| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 522 total aligned reads displayed.
TCAGGTGTTTCCCTTTGCTCTGGCTTGTGATAGAATAGTCTTGCATCTGAATTTCCTTTTTATACTATTTGGTCGAACTTCTAGTATAAGAGATTCAGATGTTTTTTGCTTGACTCAAGGTGGCTAACTTCATTTTACAATTTGCGGTTTATCTTTTTCTTTAATTTTTAAAATATTTTCAGTTAATTGTTGGTCACTTTCTAAGTAACTTTTTAACCATATTTTTACATTTGCTTGACTTGCTTTTAACACTTCTTTTGGAAGTAACGTTTGATGCTTTTCCAAAAGATAAAAA > CP043523/1771237‑1771531 | cAGGTGTTTCCCTTTGCTCTGGCTTGTGATAGAATAGTCTTGCATCTGAATTTCCTTTTTATACTATTTGGTCGAACTTCTAGTATAAGAGATTCAGATGTTTTTTGCTTGACTCAAGGTGGCTAACTTCATTTTACAATTTGCGGTTTa > 2:3138607/1‑150 (MQ=31) cAGGTGTTTCCCTTTGCTCTGGCTTGTGATAGAATAGTCTTGCATCTGAATTTCCTTTTTATACTATTTGGTCGAACTTCTAGTATAAGAGATTCAGATGTTTTTTGCTTGACTCAAGGTGGCTAACTTCATTTTACAATTTGCGGTTTa < 2:1894018/150‑1 (MQ=31) aGGTGTTTCCCTTTGCTCTGGCTTGTGATAGAATAGTCTTGCATCTGAATTTCCTTTTTATACTATTTGGTCGAACTTCTAGTATAAGAGATTCAGATGTTTTTTGCTTGACTCAAGGTGGCTAACTTCATTTTACAATTTGCGGTTTAt < 1:827657/150‑1 (MQ=32) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |