCTTTAGTCAGTGAATCAGGCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP043523/248409‑248261‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGGTTCTGTTGCAAAGTTTTCCAAAAAATCTATTTTAGTGTAAAATTGAGAAAAAAGACAGAGACGACAGAGTAATGAATCATTTTAAAGGCAAACAATTCAAAAAAGACGTCATTATTGTCGCTGTTGGTTACTACCTGCGTTACAA < CP043523/1861974‑1861826 | TGACAGCTTCCCCATTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAATGCTACAAAGGGACAGTACTTCTATGGATGTAAATGTCATGCTTTAGTCAGTGAATCAGGCTACGT > 1:3482262/1‑150 ACAGCTTCCCCATTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAATGCTACAAAGGGACAGTACTTCTATGGATGTAAATGTCATGCTTTAGTCAGTGAATCAGGCTACGTGG < 1:222714/150‑1 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2:820368/1‑150 ATCAGGCTACGTGGTTCTGTTGCAAAGTTTTCCAAAAAATCTATTGTAGTGTAAAATTGAGAAAAAAGACAGAGAGGACAGAGTAATGAATCATTTTAAAGGCAAACAATTCAAAAAAGACGTCATTATTGTCGCTGTTGGTTACTACCT < 2:3339411/150‑1 GGCTACGTGGTTCTGTTGCAAAGTTTTCCAAAAAATCTATTTTAGTGTAAAATTGAGAAAAAAGACAGAGAGGACAGAGTAATGAATCATTTTAAAGGCAAACAATTCAAAAAAGACGTCATTATTGTCGCTGTTGGTTACTACCTGCGT > 1:802277/1‑150 CTACGTGGTTCTGATGCAAAGTTTTCCAAAAAATCTATTCTAGTGTAAAATTGAGAAAAAAGACAGAGAGGACAGAGTAATGAATCATTTTAAAGGCAAACAATTAAAAAAAAACGTCATTATTGTCGCTGTTGGTTACTACATACGTTA > 2:3430268/1‑150 TACGTGGTTCTGTTGCAAAGTTTTCCAAAAAATCTATTTTAGTGTAAAATTGAGAAAAAAGACAGAGAGGACAGAGTAATGAATCATTTTAAAGGCAAACAATTCAAAAAAGACGTCATTATTGTCGCTGTTGGTTACTACCTGCGTTAC > 2:2025065/1‑150 | ATTGACAGCTTCCCCATTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAATGCTACAAAGGGACAGTACTTCTATGGATGTAAATGTCATGCTTTAGTCAGTGAATCAGGCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP043523/248409‑248261‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGGTTCTGTTGCAAAGTTTTCCAAAAAATCTATTTTAGTGTAAAATTGAGAAAAAAGACAGAGACGACAGAGTAATGAATCATTTTAAAGGCAAACAATTCAAAAAAGACGTCATTATTGTCGCTGTTGGTTACTACCTGCGTTACAA < CP043523/1861974‑1861826 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |