| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP043523 | 1,848,516 | G→A | intergenic (+24/+720) | FTN78_chr1898 → / ← FTN78_chr1899 | Cold shock protein of CSP family/Type I restriction‑modification system, restriction subunit R |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP043523 | 1,848,516 | 0 | G | A | 99.7% | 1852.5 / NA | 594 | intergenic (+24/+720) | FTN78_chr1898/FTN78_chr1899 | Cold shock protein of CSP family/Type I restriction‑modification system, restriction subunit R |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); major base A (287/304); minor base C (0/2); total (288/306) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.00e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 599 total aligned reads displayed.
TTCGCTCACTTCTCAGCAATCCAATCTGATGGATTCAAAACACTTGATGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAGCTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATGATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATGCATAAATTAGGGCCACTCTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAA > CP043523/1848370‑1848665 | ttCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTg < 1:1551902/150‑1 (MQ=14)ttCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTg < 1:182303/150‑1 (MQ=14) tCGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTgg > 2:3293108/1‑150 (MQ=14) cGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGa < 1:2349879/150‑1 (MQ=255) cGCTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGa > 2:1221034/1‑150 (MQ=14) cTCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGt > 1:1616184/1‑150 (MQ=14) tCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTc > 1:1142866/1‑150 (MQ=14) tCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTc > 1:61542/1‑150 (MQ=255) tCACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTc > 1:3725898/1‑150 (MQ=255) cACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCa > 1:4504761/1‑150 (MQ=14) cACTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCa > 1:3304036/1‑150 (MQ=14) aCTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCAt < 1:850118/150‑1 (MQ=255) cTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGATGGTCAACGTGGACGTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATAGTGCAAAAACTGGAGTCATg < 2:4144722/150‑1 (MQ=14) cTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAGTCGTGCAAAAACTGGAGTCATg > 1:3418104/1‑150 (MQ=14) cTTCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATg > 2:2806945/1‑150 (MQ=14) ttCTCATCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGa > 2:2270051/1‑150 (MQ=14) catcaatccaatcTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTc < 2:4300105/147‑1 (MQ=255) atcaatccaatcTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCa > 2:1740216/3‑150 (MQ=255) aatccaatcTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGtt > 1:2424213/1‑150 (MQ=255) aatccaatcTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGtt < 1:251932/150‑1 (MQ=255) aatccaatcTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGtt < 1:2568421/150‑1 (MQ=255) aatccaatcTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGtt < 1:2653941/150‑1 (MQ=255) tccaatcTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGtttt < 2:2058811/150‑1 (MQ=255) ccaatcTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGttttt > 2:613331/1‑150 (MQ=255) aatcTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGttttttt < 2:145415/150‑1 (MQ=255) aatcTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGttttttt > 2:1327294/1‑150 (MQ=255) ctcattgATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGCCAACGTGGCCCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTCTCAGACAATCGTGCAAAAACTCGAGTCAGGACTCCAGTTTTTTtata > 2:1831907/7‑150 (MQ=14) cTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTtata < 2:190861/150‑1 (MQ=255) gATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTTATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATAtt < 2:2193681/150‑1 (MQ=255) gATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATAtt < 1:3495511/150‑1 (MQ=255) aTGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTc > 1:760908/1‑150 (MQ=255) ggATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAg < 1:3067388/150‑1 (MQ=255) ggATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAg > 2:3458858/1‑150 (MQ=255) ttCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTg < 2:453344/150‑1 (MQ=255) aaatCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCaa > 1:3558807/1‑150 (MQ=255) tcacTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAatta < 1:2048607/149‑3 (MQ=255) cacTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAattat < 2:86278/150‑1 (MQ=255) acTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAattatg > 1:2718826/1‑150 (MQ=255) gacgaAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATgagag < 1:3763941/147‑1 (MQ=255) cgaAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAGAACCTGGAGTTATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGagagag < 2:3732336/149‑1 (MQ=255) aGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTAt > 1:726343/1‑150 (MQ=255) aGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTAt > 1:3280247/1‑150 (MQ=255) ggTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATg < 2:1629492/150‑1 (MQ=255) gTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGa < 2:2065001/150‑1 (MQ=255) gTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATACCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTTGAATCATGACTTCAGTTATTTTATATTCAGATGCACTTATGAGAGAGAATGa > 2:2468941/1‑150 (MQ=21) tCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGat < 1:520530/150‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGatat > 1:3645307/1‑150 (MQ=255) aaGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAAGCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACt < 1:2125196/150‑1 (MQ=255) aGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACtt < 2:3169989/150‑1 (MQ=255) aGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACtt < 2:2875145/150‑1 (MQ=255) aGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACtt > 1:4536992/1‑150 (MQ=255) gTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTa < 1:40115/150‑1 (MQ=255) tGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGc > 2:2561145/1‑150 (MQ=255) tGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTAGATTCAGTTGCACTTATGAGAGAGTATGATATACTTAGc > 1:3895208/1‑150 (MQ=255) aaTTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCa < 1:44493/150‑1 (MQ=255) aaTTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCa > 1:1882753/1‑150 (MQ=255) ttGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCa > 2:1532097/1‑150 (MQ=255) tGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCaa < 1:4207641/150‑1 (MQ=255) gATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAag < 2:4579061/150‑1 (MQ=255) aTGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAaga < 2:681831/150‑1 (MQ=255) gTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAgg < 1:1252645/150‑1 (MQ=255) agaagGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACt < 1:4391169/150‑1 (MQ=255) agGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTcac > 1:1994475/1‑150 (MQ=255) gTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCa < 2:519820/150‑1 (MQ=255) ggACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTGTCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCAtt > 1:1006085/1‑149 (MQ=255) aCCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCAttca > 1:1695539/1‑147 (MQ=255) ccTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCAt < 1:1740709/150‑1 (MQ=255) ccTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCAt < 1:2444477/150‑1 (MQ=255) cTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATa > 1:2189271/1‑150 (MQ=255) cTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATa < 2:3407140/150‑1 (MQ=255) cTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATa < 1:1973850/150‑1 (MQ=255) tCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATaa < 1:4119105/150‑1 (MQ=255) aaGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAAt < 1:1510733/150‑1 (MQ=255) aGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAAtn < 2:4013613/150‑2 (MQ=255) gCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTa < 2:3635750/150‑1 (MQ=255) gCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTa > 1:701065/1‑150 (MQ=255) aaTATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCa < 2:3723134/150‑1 (MQ=255) aaTATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGATTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCa > 2:4498451/1‑150 (MQ=37) tatCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCAct < 2:387153/150‑1 (MQ=38) atCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCActt > 2:198596/1‑149 (MQ=38) tCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCActtt < 2:1099649/150‑3 (MQ=37) cacaAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTa > 2:3004819/1‑150 (MQ=38) aaaaGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAata > 1:3692141/1‑150 (MQ=37) aaaaGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAata > 1:2898658/1‑150 (MQ=37) aaaaGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAata < 1:972390/150‑1 (MQ=38) aaGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGGAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAAtata > 2:4470372/1‑150 (MQ=38) aGCATAATTGTAGCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATag < 2:3519734/150‑1 (MQ=37) aTTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGt > 2:4337849/1‑150 (MQ=38) ttGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGtt > 1:1079051/1‑150 (MQ=38) aTCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGtttttt > 1:2263027/1‑150 (MQ=37) tGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTaa > 1:4281828/1‑150 (MQ=37) gAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAAt > 2:4429965/1‑150 (MQ=37) aTCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCCATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTGGGGGCACCTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGttt > 2:2235607/1‑150 (MQ=37) cGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTttat > 2:2662113/1‑150 (MQ=38) cGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTttat < 1:3834402/150‑1 (MQ=38) gTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTttatt < 2:236818/150‑1 (MQ=38) tGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTttatta < 1:3188740/150‑1 (MQ=38) gCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTattaa < 1:918876/150‑1 (MQ=38) aaaaACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTattaatt < 1:1375320/150‑1 (MQ=38) aaaaACTGGAGTCATGACTTCAGTTTGTTTAGATTCAGGGGCAATTATGAGAGAGGATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGAACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTattaagt > 2:2760121/1‑148 (MQ=37) | TTCGCTCACTTCTCAGCAATCCAATCTGATGGATTCAAAACACTTGATGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAGCTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATGATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATGCATAAATTAGGGCCACTCTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAA > CP043523/1848370‑1848665 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |