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                                                 cAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTATAAt          <  2:3618881/150‑1 (MQ=17)
                                                 cAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGCCGTGCGTTCTCTAACGCTTAGTGGTTTAACATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTACCAATTCGGGCATAAt          >  1:1732428/1‑150 (MQ=11)
                                                  aaTGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGGAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGtatgaat         <  1:70249/150‑5 (MQ=2)
                                                  aaTGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGTTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTACCAATTCGGGTATAAta         <  2:1653622/150‑2 (MQ=255)
                                                  aaTGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGTTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTACCAATTCGGGTATAAta         <  2:638451/150‑2 (MQ=255)
                                                  aaTGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTATAAta         >  2:2529795/1‑149 (MQ=17)
                                                  aaTGCTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGTAAGCGTGCTATTATAAGTCATATAGGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATATATTTTTCAATGAAATCAACTAGCAATTCGGGTAGAAtc         <  1:2960222/150‑2 (MQ=11)
                                                  aaTGATTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGTTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAGTTAACTACCAATTCTGGTATAAta         <  2:3840635/150‑2 (MQ=11)
                                                   atgcttGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGTAAGCGTGCTATTATAAGTCATATAGGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATATATTTTTCAATGAAATCAACTAGCAATTCGGGTAGAAtca        <  1:3976706/146‑3 (MQ=1)
                                                   atgcttGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGTAAGCGTGCTATTATAAGTCATATAGGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATATATTTTTCAATGAAATCAACTAGCAATTCGGGTAGAAtca        <  2:1365833/146‑3 (MQ=1)
                                                   aTGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGTTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTACCAATTCGGGTATAAtaa        <  1:530676/150‑3 (MQ=255)
                                                    tgcttGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGTAAGCGTGCTATTATAAGTCATATAGGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATATATTTTTCAATGAAATCAACTAGCAATTCGGGTAGAAtcaa       <  2:1768689/147‑4 (MQ=11)
                                                    tGGTTGTCAGTAAATGAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTATAAtaaa       <  1:1909348/150‑4 (MQ=255)
                                                    tGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGTTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTACCAATTCGGGTATAAtaaa       >  1:2758960/1‑147 (MQ=11)
                                                     ggTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGTTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTACCAATTCGGGTATAAtaaac      <  1:2224187/150‑5 (MQ=11)
                                                      gTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGTTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTACCAATTCGGGTATAAtaaact     >  1:3001575/1‑145 (MQ=11)
                                                      gTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTATAAtaaaag     >  2:448106/1‑145 (MQ=255)
                                                      cttGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGTAAGCGTGCTATTATAAGTCATATAGGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATATATTTTTCAATGAAATCAACTAGCAATTCGGGTAGAAtcaagt     >  1:1786722/2‑145 (MQ=1)
                                                      cttGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGTAAGCGTGCTATTATAAGTCATATAGGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATATATTTTTCAATGAAATCAACTAGCAATTCGGGTAGAAtcaagt     >  2:4413213/2‑145 (MQ=1)
                                                      cttGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGTAAGCGTGCTATTATAAGTCATATAGGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATATATTTTTCAATGAAATCAACTAGCAATTCGGGTAGAAtcaagt     <  2:3473026/149‑6 (MQ=1)
                                                      cttGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGTAAGCGTGCTAGTATAAGTCATATAGGTCGTGCGCTTTCTGATGCTCAGTAGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATATATTTTTCAATGAAATCAACTAGCGATTCGGGTAGAAtcaagt     >  2:4205210/2‑145 (MQ=11)
                                                       ttGTCAGTAAATAAACAAAAACTGTTGTAAGCGTGCTATTATAAGTCATATAGGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATATATTTTTCAATGAAATCAACTAGCAATTCGGGTAGAAtcaagtn    <  1:440236/150‑7 (MQ=1)
                                                        tGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGTAAGCGTGCTATTATAAGTCATATAGGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATATATTTTTCAATGAAATCAACTAGCAATTCGGGTAGAAtcaagttt   <  2:1571619/150‑8 (MQ=1)
                                                        tGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGTAAGCGTGCTATTATAAGTCATATAGGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATATATTTTTCAATGAAATCAACTAGCAATTCGGGTAGAAtcaagttt   <  2:359361/150‑8 (MQ=1)
                                                        tGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGTTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTACCAATTCGGGTATAAtaaactat   >  2:1881411/1‑143 (MQ=11)
                                                        tGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGTTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTACCAATTCGGGTATAAtaaactat   >  1:2703353/1‑143 (MQ=11)
                                                        tGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGTTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTACCAATTCGGGTATAAtaaactat   <  2:2650011/150‑8 (MQ=11)
                                                                                                                                                     |                                                         
TTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCAAGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTATAATGTAGAATA  >  CP043523/1862076‑1862282

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: