| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP043523 | = 795292 | 342 (0.650) | 183 (0.370) +CTCGGTG |
82/284 | 16.6 | 31.4% | coding (395/411 nt) | FTN78_chr0848 | Mobile element protein |
| ? | CP043523 | 838360 = | 497 (0.950) | intergenic (‑66/+92) | FTN78_chr0888/FTN78_chr0889 | hypothetical protein/General stress protein, Gls24 family | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 342 total aligned reads displayed.
CATGGACATTTAAAAAGAGAGTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGATTAAAATTCTACGTTTGTTACTCTAAAAACTTGACGTAACGTCAGTTTTTTTTAGATATCTCTTTTTATAAAAATAGTATGGAAAGATTTTAAGACTATCTTTCCAATTGTATACTTTTAAAA > CP043523/795144‑795441 | aTGGACATTTAAAAAGAGAGTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGaaa > 2:3363517/1‑150 (MQ=32) tGGACATTTAAAAAGAGAGTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGaaaa > 2:1072530/1‑150 (MQ=32) tGGACATTTAAAAAGAGAGTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGaaaa < 1:1627290/150‑1 (MQ=32) ggACATTTAAAAAGAGAGTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAg < 1:1368503/150‑1 (MQ=32) aTTTAAAAAGAGAGTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTaa < 1:2778545/150‑1 (MQ=32) tttAAAAAGAGAGTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAg < 1:607767/150‑1 (MQ=32) tttAAAAAGAGAGTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAg < 2:1519126/150‑1 (MQ=32) aaaaaGAGAGTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGc < 2:3676415/150‑1 (MQ=32) aaaGAGAGTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCtt > 1:3979904/1‑150 (MQ=32) aaaGAGAGTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCtt < 1:172755/150‑1 (MQ=32) agagagTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTaa > 1:444314/1‑150 (MQ=32) agagTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTaaaa > 1:3108420/1‑150 (MQ=32) agagTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTaaaa > 2:1135614/1‑150 (MQ=32) agTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAaaata > 1:3504375/1‑150 (MQ=32) ggTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAaataaata < 1:2417415/150‑1 (MQ=32) ggTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAaataaata < 1:1208116/150‑1 (MQ=32) gtgtACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAg < 1:1137178/150‑1 (MQ=32) tgtACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGa > 1:2488412/1‑150 (MQ=32) 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ccAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGATTaa > 2:1714837/1‑150 (MQ=11) ccAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGATTaa < 2:3756427/150‑1 (MQ=11) aTCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGATTAAAATTCTACGTTTGTTACTCTAAAAACTTGACg < 1:688323/150‑1 (MQ=11) aTCAGAGTATTATCTGGTTCATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAATGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGATTACAATTCTACGTTTGTTACTCTAAAAACTTGACg < 2:4383838/150‑1 (MQ=2) gagTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGATTAAAATTCTACGTTTGTTACTCTAAAAACTTGACGTAAc < 2:2910374/150‑1 (MQ=32) agTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGATTAAAATTCTACGTTTGTTACTCTAAAAACTTGACGTAACg < 1:2391506/150‑1 (MQ=32) agTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGATTAAAATTCTACGTTTGTTACTCTAAAAACTTGACGTAACg < 1:1943790/150‑1 (MQ=32) agTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGATTAAAATTCTACGTTTGTTACTCTAAAAACTTGACGTAACg > 2:621433/1‑150 (MQ=32) agTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGATTAAAATTCTACGTTTGTTACTCTAAAAACTTGACGTAACg > 2:1599534/1‑150 (MQ=32) ttttCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGATTAAAATTCTACGTTTGTTACTCTAAAAACTTGACGTAACGTCAg < 1:4363210/150‑1 (MQ=33) tGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGATTAAAATTCTACGTTTGTTACTCTAAAAACTTGACGTAACGTCAGttttt < 1:1133266/150‑1 (MQ=38) tGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGATTAAAATTCTACGTTTGTTACTCTAAAAACTTGACGTAACGTCAGttttt < 1:1453515/150‑1 (MQ=38) gTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGATTAAAATTCTACGTTTGTTACTCTAAAAACTTGACGTAACGTCAGttttttt < 1:1268925/150‑1 (MQ=39) gTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGATTAAAATTCTACGTTTGTTACTCTAAAAACTTGACGTAACGTCAGttttttt > 1:769469/1‑150 (MQ=39) tACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGATTAAAATTCTACGTTTGTTACTCTAAAAACTTGACGTAACGTCAGtttttttt < 1:2022163/150‑1 (MQ=40) 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gAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGATTAAAATTCTACGTTTGTTACTCTAAAAACTTGACGTAACGTCAGTTTTTTTTAGATATCTCTTTTTATAAAAATAGTATGGAAAGATTTTAAGACTATCTTTCCAATTGTATACTTTTaaa < 2:1181961/150‑1 (MQ=255) gAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGATTAAAATTCTACGTTTGTTACTCTAAAAACTTGACGTAACGTCAGTTTTTTTTAGATATCTCTTTTTATAAAAATAGTATGGAAAGATTTTAAGACTATCTTTCCAATTGTATACTTTTaaa > 2:2619619/1‑150 (MQ=255) | CATGGACATTTAAAAAGAGAGTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGATTAAAATTCTACGTTTGTTACTCTAAAAACTTGACGTAACGTCAGTTTTTTTTAGATATCTCTTTTTATAAAAATAGTATGGAAAGATTTTAAGACTATCTTTCCAATTGTATACTTTTAAAA > CP043523/795144‑795441 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |