Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP043523 | 1,867,671 | C→T | L49F (CTC→TTT) | FTN78_chr1914 → | Site‑specific recombinase, DNA invertase Pin related protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP043523 | 1,867,671 | 0 | C | T | 99.7% | 1195.0 / NA | 359 | L49F (CTC→TTT) | FTN78_chr1914 | Site‑specific recombinase, DNA invertase Pin related protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (185/173); total (186/173) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 359 total aligned reads displayed.
AAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAGAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAATTTACGGGGACTACAGTTGAACGTCCACAATTTAATTTAGTGCTCAAAAAGTTAACAAATGGCGATACTTTAATTGTGACAAAGTTAGATCGATTAGCCAGGAACACTAAAGAAGTTTTAGAAATTGTTCAATCGTTATTTAATAGAGGAATTAAGGTTTATATATTAAATATTGGACTTA > CP043523/1867528‑1867807 | aaaaTTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAg > 2:241059/1‑150 (MQ=255) ctgttGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCATATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTAGTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGt > 2:1829457/4‑150 (MQ=255) ttGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGCAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATTTAGTATTTAAAAAGTTaa < 2:2809675/150‑1 (MQ=255) ttGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTaa < 1:4116172/150‑1 (MQ=255) ttGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTCTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTaa < 2:4033878/150‑1 (MQ=255) tGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTaaa > 1:1547025/1‑149 (MQ=255) tGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTaaa < 1:304665/150‑2 (MQ=255) tGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTaaa < 1:95738/150‑2 (MQ=255) gggTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTaaag < 2:348165/150‑3 (MQ=255) gggTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTaaag > 1:1878045/1‑148 (MQ=255) aTGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTaaaggatg > 2:1096112/1‑144 (MQ=255) aCTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAAtt > 1:4308158/1‑150 (MQ=255) ttttGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAGGGATGGTGACACTTTAATtgt < 1:2911110/150‑1 (MQ=255) ttttGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATtgt > 1:3979612/1‑150 (MQ=255) ttGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGa > 2:2197033/1‑150 (MQ=255) ttGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGa > 2:3491824/1‑150 (MQ=255) ttGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGa > 2:1615355/1‑150 (MQ=255) gAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTCAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTCTAACTGTGACa > 2:1340637/1‑150 (MQ=255) aCAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACaaa > 1:4593346/1‑150 (MQ=255) caaaaaTTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAg < 2:1306822/147‑1 (MQ=255) caaaaaTTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAg > 2:2163536/4‑150 (MQ=255) aaaaaTTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGt > 2:529257/3‑150 (MQ=255) aaaaTTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGtt > 2:786730/2‑150 (MQ=255) aaTTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAg < 2:1878218/150‑1 (MQ=255) aaTTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAg < 1:2006139/150‑1 (MQ=255) aTTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGa > 2:2439307/1‑150 (MQ=255) tAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGacc < 1:4412446/150‑3 (MQ=255) aGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGaccg > 1:225221/1‑147 (MQ=255) aGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCg < 1:2153985/150‑1 (MQ=255) aaTCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGAt > 1:3115261/1‑150 (MQ=255) aTCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGAtt < 1:2366786/150‑1 (MQ=255) aTCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGAtt > 1:1975276/1‑150 (MQ=255) tctcAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTa < 1:2989103/150‑1 (MQ=255) ctcAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAg > 1:3390027/1‑150 (MQ=255) ctcAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAg > 1:1839710/1‑150 (MQ=255) aaTTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCGAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAg > 1:3995288/1‑150 (MQ=255) nttGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAgg > 2:947998/2‑150 (MQ=255) aTTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAgg > 2:638848/1‑150 (MQ=255) ttGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGa < 2:3019804/150‑1 (MQ=255) ttGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGa < 1:3743522/150‑1 (MQ=255) tGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGaa > 2:3117332/1‑150 (MQ=255) tGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGaa > 1:1583104/1‑150 (MQ=255) gAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGTACAGTTTTCTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATCTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAATTTAGACCGATTAGCCAGGAac < 2:4450628/150‑1 (MQ=255) aaGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAaca < 2:1957415/150‑1 (MQ=255) gTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACt < 2:1892079/150‑1 (MQ=255) tCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTag < 1:748033/150‑2 (MQ=255) cTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTaga > 2:1706947/1‑148 (MQ=255) cTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTAGTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTaga < 1:2096898/150‑3 (MQ=255) tGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTagag > 1:656401/1‑147 (MQ=255) tGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTagag < 1:125481/150‑1 (MQ=255) gAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAgaga > 1:2563411/1‑150 (MQ=255) aagCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGttt < 2:2747617/150‑1 (MQ=255) gCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTa < 1:577042/150‑1 (MQ=255) gCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTa > 1:2276471/1‑150 (MQ=255) cAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAg > 2:673405/1‑150 (MQ=255) aGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGa < 1:170910/150‑1 (MQ=255) aGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGa > 1:1059678/1‑150 (MQ=255) aGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGa > 1:4156189/1‑150 (MQ=255) gAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGaaa > 2:3287881/1‑150 (MQ=255) gAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGaaa > 2:809159/1‑150 (MQ=255) aGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAAt < 1:2189582/150‑1 (MQ=255) aGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAAt > 1:3761097/1‑150 (MQ=255) cAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTg > 2:2303986/1‑150 (MQ=255) agaagaAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGt > 1:3256928/1‑150 (MQ=255) gaagaaGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATGTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGtt > 2:2823382/1‑150 (MQ=255) gaagaaGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGAGACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGtn < 2:4156189/150‑2 (MQ=255) gaagaaGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGtt < 1:4517411/150‑1 (MQ=255) aagaagTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGTTc < 1:1327637/150‑1 (MQ=255) aagaagTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGTTc < 2:2607028/150‑1 (MQ=255) agTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGTTCAATc < 2:4566599/150‑1 (MQ=255) ttttCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGTTCAATCGt < 1:346444/150‑1 (MQ=255) tttCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGTTCAATCGtt < 2:1018003/150‑1 (MQ=255) ttCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGTTCAATCGTTa < 2:2116338/150‑1 (MQ=255) aaGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGTTCAATCGTTATTTa < 1:2331500/150‑1 (MQ=255) aGAAAAGTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGTTCAATCGTTATTTaa < 2:121967/150‑1 (MQ=255) aaaagTTTACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGTTCAATCGTTATTTAATa < 2:3641522/150‑1 (MQ=255) tactggaaCTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGTTCAATCGTTATTTAATAGAGGAAt > 1:1923610/8‑150 (MQ=255) tACTGGAACTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGTTCAATCGTTATTTAATAGAGGAAt < 2:4119408/150‑1 (MQ=255) actggaaCTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGTTCAATCGTTATTTAATAGAGGAAtt > 1:4062326/7‑150 (MQ=255) actggaaCTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGTTCAATCGTTATTTAATAGAGGAAtt < 2:4308158/144‑1 (MQ=255) actggaaCTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGTTCAATCGTTATTTAATAGAGGAAtt < 2:4482593/144‑1 (MQ=255) ctggaaCTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGTTCAATCGTTATTTAATAGAGGAATTa < 2:3908393/145‑1 (MQ=255) tggaaCTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGTTCAATCGTTATTTAATAGAGGAATTaa > 1:2896298/5‑150 (MQ=255) ggaaCTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGTTCAATCGTTATTTAATAGAGGAATTAAg > 1:876843/4‑150 (MQ=255) ggaaCTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGTTCAATCGTTATTTAATAGAGGAATTAAg > 1:873743/4‑150 (MQ=255) gaaCTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGTTCAATCGTTATTTAATAGAGGAATTAAgg < 2:3699760/148‑1 (MQ=255) aaCTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTCAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTCTTCAATCGTTATTTAATAGAGGAATTAAGGt < 2:3984456/149‑1 (MQ=255) aaCTACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGTTCAATCGTTATTTAATAGAGGAATTAAGGt > 2:4070305/2‑150 (MQ=255) tACAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGTTCAATCGTTATTTAATAGAGGAATTAAGGttca > 2:2595162/1‑148 (MQ=255) aCAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGTTCAATCGTTATTTAATAGAGGAATTAAGGttcat > 1:3897691/1‑147 (MQ=255) aCAGTCGAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGTTCAATCGTTATTTAATAGAGGAATTAAGGTTcat < 2:589703/150‑1 (MQ=255) gtcgAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGTTCAATCGTTATTTAATAGAGGAATTAAGGTTcatata < 1:1147430/147‑1 (MQ=255) gtcgAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGTTCAATCGTTATTTAATAGAGGAATTAAGGTTcatata < 2:237289/147‑1 (MQ=255) tcgAACGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGTTCAATCGTTATTTAATAGAGGAATTAAGGTTCatatat < 2:2940872/148‑1 (MQ=255) gAACGACCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTATAGAAGTTTTAGAAATTGTTCAATCGTTATTTAATAGAGGAATTAAGGTTCATATATTa < 1:3346449/150‑1 (MQ=255) aCGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGTTCAATCGTTATTTAATAGAGGAATTAAGGTTCATATATTaaa < 2:1460732/150‑1 (MQ=255) cGTCCACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGTTCAATCGTTATTTAATAGAGGAATTAAGGTTCATATATTAAat < 1:2760024/150‑1 (MQ=255) ccACAATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGTTCAATCGTTATTTAATAGAGGAATTAAGGTTCATATATTAAATAtt < 2:1548952/150‑1 (MQ=255) acaATTTAATCTAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGTTCAATCGTTATTTAATAGAGGAATTAAGGTTCATATATTAAATATTgg > 2:2074386/1‑150 (MQ=255) aatttaatctAGTATTTAAAAAGTTAAAGGATGGTGACACTTTAATTGTGACAAAGTTAGACCGATTAGCCAGGAACACTAGAGAAGTTTTAGAAATTGTTCAGTCGTTATTTAATAGAGGAATTAAGGTTCATATATTAAATATTggtc > 1:3595806/1‑148 (MQ=255) | AAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAGAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAATTTACGGGGACTACAGTTGAACGTCCACAATTTAATTTAGTGCTCAAAAAGTTAACAAATGGCGATACTTTAATTGTGACAAAGTTAGATCGATTAGCCAGGAACACTAAAGAAGTTTTAGAAATTGTTCAATCGTTATTTAATAGAGGAATTAAGGTTTATATATTAAATATTGGACTTA > CP043523/1867528‑1867807 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |