| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP043523 | 1,891,260 | 2 bp→CT | intergenic (‑30/‑119) | FTN78_chr1940 ← / → FTN78_chr1941 | Mobile element protein/Permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP043523 | 1,891,260 | 0 | G | C | 99.5% | 858.7 / ‑3.7 | 365 | intergenic (‑30/‑120) | FTN78_chr1940/FTN78_chr1941 | Mobile element protein/Permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/0); new base C (178/184); total (181/184) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.44e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.63e-01 | |||||||||||
| * | CP043523 | 1,891,261 | 0 | G | T | 99.7% | 818.8 / NA | 365 | intergenic (‑31/‑119) | FTN78_chr1940/FTN78_chr1941 | Mobile element protein/Permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base T (181/183); total (181/184) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 365 total aligned reads displayed.
AGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGGTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAATATAATGATG > CP043523/1891118‑1891335 || tCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGc > 1:674587/1‑150 (MQ=255) tttCGGTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCAc > 1:4238150/1‑150 (MQ=11) ttCGGTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACg < 2:469630/150‑1 (MQ=11) cGGTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGAc < 1:3940536/150‑1 (MQ=11) ggTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACt < 2:3513011/150‑1 (MQ=11) ggTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTATGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAATACTTTTCGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACt < 2:4337468/150‑1 (MQ=11) gTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACtt > 1:245891/1‑150 (MQ=11) ttttGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACtta < 1:12019/150‑1 (MQ=11) tttGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACATAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGTCttat < 2:4268541/150‑1 (MQ=11) ttGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACttatt < 1:1873708/150‑1 (MQ=11) aaCCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACttatttat > 1:3031521/1‑150 (MQ=11) aCCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTtatttatt < 2:1863065/150‑1 (MQ=11) cTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTAtttt < 2:3652187/150‑1 (MQ=11) cTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTAtttt < 1:2670409/150‑1 (MQ=11) cTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTAtttt > 1:2572605/1‑150 (MQ=11) tCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTc < 2:342536/150‑1 (MQ=11) aaGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCa > 1:1908724/1‑150 (MQ=11) gggAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAAt > 1:2817530/1‑150 (MQ=11) ggAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATg < 2:320448/150‑1 (MQ=11) gAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGa > 1:4531852/1‑150 (MQ=11) aaaCACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGaa < 1:4445615/150‑1 (MQ=0) tctcAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTaa > 2:853580/1‑150 (MQ=2) tctcAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTaa < 2:2413268/150‑1 (MQ=2) tctcAATGGTTGTCAGAAAATAAACAAAAACTTTTGGCAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGGCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTATGATTCAGATAGCCCGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGAGTaa > 2:3364969/1‑150 (MQ=11) tcacAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTaa > 2:3142916/4‑150 (MQ=255) ctcAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTaaa > 1:1592199/1‑150 (MQ=9) ctcAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTaaa > 1:1477289/1‑150 (MQ=9) ctcAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTaaa > 1:2379261/1‑150 (MQ=12) ctcAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTaaa > 2:2098598/1‑150 (MQ=9) tcAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGTAAGTGCGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTCAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAAGTAACTAGCAATTCGGGTaaaa < 2:4467064/150‑1 (MQ=11) cAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGATATTAACTAGCAATTCGGGTaaaaa < 2:3837381/150‑1 (MQ=11) cAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTaaaaa < 2:410113/150‑1 (MQ=255) cAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTaaaaa < 1:4462056/150‑1 (MQ=255) cAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACGTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGAGAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTaaaaa > 1:140583/1‑150 (MQ=11) aaTGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAat > 1:865068/1‑150 (MQ=255) aaTGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAat < 2:1445405/150‑1 (MQ=255) aaTGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAat > 1:3736891/1‑150 (MQ=255) aaTGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAat < 2:925654/150‑1 (MQ=255) aaTGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAat < 1:1807398/150‑1 (MQ=255) aaTGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAat < 2:4057869/150‑1 (MQ=255) aaTGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTAGAAGTTTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTTATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTATCTAGCAATTCGGGTaaaaan < 2:2632810/150‑2 (MQ=11) aaTGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTagaaag < 1:3379018/150‑2 (MQ=11) aaTGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTagaaag > 2:630128/1‑149 (MQ=11) gtGGTTGTAAGTAAATAAGCGAAAGGTTTTGGATGTGTGGTATTATAAGTCATATACGTCGTGAGCTTTCTAATGCGTAGTGCGTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTGATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCTGGTAAAAata < 2:3611042/149‑1 (MQ=11) aTGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAata > 1:2173268/1‑150 (MQ=255) aTGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAata > 2:2900539/1‑150 (MQ=255) aTGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAata > 2:576411/1‑150 (MQ=255) aTGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAata < 1:3685168/150‑1 (MQ=255) aTGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAata > 1:1056407/1‑150 (MQ=255) tGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatat < 2:4174803/150‑1 (MQ=255) tGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatat < 2:602925/150‑1 (MQ=255) tGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatat < 2:2456381/150‑1 (MQ=255) tGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatat < 2:2361322/150‑1 (MQ=255) tGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatat < 1:1117804/150‑1 (MQ=255) tGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatat > 1:1319363/1‑150 (MQ=255) tGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatat > 1:936279/1‑150 (MQ=255) tGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatat > 2:1137369/1‑150 (MQ=255) tGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACGTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAACTCGGGTAAAAatat > 1:3874100/1‑150 (MQ=11) ggTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatc < 2:3008834/150‑2 (MQ=255) ggTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatc < 2:536585/150‑2 (MQ=255) ggTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatc < 1:2940446/150‑2 (MQ=255) ggTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatc < 1:2725774/150‑2 (MQ=255) ggTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTagaaagttt < 2:1741780/150‑5 (MQ=1) gTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatca < 1:3263980/150‑3 (MQ=255) gTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatca > 1:2043514/1‑148 (MQ=255) gTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatca < 2:322717/150‑3 (MQ=255) gTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatca > 2:1643819/1‑148 (MQ=255) ttGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaa < 1:2297664/150‑4 (MQ=11) ttGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaa > 2:1381153/1‑147 (MQ=11) tGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaag > 1:2772053/1‑146 (MQ=255) tGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaag < 1:3501465/150‑5 (MQ=11) tGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaag > 1:4011497/1‑146 (MQ=11) tGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaag < 1:4307591/150‑5 (MQ=11) tGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaag > 1:4482702/1‑146 (MQ=11) tGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaag < 2:704516/150‑5 (MQ=11) tGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaag > 2:2169492/1‑146 (MQ=11) tGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaag > 2:2064283/1‑146 (MQ=11) tGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaag < 2:2048723/150‑5 (MQ=11) tGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAAATCGGGTAAAAatatcaag > 2:2921432/1‑146 (MQ=11) gTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaagt > 2:2825094/1‑145 (MQ=255) gTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaagt > 2:1524658/1‑145 (MQ=255) gTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaagt < 1:4087115/150‑6 (MQ=11) gTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaagt > 1:1709986/1‑145 (MQ=11) gTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaagt > 2:792569/1‑145 (MQ=11) gTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaagt < 2:1308703/150‑6 (MQ=11) gTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaagt > 1:1508793/1‑145 (MQ=11) gTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATGAACTCGCAATTCGGGTAAAAatatcaagt > 2:4535465/1‑145 (MQ=11) tCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaagta > 1:4177561/1‑144 (MQ=11) tCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaagta > 1:2654690/1‑144 (MQ=11) tCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaagta < 2:1244351/150‑7 (MQ=11) tCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaagta < 2:1539539/150‑7 (MQ=11) cAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaagtac > 1:252889/1‑143 (MQ=11) cAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaagtac > 1:2969074/1‑143 (MQ=11) cAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaagtac > 1:4385555/1‑143 (MQ=11) cAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaagtac < 2:2727760/150‑8 (MQ=11) cAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaagtac > 1:1787375/1‑143 (MQ=11) cAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaagtac < 2:1048744/150‑8 (MQ=11) cAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaagtac > 2:2120055/1‑143 (MQ=11) cAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaagtac < 2:1937965/150‑8 (MQ=11) cAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACGTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaagtac > 2:4397393/1‑143 (MQ=11) || AGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGGTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAATATAATGATG > CP043523/1891118‑1891335 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |