| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP043523 | 1,848,557 | G→T | intergenic (+65/+679) | FTN78_chr1898 → / ← FTN78_chr1899 | Cold shock protein of CSP family/Type I restriction‑modification system, restriction subunit R |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP043523 | 1,848,557 | 0 | G | T | 99.8% | 1646.1 / NA | 498 | intergenic (+65/+679) | FTN78_chr1898/FTN78_chr1899 | Cold shock protein of CSP family/Type I restriction‑modification system, restriction subunit R |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); major base T (222/274); minor base C (0/1); total (222/276) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 513 total aligned reads displayed.
CACTTGATGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAGCTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATGATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATGCATAAATTAGGGCCACTCTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAACATACAAATT > CP043523/1848410‑1848688 | cacTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAattat < 2:86278/150‑1 (MQ=255)cacTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAattat > 1:3488502/1‑150 (MQ=255)cacTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAattat < 1:2036963/150‑1 (MQ=255) acTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAattatg > 2:3115218/1‑150 (MQ=255) acTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTACCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAattatg < 2:4332934/150‑1 (MQ=255) cTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAAttatga < 1:2335210/150‑1 (MQ=255) ttGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATgag < 2:2934640/150‑1 (MQ=255) ttGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATgag > 1:2206698/1‑150 (MQ=255) tgacgaAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAATGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATgaga < 2:20329/150‑1 (MQ=255) gacgaAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATgagag < 2:1290809/147‑1 (MQ=255) gacgaAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATgagag < 1:3763985/147‑1 (MQ=255) acgaAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATgagaga < 2:35143/148‑1 (MQ=255) acgaAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATgagaga > 2:3428369/3‑150 (MQ=255) aaGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTa < 1:3690251/150‑1 (MQ=255) aGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTAt < 2:2485747/150‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTGAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGatat > 1:4063786/1‑150 (MQ=255) aaaaaGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGatat > 1:3645307/1‑150 (MQ=255) aaaGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATAc > 1:1564113/1‑150 (MQ=255) aaGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAAGCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACt < 1:2125196/150‑1 (MQ=255) gTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTa < 1:998051/150‑1 (MQ=255) ttGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAg > 1:585021/1‑150 (MQ=255) aaTTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCa < 2:4478858/150‑1 (MQ=255) aaTTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCa > 2:3642948/1‑150 (MQ=255) aaTTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCa > 2:4550013/1‑150 (MQ=255) ttGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCa < 1:4456208/150‑1 (MQ=255) gATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAag < 2:4579061/150‑1 (MQ=255) aTGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAaga > 1:261909/1‑150 (MQ=255) gTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAgg > 2:2332303/1‑150 (MQ=255) agaagGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACt > 1:3009712/1‑150 (MQ=255) gTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCacac < 1:4506693/150‑1 (MQ=255) cGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTccc > 1:4566781/1‑150 (MQ=255) gTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCa < 1:2250682/150‑1 (MQ=255) gTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCa < 2:612669/150‑1 (MQ=255) tGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCGTGACTTCAGTCTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTGTGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCAt < 2:4028887/150‑1 (MQ=37) ggACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTGTCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCAtt > 1:1006085/1‑149 (MQ=255) ggACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCAtt < 1:1685858/150‑2 (MQ=255) gACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCAttc < 1:439478/150‑3 (MQ=255) ccTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCAt < 1:3733489/150‑1 (MQ=255) ccTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCAt < 1:1740709/150‑1 (MQ=255) cTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATa < 1:1973850/150‑1 (MQ=255) cAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATaac > 1:1110656/1‑149 (MQ=255) aaGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAAt < 2:4504761/150‑1 (MQ=255) gCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTa > 1:701065/1‑150 (MQ=255) aGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAgg > 1:3858865/1‑150 (MQ=255) aGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAgg > 2:1505237/1‑150 (MQ=255) gTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAggg < 2:1615778/150‑1 (MQ=255) ttAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAgggg < 1:3295019/150‑2 (MQ=255) ttAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAgggg > 2:2063572/1‑149 (MQ=255) ttAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAgggg > 2:1888702/1‑149 (MQ=255) ttAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAgggg > 1:815974/1‑149 (MQ=255) tAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAggggc > 1:1493765/1‑148 (MQ=255) atatCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCAc > 2:2422323/1‑150 (MQ=255) atatAACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCAc > 2:4452757/1‑150 (MQ=37) tatCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCAct < 2:387153/150‑1 (MQ=38) atCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCActt < 2:1142866/150‑2 (MQ=37) tCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCActtt > 2:3271567/1‑148 (MQ=37) cacaAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTa > 2:3004819/1‑150 (MQ=38) acaAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTaa > 1:1798408/1‑150 (MQ=38) cacaaGCATAATTGTATCTGAGAATCGTGCAAAAACCGGAGTCATGACTTCACTTTTTTTATATTCATTTGCAATTATTAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGAAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAat < 2:2239778/147‑1 (MQ=255) caAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAat > 1:314282/1‑150 (MQ=38) aaaaGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGCAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACAGTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAata < 2:3981294/150‑1 (MQ=38) aaaGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAatat > 1:354503/1‑150 (MQ=38) aaaGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAatat > 2:1650344/1‑150 (MQ=38) gCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATaga > 1:4139214/1‑150 (MQ=38) cATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATagag < 2:197909/150‑1 (MQ=38) aaTTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTgg > 1:128396/1‑150 (MQ=38) aTTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGt < 1:1868580/150‑1 (MQ=38) ttGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGCTTTTTTAGATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGtt > 2:3728434/1‑150 (MQ=37) tGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGttt > 1:2755630/1‑150 (MQ=38) gTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGtttt > 1:3392371/1‑150 (MQ=38) gTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGtttt > 1:4231208/1‑150 (MQ=37) aTCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGtttttt > 2:1406213/1‑150 (MQ=38) gAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAAt < 1:243119/150‑1 (MQ=38) aaaaTCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTACGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATg < 2:4428286/150‑1 (MQ=38) aTCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGttt < 2:332430/150‑1 (MQ=38) aTCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGttt < 1:724017/150‑1 (MQ=38) cGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTttat > 2:2662113/1‑150 (MQ=38) gTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTttatt > 1:1191271/1‑150 (MQ=38) gTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTttatt > 1:428858/1‑150 (MQ=38) tGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTttatta < 2:2563773/150‑1 (MQ=38) gCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTattaa > 1:2479716/1‑150 (MQ=38) gCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTattaa < 1:918876/150‑1 (MQ=38) cAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTattaat < 1:1327294/150‑1 (MQ=38) aaaaACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTattaatt > 2:1754723/1‑150 (MQ=38) aaaaACTGGAGTCATGACTTCAGTTTGTTTAGATTCAGGGGCAATTATGAGAGAGGATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGAACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTattaagt > 2:2760121/1‑148 (MQ=37) aacTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTaattaaa < 1:2808792/148‑1 (MQ=38) tGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTaattaaaatt > 1:326255/1‑150 (MQ=38) tGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTaattaaaatt > 2:756886/1‑150 (MQ=38) tCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGAAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAatat > 2:692991/1‑150 (MQ=255) cATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATAtt < 2:3558807/150‑1 (MQ=38) aaTGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAATAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATAtt < 2:526567/149‑1 (MQ=255) ttcatttCATTTTTTTTATATTCATTTTCAATTATGAGACAGTATTATATACTTTTCCATCAAGAAGAAACTCACACTTCCCATTCATTTATTTTACTCACTTTTATATATATTGGTTTTTTTTATGTTTATTAATTAAAATTAATAttt < 2:2206698/145‑1 (MQ=255) aTGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATAttt < 1:4448716/150‑1 (MQ=38) aTGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATAttt > 1:3920936/1‑150 (MQ=38) tGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTa < 1:4534831/150‑1 (MQ=38) tCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCAAACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTGATTGAAATTAATATTTaaaaga > 2:4235854/1‑148 (MQ=38) cAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTaaaagat > 1:2915828/1‑147 (MQ=38) gTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAGAttt > 2:212088/1‑148 (MQ=38) tttttttATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTaaaagattta < 1:645677/150‑7 (MQ=38) tttATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAGAtttatata > 1:749206/1‑143 (MQ=38) | CACTTGATGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAGCTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATGATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATGCATAAATTAGGGCCACTCTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAACATACAAATT > CP043523/1848410‑1848688 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |