| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP043523 | 2,065,547 | G→A | G206S (GGC→AGC) | FTN78_chr2137 → | Pur operon repressor PurR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP043523 | 2,065,547 | 0 | G | A | 99.5% | 1832.6 / NA | 558 | G206S (GGC→AGC) | FTN78_chr2137 | Pur operon repressor PurR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/1); new base A (286/267); total (289/269) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 559 total aligned reads displayed.
GTTCGTCGTGACCCTAAAGTGACCGAAGGAGCAACGCTCAATGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAGGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACGATTGATTGATGATTACAAATCAATCTTGAAAGTTGATCGAATTGAT > CP043523/2065400‑2065693 | ttCGTCGTGACCCTAAAGTGACCGAAGGAGCAACGCTCAATGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAgcg > 1:874902/1‑150 (MQ=255) ttCGTCGTGACCCTAAAGTGACCGAAGGAGCAACGCTCAATGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAgcg < 1:2469914/150‑1 (MQ=255) tcgtcgTGACCCTAAAGTGACCGAAGGAGCAACGCTCAATGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAgcgc < 2:4028243/150‑1 (MQ=255) cgtcgtGACCCTAAAGTGACCGAAGGAGCAACGCTCAATGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCa > 2:1435730/1‑150 (MQ=255) cgtcgtGACCCTAAAGTGACCGAAGGAGCAACGCTCAATGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCa > 2:556727/1‑150 (MQ=255) cgtGACCCTAACGTGACCGAAGGAGCAACGCTCAATGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGa < 1:1653062/150‑1 (MQ=255) cgtGACCCTAAAGTGACCGAAGGAGCAACGCTCAATGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACGTCATGAAAAGCggagga > 2:3868436/1‑150 (MQ=255) tGACCCTAAAGTGACCGAAGGCGCAACGCTCAATGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTGGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAATATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAAc > 2:4436241/1‑150 (MQ=255) tGACCCTAAAGTGACCGAAGGAGCAACGCTCAATGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAAc < 1:264921/150‑1 (MQ=255) gACCCTAAAGTGACCGAAGGAGCAACGCTCAATGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAAcn < 1:1396757/150‑2 (MQ=255) gACCCTAAAGTGACCGAAGGAGCAACGCTCAATGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAAca > 2:3123231/1‑150 (MQ=255) gACCCTAAAGTGACCGAAGGAGCAACGCTCAATGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAAca > 1:1716769/1‑150 (MQ=255) gaGTGACCGAAGGAGCAACGCTCAATGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATg < 2:2823274/149‑1 (MQ=255) aaGTGACCGAAGGAGCAACGCTCAATGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATg < 1:1001464/150‑1 (MQ=255) aGTGACCGAAGGAGCAACGCTCAATGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATgg > 1:4135123/1‑150 (MQ=255) gACCGAAGGAGCAACGCTCAATGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAAt > 1:4109760/1‑150 (MQ=255) aCCGAAGGAGCAACGCTCAATGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATg > 1:2232658/1‑150 (MQ=255) cGAAGGAGCAACGCTCAATGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATgag < 1:2841799/150‑1 (MQ=255) gAAGGAGCAACGCTCAATGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATgaga > 2:2343965/1‑150 (MQ=255) gAAGGAGCAACGCTCAATGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATgaga > 2:3981020/1‑150 (MQ=255) ggAGCAACGCTCAATGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGt < 2:1992209/150‑1 (MQ=255) ggAGCAACGCTCAATGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGt < 1:509986/150‑1 (MQ=255) gAGCAACGCTCAATGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTc < 2:1916810/150‑1 (MQ=255) aGCAACGCTCAATGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCt < 1:1429153/150‑1 (MQ=255) cAACGCTCAATGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTg < 1:3124707/150‑1 (MQ=255) naCGCTCAATGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCAAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGt > 2:4525991/2‑150 (MQ=255) aaCGCTCAATGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGt > 1:648559/1‑150 (MQ=255) gCTCAATGTAAATTATATCTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCa < 2:4379436/150‑1 (MQ=255) tCAATGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATg < 1:1188899/150‑1 (MQ=255) cAATGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGa > 2:3550657/1‑150 (MQ=255) aTGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAAt > 2:3698539/1‑150 (MQ=255) aTGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAAt > 2:2959299/1‑150 (MQ=255) tGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAAtt < 1:710530/150‑1 (MQ=255) tGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAAtt > 1:2418335/1‑150 (MQ=255) aaTTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGAt < 2:3334737/150‑1 (MQ=255) aaTTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTCTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAACGAAGGAAAAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATATGAt > 2:6843/1‑150 (MQ=255) tataTGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGt < 2:615822/150‑1 (MQ=255) tatGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGttt < 2:2675715/150‑1 (MQ=255) tatGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGttt > 1:4541597/1‑150 (MQ=255) atGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTa < 1:255763/150‑1 (MQ=255) atGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTa > 1:4437381/1‑150 (MQ=255) atGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTa > 2:3601027/1‑150 (MQ=255) cAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTg < 1:3470664/150‑1 (MQ=255) aGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGc > 1:572333/1‑150 (MQ=255) gTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCg < 1:3284067/150‑1 (MQ=255) ttCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCgg > 1:225975/1‑150 (MQ=255) ttCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCgg > 1:2962701/1‑150 (MQ=255) aGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGtt < 2:2495235/150‑1 (MQ=255) gCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTg < 1:1861454/150‑1 (MQ=255) ctctCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGc > 2:2087686/1‑150 (MQ=255) ctctCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATATGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGc > 2:2170404/1‑150 (MQ=255) tctcGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGcc > 1:4311322/1‑150 (MQ=255) ctcGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCg < 2:1336876/150‑1 (MQ=255) tgtTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGtctt > 1:3862295/1‑150 (MQ=255) gAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGtctttctt > 2:495046/1‑150 (MQ=255) atatGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAgg < 2:16667/150‑1 (MQ=255) atGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGa > 1:1762028/1‑150 (MQ=255) cTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCTGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCtt > 1:1240772/1‑150 (MQ=255) cTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCtt < 1:2869370/150‑1 (MQ=255) aTCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTaa < 2:3809173/150‑1 (MQ=255) aTCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTaa > 1:2733719/1‑150 (MQ=255) aaaCGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGga > 2:872603/1‑150 (MQ=255) aaaCGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGga > 1:1040054/1‑150 (MQ=255) aaCGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGgag < 1:1967174/150‑1 (MQ=255) aCGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGgaga > 2:3304951/1‑150 (MQ=255) ggAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAAc > 2:2545562/1‑150 (MQ=255) ggAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAAc > 2:3210178/1‑150 (MQ=255) gTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACgat < 2:1370631/150‑1 (MQ=255) tttCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACgattga < 1:4480774/150‑1 (MQ=255) tCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACgattgatt < 1:1590261/150‑1 (MQ=255) tCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACgattgatt < 1:2000862/150‑1 (MQ=255) cAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACGattgattg < 1:798377/150‑1 (MQ=255) aTTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACGATtgattgat > 1:1443849/1‑150 (MQ=255) tGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACGATTGATtgatga < 1:2077341/150‑1 (MQ=255) tGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACGATTGATtgatga > 1:3239269/1‑150 (MQ=255) ggTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACGATTGATTgatgat < 2:940750/150‑1 (MQ=255) aaaaTGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACGATTGATTGATGATTACa > 2:1597156/1‑150 (MQ=255) aaaTGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACGATTGATTGATGATTACaa > 1:375864/1‑150 (MQ=255) aaaTGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATAGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACGATTGATTGATGATTACaa > 2:4078854/1‑150 (MQ=255) aaTGTCTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACGATTGATTGATGATTACaaa > 2:4271493/1‑150 (MQ=255) gTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACGATTGATTGATGATTACAaatca < 1:4053093/150‑1 (MQ=255) tGATCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACGATTGATTGATGATTACAAATCAATCt < 1:3986908/150‑1 (MQ=255) aTCGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACGATTGATTGATGATTACAAATCAATCTTg < 1:2156196/150‑1 (MQ=255) cGTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACGATTGATTGATGATTACAAATCAATCTTGaa < 2:228832/150‑1 (MQ=255) gTTGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACGATTGATTGATGATTACAAATCAATCTTGaaa < 2:3038592/150‑1 (MQ=255) ttGATGACTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACGATTGATTGATGATTACAAATCAATCTTGAAAg > 1:2907679/1‑150 (MQ=255) gatgaCTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACGATTGATTGATGATTACAAATCAATCTTGAAAGtt < 1:3797605/150‑1 (MQ=255) gatgaCTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACGATTGATTGATGATTACAAATCAATCTTGAAAGtt < 1:3567824/150‑1 (MQ=255) gatgaCTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACGATTGATTGATGATTACAAATCAATCTTGAAAGtt < 1:607783/150‑1 (MQ=255) atgaCTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACGATTGATTGATGATTACAAATCAATCTTGAAAGTTg < 2:1775901/150‑1 (MQ=255) atgaCTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACGATTGATTGATGATTACAAATCAATCTTGAAAGTTg > 2:1021459/1‑150 (MQ=255) atgaCTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACGATTGATTGATGATTACAAATCAATCTTGAAAGTTg > 1:956841/1‑150 (MQ=255) atgaCTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACGATTGATTGATGATTACAAATCAATCTTGAAAGTTg < 2:4173572/150‑1 (MQ=255) aCTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACGATTGATTGATGATTACAAATCAATCTTGAAAGGTGATc > 1:2051994/1‑150 (MQ=255) cTTCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACGATTGATTGATGATTACAAATCAATCTTGAAAGTTGATCg > 2:823809/1‑150 (MQ=255) ttCATGAAAAGCGCAGGAAAAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAATGGAGAACGATTGATTGATGATTACAAATCAATCTTGAAAGTTGATCGa < 2:3432174/150‑1 (MQ=255) tCATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACGATTGATTGATGATTACAAATCAATCTTGAAAGTTGATCGaa > 2:745510/1‑150 (MQ=255) cATGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACGATTGATTGATGATTACAAATCAATCTTGAAAGTTGATCGAAt < 1:2343965/150‑1 (MQ=255) aTGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACGATTGATTGATGATTACAAATCAATCTTGAAAGTTGATCGAAtt < 1:2686603/150‑1 (MQ=255) tGAAAAGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACGATTGATTGATGATTACAAATCAATCTTGAAAGTTGATCGAATTg > 1:3654819/1‑150 (MQ=255) | GTTCGTCGTGACCCTAAAGTGACCGAAGGAGCAACGCTCAATGTAAATTATATGTCAGGTTCAAGCTCTCGTGTTGAAAATATGACTTTATCCAAACGGAGTCTTTCAATTGGTCAAAATGTTTTGATCGTTGATGACTTCATGAAAGGCGCAGGAACAATCAATGGAATGAGAAGTCTTGTCCATGAATTTGATTGTTTACTTGCCGGTGTTGCCGTCTTTCTTGAGGGACCTTTTAAAGGAGAACGATTGATTGATGATTACAAATCAATCTTGAAAGTTGATCGAATTGAT > CP043523/2065400‑2065693 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |