| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP043523 | 1,885,008 | 2 bp→CC | coding (690‑691/1467 nt) | FTN78_chr1930 → | Putative UV‑damage repair protein UvrX |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP043523 | 1,885,008 | 0 | G | C | 99.8% | 1987.4 / NA | 562 | A230A (GCG→GCC) | FTN78_chr1930 | Putative UV‑damage repair protein UvrX |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (298/262); minor base T (0/1); total (299/263) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.69e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP043523 | 1,885,009 | 0 | T | C | 99.8% | 1997.2 / NA | 562 | L231L (TTA→CTA) | FTN78_chr1930 | Putative UV‑damage repair protein UvrX |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (298/263); minor base A (1/0); total (299/263) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 562 total aligned reads displayed.
ACAAATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTCGGACTATATGTGACTGTGGGCATGGGAGACAATCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCGTTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAGTAAACTATGGACGATCCCTAAGATGACGGACTTCTGGGGAATCGGAAAACGAACTGAGAAACGATTAAACAAACTTGGAATCACTTCTATCAAAGAGCTTGCGAATGCTGACCC > CP043523/1884864‑1885148 || agaTGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATcc > 1:893183/3‑150 (MQ=255) aTGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGt > 1:2538966/1‑150 (MQ=255) aTGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGt > 2:337444/1‑150 (MQ=255) aaTCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTAt < 1:2982986/150‑1 (MQ=255) aTCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATg > 1:4417080/1‑150 (MQ=255) tCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGa > 2:826967/1‑150 (MQ=255) cGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGaa > 1:2271167/1‑150 (MQ=255) cGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGaa < 2:2884941/150‑1 (MQ=255) gAATGGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAg < 2:1435774/150‑1 (MQ=255) aTTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGAt < 1:3603541/150‑1 (MQ=255) aTTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGAt < 1:2071220/150‑1 (MQ=255) tGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGt < 2:3580410/150‑1 (MQ=255) ttAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCt < 2:663502/150‑1 (MQ=255) tAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTa > 1:4026948/1‑150 (MQ=255) aGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAGTATGAGAGCCCTAATCCATTATGAAGATGTCCCTaa > 1:3790228/1‑149 (MQ=255) gACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTaat < 2:3118129/150‑3 (MQ=255) gACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTaat > 2:1800043/1‑148 (MQ=255) gACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTaat < 2:3865303/150‑3 (MQ=255) gACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTaat < 2:580907/150‑3 (MQ=255) gACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTaat < 1:1277718/150‑3 (MQ=255) aCTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATa < 2:219437/150‑1 (MQ=255) ttGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATaaa < 1:1040530/150‑1 (MQ=255) tGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAAc > 2:1473808/1‑150 (MQ=255) cAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTa < 1:2692103/150‑1 (MQ=255) gTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGa < 2:3501381/150‑1 (MQ=255) tGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGAc < 1:3894997/150‑1 (MQ=255) gaTTCGAGATAAACTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGAcaat > 1:238780/1‑147 (MQ=255) gagaTAAACTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTa > 1:3317159/1‑150 (MQ=255) aTAAACTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGa > 1:1353903/1‑150 (MQ=255) tAAACTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGAt < 2:4011226/150‑1 (MQ=255) aaaCTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATg < 2:893183/150‑1 (MQ=255) aaaCTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATg < 2:2357681/150‑1 (MQ=255) aaaCTAGGACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATg < 2:1125124/150‑1 (MQ=255) taggACTATATGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGAcag < 1:1593374/148‑3 (MQ=255) atatGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTg > 2:1610053/1‑150 (MQ=255) tatGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATTAAGATGTTCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTgg < 2:3733583/150‑1 (MQ=255) tatGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTgg < 1:1490671/150‑1 (MQ=255) atGTGACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTggg < 2:4300875/150‑1 (MQ=255) tgtgACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTgggg > 2:1227311/1‑150 (MQ=255) tgACTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGaa < 1:3176576/150‑1 (MQ=255) aCTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAAtt > 2:2080925/1‑149 (MQ=255) cTGTTGGGATGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAAttg > 1:4214835/1‑148 (MQ=255) gttgggaTGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGa < 1:1760346/144‑1 (MQ=255) ttgggaTGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGCCAGATTTCTGGGGAATTGGaa > 2:3062481/6‑150 (MQ=255) ttgggaTGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGaa > 1:841198/6‑150 (MQ=255) tgggaTGGGAGACAACCCCCTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGaaa > 2:4122910/5‑150 (MQ=255) gggaTGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGaaag < 2:1066276/147‑2 (MQ=255) ggaTGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGaaagc > 1:1938282/3‑148 (MQ=255) aTGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGa > 2:330943/1‑150 (MQ=255) aTGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGa < 1:4352327/150‑1 (MQ=255) tGGGAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGaa < 2:4503715/150‑1 (MQ=255) ggAGACAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACt > 2:2745586/1‑150 (MQ=255) agaCAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTga < 1:244066/150‑1 (MQ=255) aCAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTgaga < 1:811955/150‑1 (MQ=255) aCAACCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTgaga < 2:4378138/150‑1 (MQ=255) aaccccTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGaaa < 1:264760/147‑1 (MQ=255) aaccccATGCTAGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGaaa > 2:2686257/4‑150 (MQ=255) accccTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAAc < 1:2142164/148‑1 (MQ=255) ccccTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACg < 2:3782192/149‑1 (MQ=255) ccccTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACg > 1:3753947/2‑150 (MQ=255) ccccTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACg > 2:1748463/2‑150 (MQ=255) cccTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGa < 1:3832673/150‑1 (MQ=255) cccTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGa > 1:609044/1‑150 (MQ=255) ccTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGAt > 1:2191478/1‑150 (MQ=255) cttgcttgCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGAtt > 2:4199465/1‑150 (MQ=255) cttgcttgCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGAtt < 1:732321/150‑1 (MQ=255) tgcttgcCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTaa < 2:531038/150‑1 (MQ=255) gcCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTaaacaaa < 1:964899/150‑1 (MQ=255) ccAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTaaacaaac > 2:2921136/1‑150 (MQ=255) cAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTAAACAAACt < 1:53409/150‑1 (MQ=255) cAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTAAACAAACt > 2:3226466/1‑150 (MQ=255) aaCTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTAAACAAACTTg > 2:1688685/1‑150 (MQ=255) ttGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCCAACTGAGAAACGATTAAACAAACTTGGaa < 1:2795879/150‑1 (MQ=255) tGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTAAACAAACTTGGAAt < 2:697550/150‑1 (MQ=255) cAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTAAACAAACTTGGAATcn < 2:2497957/150‑2 (MQ=255) cAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTAAACAAACTTGGAATCa < 1:3098022/150‑1 (MQ=255) aaTGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTAAACAAACTTGGAATCAc < 2:4046708/150‑1 (MQ=255) tGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTAAACAAACTTGGAATCACtt > 2:300329/1‑150 (MQ=255) tGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTAAACAAACTTGGAATCACtt > 2:2049112/1‑150 (MQ=255) aaCTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTAAACAAACTTGGAATCACTTCTATc > 2:264725/1‑150 (MQ=255) aCTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTAAACAAACTTGGAATCACTTCTATCa < 1:2280597/150‑1 (MQ=255) cTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTAAACAAACTTGGAATCACTTCTATCaa < 1:1115515/150‑1 (MQ=255) tATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTAAACAAACTTGGAATCACTTCTATCaaa < 2:3181531/150‑1 (MQ=255) tATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTAAACAAACTTGGAATCACTTCTATCaaa < 2:773493/150‑1 (MQ=255) aTGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTAAACAAACTTGGAATCACTTCTATCAAag > 2:3931939/1‑150 (MQ=255) tGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTAAACAAACTTGGAATCACTTCTATCAAaga > 1:2841160/1‑150 (MQ=255) tGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTAAACAAACTTGGAATCACTTCTATCAAaga > 1:3657938/1‑150 (MQ=255) ccAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTAAACAAACTTGGAATCACTTCTATCAAAGAGc > 1:1683986/1‑150 (MQ=255) ccAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTAAACAAACTTGGAATCACTTCTATCAAAGAGc < 1:4512544/150‑1 (MQ=255) cAAGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTACACAAACTTGGAATCACTTCTATCAAAGAGCt > 1:4154482/1‑150 (MQ=255) aaGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTAAACAAACTTGGAATCACTTCTATCAAAGAGCtt < 2:1852002/150‑1 (MQ=255) aaGCACAATGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTAAACAAACTTGGAATCACTTCTATCAAAGAGCtt > 1:3518427/1‑150 (MQ=255) aaTGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTAAACAAACTTGGAATCACTTCTATCAAAGAGCTTGCGAAt < 1:4591594/150‑1 (MQ=255) aaTGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTAAACAAACTTGGAATCACTTCTATCAAAGAGCTTGCGAAt > 1:3357759/1‑150 (MQ=255) aTGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTAAACAAACTTGGAATCACTTCTATCAAAGAGCTTGCGAATg < 1:325627/150‑1 (MQ=255) tGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTAAACAAACTTGGAATCACTTCTATCAAAGAGCTTGCGAATGc < 2:3654428/150‑1 (MQ=255) tGATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTAAACAAACTTGGAATCACTTCTATCAAAGAGCTTGCGAATGc < 2:474896/150‑1 (MQ=255) gATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTAAACAAACTTGGAATCACTTCTATCAAAGAGCTTGCGAATGCt < 2:3272788/150‑1 (MQ=255) gATAATATGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTAAACAAACTTGGAATCACTTCTATCAAAGAGCTTGCGAATGCt > 1:1206281/1‑150 (MQ=255) taataTGAGAGCCCTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAATAAACTATGGACAATTCCTAAGATGACAGATTTCTGGGGAATTGGAAAGCGAACTGAGAAACGATTAAACAAACTTGGAATCACTTCTATCAAAGAGCTTGCGAATGCTGa > 2:1916866/1‑150 (MQ=255) || ACAAATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTCGGACTATATGTGACTGTGGGCATGGGAGACAATCCCTTGCTTGCCAAACTTGCAATGGATAACTATGCCAAGCACAATGATAATATGAGAGCGTTAATCCGTTATGAAGATGTCCCTAGTAAACTATGGACGATCCCTAAGATGACGGACTTCTGGGGAATCGGAAAACGAACTGAGAAACGATTAAACAAACTTGGAATCACTTCTATCAAAGAGCTTGCGAATGCTGACCC > CP043523/1884864‑1885148 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |