New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP043523 | 1400514 = | 520 (0.980) | 215 (0.450) +AAACTCCTTTTTTAAT |
63/262 | 22.6 | 31.8% | intergenic (+110/‑3) | FTN78_chr1417/FTN78_chr1418 | Transcriptional regulator/neutral endopeptidase |
? | CP043523 | 1439105 = | 518 (0.970) | intergenic (‑98/+105) | FTN78_chr1453/FTN78_chr1454 | tyrosine phosphatase/Oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide‑binding protein OppA | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 522 total aligned reads displayed.
GCAAAATTGCTAAAATTTATCGTTTCAGAACTATTTAATTACGAGTTTACATTAATTTTCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCAGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGATTTAGCTG > CP043523/1400367‑1400661 | gCAAAATTGCTAAAATTTATCGTTTCAGAACTATTTAATTACGAGTTTACATTAATTTTCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCg < 2:4650491/148‑1 (MQ=255) aaaaTTGCTAAAATTTATCGTTTCAGAACTATTTAATTACGAGTTTACATTAATTTTCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGat > 2:2070481/1‑148 (MQ=255) aTTGCTAAAATTTATCGTTTCAGAACTATTTAATTACGAGTTTACATTAATTTTCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATg < 1:1498887/148‑1 (MQ=255) ttGCTAAAATTTATCGTTTCAGAACTATTTAATTACGAGTTTACATTAATTTTCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGa > 1:762517/1‑148 (MQ=255) gCTAAAATTTATCGTTTCAGAACTATTTAATTACGAGTTTACATTAATTTTCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACa < 1:3569/148‑1 (MQ=255) gCTAAAATTTATCGTTTCAGAACTATTTAATTACGAGTTTACATTAATTTTCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACa > 1:3877761/1‑148 (MQ=255) cTAAAATTTATCGTTTCAGAACTATTTAATTACGAGTTTACATTAATTTTCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACaa < 1:3408643/148‑1 (MQ=255) tAAAATTTATCGTTTCAGAACTATTTAATTACGAGTTTACATTAATTTTCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAg < 1:1185078/148‑1 (MQ=255) aaaaTTTATCGTTTCAGAACTATTTAATTACGAGTTTACATTAATTTTCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAgg < 2:1664124/148‑1 (MQ=255) tttATCGTTTCAGAACTATTTAATTACGAGTTTACATTAATTTTCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTc > 1:4306648/1‑148 (MQ=255) tttATCGTTTCAGAACTATTTAATTACGAGTTTACATTAATTTTCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATACAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTc < 1:2661066/148‑1 (MQ=255) aTCGTTTCAGAACTATTTAATTACGAGTTTACATTAATTTTCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAg < 2:1584879/148‑1 (MQ=255) aTCGTTTCAGAACTATTTAATTACGAGTTTACATTAATTTTCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAg < 2:1030582/148‑1 (MQ=255) aTCGTTTCAGAACTATTTAATTACGAGTTTACATTAATTTTCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAg < 2:2373057/148‑1 (MQ=255) tttCAGAACTATTTAATTACGAGTTTACATTAATTTTCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAgatga > 2:3916918/1‑148 (MQ=255) tCAGAACTATTTAATTACGAGTTTACATTAATTTTCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGAtt > 1:1869431/1‑148 (MQ=255) cAGAACTATTTAATTACGAGTTTACATTAATTTTCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGAttt > 1:2248113/1‑148 (MQ=255) aCTATTTAATTACGAGTTTACATTAATTTTCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTc < 1:1996176/148‑1 (MQ=255) tttAATTACGAGTTTACATTAATTTTCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTa > 1:909793/1‑148 (MQ=255) ttACGAGTTTACATTAATTTTCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGtt < 2:3879787/148‑1 (MQ=255) ttACGAGTTTACATTAATTTTCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGtt < 1:370224/148‑1 (MQ=255) aCGAGTTTACATTAATTTTCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTaa > 1:974505/1‑148 (MQ=255) gAGTTTACATTAATTTTCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATg > 1:139261/1‑148 (MQ=255) gAGTTTACATTAATTTTCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATg < 1:1010359/148‑1 (MQ=255) aGTTTACATTAATTTTCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGc < 2:1933952/148‑1 (MQ=255) gTTTACATTAATTTTCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCt > 1:1257537/1‑148 (MQ=255) tAATTTTCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGtt < 2:794203/148‑1 (MQ=255) aTTTTCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAg < 1:3953481/148‑1 (MQ=255) aTTTTCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAg < 2:1705085/148‑1 (MQ=255) tttCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGaa > 1:2777302/1‑148 (MQ=255) tCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGaaaa < 1:4528364/148‑1 (MQ=255) cAAATTGCTGTTAAAAAGTTCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAAt < 2:1756249/148‑1 (MQ=255) aaaTTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATg > 2:4201824/1‑148 (MQ=255) aaTTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGc < 1:3187405/148‑1 (MQ=255) aTTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCa < 1:4267399/148‑1 (MQ=255) ttGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAg < 1:2456005/148‑1 (MQ=255) ttGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAg < 2:384978/148‑1 (MQ=255) tGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGa < 1:316519/148‑1 (MQ=255) tGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGa > 1:4359273/1‑148 (MQ=255) gCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGaa < 1:713951/148‑1 (MQ=255) cTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGaaa < 2:3191370/148‑1 (MQ=255) cTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGaaa > 2:3413179/1‑148 (MQ=255) gTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAAtt > 2:4368201/1‑148 (MQ=255) ttAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTc < 2:4440660/148‑1 (MQ=255) ttAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTc > 1:3796823/1‑148 (MQ=255) tAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTcc < 1:538776/148‑1 (MQ=255) aaaaaGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCt > 1:363404/1‑148 (MQ=255) aaGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCa < 2:30642/148‑1 (MQ=255) 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atatCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCAGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAAt < 2:3622485/148‑1 (MQ=255) atatCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCAGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAAt > 1:4182603/1‑148 (MQ=255) atatCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCAGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAAt > 1:931173/1‑148 (MQ=255) tCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTg > 2:1489578/1‑148 (MQ=255) tCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCAGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTg < 2:293806/148‑1 (MQ=255) ccATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCAGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTgg > 2:2307645/1‑148 (MQ=255) ccATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCAGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTgg > 2:4071132/1‑148 (MQ=255) aataGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCAGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTaa > 1:4224071/1‑148 (MQ=255) ataGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCAGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTaaa > 1:1098270/1‑148 (MQ=255) ataGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCAGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTaaa < 1:2748840/148‑1 (MQ=255) ataGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCAGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTaaa < 1:2070481/148‑1 (MQ=255) aggaggTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCAGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGa > 2:4303773/1‑148 (MQ=255) aggaggTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCAGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGa < 2:1289829/148‑1 (MQ=40) ggaggTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCAGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGAt > 2:2988041/1‑148 (MQ=255) ggTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCAGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGATTTa < 1:461452/148‑1 (MQ=39) gTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCAGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGATTTAg > 1:2854255/1‑148 (MQ=38) tCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCAGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGATTTAGc > 1:833455/1‑148 (MQ=38) | GCAAAATTGCTAAAATTTATCGTTTCAGAACTATTTAATTACGAGTTTACATTAATTTTCAAATTGCTGTTAAAAAGTGCTGATGGAATTCGTCAGCGCTTTTTTGTAAGTATGATATAATATAAAAAATATCCATAATAGGAGGTCGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCAGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGATTTAGCTG > CP043523/1400367‑1400661 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |