Predicted mutation | ||||||
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RA | CP043523 | 1,891,241 | C→A | intergenic (‑11/‑139) | FTN78_chr1940 ← / → FTN78_chr1941 | Mobile element protein/Permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP043523 | 1,891,241 | 0 | C | A | 99.1% | 1036.1 / ‑0.5 | 456 | intergenic (‑11/‑139) | FTN78_chr1940/FTN78_chr1941 | Mobile element protein/Permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (3/1); new base A (213/238); total (216/240) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.50e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 460 total aligned reads displayed.
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |