Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP043523 | 1,884,363 | G→A | E15E (GAG→GAA) | FTN78_chr1930 → | Putative UV‑damage repair protein UvrX |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP043523 | 1,884,363 | 0 | G | A | 99.6% | 1591.5 / ‑5.0 | 482 | E15E (GAG→GAA) | FTN78_chr1930 | Putative UV‑damage repair protein UvrX |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); major base A (286/192); minor base C (1/1); total (288/194) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 482 total aligned reads displayed.
AACATTTTATCAGTTTTAATGTTT‑TTTT‑TATTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACAATGGAACAATTAAAATTAAATCAATACTTTGACTATTCCCTTGAGCCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTAAAGGGTTAACGCTTGCCTCTAGTCC > CP043523/1884224‑1884509 | tccaagttATCAGTTTTGGTGTTTATTTC‑GATTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCAcgtcgt < 2:3541085/144‑1 (MQ=255) caagttATCAGTTTTGGTGTTTATTTC‑GATTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGc > 1:3142758/5‑150 (MQ=255) gttATCAGTTTTGGTGTTTATTTC‑GATTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCAt < 2:2926240/149‑1 (MQ=255) gttATCAGTTTTGGTGTTTATTTC‑GATTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCAt < 1:1646375/149‑1 (MQ=255) gttATCAGTTTTGGTGTTTATTTC‑GATTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCAt > 1:2461537/2‑150 (MQ=255) ttATCAGTTTTGGTGTTTATTTC‑GATTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATc < 1:695988/150‑1 (MQ=255) tATCAGTTTTGGTGTTTATTTC‑GATTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGACCCACGTGGTGCCATcc > 1:3699127/1‑150 (MQ=255) tCAGTTTTGGTGTTT‑ATTTCGATTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCctc < 1:2816530/150‑1 (MQ=255) tatttcgaTTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCaa < 1:3772947/143‑1 (MQ=255) tttcgaTTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGt < 2:2150128/145‑1 (MQ=255) cgaTTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTa > 1:278281/3‑150 (MQ=255) aTTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTTTTTTTTTTGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAAt > 2:2731855/1‑150 (MQ=255) aTTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTTCTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAAt < 2:434932/150‑1 (MQ=255) aTTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAAt > 1:594757/1‑150 (MQ=255) tGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTa > 2:133732/1‑150 (MQ=255) gTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTAt > 2:1314843/1‑150 (MQ=255) gTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTAt > 1:4198354/1‑150 (MQ=255) gTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTAt > 1:1975891/1‑150 (MQ=255) tttttCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTTTTTTAGTATGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATg > 2:4134461/1‑150 (MQ=255) ttttCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGc > 2:3874876/1‑150 (MQ=255) tCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTc > 1:1508702/1‑150 (MQ=255) aCTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCaa > 2:1411544/1‑150 (MQ=255) aCTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCaa < 2:2360292/150‑1 (MQ=255) aCTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCaa > 1:3400934/1‑150 (MQ=255) tctAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAAtt > 2:3398293/1‑150 (MQ=255) tctAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAAtt < 2:3611439/150‑1 (MQ=255) tAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCTCGTCGTGTCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGa < 2:3731155/150‑1 (MQ=255) aaaaaaGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAAt > 2:1768460/1‑150 (MQ=255) aaaaGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGc < 2:2223364/150‑1 (MQ=255) aaaGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACTATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCg < 2:3647081/150‑1 (MQ=255) aGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGtt > 1:496476/1‑150 (MQ=255) atatAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTGTCAAGATGGCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCa > 1:3514196/1‑150 (MQ=255) tataATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAg < 2:3165081/150‑1 (MQ=255) taataTCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCg > 1:2636518/1‑150 (MQ=255) atatCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGaa > 1:3355391/1‑150 (MQ=255) tatCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGaaa > 2:2823925/1‑150 (MQ=255) tatCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGaaa > 2:4572106/1‑150 (MQ=255) cAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCGAGTCTAATCATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAAttt < 2:3988519/150‑1 (MQ=255) tAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTaaa > 1:4470587/1‑150 (MQ=255) aaaCTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATc < 2:1148898/150‑1 (MQ=255) aaCTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATcc > 2:309491/1‑150 (MQ=255) aaCTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATcc > 1:3161357/1‑150 (MQ=255) cTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCctc > 2:2980554/1‑150 (MQ=255) cTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCctc < 1:1007542/150‑1 (MQ=255) tttttGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCa > 1:3842558/1‑150 (MQ=255) tGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTCGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTtc < 2:2026420/150‑1 (MQ=255) gATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTtct < 1:1130704/150‑1 (MQ=255) gATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTtct > 1:1697267/1‑150 (MQ=255) gATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTtct > 1:1593502/1‑150 (MQ=255) aTTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTtctc < 1:2367581/150‑1 (MQ=255) aTTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTtctc > 1:3595437/1‑150 (MQ=255) aTTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTtctc > 2:1218315/1‑150 (MQ=255) tttAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTctct > 2:153156/1‑150 (MQ=255) ttAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCtt < 1:4419782/150‑1 (MQ=255) ttAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCtt < 1:325419/150‑1 (MQ=255) tAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCttt < 1:3451904/150‑1 (MQ=255) aggaggAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTtg > 1:2004423/1‑150 (MQ=255) ggaggaACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTtgt > 2:755435/1‑150 (MQ=255) gaggaACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTtgtg > 1:1248255/1‑150 (MQ=255) gaggaACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTtgtg < 1:187277/150‑1 (MQ=255) gaggaACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGCCTAAGTATGCTTCAATTGCATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTCACCACTCCTCTTtgtg > 2:429985/1‑150 (MQ=255) aggaACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTgtgt > 2:1708584/1‑150 (MQ=255) aggaACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTgtgt > 1:2931304/1‑150 (MQ=255) aactatggaacaatTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCAt < 1:4447113/146‑1 (MQ=255) ctatggaacaatTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGa > 2:512341/3‑150 (MQ=255) atggaacaatTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGt > 2:608036/1‑150 (MQ=255) aacaatTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAg < 1:439232/150‑1 (MQ=255) aattaaaattaaATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAg < 2:1045257/150‑1 (MQ=255) aattaaaattaaATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAg > 1:920307/1‑150 (MQ=255) aaattaaaTAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCAt > 1:1067528/1‑150 (MQ=255) attaaaTAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTc > 1:3965046/1‑150 (MQ=255) attaaaTAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTc > 2:3489760/1‑150 (MQ=255) ttaaaTAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCt < 1:4313856/150‑1 (MQ=255) taaataaaTACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTa < 2:253860/150‑1 (MQ=255) aataaataCTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTaaa > 1:1436695/1‑150 (MQ=255) aataaataCTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTaaa > 1:2710232/1‑150 (MQ=255) ataaaTACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTAAAg < 2:2461537/147‑1 (MQ=255) ataaaTACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTAAAg > 1:616333/4‑150 (MQ=255) aaaTACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTAAAggg > 2:2783059/2‑150 (MQ=255) aaaTACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTAAAggg > 2:468980/2‑150 (MQ=255) aaTACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTAAAGGGt > 2:3352683/1‑150 (MQ=255) aTACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTAAAGGGtt < 2:859293/150‑1 (MQ=255) aTACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTAAAGGGtt < 1:464874/150‑1 (MQ=255) aCTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTAAAGGGTTaa > 1:2541042/1‑150 (MQ=255) tGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTAAAGGGTTAACGCt > 2:1229862/1‑150 (MQ=255) actactCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTAAAGGGTTAACGCTTg > 2:1621642/1‑150 (MQ=255) ctcctctcTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCATCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTAAAGGGTTAACGCTTGc < 1:2795548/143‑1 (MQ=255) ctactcgcTTGAACCACGTCGTGCCATCGTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTAAAGGGTTAACGCTTGc < 2:3141775/143‑1 (MQ=255) ctactcgcTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTAAAGGGTTAACGCTTGc > 1:2284360/8‑150 (MQ=255) ctactcgcTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTAAAGGGTTAACGCTTGc > 2:4430060/8‑150 (MQ=255) ctactcgcTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTAAAGGGTTAACGCTTGc > 2:1968080/8‑150 (MQ=255) actcgcTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTAAAGGGTTAACGCTTGCct < 1:1314843/145‑1 (MQ=255) ctcgcTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTAAAGGGTTAACGCTTGCctc < 1:3102058/146‑1 (MQ=255) tcgcTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCATATCACTCTAAAGGGTTAACGCTTGCctct > 2:4539778/4‑150 (MQ=255) cgcTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTAAAGGGTTAACGCTTGCCTCTa > 1:1720397/3‑150 (MQ=255) gcTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTAAAGGGTTAACGCTTGCCTCTAg > 1:849946/2‑150 (MQ=255) cTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTAAAGGGTTAACGCTTGCCTCTAGt < 1:4134461/150‑1 (MQ=255) ttGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTAAAGGGTTAACGCTTGCCTCTAGTc < 1:2153983/150‑1 (MQ=255) tGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTAAAGGGTTAACGCTTGCCTCTAGTcc < 2:4083056/150‑1 (MQ=255) tGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTAAAGGGTTAACGCTTGCCTCTAGTcc < 1:4107275/150‑1 (MQ=255) | AACATTTTATCAGTTTTAATGTTT‑TTTT‑TATTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACAATGGAACAATTAAAATTAAATCAATACTTTGACTATTCCCTTGAGCCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTAAAGGGTTAACGCTTGCCTCTAGTCC > CP043523/1884224‑1884509 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |