| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP043523 | = 1607375 | 494 (0.980) | coding (1039/1434 nt) | FTN78_chr1639 | Lysine‑specific permease | |||||
Only 100 of 629 total aligned reads displayed.
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TTGCAACAATTATTTGTTTTATTGCTTTCTTAACTGGAATATTTGGAACGCAAATTTATCTTTTCTTGGTTGATTTATCATCACTAACAGGCTTTCTTGCTTGGCTTGGAATTTCTATCAGTCATATCCGTTTTAGAAGAGCCTATATTG < 2:4445555/150‑1 TGCAACAATTATTTGTTTTATTGCTTTCTTAACTGGAATATTTGGAACGCAAATTTATCTTTTCTTGGTTGATTTATCATCACTAACAGGCTTTCTTGCTTGGCTTGGAATTTCTGTCAGTCATATCCGTTTTAGAAGAGCCTATATTGC > 1:4014595/1‑150 GCAACAATTATTTGTTTTATTGCTTTCTTAACTGGAATATTTGGAACGCAAATTTATCTTTTCTTGGTTGATTTATCATCACTAACAGGCTTTCTTGCTTGGCTTGGAATTTCTATCAGTCATATCCGTTTTAGAAGAGCCTATATTGCT > 1:39138/1‑150 AACAATTATTTGTTTTATTGCTTTCTTAACTGGAATATTTGGAACGCAAATTTATCTTTTCTTGGTTGATTTATCATCACTAACAGGCTTTCTTGCTTGGCTTGGAATTTCTATCAGTCATATCCGTTTTAGAAGAGCCTATATTGCTCA < 2:4089425/150‑1 AACAATTATTTGTTTTATTGCTTTCTTAACTGGAATATTTGGAACGCAAATTTATCTTTTCTTGGTTGATTTATCATCACTAACAGGCTTTCTTGCTTGGCTTGGAATTTCTATCAGTCATATCCGTTTTAGAAGAGCCTATATTGCTCA < 1:1038625/150‑1 ACAATTATTTGTTTTATTGCTTTCTTAACTGGAATATTTGGAACGCAAATTTATCTTTTCTTGGTTGATTTATCATCACTAACAGGCTTTCTTGCTTGGCTTGGAATTTCTAACAGTCATATCCGTTTTAGAAGAGCCTATATTGCTCAA > 2:29154/1‑150 CAATTATTTGTTTTATTGCTTTCTTAACTGGAATATTTGGAACGCAAATTTATCTTTTCTTGGTTGATTTATCATCACTAACAGGCTTTCTTGCTTGGCTTGGAATTTCTATCAGTCATATCCGTTTTAGAAGAGCCTATATTGCTCAAG > 2:597250/1‑150 CAATTATTTGTTTTATTGCTTTCTTAACTGGAATATTTGGAACGCAAATTTATCTTTTCTTGGTTGATTTATCATCACTAACAGGCTTTCTTGCTTGGCTTGGAATTTCTATCAGTCATATCCGTTTTAGAAGAGCCTATATTGCTCAAG < 1:740072/150‑1 AATTATTTGTTTTATTGCTTTCTTAACTGGAATATTTGGAACGCAAATTTATCTTTTCTTGGTTGATTTATCATCACTAACAGGCTTTCTTGCTTGGCTTGGAATTTCTATCAGTCATATCCGTTTTAGAAGAGCCTATATTGCTCAAGG < 1:625042/150‑1 AATTATTTGTTTTATTGCTTTCTTAACTGGAATATTTGGAACGCAAATTTATCTTTTCTTGGTTGATTTATCATCACTAACAGGCTTTCTTGCTTGGCTTGGAATTTCTATCAGTCATATCCGTTTTAGAAGAGCCTATATTGCTCAAGG > 1:3377884/1‑150 AAAATACTTACATTTTTCAAAAAATGAGGATGTTAAATAGTTTTTTTAATTTTGTTATTTAGACTAGATTTGGTAAATATTTAGAAAGGTTTCTTGTGGAAATAAAAGATATTCAGCCTCAACTTTATAAGCAGTTCTCAACGATTTTGCAACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP043523/1573488‑1573335‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caacaATTATTTGTTTTATTGCTTTCTTAACTGGAATATTTGGAACGCAAATTTATCTTTTCTTGGTTGATTTATCATCACTAACAGGCTTTCTTGCTTGGCTTGGAATTTCTATCAGTCATATCCGTTTTAGAAGAGCCTATATTGCTCAAGG < CP043523/1607375‑1607227 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |