Predicted mutation | ||||||
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RA | CP043523 | 1,882,570 | T→C | intergenic (+281/‑274) | FTN78_chr1926 → / → FTN78_chr1927 | hypothetical protein/3‑ketoacyl‑CoA thiolase, Acetyl‑CoA acetyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP043523 | 1,882,570 | 0 | T | C | 99.7% | 1335.9 / NA | 586 | intergenic (+281/‑274) | FTN78_chr1926/FTN78_chr1927 | hypothetical protein/3‑ketoacyl‑CoA thiolase, Acetyl‑CoA acetyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); major base C (394/188); minor base G (2/0); total (397/189) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 586 total aligned reads displayed.
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |