| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP043523 | 1,847,814 | T→C | intergenic (‑268/‑1) | FTN78_chr1896 ← / → FTN78_chr1897 | Mobile element protein/Cold shock protein of CSP family |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP043523 | 1,847,814 | 0 | T | C | 99.8% | 1750.3 / ‑5.5 | 495 | intergenic (‑268/‑1) | FTN78_chr1896/FTN78_chr1897 | Mobile element protein/Cold shock protein of CSP family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (245/248); total (246/249) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.46e-01 | |||||||||||
Only 100 of 503 total aligned reads displayed.
AAAATCAATAAGTTTTAAATAGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATAGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTATATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTT > CP043523/1847667‑1847960 | aaTCAATAAGTTTTAAATAGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGa > 2:435564/1‑150 (MQ=255) aTCAATAAGTTTTAAATAGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGaa > 1:2079583/1‑150 (MQ=255) aaGTTTTAAATAGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAgg < 1:4253349/150‑1 (MQ=255) aGTTTTAAATAGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGa < 2:4514630/150‑1 (MQ=255) gTTTTAAATAGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGaa > 2:2630581/1‑150 (MQ=255) ttttAAATAGAACAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTATTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAAc < 2:3023445/150‑1 (MQ=255) tAAATAGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAAt > 2:4481375/1‑150 (MQ=255) aaaTAGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATa > 2:1631904/1‑150 (MQ=255) aaaTAGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATa < 1:977470/150‑1 (MQ=255) aTAGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAGTGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATaaa > 2:4012359/1‑150 (MQ=255) tAGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAAt < 1:1296634/150‑1 (MQ=255) tAGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAAt > 1:2197430/1‑150 (MQ=255) aGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAAtt < 1:4341032/150‑1 (MQ=255) aGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAAtt > 1:2126819/1‑150 (MQ=255) gACCACTTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTg < 2:1300180/150‑1 (MQ=255) aCCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTgg < 1:1183805/150‑1 (MQ=255) aaTTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGttt < 2:2587270/150‑1 (MQ=255) tttGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTaa < 1:766989/150‑1 (MQ=255) tttGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTaa < 2:943440/150‑1 (MQ=255) ttGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAAc < 1:542836/150‑1 (MQ=255) ttGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAAc > 1:499377/1‑150 (MQ=255) tGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACg < 1:2613340/150‑1 (MQ=255) aCTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTTGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCt > 1:3681518/1‑150 (MQ=255) ggTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACaa > 2:3386/1‑150 (MQ=255) aGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGc > 2:386565/1‑150 (MQ=255) gAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCt > 1:4502033/1‑150 (MQ=255) gAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCt < 2:3658198/150‑1 (MQ=255) aaTAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTa < 2:2775024/150‑1 (MQ=255) aTAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATGAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTAt > 1:4058641/1‑150 (MQ=255) aGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAAAAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATgg > 1:1931730/1‑150 (MQ=255) ggTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGt < 2:87110/150‑1 (MQ=255) gtgtTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGtt < 1:3750486/150‑1 (MQ=255) tgtTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGttt > 2:3768058/1‑150 (MQ=255) gtTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGtttt > 1:2417493/1‑150 (MQ=255) gtTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGtttt > 1:316718/1‑150 (MQ=255) gtTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGtttt < 1:1876882/150‑1 (MQ=255) ttACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTtta > 1:1768287/1‑150 (MQ=255) ttACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTtta > 2:550653/1‑150 (MQ=255) tACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGTAATTTTTGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTTACGCTGACAAAGGCTATGGTTttat > 2:3048582/1‑150 (MQ=255) tACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTttat > 2:1172799/1‑150 (MQ=255) aCTATTAAGAGGTATGTTTTGTCTCTAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTttatt < 1:3897855/150‑1 (MQ=255) aCTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTttatt > 1:3003026/1‑150 (MQ=255) aCTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTttatt > 2:1554407/1‑150 (MQ=255) aCTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTttatt < 1:3502753/150‑1 (MQ=255) tATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTtattat < 2:1044863/150‑1 (MQ=255) tAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGc < 2:2038169/150‑1 (MQ=255) tAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGc > 2:427051/1‑150 (MQ=255) tAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGc > 1:3417369/1‑150 (MQ=255) agagGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAg < 1:1044492/150‑1 (MQ=255) gagGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAga > 1:2431560/1‑150 (MQ=255) aggtaggtTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAgat > 2:4547264/1‑150 (MQ=255) ggtTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGatat > 2:3348142/1‑150 (MQ=255) gtTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATg < 1:1356962/150‑1 (MQ=255) gtTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATg > 2:2157290/1‑150 (MQ=255) ttGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCaa < 1:2935439/150‑1 (MQ=255) tctcGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTTTTTATTTTGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGAt > 2:3409039/1‑150 (MQ=255) tctcGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGAt < 2:2251990/150‑1 (MQ=255) ctcGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGAtg > 2:744986/1‑150 (MQ=255) ctcGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCACAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGAtg < 1:2311855/150‑1 (MQ=255) aGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTTTTTTTTTTTTATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTGACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGtt > 2:1416086/1‑150 (MQ=255) aGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGtt < 1:1618892/150‑1 (MQ=255) aGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTACGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGtt > 2:2888351/1‑150 (MQ=255) gTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGttt > 2:2461333/1‑150 (MQ=255) aTGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGcttat < 1:613560/150‑1 (MQ=255) aTGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGcttat > 2:1220098/1‑150 (MQ=255) ttttAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGcttatctc > 2:2204074/1‑150 (MQ=255) tttAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGcttatctct < 1:589783/150‑1 (MQ=255) ttAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCCATGGTTTTATTATGGCAGATGCTATGCAAGACGTGTTTGcttatctctt > 2:1349012/1‑150 (MQ=255) tAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGcttatctctta < 1:1479643/150‑1 (MQ=255) ggAATGCACTTTTTTGCAATATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGcttatctcttatc > 2:1002032/1‑150 (MQ=255) gAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGcttatctcttatct < 1:323968/150‑1 (MQ=255) aTGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTAt > 2:2085602/1‑150 (MQ=255) gCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTc < 1:168235/150‑1 (MQ=255) cACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCa < 2:2821739/150‑1 (MQ=255) aCTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAg < 2:499335/150‑1 (MQ=255) tttttCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAggg > 2:2491776/1‑150 (MQ=255) tttttCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAggg < 2:3456618/150‑1 (MQ=255) ttCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGaaa > 1:4564093/1‑150 (MQ=255) gCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGa > 2:1906940/1‑150 (MQ=255) cAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGAt < 2:1689053/150‑1 (MQ=255) aaaTGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGAttt > 2:3536656/1‑150 (MQ=255) aaTGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGAtttt > 1:2873770/1‑150 (MQ=255) aaTGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGAtttt < 2:3239131/150‑1 (MQ=255) ggATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTaaaa > 2:1776120/1‑150 (MQ=255) ggATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTaaaa < 1:1795354/150‑1 (MQ=255) gATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTaaaaa > 1:4439009/1‑150 (MQ=255) aTTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTaaaaaa > 1:2794410/1‑150 (MQ=255) tACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATAc < 1:4530705/150‑1 (MQ=255) atgatgCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGa > 1:3054246/1‑150 (MQ=255) gatgCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAg > 2:3898267/1‑150 (MQ=255) gatgCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAg < 1:41374/150‑1 (MQ=255) gatgCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAg < 1:860126/150‑1 (MQ=255) atgCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAgg > 2:585280/1‑150 (MQ=255) atgCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGAAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGAAAAAAAAAAAAAAAAATACGATGAAgg < 2:2366271/150‑1 (MQ=255) tgCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGAATAAAAAAAATACGATGAAGGt < 2:4605487/150‑1 (MQ=255) gAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCaa < 1:2730142/150‑1 (MQ=255) aaaGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCGAGACGTGTTTGCTTATCTCTTGTCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCaaa > 2:4106718/1‑150 (MQ=255) aTGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGtt > 2:633339/1‑150 (MQ=255) tGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTa < 1:3368609/150‑1 (MQ=255) tattacATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACt > 2:29657/1‑150 (MQ=255) | AAAATCAATAAGTTTTAAATAGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATAGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTATATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTT > CP043523/1847667‑1847960 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |