| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | CP043523 | 1848608 | 1848804 | 197 | 334 [328] | [329] 333 | FTN78_chr1898/FTN78_chr1899 | Cold shock protein of CSP family/Type I restriction‑modification system, restriction subunit R |
Only 100 of 333 total aligned reads displayed.
GTTAATTATCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGG‑‑TATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCCCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTTGTGTTCCACTTTCTATCAATGTTTTAAGAAGCTTAACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATGAACAATAAATGCA > CP043523/1848715‑1848954 | atcgggtATCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCt > 2:2280391/7‑150 (MQ=25) tcgggtATCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCtt < 1:3314148/145‑1 (MQ=25) cgggtATCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCttt > 2:2964825/5‑150 (MQ=37) cgggtATCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCttt > 1:3214194/5‑150 (MQ=37) gggtATCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTa > 1:3167521/4‑150 (MQ=37) gggtATCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTa > 2:331745/4‑150 (MQ=37) gggtATCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTa < 2:4279760/147‑1 (MQ=37) ggtATCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTAt < 2:1842586/148‑1 (MQ=37) ggtATCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTAt < 1:203189/148‑1 (MQ=37) gtATCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTAtt > 2:2762552/2‑150 (MQ=37) gtATCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTAtt > 2:2789031/2‑150 (MQ=37) tATCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCTCTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATtc > 1:4469679/1‑150 (MQ=37) tCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATtcct < 2:834676/150‑1 (MQ=37) tCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATtcct > 1:1872411/1‑150 (MQ=38) tCAAGTCATAGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGTGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATtcct < 2:3630865/150‑1 (MQ=255) cAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATtcctc < 2:2397921/150‑1 (MQ=38) cAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATtcctc > 1:2923021/1‑150 (MQ=38) cAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATacctc > 2:3940632/1‑150 (MQ=37) gTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCAt > 2:1377170/1‑150 (MQ=38) gTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCAt < 1:3417213/150‑1 (MQ=38) tCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCAtt > 1:431464/1‑150 (MQ=255) tCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCAtt > 1:2796770/1‑150 (MQ=255) tCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCAtt < 2:2995082/150‑1 (MQ=38) tCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCAtt < 2:3006321/150‑1 (MQ=255) tCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCAtt > 2:2951964/1‑150 (MQ=255) tCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCAtt > 1:605502/1‑150 (MQ=255) tGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGAt < 2:1049710/150‑1 (MQ=255) ggCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATa > 1:4428254/1‑150 (MQ=255) gCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATAc < 2:2050713/150‑1 (MQ=255) tAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTa > 2:4519950/1‑150 (MQ=255) aataatCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTAtt < 2:3245881/150‑1 (MQ=255) ataatCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTg > 1:1715443/1‑150 (MQ=255) ataatCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTg > 2:1195817/1‑150 (MQ=255) aatCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTa > 1:2653281/1‑150 (MQ=255) aatCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTa > 2:473864/1‑150 (MQ=255) atCAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTAc > 2:3991522/1‑150 (MQ=255) cAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCa > 1:1798045/1‑150 (MQ=255) cAACTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCa < 1:2901864/150‑1 (MQ=255) aCTAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATa < 2:1732212/150‑1 (MQ=255) tAGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAAc > 2:4011078/1‑150 (MQ=255) aGCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACt < 2:2510714/150‑1 (MQ=255) gCAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACtt < 2:35528/150‑1 (MQ=255) cAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTg > 2:3285667/1‑150 (MQ=255) cAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTg < 1:193821/150‑1 (MQ=255) cAATTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTg > 2:3185010/1‑150 (MQ=255) aaTTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGTATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGa < 1:3454760/150‑1 (MQ=255) aaTTCGGGTTTATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGa > 2:34408/1‑150 (MQ=255) cgggtttATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAAGTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTCGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATAGTATGGTACCATAACTTGAAAGc > 2:4232153/7‑150 (MQ=255) ggtttATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCAc > 1:2684937/5‑150 (MQ=255) gtttATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACt < 1:449387/147‑1 (MQ=255) gtttATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACt < 1:2455003/147‑1 (MQ=255) ttATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCAGCAATAGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTta > 2:1514544/2‑150 (MQ=255) tATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTtat > 1:3688099/1‑150 (MQ=255) ttAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTtatat < 1:1368684/150‑1 (MQ=255) tAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTtatata > 2:3125557/1‑150 (MQ=255) tAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTtatata < 1:3300129/150‑1 (MQ=255) aaTATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATaa > 2:586408/1‑150 (MQ=255) tatatCTATAAATTGTTGTTCTAGAACCTCCTCAAGCATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAAt < 2:1340664/150‑1 (MQ=255) tatatCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATaaaa < 2:1084203/150‑2 (MQ=255) tatatCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAAt < 1:827800/150‑1 (MQ=255) tatatCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAAt > 2:2221993/1‑150 (MQ=255) atatCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATg > 2:552936/1‑150 (MQ=255) atatCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATg > 1:2815390/1‑150 (MQ=255) ntCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGaa > 2:948167/2‑150 (MQ=255) cTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACa > 2:3714952/1‑150 (MQ=255) tataAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACAt > 2:1067351/1‑150 (MQ=255) ataAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATa > 1:895560/1‑150 (MQ=255) taAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATan < 1:1465088/150‑2 (MQ=255) taAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAg < 2:2617377/150‑1 (MQ=255) taAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAg > 1:2619242/1‑150 (MQ=255) taAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAg > 1:2145066/1‑150 (MQ=255) aaTTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAGGCACTTATATAAATGAACATAGaa > 1:3958453/1‑150 (MQ=255) aaTTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGaa > 2:409803/1‑150 (MQ=255) ttgttgTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATa > 1:2508439/1‑150 (MQ=255) tgttCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAAtt < 1:1092547/150‑1 (MQ=255) gttCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTa > 1:954390/1‑150 (MQ=255) gttCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTa > 2:1406555/1‑150 (MQ=255) tCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACg > 2:1099281/1‑150 (MQ=255) tCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACg < 1:3796797/150‑1 (MQ=255) cTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGGATAAATTACgg > 2:4402597/1‑150 (MQ=255) cTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACgg > 2:3497056/1‑150 (MQ=255) tAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACggg > 1:495701/1‑150 (MQ=255) tAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACggg < 1:1144134/150‑1 (MQ=255) gAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGtt > 1:1422229/1‑150 (MQ=255) gAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGtt < 2:2659647/150‑1 (MQ=255) aaaCTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTa > 1:1186328/1‑150 (MQ=255) ctcctcAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATg < 1:2981453/150‑1 (MQ=255) ctcctcAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATg < 1:2738753/150‑1 (MQ=255) tCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATGa > 2:1242821/1‑150 (MQ=255) ctcAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATGAAc < 2:769944/148‑1 (MQ=255) tcAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATGAACa > 1:4169956/2‑150 (MQ=255) tcAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATGAACa < 2:2817111/149‑1 (MQ=255) cAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATGAACaa < 2:2003251/150‑1 (MQ=255) aaGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATGAACaag < 1:228793/150‑2 (MQ=255) aaTCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAATAAGCTTTACGTCTCTATTCCTACATTGATAGTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACGTAGAATAAATTACGGGTTAATGAACAAGaaa > 2:4354278/1‑150 (MQ=255) tCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATGAACAAGAAATg < 1:634069/150‑1 (MQ=255) tCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATGAACAAGAAATg < 1:1021148/150‑1 (MQ=255) ccGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATGAACAAGAAATgt < 2:636827/150‑2 (MQ=255) cGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATGAACAAGAAATgta < 1:3543896/150‑3 (MQ=255) cGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATGAACAAGAAATgta < 2:1862413/150‑3 (MQ=255) | GTTAATTATCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGG‑‑TATTAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCCCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTTGTGTTCCACTTTCTATCAATGTTTTAAGAAGCTTAACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATGAACAATAAATGCA > CP043523/1848715‑1848954 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |