| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP043523 | 336292 = | 395 (0.750) | 101 (0.200) +CTCGGTG |
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| ? | CP043523 | 838360 = | 497 (0.950) | intergenic (‑66/+92) | FTN78_chr0888/FTN78_chr0889 | hypothetical protein/General stress protein, Gls24 family | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 396 total aligned reads displayed.
TCCCCTCTACCATATTATCAATCTCATCTTCAGAATATACACAAATTTTTTTTTCATTCTTATATTGAATAACATAAACATATTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTATTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCTTTTTAAATGTCCATGC > CP043523/336139‑336441 | ctctACCATATTATCAATCTCATCTTCAGAATATACACAAATTTTTTTTTCATTCTTATATTGAATAACATAAACATATTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCtttt > 2:1601951/1‑150 (MQ=255) ctctACCATATTATCAATCTCATCTTCAGAATATACACAAATTTTTTTTTCATACTTATATTGAATAACATAAACATATTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCtttt > 2:4077905/1‑150 (MQ=255) tctACCATATTATCAATCTCATCTTCAGAATATACACAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATAACATAAACATATTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTc > 2:100402/1‑150 (MQ=25) tctACCATATTATCAATCTCATCTTCAGAATATACACAAATTTTTTTTTCATTCTTATATTGAATAACATAAACATATTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTc < 1:2149547/150‑1 (MQ=255) atatTATCAATCTCATCTTCAGAATATACACAAATTTTTTTTTCATTCTTATATTGAATAACATAAACATATTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTg < 2:2180934/150‑1 (MQ=255) atatTATCAATCTCATCTTCAGAATATACACAAATTTTTTTTTCATTCTTATATTGAATAACATAAACATATTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTg < 2:54221/150‑1 (MQ=255) atCAATCTCATCTTCAGAATATACACAAATTTTTTTTTCATTCTTATATTGAATAACATAAACATATTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAg > 1:4547218/1‑150 (MQ=255) atCAATCTCATCTTCAGAATATACACAAATTTTTTTTTCATTCTTATATTGAATAACATAAACATATTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAg > 1:1038410/1‑150 (MQ=255) atCAATCTCATCTTCAGAATATACACAAATTTTTTTTTCATTCTTATATTGAATAACATAAACATATTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAg > 1:2814099/1‑150 (MQ=255) cAATCTCATCTTCAGAATATACACAAATTTTTTTTTCATTCTTATATTGAATAACATAAACATATTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGgt > 1:1126679/1‑150 (MQ=255) cAATATCATCTTAAGAATATACACAACTTTTTTTTTCACTCTTATATTGAATAACATAAACATATTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGgt < 1:3890790/150‑1 (MQ=255) tctcATCTTCAGAATATACACAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTGAATAACATAAACATATTTACGTTATTTGAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTTATCTATTTACTTTAAGCACTTACATTTTTAAATTGTTTATgtttt > 2:16882/1‑147 (MQ=18) tctcATCTTCAGAATATACACAAATTTTTTTTTCATTCTTATATTGAATAACATAAACATATTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTa < 1:1443246/150‑1 (MQ=255) 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aaGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTATTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCttt > 1:1946510/1‑150 (MQ=32) aGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTATTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCtttt < 2:1766220/150‑1 (MQ=32) gCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTATTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCttttt < 2:2542023/150‑1 (MQ=32) aCTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTATTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCTTTTTaa > 1:2596783/1‑150 (MQ=32) cTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTATTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCTTTTTaaa > 2:1268822/1‑150 (MQ=32) cTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTATTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCTTTTTaaa < 2:1646195/150‑1 (MQ=32) tACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTATTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCTTTTTAAATg > 1:1537668/1‑150 (MQ=32) tACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTATTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCTTTTTAAATg < 2:3490809/150‑1 (MQ=32) cTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTATTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCTTTTTAAATGTcc < 2:2655477/150‑1 (MQ=32) cTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTATTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCTTTTTAAATGTcc < 2:4547218/150‑1 (MQ=32) tttCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTATTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCTTTTTAAATGTCCAt > 2:3750535/1‑150 (MQ=32) tttCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTATTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCTTTTTAAATGTCCAt < 2:2412473/150‑1 (MQ=32) | TCCCCTCTACCATATTATCAATCTCATCTTCAGAATATACACAAATTTTTTTTTCATTCTTATATTGAATAACATAAACATATTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTATTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCTTTTTAAATGTCCATGC > CP043523/336139‑336441 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |