| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP043523 | 1,882,567 | G→A | intergenic (+278/‑277) | FTN78_chr1926 → / → FTN78_chr1927 | hypothetical protein/3‑ketoacyl‑CoA thiolase, Acetyl‑CoA acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP043523 | 1,882,567 | 0 | G | A | 99.8% | 1320.1 / NA | 593 | intergenic (+278/‑277) | FTN78_chr1926/FTN78_chr1927 | hypothetical protein/3‑ketoacyl‑CoA thiolase, Acetyl‑CoA acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (399/193); minor base C (1/0); total (400/193) | |||||||||||
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Only 100 of 593 total aligned reads displayed.
AAGAGCTTTCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATGCCTCGAATAGTCTCCATGCCCTTTATCGTGGTTGAGGCAGTACGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCTATTAGATTGTTAAGGTATTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAATTCATTACTCTGTAATTTTCTAAAGGCAGAGCCAATAGACGGAGCTTTATCCGTGACAATTACTCTAGGTTCAACAAACTGCTTATGTAGTCG > CP043523/1882421‑1882695 | gttCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAAGGGTCTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGTTCTATTAAATTGTTAAGATACTTCAca > 2:2996742/2‑149 (MQ=11) ttCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAAGGGTCTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGTTCTATTAAATTGTTAAGATACTTCAcag < 2:2380474/150‑3 (MQ=11) ttCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAAGGGTCTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGTTCTATTAAATTGTTAAGATACTTCAcag < 2:1196296/150‑3 (MQ=11) tCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAAGGGTCTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGTTCTATTAAATTGTTAAGATACTTCAcagt > 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |